Деревня расположилась на левом берегу реки Пинеги в 20 км от Пиринеми и 33 км северо-западнее села Карпогоры. К северу от Шотогорки находятся деревни Пиринемь и Чешегора, к югу — деревни Кылма (нежил.) и Березник.