Альтернативный митохондриальный код плоских червей (таблица перевода 14) - это генетический код, обнаруженный в митохондриях Platyhelminthes и Nematodes .
Код
AAs = FFLLSSSSYYY*CCWWLLLLPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNNKSSSSVVVVAAAADDEEGGGG
Starts = -----------------------------------M----------------------------
Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGG
Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG
Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG
Основания: аденин (A), цитозин (C), гуанин (G) и тимин (T) или урацил (U).
Аминокислоты: аланин (Ala, A), аргинин (Arg, R), аспарагин (Asn, N), аспарагиновая кислота (Asp, D), цистеин (Cys, C), глутаминовая кислота (Glu, E), глутамин (Gln , Q), глицин (Gly, G), гистидин (His, H), изолейцин (Ile, I), лейцин (Leu, L), лизин (Lys, K), метионин (Met, M), фенилаланин (Phe, F), пролин (Pro, P), серин (Ser, S), треонин (Thr, T), триптофан (Trp, W), тирозин (Tyr, Y), валин (Val, V)
Отличия от стандартного кода
Кодоны ДНК | Кодоны РНК | Этот код (14) | Стандартный код (1) | |
---|---|---|---|---|
AAA | AAA | Asn (N) | Лис (К) | |
AGA | AGA | Сер (S) | Арг (R) | |
AGG | AGG | Сер (S) | Арг (R) | |
TAA | UAA | Тюр (Y) | СТОП = Тер (*) | |
TGA | UGA | Trp (Вт) | СТОП = Тер (*) |
Систематический диапазон и комментарии
- Platyhelminthes (плоские черви) и Nematoda (круглые черви).
Код 14 отличается от кода 9 ( митохондриальный код иглокожих и плоских червей ) только переводом UAA в Tyr, а не STOP. Исследование 2000 г. [1] не нашло доказательств того, что кодон UAA кодирует Tyr у плоских червей, но существуют другие мнения. Очень мало записей GenBank , которые переводятся с кодом 14, но тестовый перевод показывает, что повторный перевод этих записей с кодом 9 может вызвать преждевременное завершение работы. Совсем недавно было обнаружено, что UAA кодирует тирозин у нематод Radopholus similis [2] и Radopholus arabocoffeae . [3]
Смотрите также
Рекомендации
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии . [4]
- ^ Телфорд MJ, Herniou Е.А., Рассел Б., Литтлвуд DT (октябрь 2000). «Изменения митохондриальных генетических кодов как филогенетических признаков: два примера от плоских червей» . Труды Национальной академии наук США . 10. 97 (21): 11359–64. Bibcode : 2000PNAS ... 9711359T . DOI : 10.1073 / pnas.97.21.11359 . PMC 17205 . PMID 11027335 .
- ^ Иоахим Э.М. Якоб; Бартель Ванхольм; Томас Ван Левен и Годелиев Гейзен (2009). «Уникальное изменение генетического кода в митохондриальном геноме паразитической нематоды Radopholus similis » . BMC Res Notes . 2 : 192. DOI : 10,1186 / 1756-0500-2-192 . PMC 2761399 . PMID 19778425 .
- ^ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?name=Radopholus+arabocoffeae
- ^ Эльзановский А., Остелл Дж, Лейпе Д., Сусов В. "Генетические коды" . Браузер таксономии . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), Национальная медицинская библиотека США . Проверено 1 июля +2016 .