Akkermansia glycanphila представляет собой разновидность бактерий, разлагающих кишечный муцин . Впервые он был выделен из фекалий сетчатого питона ( Malayopython reticulatus ) в 2016 году. [1]
Род был назван в честь Антуна Д.Л. Аккерманса (1940–2006), голландского микробиолога, получившего признание за его вклад в микробную экологию, и эпитета из новой латыни и греческого языка, означающего «любящий гликаны». [2]
A. glycaniphila , как и A. muciniphila , является грамотрицательной , строго анаэробной , неподвижной , не образующей спор бактерией овальной формы. Тип штамма - Pyt T (= DSM100705 T = CIP 110913 T ). A. glycaniphila может использовать муцин в качестве единственного источника углерода и азота. Его можно культивировать в тех же условиях, что и A. muciniphilia., (анаэробные условия на среде, содержащей желудочный муцин). При выращивании на мягкой агаризованной муциновой среде появляются колонии белого цвета диаметром 0,7 мм. Длинная ось одиночных клеток составляет 0,6–1,0 мкм. Клетки покрыты нитями, встречаются поодиночке, парами, короткими цепочками и агрегатами. [1]
Бактериальный геном A. glucaniphila Pyt T кодируется на одной хромосоме длиной 3 074 121 п.н. Содержание G+C составляет 57,6% и содержит 2532 кодирующих участка , все 21 ген тРНК и три полных оперона рРНК . Для 72% (1811) кодирующих последовательностей можно было предсказать функцию. Анализ генома выявил наличие многих ферментов, разлагающих муцин, некоторые из которых, по прогнозам, секретируются: 54 гликозидгидролазы , одна гликозилгидролаза , семь сиалидаз и три сульфатазы . Предполагается, что геном Pyt T кодируетцитохром bd убихинолоксидаза , что указывает на возможность аэробного дыхания . [3]
Эта бактерия, вероятно, населяет кислородно -аноксическую поверхность муцинового слоя кишечника. [3] Это было продемонстрировано для A. muciniphila Muc T. [4] Секвенирование ампликона гена 16s рРНК показывает, что представители рода Akkermansia были обнаружены у животных с разнообразной анатомией желудочно-кишечного тракта (передняя кишка, задняя кишка или простая) и в рационе (от травоядных до всеядных и плотоядных). Он был обнаружен у млекопитающих, как диких, так и одомашненных, а также у немлекопитающих, таких как птицы, рыбы и рептилии, такие как бирманский питон. [5] Типы муцина и экспрессируемые типы гликанов различаются между этими организмами, но слизь является постоянным признаком их кишечного тракта/ [6]Возможно, микробы, колонизирующие слизь, играют роль в защите хозяина от кишечных патогенов и способствуют восстановлению микробиоты. [7] Был секвенирован полный геном A. glycaniphilia . [3]