Уфимская духовная семинария — среднее учебное заведение Уфимской епархии Русской православной церкви для подготовки церковно- и священнослужителей. Действовала в городе Уфе с 1800 по 1917 годы.
Семинария в Уфе была открыта по определению Святейшего Синода от 25 июня 1800 года и до 1865 года именовалась Оренбургской (по названию епархии). При разделении Оренбургской епархии на Оренбургскую и Уфимскую, семинария получила наименование Уфимской.
При семинарии в 1804 году был открыт сиротский дом, функционировала церковь во имя Св.Иоанна Златоуста (освящена в 1844 году).
В Духовной семинарии изучали классические славяно-греко-латинское церковное красноречия, медицину, рисование (с 1804г.), французский и немецкий языки (с 1808). В 1840 введены курсы: богословия, учение о вероисповеданиях и расколе, Священное Писание, герменевтика, православное исповедание, патистика, Библейская история Христианской Церкви - общая и русская, история, археология, церковное каноническое право, учение о богослужебных книгах, пасхалия; уроки логики, психологии, риторики, поэзии, физики, алгебры, еврейский, татарский, чувашский языки и др. В 1898 году в семинарии училось 181 учеников.[1]
В 1917 году семинария была закрыта, а с 1930 года в семинарском здании разместился Башкирский сельскохозяйственный институт.
Первоначально семинария размещалась в деревянном здании на улице Фроловской. Это здание 5 марта 1806 г. сгорело и семинаристы длительное время проводили учебные занятия в тесных флигелях неподалёку.