Клуб был основан в 1935 году как футбольная секция компании «Токио Газ». В 1999 году перед присоединением к профессиональной футбольной Джей-лиге переименован в «ФК Токио». В первом же профессиональном сезоне клуб занял 2-е место во Втором дивизионе Джей-лиги и вышел в Первый дивизион. Сейчас клуб по-прежнему играет в элитном дивизионе Японии. Высшим достижением в чемпионате было 2-ое место в сезоне 2019.