Ада регулон

При репарации ДНК регулон Ада представляет собой набор генов , экспрессия которых необходима для адаптивного ответа (также известного как «реакция Ада», отсюда и название), который запускается в прокариотических клетках при воздействии сублетальных доз алкилирующих агентов . Это позволяет клеткам переносить воздействие таких агентов, которые в противном случае являются токсичными и мутагенными.

Ответ Ada включает экспрессию четырех генов: ada, alkA, alkB и aidB . Продукт гена ada , белок Ada, является активатором транскрипции всех четырех генов. Основания ДНК, поврежденные алкилированием, удаляются с помощью различных стратегий.

Алкилирующие агенты из группы мутагенов и канцерогенов, модифицирующие ДНК путем алкилирования . Повреждения алкильных оснований могут останавливать репликацию, прерывать транскрипцию или сигнализировать об активации контрольных точек клеточного цикла или апоптоза . У млекопитающих они могут быть вовлечены в канцерогенез , нейродегенеративные заболевания и старение. Алкилирующие агенты могут вводить метильные или этильные группы на все доступные атомы азота и кислорода в основаниях ДНК, вызывая ряд повреждений.

Большинство данных указывает на то, что среди 11 идентифицированных основных модификаций две, 3-метиладенин (3meA) и O 6 -метилгуанин (O 6 -meG), в основном ответственны за биологические эффекты алкилирующих агентов. [1]

Белок Ada состоит из двух основных доменов, С-концевого домена и N-концевого домена, связанных шарнирной областью, восприимчивой к протеолитическому расщеплению. Эти домены могут функционировать независимо. AdaCTD переносит метиловые аддукты от O 6 -meG и O 4 -meG на свой остаток Cys-321, тогда как AdaNTD деметилирует метил-фосфотриэфиры путем переноса метила на свой остаток Cys-38. [2] [3] [4]

Ген alkA кодирует гликозилазу , которая восстанавливает различные повреждения, включая N-7-метилгуанин, N-3-метилпурины и O 2 -метилпиримидины . [2] Белок AlkA удаляет поврежденное основание из сахаро-фосфатного остова, расщепляя гликозильную связь, соединяющую основание с сахаром, образуя абазовый участок. Дальнейшая обработка абазового сайта АР-эндонуклеазами, полимеразой I и лигазой завершает репарацию. [5]

Ада Регуляторная сеть