Станица Ермаковская, а также примыкающие к ней хутора расположены в долине реки Долгой (которая теперь окончательно высохла), основана в 1876 году. Своё название станица получила в честь казачьего атамана Ермака Тимофеевича, покорителя Сибири. До 1915 года станица относилась к Первому Донскому округу. В том же году в ней насчитывалось 465 дворов и 1587 человек населения. Все прочие поселения на территории современного муниципального образования были образованы в конце XIX — начале XX века.
В 1920 году в станице Ермаковской был образован Ермаковский сельский совет. Согласно архивным документам, с 1943 года на территории земель нынешнего сельского поселения были организованы три сельских совета:
17 января 1992 года была образована Ермаковская сельская администрация, которая стала правопреемником Ермаковского сельского совета.