Ультраструктура — термин для обозначения наноструктуры биологического объекта. Может применяться по отношению к клеткам, тканям, органам и другим биологическим структурам. Исследование ультраструктуры стало возможно после создания электронного микроскопа и ультрамикроскопии[1].
Ультраструктурный анализ наравне с молекулярной филогенетикой является надёжным способом классификации организмов[2].