Шарлотта Иоганна Вальдек-Вильдунгенская (нем. Charlotte Johanna von Waldeck-Wildungen; 13 декабря 1664, Арользен — 1 февраля 1699, Хильдбургхаузен) — графиня Вальдек-Вильдунгенская, в замужестве герцогиня Саксен-Кобург-Заальфельдская.
Шарлотта София — дочь графа Иосии Вальдек-Вильдунгенского и его супруги Вильгельмины Кристины, дочери графа Вильгельма Нассау-Гильхенбахского.
2 декабря 1690 года в Маастрихте Шарлотта София вышла замуж и стала второй супругой герцога Иоганна Эрнста Саксен-Кобург-Заальфельдского, сына герцога Эрнста I Саксен-Кобург-Альтенбургского. В этом браке родилось восемь детей: