Элис Баркан - американский молекулярный биолог и профессор биологии Орегонского университета . Она известна своей работой по регуляции генов хлоропластов и синтезу белков.
Алиса Баркан | |
---|---|
Альма-матер | Массачусетский технологический институт (BS), Висконсинский университет (доктор философии) |
Известен | генетические механизмы в хлоропласте |
Награды | Член Американской ассоциации развития науки (2017 г.), член Национальной академии наук (2020 г.) |
Научная карьера | |
Поля | Молекулярная биология |
Учреждения | Орегонский университет |
Докторант | Джанет Э. Мертц [1] |
Образование
Алиса Баркан получила степень бакалавра из Массачусетского технологического института .
В 1983 году защитила кандидатскую диссертацию. из Университета Висконсина под руководством Джанет Э. Мерц , с диссертацией «Характеристика обезьяньего вируса 40 поздних мутантов региона-лидера». [2] [3] [4]
Карьера и награды
Баркан поступила в Орегонский университет в 1991 году, где в настоящее время является профессором Института молекулярной биологии. [5]
В 2017 году Баркан был назван членом Американской ассоциации развития науки [6].
В 2018 году Баркан получил премию Лоуренса Богорада за выдающиеся достижения в исследованиях биологии растений от Американского общества биологов растений .
Баркан был удостоен награды за выдающиеся успехи преподавательского состава Университета Орегона за 2018-19 гг. [7]
Баркан был избран членом Национальной академии наук в 2020 году. [8] Избрание в Национальную академию является одной из высших наград в научной области. [9] [ циркулярная ссылка ]
Университет Орегона (UO) наградил Баркан Премией за выдающуюся карьеру в 2020 году, чтобы отметить не только ее научные достижения, но и ее карьерный вклад в преподавание, наставничество и лидерство в UO. [10]
Исследовать
Исследования Баркана сосредоточены на том, как белки, кодируемые ядром, влияют на экспрессию генов хлоропластов . [11] [12] [13] В экспериментах, проведенных в ее лаборатории, используются мутанты, в основном кукурузы ( Zea mays ), но также Arabidopsis thaliana , для исследования трансляции и стабильности мРНК хлоропластов , а также многих аспектов созревания РНК, включая сплайсинг и редактирование . [14] [15] [16] Баркан и ее коллеги открыли и изучили десятки ядерных генов растений, которые кодируют белки, связывающие РНК хлоропластов, которые напрямую влияют на многие аспекты метаболизма РНК (процессинг, сплайсинг, трансляция, стабильность). [17] Большинство кодируемых ядром белков, охарактеризованных Барканом, содержат пентатрикопептидные повторы (PPR). [18] Баркан также открыл и назвал домен CRM ( сплайсинг РНК хлоропластов и созревание рибосом ), который обнаружен в кодируемых ядром белках, необходимых для сплайсинга РНК хлоропластов. [19] [20] В 2019 году Баркан и его коллеги успешно сконструировали белки PPR, которые связывают определенные последовательности РНК in vivo, тем самым создав систему для создания целевых взаимодействий белок-РНК . [21] [22]
Личная жизнь
Баркан является одним из основателей музыкальной группы Byrdsong Renaissance Consort, с которой она играет на скрипке и блокфлейте. [23]
Рекомендации
- ^ "Биографические данные Джанет Мерц, 1984" . Репозиторий архивов CSHL . Проверено 24 мая 2019 .
- ^ «Алиса Баркан» . Университет Орегона - Институт молекулярной биологии . Проверено 24 мая 2019 .
- ^ "Диссертация Алисы Баркан" . Библиотеки Университета Висконсина . Проверено 17 июля 2019 .
- ^ "Биографические данные Джанет Мерц, 1984 год" . Репозиторий архивов CSHL . Проверено 24 мая 2019 .
- ^ «Алиса Баркан» . molbio.uoregon.edu . Проверено 14 июня 2020 .
- ^ «Шесть преподавателей UO названы стипендиатами AAAS» . Университет Орегона . Проверено 24 мая 2019 .
- ^ «Провост объявляет лауреатов награды за выдающиеся достижения» . Вокруг O . Университет Орегона . Проверено 29 декабря 2020 года .
- ^ «Выборы в НАН Беларуси-2020» . www.nasonline.org . Проверено 2 мая 2020 .
- ^ «Национальная академия наук» . Википедия . Проверено 29 декабря 2020 года .
- ^ «Пять преподавателей получают награды за выдающиеся исследования» . Вокруг O . Университет Орегона . Проверено 29 декабря 2020 года .
- ^ Баркан, Алиса; Маленький, Ян (2014-04-29). «Пентатрикопептидные повторяющиеся белки в растениях» . Ежегодный обзор биологии растений . 65 (1): 415–442. DOI : 10,1146 / annurev-arplant-050213-040159 . ISSN 1543-5008 . PMID 24471833 .
