Ю -Ги-О! В сериале представлен обширный состав персонажей, созданных Кадзуки Такахаши . Действие сериала происходит в вымышленном городе Японии под названием Домино-Сити, откуда родом большинство персонажей, появляющихся в сериале. Многие элементы сюжета также находятся под влиянием Египта и египетской мифологии , поэтому в истории также появляются египетские персонажи.
Оригинальная манга Yu-Gi-Oh! рассказывает историю Юги Муто, робкого мальчика, который любит всевозможные игры, но над ним часто издеваются. Однажды он решает древний артефакт, известный как «Загадка тысячелетия», заставляя его тело стать хозяином таинственного духа с личностью игрока. С этого момента, всякий раз, когда Юги или одному из его друзей угрожают те, в чьих сердцах тьма, этот «Темный Юги» показывает себя и бросает им вызов в опасной «Темной игре» (闇のゲーム Yami no Gēmu; Игра теней в английские СМИ), которые раскрывают истинную природу чьего-либо сердца, проигравшие в этих состязаниях часто подвергаются мрачному наказанию, называемому «Игрой Штрафников». По ходу сериала Юги и его друзья (Кацуя Джонучи, Анзу Мазаки, Хирото Хонда, а затем Ре Бакура) узнают, что этот другой Юги внутри его головоломки на самом деле является духом безымянного фараона из египетских времен, который потерял свои воспоминания. Пытаясь помочь фараону вернуть воспоминания, Юги и его товарищи проходят через множество испытаний, рискуя жизнью против других, владеющих таинственными предметами тысячелетия и темной силой Игр теней.
Японские имена в западном порядке (имя перед фамилией) и английские названия манги указаны первыми, а английские названия аниме — вторыми, если это применимо.
Во время сюжетной арки «Мир тысячелетия» Дарк Юги отправляется в свои потерянные воспоминания и встречает старых знакомых из Древнего Египта в качестве неигровых персонажей (неигровых персонажей) в лучшей настольной ролевой игре Дарк Бакуры, Shadow RPG (闇のＲ・Ｐ・Ｇ , Yami no Ā Pī Jī ) , кампания, основанная на прошлом.
Шесть Верховных Жрецов (六神官, Року Синкан ) защищают семь Предметов Тысячелетия своей жизнью и должны поклясться в вечной верности фараону Атему (выступающему в качестве игрового персонажа Темного Юги, духа Атема в наше время). В эпоху, когда Игры Теней использовались для определения судьбы человека, эти Жрецы использовали Предметы Тысячелетия и колдовство, чтобы вытащить и запечатать человеческие души ( Ка ), которые принимают форму Духов Монстров, в каменные плиты для ведения битвы; обычно от преступников и тех, кто ворует из гробниц фараонов. В ролевой игре здоровье и магия каждого персонажа обозначались его Ba Gauge.