44-я отдельная разведывательная авиационная эскадрилья ВВС Балтийского флота, она же 44-я отдельная авиационная эскадрилья ВВС Балтийского флота — воинское подразделение вооружённых сил СССР в Великой Отечественной войне.
На вооружении эскадрильи к началу войны состояли самолёты МБР-2, базировалось подразделение в Таллине
Можно говорить о том, что эскадрилья среди советских ВВС флота первой приняла участие в боевых действиях: в 3-30 22 июня 1941 года два самолёта МБР-2, вылетевшие из Таллина обнаружили группу неизвестных кораблей и были ею обстреляны. Это оказался отряд немецких минных заградителей, возвращающийся домой после установки закграждений. 24 июня 1941 года самолёты эскадрильи по ошибки подвергли атаке советскую подводную лодку М-90 и вынудили её залечь на дно.
С начала августа 1941 года эскадрилья была привлечена к обороне Таллина, действует по сухопутным немецким войскам, продвигающимся к столице Эстонии, 26 августа 1941 года была вынуждена перелететь в Ленинград
В сентябре 1941 года вошла в состав 15-го авиационного полка ВВС Балтийского флота и вела боевые действия в составе полка до марта 1943 года, а с марта 1943 года и до конца войны - в составе 15-го отдельного морского разведывательного авиационного полка ВВС Балтийского флота.
На 1 января 1943 года базируется на аэродроме Борки, на 1 января 1944 года - Гражданка, на 1 ноября 1944 года в Паневежисе, где по всей видимости, и закончила войну.