Федера́льное аге́нтство нау́чных организа́ций (сокр. ФАНО́ России) — существовавший в 2013—2018 годах федеральный орган исполнительной власти, осуществлявший функции по нормативно-правовому регулированию и оказанию государственных услуг в области науки, образования, здравоохранения и агропромышленного комплекса, а также по управлению федеральным имуществом, находящимся в ведении Российской академии наук.
Процесс реформы был инициирован существовавшим в то время Министерством образования и науки Российской Федерации и юридически оформлен в виде федерального закона от 27 сентября 2013 года[3]. Согласно закону, к РАН были присоединены академии медицинских и сельскохозяйственных наук, а организации, входившие в академии, и их имущество переданы в управление новому органу федеральной власти (ФАНО России). Агентство подчинялось Правительству Российской Федерации.
24 октября 2013 года председатель Правительства Российской Федерации Дмитрий Медведев назначил главой ФАНО России Михаила Котюкова[4] (ранее — заместителя министра финансов РФ), который оставался в этой должности в течение всего времени существования ФАНО России.
25 октября стало известно, что агентство будет управлять всем имуществом научных организаций России, а не только имуществом, принадлежавшим бывшим учреждениям РАН[5]. Позже было уточнено, что науку в вузах оставят в ведении Минобрнауки России[6].
30 декабря 2013 года распоряжением Правительства Российской Федерации № 2591-р был утверждён список из 1007 учреждений, переходящих в подчинение ФАНО России; после серии корректировок, на ноябрь 2017 года, он включал 1008 учреждений[7]. Все эти организации ранее подчинялись Российской академии наук, Российской академии медицинских наук или Россельхозакадемии.
В ноябре 2014 года путём открытого голосования на сайте ФАНО России[8] были отобраны кандидаты в состав комиссии по оценке результативности деятельности научных организаций. 25 ноября при Агентстве был образован Научно-координационный совет в составе 45 ведущих российских учёных[9].