Столица Японии — политический и административный центр Японии, местопребывание правительства и других высших органов государственной власти. С 1868 года по настоящее время столицей Японии является Токио.
В ходе истории страны столицы Японии менялись. Столица определялась по местонахождению императорского дворца и, соответственно, местопребыванию императора, даже в то время, когда фактически страной управлял сёгунат. Иногда отдельно выделяют столицы сёгуната, так, например, с 1603 по 1868 год столицей сёгуната был Эдо, в то время как имперской столицей был Киото. В ранней истории Японии, с 390 по 794 год, столица менялась несколько десятков раз, и наконец в 794 году столицей стал город Хэйан-кё (будущий Киото), пробывший в статусе столицы более тысячи лет, до 1868 года. В 1868 году Император Муцухито перенёс столицу в Эдо, переименовав его в Токио, резиденцией императоров и императорского двора стал Императорский дворец Токио.
В приведённой ниже таблице указаны столицы Японии, годы, в течение которых город был столицей, а также современное географическое название местности, на которой располагалась столица[1].
С 1192 по 1868 год Японией большую часть времени фактически управляли сёгуны, поэтому фактическими столицами были города, в которых располагалось правительство сёгуна, называемое бакуфу.