Никола́й Ива́нович Суббо́тин (13 (25) ноября 1827 — 30 мая (12 июня) 1905) — русский историк церкви, публицист, доктор богословия, заслуженный профессор и преподаватель Московской духовной академии; тайный советник.
Родился 13 (25) ноября 1827 года в семье протоиерея старого Покровского собора в Шуе Владимирской губернии. Окончил Шуйское духовное училище (1842) и Владимирскую духовную семинарию (1848). В числе лучших четырёх выпускников был отправлен в Московскую духовную академию, которую окончил в 1852 году третьим магистром XVIII курса. Выпускное сочинение — «О заслугах духовенства в отношении к верховной власти в России».
В октябре 1852 года он был назначен преподавателем в Вифанскую семинарию: в высшем отделении читал церковную историю и церковное законоведение; в среднем отделении преподавал церковно-библейскую историю. С ноября 1853 года был одновременно помощником инспектора семинарии. Свою магистерскую диссертацию «Об отношениях духовенства русского к князьям с XI в. до половины XV в.» он представил в 1854 году (была напечатана в «Прибавлениях к творениям святых отцов»). Был утверждён в степени магистра 12 ноября 1854 года, а спустя год был перемещён в Московскую духовную академию, где с ноября 1855 года в звании бакалавра, а с 24 февраля 1859 года в звании экстраординарного профессора преподавал библейскую герменевтику и учение о вероисповеданиях, ересях и расколах. С ноября 1857 года исполнял также обязанности помощника инспектора, с сентября 1860 — помощника библиотекаря, а с ноября 1862 года был библиотекарем Московской духовной академии — оставаясь в этой должности до мая 1864 года, когда был определён секретарём Комитета для цензуры духовных книг.
По новому уставу 1869 года из учения о вероисповеданиях была выделена отдельная дисциплина, и Субботин возглавил с 1870 года новую кафедру истории и обличения русского раскола. В этом же году он был избран членом совета Московской духовной академии.
К 1874 году он завершил большой труд «Происхождение, так называемой, Австрийской или Белокриницкой иерархии» (М., 1874), который был представлен им в качестве диссертации на степень доктора богословия, которой был удостоен в июле того же года. В сентябре он был утверждён в звании ординарного профессора Московской духовной академии, а в ноябре академическим советом был избран помощником ректора по церковно-историческому отделения и занимал эту должность до сентября 1883 года.
С 1875 года Николай Субботин был редактором журнала «Братское слово», статьи которого вызывали негодование у старообрядцев. В январе 1879 года советом академии он был определён одним из редакторов журнала «Прибавления к Творениям Святых Отцов» (до сентября 1883 года).