- ^ Уоткинс, Кеннет П .; Уильямс-Кэрриер, Розалинда; Чотевутмонтри, Пракитчай; Фризо, Джулия; Тойбнер, Марлен; Белчер, Сьюзен; Руве, Ханнес; Шмитц-Линневебер, Кристиан; Вейк, Клаас Й. ван; Баркан, Алиса (2020). «Изучение протеома, связанного с мРНК, кодирующей белок реакционного центра D1 Фотосистемы II в хлоропластах растений» . Заводской журнал . 102 (2): 369–382. DOI : 10.1111 / tpj.14629 . ISSN 1365-313X . PMID 31793101 .
- ^ Чотевутмонтри, Пракитчай; Баркан, Алиса (2016-07-14). Уоллман, Фрэнсис-Андре (ред.). «Динамика трансляции хлоропластов при дифференцировке хлоропластов кукурузы» . PLOS Genetics . 12 (7): e1006106. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1006106 . ISSN 1553-7404 . PMC 4945096 . PMID 27414025 .
- ^ Баркан, А. (1988-09-01). «Каждый из белков, кодируемых сложной единицей транскрипции хлоропластов, транслируется как с моноцистронных, так и с полицистронных мРНК» . Журнал EMBO . 7 (9): 2637–2644. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1988.tb03116.x . ISSN 0261-4189 . PMC 457051 . PMID 2460341 .
- ^ Баркан, А. (1993-04-01). «Ядерные мутанты кукурузы с дефектами в сборке полисома хлоропласта изменили метаболизм РНК хлоропласта» . Растительная клетка . 5 (4): 389–402. DOI : 10.1105 / tpc.5.4.389 . ISSN 1040-4651 . PMC 160279 . PMID 12271069 .
- ^ Jenkins, BD; Кульханек, диджей; Баркан, А. (1997-03-01). «Ядерные мутации, которые блокируют сплайсинг РНК группы II в хлоропластах кукурузы, выявляют несколько классов интронов с различными требованиями к факторам сплайсинга» . Растительная клетка . 9 (3): 283–296. DOI : 10.1105 / tpc.9.3.283 . ISSN 1040-4651 . PMC 156918 . PMID 9090875 .
- ^ Баркан, Алиса; Гольдшмидт-Клермон, Мишель (07.06.2000). «Участие ядерных генов в экспрессии генов хлоропластов» . Биохимия . 82 (6): 559–572. DOI : 10.1016 / S0300-9084 (00) 00602-7 . ISSN 0300-9084 . PMID 10946107 .
- ^ Баркан, Алиса; Маленький, Ян (2014-04-29). «Пентатрикопептидные повторяющиеся белки в растениях» . Ежегодный обзор биологии растений . 65 (1): 415–442. DOI : 10,1146 / annurev-arplant-050213-040159 . ISSN 1543-5008 . PMID 24471833 .
- ^ Остхаймер, GJ (1 августа 2003 г.). «Факторы сплайсинга интронов группы II, полученные путем диверсификации древнего РНК-связывающего домена» . Журнал EMBO . 22 (15): 3919–3929. DOI : 10,1093 / emboj / cdg372 . ISSN 1460-2075 . PMC 169045 . PMID 12881426 .
- ^ де Лонжевиаль, Андеол Фалькон; Small, Ian D .; Лурин, Клэр (2010). «Ядерно кодируемые факторы сплайсинга, участвующие в сплайсинге РНК в органеллах высших растений» . Молекулярный завод . 3 (4): 691–705. DOI : 10.1093 / MP / ssq025 . PMID 20603383 .
- ^ Макдермотт, Джеймс Дж .; Уоткинс, Кеннет П .; Уильямс-Кэрриер, Розалинда; Баркан, Алиса (2019-08-01). «Захват рибонуклеопротеина посредством экспрессии in vivo конструируемого белка-повтора пентатрикопептида в Arabidopsis» . Растительная клетка . 31 (8): 1723–1733. DOI : 10.1105 / tpc.19.00177 . ISSN 1040-4651 . PMC 6713294 . PMID 31123048 .
- ^ Рохас, Маргарита; Юй Циго; Уильямс-Кэрриер, Розалинда; Малига, Пал; Баркан, Алиса (2019). «Сконструированные белки PPR как индуцибельные переключатели для активации экспрессии трансгенов хлоропластов» . Природа Растения . 5 (5): 505–511. DOI : 10.1038 / s41477-019-0412-1 . ISSN 2055-0278 . PMID 31036912 . S2CID 139103684 .
- ^ "Консорт Возрождения Byrdsong" . byrdsongconsort.com . Проверено 14 июня 2020 .
Внешние ссылки
- Публикации Алисы Баркан, проиндексированные Google Scholar
- Профиль Института молекулярной биологии Орегонского университета