Федеральное агентство по управлению особыми экономическими зонами (РосОЭЗ) — федеральный орган исполнительной власти России, существовавший в 2005—2009 годах, находившийся в ведении Министерства экономического развития Российской Федерации.
Агентство осуществляло функции по оказанию государственных услуг и правоприменительные функции в сфере управления особыми экономическими зонами, функции по контролю за выполнением соглашений об осуществлении (ведении) промышленно-производственной, технико-внедренческой и туристско-рекреационной деятельности в особых экономических зонах, в портовых особых экономических зонах по обеспечению действия специального правового режима Особой экономической зоны в Калининградской области.
Федеральное агентство по управлению особыми экономическими зонами, подведомственное Министерству экономического развития и торговли Российской Федерации, было образовано 22 июля 2005 года Указом Президента Российской Федерации № 855 в целях реализации подписанного в тот же день Федерального закона «Об особых экономических зонах в Российской Федерации».
19 августа 2005 года было утверждено Положение об агентстве, установлена численность центрального аппарата (185 человек) и его юридический адрес — Москва, Овчинниковская набережная, д. 18/1. Также установлены количество должностей заместителя руководителя — 5 единиц, количество управлений в центральном аппарате — 9 и численность работников территориальных подразделений — 200 человек.
В апреле 2006 года для реализации некоторых функций по управлению особыми экономическими зонами на базе ФГУП «Внешстройимпорт» было создано ОАО «Особые экономические зоны» со 100-процентным государственным участием. За агентством были закреплены полномочия собственника в новом обществе.
В апреле 2007 года аппарат агентства был заметно увеличен вследствие передачи некоторых функций от Федеральной службы кадастра объектов недвижимости. Так, количество управлений в центральном аппарате было увеличено до 12-ти, его численность — до 327 человек, численность работников территориальных органов — до 650 человек.