Чемпионат России по хоккею с шайбой 2006/2007 стартовал 7 сентября 2006 года для Суперлиги и 16 сентября для Высшей лиги.
25 марта 2006 года президент ФХР А. Я. Стеблин подал в отставку. Поводом для этого послужил инцидент, произошедший 8 января в Санкт-Петербурге на финале Кубка европейских чемпионов. Там Стеблин, находясь в нетрезвом состоянии, оскорбил представителей российской и международной хоккейной общественности, включая главу Международной федерации хоккея Рене Фазеля, а также допустил рукоприкладство по отношению к спортивному журналисту Всеволоду Кукушкину.[1]
25 апреля 2006 года на пост президента ФХР единогласно (93 голоса «за» и 0 «против») был избран Владислав Александрович Третьяк.
В результате ФХР отозвала у ПХЛ полномочия на проведение чемпионата России (которые до этого были делегированы ей по договору). В ФХР было создано Управление по проведению соревнований, главой которого был назначен Владимир Шалаев.
Новое руководство ввело ряд существенных изменений в регламент проведения чемпионата. В основном они коснулись участия в чемпионате иностранных игроков. Был введён своеобразный «налог» на легионеров. Первоначально ФХР предполагала, что за полевого игрока клуб Суперлиги обязан будет заплатить 1,5 миллиона, а за вратаря 9 миллионов рублей. В итоге «штраф» за вратаря был снижен до 4,5 миллионов рублей. Кроме этого был введён потолок зарплат клубов (ограничение фонда совокупного дохода хоккеистов клуба) — 300 миллионов рублей.
Ещё в прошлом сезоне владельцы хоккейного клуба «Спартак» собиралось найти новых владельцев для команды. Летом 2006 года главе Фонда поддержки народной команды «Спартак» Игорю Шабдурасулову удалось отыскать желающих стать новыми владельцами клуба. Посредником в продаже выступал Вадим Алексеевич Мельков. Однако, после трагической гибели 9 июля 2006 года Вадима Мелькова в авиакатастрофе аэробуса A-310 в Иркутске, переговоры прекратились, так как спонсоры готовы были выделить средства только под непосредственное участие Мелькова в проекте[2].