Мужской баскетбольный турнир NAIA 1946 года проходил в марте в муниципальной аудитории в Канзас-Сити, штат Миссури . В 9-м ежегодном баскетбольном турнире NAIA приняли участие 32 команды, играющие в формате single-elimination. [1] Игра чемпионата была выиграна Университетом Южного Иллинойса , когда Салюки победили Университет штата Индиана Sycamores 49-40.
Штат Центральный Миссури , первоначальные национальные чемпионы и первые последовательные национальные чемпионы, играли в своем финальном турнире NAIA, хотя они оставались членами NAIA еще десять лет, уйдя в середине 1950-х, чтобы присоединиться к NCAA . Мулы участвовали в семи турнирах с общим рекордом в 13 побед и 6 поражений. Мулы выиграли два национальных чемпионата в 1937 и 1938 годах и заняли 4-е место в 1942 году .
Многие рекорды, установленные турниром 1945 года, были побиты, а многие награды были учреждены намного позже:
В игре за третье место участвовали проигравшие команды национального полуфиналиста, которые определили 3-е и 4-е места в турнире. В эту игру играли до 1988 года.