В мужском хоккейном турнире NCAA Division I 1999 года участвовали 12 школ, которые играли в игре на выбывание , чтобы определить национального чемпиона NCAA Division I. Он начался 26 марта 1999 г. Второй тур состоялся 27 и 28 марта. Полуфиналы состоялись 1 апреля. Матч национального первенства состоялся 3 апреля 1999 г. Всего было сыграно 11 игр, 3 финала на Arrowhead Pond (теперь Honda Center ) в Анахайме , Калифорния . Университет штата Мэн победил Нью-Гэмпшир со счетом 3–2 в овертайме и завоевал свой второй национальный чемпионат.
Заявки и посев для каждой команды в турнире были объявлены после завершения турниров конференции 20 марта 1999 года. Центральная студенческая хоккейная ассоциация (CCHA) предоставила четырем командам место в турнире: Hockey East и Western Collegiate Hockey . У каждой ассоциации (WCHA) было по три команды, получивших место в турнире, а у ECAC было два места.