Систематический перечень судоходных рек России (с водохранилищами) составлен на основе перечня внутренних водных путей Российской Федерации. Формирование перечня проходило по принципу: океан — море — река — приток реки — приток притока и так далее. Если река указана и в основных и в дополнительных судовых ходах, в списке указывается только основные судовые хода. Протоки и рукава указаны только для основных ходов.