Значение систематики для современной биологии можно выразить словами известного российского ботаника, знатока систематики, Армена Леоновича Тахтаджяна:
Методы, применяемые для построения систем классификации растений, совершенствовались с развитием науки. В современной филогенетической систематике можно выделить три крупные группы методов:
Классификация растений вызывает сложности в том числе и из-за разногласий между сторонниками монофилии и полифилии.