Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Archaeplastida
Река Спраг (живописные изображения округа Кламат, штат Орегон) (klaDA0073) .jpg
Деревья, травы и водоросли в районе реки Спраг, штат Орегон
Научная классификация е
Домен:Эукариоты
(без рейтинга):Потогонные
(без рейтинга):Archaeplastida
Adl et al. , 2005 [1]
Подгруппы
Синонимы

Архепластиды (или королевство Plantae зепзи Лата ) являются основной группой эукариота , содержащая красные водоросли (Rhodophyta) на, зеленые водоросли , и наземные растения , а также некоторые меньшие группы , такая , как глаукофитовые водоросли . [4] Все линии Archaeplastida стали фотоавтотрофными , за исключением линии Rhodelphidia , сестры Rhodophyta, которая до сих пор остается нефотосинтетической хищной (эукариотрофной) жгутиконосой. У Archaeplastida есть хлоропласты.которые окружены двумя мембранами, что позволяет предположить, что они были приобретены непосредственно в результате единичного эндосимбиоза , питаясь цианобактериями . [5] Все другие группы, которые имеют хлоропласты, помимо амебоидной Paulinella chromatophora , имеют хлоропласты, окруженные тремя или четырьмя мембранами, что позволяет предположить, что они были вторично получены из красных или зеленых водорослей. В отличие от красных и зеленых водорослей, глаукофиты никогда не участвовали во вторичных эндосимбиозах. [6]

Клетки Archaeplastida обычно лишены центриолей и имеют митохондрии с плоскими кристами . У них обычно есть клеточная стенка , содержащая целлюлозу , а пища хранится в виде крахмала . Однако эти характеристики присущи и другим эукариотам. Основное свидетельство того, что Archaeplastida образуют монофилетическую группу, исходит из генетических исследований, которые показывают, что их пластиды, вероятно, имели единственное происхождение. Это свидетельство оспаривается. [7] [8] На основании имеющихся на сегодняшний день данных невозможно подтвердить или опровергнуть альтернативные сценарии эволюции единственномупервичный эндосимбиоз . [9] Фотосинтезирующие организмы с пластидами различного происхождения (например, бурые водоросли ) не относятся к Archaeplastida.

Archaeplastidans делятся на две основные эволюционные линии. Красные водоросли пигментированы хлорофиллом а и фикобилипротеинами , как и большинство цианобактерий, и накапливают крахмал вне хлоропластов. Зеленые водоросли и наземные растения - вместе известные как Viridiplantae (лат. «Зеленые растения») или Chloroplastida - пигментированы хлорофиллами a и b , но не имеют фикобилипротеинов, а крахмал накапливается внутри хлоропластов. [10] Глаукофиты имеют типичные цианобактериальные пигменты и необычно удерживают клеточную стенку в своих пластидах (называемых цианеллами). [1]

Не следует путать Archaeplastida с более старым и устаревшим названием Archiplastideae, которое относится к цианобактериям и другим группам бактерий. [11] [12]

Таксономия [ править ]

Смотрите также: эукариот § Филогения

Консенсус в 2005 г., когда группа, состоящая из глаукофитов, красных и зеленых водорослей и наземных растений, была названа «Archaeplastida» [1], заключалась в том, что это клады , то есть монофилетические . Многие исследования, опубликованные с тех пор, подтвердили согласие. [13] [14] [15] [16] Однако другие исследования показали, что группа парафилетична . [17] [18] [19] [8] На сегодняшний день ситуация кажется нерешенной, но в недавнем исследовании (с обогащением генов красных водорослей) был продемонстрирован сильный сигнал для монофилии Plantae (Archaeplastida). [20] Сделанное здесь предположение состоит в том, что Archaeplastida является действительной кладой.

Группе были даны разные названия. Некоторые авторы просто называют эту группу растениями или Plantae. [21] [22] Однако название Plantae неоднозначно, поскольку оно также применялось к менее инклюзивным кладам , таким как Viridiplantae и эмбриофиты . Чтобы различить, большую группу иногда называют Plantae sensu lato («растения в широком смысле»).

