Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
ADH1B
Белок ADH1B PDB 1deh.png
Доступные конструкции
PDBПоиск человеческого UniProt: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1DEH , 1HDX , 1HDY , 1HDZ , 1HSZ , 1HTB , 1U3U , 1U3V , 3HUD

Идентификаторы
ПсевдонимыADH1B , ADH2, HEL-S-117, алкогольдегидрогеназа 1B (класс I), бета-полипептид
Внешние идентификаторыOMIM : 103720 HomoloGene : 133563 GeneCards : adh1b
Расположение гена ( человек )
Хромосома 4 (человек)
Chr.Хромосома 4 (человек) [1]
Хромосома 4 (человек)
Геномное расположение ADH1B
Геномное расположение ADH1B
Группа4q23Начинать99 304 971 п.н. [1]
Конец99 352 760 п.н. [1]
Генная онтология
Молекулярная функция• оксидоредуктазы активность
• иона цинка связывания
• алкогольдегидрогеназы (НАД) активность
• иона металла связывания
• алкогольдегидрогеназы активности, цинк-зависимой
• ретинола дегидрогеназы
Сотовый компонент• цитоплазма
• нуклеоплазма
• цитозоль
• клеточная мембрана
Биологический процесс• окислительно-восстановительный процесс
• этанол окисление
• ретинол процесс обмена веществами
• кислоты метаболический процесс ретиноевой
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

125

н / д

Ансамбль

ENSG00000196616

н / д

UniProt

P00325

н / д

RefSeq (мРНК)

NM_001286650
NM_000668

н / д

RefSeq (белок)

NP_000659
NP_001273579

н / д

Расположение (UCSC)Chr 4: 99,3 - 99,35 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Алкогольдегидрогеназы 1B представляет собой фермент , который у человека кодируется adh1b гена . [3] [4]

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства алкогольдегидрогеназ . Члены этого семейства ферментов метаболизируют широкий спектр субстратов, включая этанол (алкогольные напитки), ретинол , другие алифатические спирты, гидроксистероиды и продукты перекисного окисления липидов . Кодируемый белок, известный как ADH1B или бета-ADH, может образовывать гомодимеры и гетеродимеры с субъединицами ADH1A и ADH1C, проявляет высокую активность в окислении этанола [5] [6] и играет важную роль в катаболизме этанола (окисление этанола до ацетальдегида). Ацетальдегид далее метаболизируется до ацетата альдегиддегидрогеназой.гены. Три гена, кодирующие тесно связанные субъединицы альфа, бета и гамма, тандемно организованы в геномном сегменте в виде кластера генов . [7]

Ген человека расположен на хромосоме 4 в 4q22.

Ранее ADH1B назывался ADH2 . В семействе алкогольдегидрогеназ больше генов. Эти гены теперь обозначаются как ADH1A , ADH1C и ADH4 , ADH5 , ADH6 и ADH7 . [8]

Варианты [ править ]

Одного нуклеотидный полиморфизм (SNP) , в adh1b является rs1229984 , что изменения аргинина к гистидину в остатке 47 зрелого белка; [9] стандартная номенклатура теперь включает инициирующий метионин, поэтому официально его положение составляет 48. «Типичный» вариант этого обозначался как ADH2 (1) или ADH2 * 1, а «атипичный» - как, например, , ADH2 (2), ADH2 * 2, ADH1B * 48His. Этот SNP связан с риском алкогольной зависимости, расстройств, связанных с употреблением алкоголя, и употреблением алкоголя, при этом атипичный генотип снижает риск алкоголизма . [10] [11] [12]

Другой SNP - это rs2066702 [Arg370Cys]. [13] первоначально назывался позицией 369. Этот SNP часто встречается у населения из Африки, а также снижает риск алкогольной зависимости. [14]

Роль в патологии [ править ]

Заметное снижение мРНК ADH1B было обнаружено в фибробластах роговицы, взятых у лиц, страдающих кератоконусом . [15]

См. Также [ править ]

