Алексей Матвеевич Филомафи́тский (17 [29] марта 1807, Малахово, Ярославская губерния — 22 января [3 февраля] 1849, Москва[1]) — российский физиолог, доктор медицины, ординарный профессор и декан медицинского факультета Московского университета. Известен как один из основоположников экспериментальной физиологии в России, как автор учебника «Физиология» и сочинений по переливанию крови и наркозу.
Родился 17 (29) марта 1807 года в селе Малахово Романовского уезда Ярославской губернии[2] в семье местного священника; окончил здесь приходскую начальную школу. Среднее образование получил в Ярославской духовной семинарии, затем, в 1824 году, поступил в Императорский Харьковский университет, на отделение словесных наук, где его старший брат Евграф преподавал историю, но вскоре перешёл на медицинский факультет. Окончив курс с званием лекаря 1-го отделения, в 1828 году он сдал экзамен в Императорской Академии наук и поступил в Профессорский институт при Дерптском университете, где он специально занимался физиологией. Был удостоен степени доктора медицины за диссертацию на латинском языке «О дыхании птиц» (1833). В этом же году был направлен в Берлинский университет, где занимался в лаборатории И. Мюллера.
В 1835 году, по возвращении из-за границы, он был определён преподавателем в Императорский Московский университет и четыре месяца спустя (31.12.1835), при введении в действие нового университетского устава, был утверждён в звании экстраординарного профессора по кафедре физиологии и общей патологии, а с 1837 года и до своей смерти читал, в звании ординарного профессора, помимо физиологии, сравнительную анатомию и общую патологию. С 1846 года был деканом медицинского факультета Московского университета.
Филомафитский — один из первых представителей экспериментального направления физиологии в России. Резко критиковал умозрительный путь получения знаний, считал, что опираться можно только на опыт. Прибегал к вивисекции животных (лягушка, собака, голубь). Проводил эксперименты с перерезкой блуждающих нервов, изучал рефлекс кашля, химизм и механизм желудочного пищеварения и другие. Широко использовал оптические приборы (впервые в России применил микроскоп для исследования клеток крови). Стремился связать физиологию с практическими задачами медицины.
Не принимал электрическую теории нервного возбуждения, подчёркивал различие между электричеством и «нервным живым началом». Опережая существовавшие взгляды, он первым высказал мысль о том, что источником тепла в живом организме является «животно-химический процесс», то есть обмен веществ. Говорил о процессах угнетения и задерживания рефлекторных реакций в головном мозге.