Расположен в северной части Казахстана, на озере Щучье, в 70 км к юго-востоку от административного центра области города Кокшетау. Железнодорожная станция «Курорт-Боровое» на линии Петропавловск — Астана.
По классификации Кёппена климат Щучинска является влажным континентальным климатом с тёплым лето (Dfb). Среднегодовая температура равна 3°C. Средняя температура самого холодного месяца- января: -14,5°C, а самого теплого месяца-июля: 20,2°C. В год выпадает около 410 мм осадков. В основном осадки выпадают в период с апреля по октябрь
В 1850 году в 15 километрах от станицы Котуркульской (Котыркольской) (основана в 1849 году) появился выселок Щучинский, который стал одним из форпостов сибирских казаков с административным центром в Омске.
Первыми поселенцами станицы Щучинской были казаки и крестьяне после крестьянской реформы середины XIX века. В станицу прибыли и крестьяне-переселенцы из Харьковской губернии (деревня Старобельская)
Административно выселок находился при станице Котуркульской. В 1850 году в Щучинской станице были построены первые дома. Атаманской улицей стала та, где жил атаман, та, где стояла церковь — Церковной, ведущая к базару — Базарной.
21 октября 1868 года подписан Высочайший указ его Императорского Величества Российской Империи об основании Акмолинской области с административным центром в Омске. Акмолинская область была образована в составе Западно-Сибирского генерал-губернаторства, станица Щучинская отнесена к Кокчетавскому уезду этой области.