В 1999 году был утверждён список населённых пунктов Вологодской области. Согласно этому списку, в Кубинский сельсовет входил 51 населённый пункт, центром его была деревня Ивачино[1].
1 января 2006 года Кубинский сельсовет был преобразован в сельское поселение[3]. Первоначально оно было указано в законе как Кубенское, законом от 26 мая 2010 года название было исправлено на Кубинское[4], а 18 апреля 2012 года — обратно на Кубенское[5]
Законом Вологодской области от 28 апреля 2015 года № 3634-ОЗ[7], сельские поселения Кубенское и Разинское преобразованы, путём объединения, в сельское поселение Кубенское с административным центром в деревне Сорожино.
На территории сельского поселения зарегистрировано 27 частных предпринимателей, которые в основном заняты лесозаготовками и переработкой древесины. Работают 5 магазинов, Дом сестринского ухода, 3 ФАПа, отделения связи в деревнях Ивачино и Сорожино, Сорожинская общеобразовательная школа, Нижне-Кубенская общеобразовательная школа, Сорожинский центр досуга, Кубенский сельский клуб, Нижне-Кубенский дом культуры.
Действуют скважина, водонапорная башня, водопроводные и канализационные сети, в посёлке Нижне-Кубенский объекты социальной сферы обслуживает котельная.