Фрагментация среды обитания — появление и увеличение фрагментации естественной среды обитания, вызывающее фрагментацию популяции и распад экосистемы.
Основная проблема — уменьшение естественной среды обитания и биоразнообразия[1]. В разрозненных фрагментах дикой природы количество видов уменьшается[2]. Изолированные участки лесов Амазонии размером в 100 гектар потеряли половину видов за 15 лет[3].
Фрагментация среды обитания делает невозможной миграцию растений и животных в ответ на деятельность человека или изменения климата. При наличии путей миграции колебания популяции уменьшаются.