Центральный совет был основан 19 июля 1950 г. во Франкфурте-на-Майне делегатами уже существующих еврейских общин в ФРГ и их региональных объединений. В его первый совет директоров вошли: государственный уполномоченный Баварии по делам рас, религиозных и политических преследований Филипп Ауэрбах; Хайнц Галински, который был освобожден в Берген-Бельзене и впоследствии много лет возглавлял берлинскую еврейскую общину; адвокат Бенно Остертаг, специализирующийся на вопросах возмещения ущерба ; два члена Центрального комитета в зоне США Пейсах Пикач и Хаскиль Эйфе; Йозеф Розенсафт и Норберт Волльхейм для британской зоны. Первой резиденцией Центрального совета евреев в Германии был Франкфурт-на-Майне , с 1951 г. - Дюссельдорф , с 1985 г. - Бонн, а с 1 апреля 1999 г. - Берлин, где головной офис располагается в Leo-Baeck-Haus .
Сама организация отмечает, что всего через два месяца после освобождения Германии союзниками и капитуляции нацистской Германии был сформирован Центральный комитет освобожденных евреев в американской зоне . Он считается одной из первых ячеек Центрального совета, который был основан пятью годами позже. Подобные союзы существовали и в других оккупационных зонах. В 1945 г. был восстановлен 51 приход; год спустя в Германии было уже 67 еврейских общин.
В первые несколько лет организация считала своей основной задачей влиять на законодательство, чтобы исправить национал-социалистическую несправедливость. Позже борьба с антисемитизмом , поддержка сближения между Германией и Государством Израиль и содействие работе сообществ-членов и региональных ассоциаций стали более важными задачами, а также приверженность взаимопониманию между евреями и не евреями.
После падения Берлинской стены и воссоединения Германии в 1990 году иммиграция десятков тысяч евреев (в основном в качестве «беженцев по квоте») из стран бывшего Советского Союза (государств СНГ) стала новым фокусом. Они были распределены по федеральным землям в соответствии с ключом Кенигштайна, который в основном учитывает количество жителей. Число членов еврейской общины Германии с 1990 года увеличилось более чем в три раза.
Те, кто родился в Германии, по-прежнему формируют Центральный совет - и несколько евреев из Восточной Европы, которые сейчас составляют большинство членов общины во многих местах. Центральный совет издает еженедельную газету Jüdische Allgemeine . Союз прогрессивных евреев , чьи приходы имеют ок. 3000 членов, является вторым по величине объединение еврейских общин в Германии после Центрального Совета. После ранее напряженных отношений между двумя организациями отношения теперь нормализовались. В некоторых случаях теперь члены региональных ассоциаций Союза прогрессивных евреев в Центральном совете евреев Германии.