  • Алкогольдегидрогеназа
  • Альдегиддегидрогеназа

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000196616 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ↑ Smith M (март 1986). «Генетика алкогольных и альдегиддегидрогеназ человека». Успехи в генетике человека 15 . Достижения в генетике человека . 15 . С. 249–90. DOI : 10.1007 / 978-1-4615-8356-1_5 . ISBN 978-1-4615-8358-5. PMID  3006456 .
  4. ^ Херли TD, Edenberg HJ (2012). «Гены, кодирующие ферменты, участвующие в метаболизме этанола» . Исследование алкоголя . 34 (3): 339–44. PMC 3756590 . PMID 23134050 .  
  5. ^ Херли TD, Edenberg HJ, Bosron WF (1990). «Экспрессия и кинетическая характеристика вариантов бета 1 бета 1 алкогольдегидрогеназы человека, содержащих замены в аминокислоте 47». J. Biol. Chem . 265 (27): 16366–72. PMID 2398055 . 
  6. ^ Херли TD, Edenberg HJ (2012). «Гены, кодирующие ферменты, участвующие в метаболизме этанола» . Исследование алкоголя . 34 (3): 339–44. PMC 3756590 . PMID 23134050 .  
  7. ^ «Entrez Gene: ADH1B алкогольдегидрогеназа IB (класс I), бета-полипептид» . Проверено 19 декабря 2019 .
  8. ^ Херли TD, Edenberg HJ (2012). «Гены, кодирующие ферменты, участвующие в метаболизме этанола» . Исследование алкоголя . 34 (3): 339–44. PMC 3756590 . PMID 23134050 .  
  9. Перейти ↑ Matsuo Y, Yokoyama R, Yokoyama S (август 1989 г.). «Гены алкогольных дегидрогеназ человека бета 1 и бета 2 отличаются только одним нуклеотидом». Европейский журнал биохимии . 183 (2): 317–20. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1989.tb14931.x . PMID 2547609 . 
  10. ^ Херли TD, Edenberg HJ (2012). «Гены, кодирующие ферменты, участвующие в метаболизме этанола» . Исследование алкоголя . 34 (3): 339–44. PMC 3756590 . PMID 23134050 .  
  11. ^ Томассон HR, Edenberg HJ, Крэбб DW, Mai XL, Джером RE, Li TK, Ван SP, Лин YT, Лу RB, Инь SJ (апрель 1991). «Генотипы алкоголя и альдегиддегидрогеназы и алкоголизм у китайских мужчин» . Американский журнал генетики человека . 48 (4): 677–81. PMC 1682953 . PMID 2014795 .  
  12. ^ Bierut LJ, Goate AM, Breslau N, Johnson EO, Bertelsen S, Fox L, Agrawal A, Bucholz KK, Grucza R, Hesselbrock V, Kramer J, Kuperman S, Nurnberger J, Porjesz B, Saccone NL, Schuckit M, Tischfield Дж., Ван Дж. К., Фоуд Т., Райс Дж. П., Эденберг Х. Дж. (Апрель 2012 г.). «ADH1B связан с алкогольной зависимостью и употреблением алкоголя в популяциях европейского и африканского происхождения» . Молекулярная психиатрия . 17 (4): 445–50. DOI : 10.1038 / mp.2011.124 . PMC 3252425 . PMID 21968928 .  
  13. ^ Burnell JC, Карр LG, Dwulet FE, Edenberg HJ, Li Т.К., Bosron WF (август 1987). «Субъединица бета 3 алкогольдегидрогеназы человека отличается от бета 1 заменой Cys на Arg-369, которая снижает связывание NAD (H)». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 146 (3): 1227–33. DOI : 10.1016 / 0006-291x (87) 90779-0 . PMID 3619918 . 
  14. ^ Уолтерс Р.К., Адамс MJ, Адкинс А.Е., Алиев Ф., Бакану С.А., Батцлер А. и др. (2018-03-10). «Транс-предковый GWAS алкогольной зависимости выявляет общие генетические основы психических расстройств» . bioRxiv : 257311. дои : 10,1101 / 257311 .
  15. ^ Mootha В.В., Kanoff Ю.М., Shankardas Дж, Dimitrijevich S (2009). «Заметное снижение алкогольдегидрогеназы в кератоконусных фибробластах роговицы» . Молекулярное зрение . 15 : 706–12. PMC 2666775 . PMID 19365573 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Харада S (апрель 2001 г.). «[Классификация ферментов и полиморфизмов метаболизма алкоголя - специфичность на японском языке]». Нихон Арукору Якубуцу Игаккай Засси = Японский журнал исследований алкоголя и наркозависимости . 36 (2): 85–106. PMID  11398342 .
  • Green RF, Stoler JM (июль 2007 г.). «Генотип алкогольдегидрогеназы 1B и алкогольный синдром плода: мини-обзор HuGE» . Американский журнал акушерства и гинекологии . 197 (1): 12–25. DOI : 10.1016 / j.ajog.2007.02.028 . PMID  17618743 .
  • Lange LG, Sytkowski AJ, Vallee BL (октябрь 1976 г.). «Алкогольдегидрогеназа печени человека: очистка, состав и каталитические свойства». Биохимия . 15 (21): 4687–93. DOI : 10.1021 / bi00666a023 . PMID  9982 .
