Шептако́вская со́тня — административно-территориальная и войсковая единица в составе Стародубского полка Гетманщины, существовавшая в XVII—XVIII веках.
Шептаковская сотня упоминается в составе Стародубского полка в течение всего времени его существования, с момента образования (1654) до расформирования (1782). По всей видимости, была образована ещё в 1651—1653 гг. как «вторая Новгородская» сотня, в составе которой село Шептаки («Шептаковское») упоминается в Присяжных книгах 1654 года.[1]
По царской грамоте 1665 г., Шептаковская сотня была пожалована гетману Брюховецкому, «со всеми селами и деревнями, с крестьянами и бобылями и всякими угодьями, в вечное владение, опрочь казацких дворов и земель». Крестьяне Шептаковской сотни составили особую Шептаковскую волость, и после Брюховецкого ею стали владеть его преемники. Однако Шептаковская волость не ограничивалась пределами Шептаковской сотни: несколько сёл этой волости находились в соседних сотнях.
В 1668 г. Пётр Дорошенко, который занял Левобережье и вытеснил Брюховецкого на юг, создал из части Нежинского и Стародубского полков Новгород-Северский полк, куда вошла и Шептаковская сотня. Но новый левобережный гетман Демьян Многогрешный в начале 1669 г. упразднил Новгород-Северский полк и восстановил прежнее административное деление.
По упразднении полкового и сотенного деления (с 1782), основная часть территории Шептаковской сотни вошла в Новгород-Северский уезд и в настоящее время находится в составе Украины. Село Кистёр и слобода Андрейковичи вошли в Погарский уезд и ныне относятся к Погарскому району Брянской области.
Шептаковская сотня располагалась в юго-восточной части Стародубского полка, между полковой и Новгородской сотнями; занимала правобережье Десны ниже устья Судости, до реки Ревны.