  • Херли Т.Д., Босрон В.Ф., Гамильтон Д.А., Амзель Л.М. (сентябрь 1991 г.). «Структура бета-1 бета-1 алкогольдегидрогеназы человека: каталитические эффекты замен неактивных центров» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 88 (18): 8149–53. DOI : 10.1073 / pnas.88.18.8149 . PMC  52464 . PMID  1896463 .
  • Стюарт MJ, McBride MS, Winter LA, Duester G (июнь 1990). «Промоторы генов алкогольдегидрогеназы человека ADH1, ADH2 и ADH3: взаимодействие CCAAT / энхансер-связывающего белка с элементами, фланкирующими ADH2 TATA-бокс». Джин . 90 (2): 271–9. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (90) 90190-3 . PMID  2169444 .
  • Винтер Л.А., Стюарт М.Дж., Шин М.Л., Донг Й., Поллингер Л., Окрет С., Густафссон Дж. А., Дестер Г. (июль 1990 г.). «Элемент гормонального ответа, расположенный выше гена алкогольдегидрогеназы ADH2 человека, состоит из трех тандемных сайтов связывания рецепторов глюкокортикоидов». Джин . 91 (2): 233–40. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (90) 90093-7 . PMID  2210383 .
  • Карр Л.Г., Эденберг Г.Дж. (январь 1990 г.). «цис-действующие последовательности, участвующие в связывании белков и транскрипции in vitro гена алкогольдегидрогеназы человека ADH2». Журнал биологической химии . 265 (3): 1658–64. PMID  2295648 .
  • Ясунами М., Кикучи И., Сарапата Д., Ёсида А. (июнь 1990 г.). «Кластер генов алкогольдегидрогеназы класса I человека: три гена тандемно организованы в сегменте генома длиной 80 т.п.н.». Геномика . 7 (2): 152–8. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (90) 90535-3 . PMID  2347582 .
  • Херли Т.Д., Эденберг Х.Дж., Босрон ВФ (сентябрь 1990 г.) «Экспрессия и кинетическая характеристика вариантов бета 1 бета 1 алкогольдегидрогеназы человека, содержащих замены в аминокислоте 47». Журнал биологической химии . 265 (27): 16366–72. PMID  2398055 .
  • Карр Л.Г., Сюй Й., Хо У.Х., Эденберг Х.Д. (август 1989 г.). «Нуклеотидная последовательность гена ADH2 (3), кодирующего субъединицу бета 3 алкогольдегидрогеназы человека». Алкоголизм, клинические и экспериментальные исследования . 13 (4): 594–6. DOI : 10.1111 / j.1530-0277.1989.tb00383.x . PMID  2679216 .
  • Цукахара М., Ёсида А. (февраль 1989 г.). «Хромосомное присвоение кластерного локуса алкогольдегидрогеназы хромосоме 4q21-23 человека путем гибридизации in situ». Геномика . 4 (2): 218–20. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (89) 90304-2 . PMID  2737681 .
  • Дестер Г., Смит М., Биланчон В., Хэтфилд Г. В. (февраль 1986 г.). «Молекулярный анализ семейства генов алкогольдегидрогеназы класса I человека и нуклеотидной последовательности гена, кодирующего бета-субъединицу». Журнал биологической химии . 261 (5): 2027–33. PMID  2935533 .
  • Икута Т., Сзето С., Йошида А. (февраль 1986 г.). «Три субъединицы алкогольдегидрогеназы человека: структура кДНК, молекулярная и эволюционная дивергенция» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 83 (3): 634–8. DOI : 10.1073 / pnas.83.3.634 . PMC  322918 . PMID  2935875 .
  • Икута Т., Фудзиёси Т., Курачи К., Ёсида А. (май 1985 г.). «Молекулярное клонирование полноразмерной кДНК алкогольдегидрогеназы человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 82 (9): 2703–7. DOI : 10.1073 / pnas.82.9.2703 . PMC  397633 . PMID  2986130 .
  • Hedén LO, Höög JO, Larsson K, Lake M, Lagerholm E, Holmgren A, Vallee BL, Jörnvall H, von Bahr-Lindström H (январь 1986). «Клоны кДНК, кодирующие бета-субъединицу алкогольдегидрогеназы печени человека, имеют 3'-некодирующие области разного размера» . Письма FEBS . 194 (2): 327–32. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (86) 80111-9 . PMID  3000832 . S2CID  39171264 .
  • Сюй Ю.Л., Карр Л.Г., Босрон В.Ф., Ли Т.К., Эденберг Х.Дж. (апрель 1988 г.). «Генотипирование алкогольдегидрогеназ человека в локусах ADH2 и ADH3 после амплификации последовательности ДНК». Геномика . 2 (3): 209–14. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (88) 90004-3 . PMID  3397059 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Расположение генома человека ADH1B и страница сведений о гене ADH1B в браузере генома UCSC .