Чтобы избежать двусмысленности, были предложены другие названия. Primoplantae, появившаяся в 2004 г., кажется, является первым новым названием, предложенным для этой группы. [3] Другое название, применяемое к этому узлу - Plastida, определяемое как клад, разделяющий «пластиды первичного (прямого прокариотного) происхождения [как] в Magnolia virginiana Linnaeus 1753». [23]

Хотя многие исследования предполагают, что Archaeplastida образуют монофилетическую группу, [24] в статье 2009 года утверждается, что они на самом деле являются парафилетическими . [19] Обогащение новых генов красных водорослей в недавнем исследовании демонстрирует сильный сигнал для монофилии Plantae (Archaeplastida) и столь же сильный сигнал об истории обмена генами между красными / зелеными водорослями и другими линиями. [20] Это исследование дает представление о том, насколько обширные данные о мезофильных генах красных водорослей имеют решающее значение для тестирования спорных вопросов эволюции эукариот и для понимания сложных паттернов наследования генов у простейших.

Название Archaeplastida было предложено в 2005 году большой международной группой авторов (Адл и др. ), Которые стремились создать классификацию эукариот, которая учитывала бы морфологию, биохимию и филогенетику и которая имела «некоторую стабильность в ближайшем будущем». срок." Они отказались от использования формальных таксономических рангов в пользу иерархического расположения, при котором названия клад не означают ранг. Таким образом, название типа «Glaucophyta» и название класса «Rhodophyceae» появляются на одном уровне в их классификации. Подразделения, предлагаемые для Archaeplastida, показаны ниже как в табличной, так и в схематической форме . [1]

Архепластида :

Глаукофитовые водоросли Glaucocystis
  • Glaucophyta Skuja, 1954 (Glaucocystophyta Kies & Kremer, 1986 ) - глаукофиты
  • Глаукофиты - это небольшая группа пресноводных одноклеточных водорослей. Их хлоропласты, называемые цианеллами , имеют пептидогликановый слой, что делает их более похожими на цианобактерии, чем на хлоропласты остальных архепластид.
Rhodophyte Laurencia
  • Rhodophyceae Thuret, 1855, исправ. Rabenhorst, 1863, исправление. Adl et al. , 2005 (Rhodophyta Wettstein 1901 ) - красные водоросли
Красные водоросли составляют одну из самых больших групп водорослей. Большинство из них - это водоросли, многоклеточные и морские. Их красный цвет обусловлен фикобилипротеинами , используемыми в качестве дополнительных пигментов при улавливании света для фотосинтеза.
  • Chloroplastida Adl et al. , 2005 (Viridiplantae Cavalier-Smith 1981 ; Chlorobionta Jeffrey 1982, исправлено. Бремер 1985, исправлено. Льюис и МакКорт 2004 ; Chlorobiota Kendrick and Crane 1997 )
Хлоропластида - это термин, выбранный Adl et al. для группы, состоящей из зеленых водорослей и наземных растений (эмбриофитов). За исключением вторичных потерь, все они имеют хлоропласты без пептидогликанового слоя и без фикобилипротеинов.
Chlorophyte Stigeoclonium
  • Chlorophyta Pascher, 1914, исправление. Льюис и МакКорт, 2004 - зеленые водоросли (часть)
  • Adl et al. используйте узкое определение Chlorophyta; другие источники включают Chlorodendrales и Prasinophytae, которые сами по себе могут быть объединены.
  • Ulvophyceae Mattox & Stewart, 1984 г.
  • Trebouxiophyceae Friedl, 1995 (Pleurastrophyceae Mattox et al. 1984 ; Microthamniales Melkonian 1990 )
  • Chlorophyceae Christensen, 1994.
  • Chlorodendrales Fritsch, 1917 - зеленые водоросли (часть)
  • Prasinophytae Cavalier-Smith, 1998, исправлено. Льюис и МакКорт, 2004 - зеленые водоросли (часть)
  • Мезостигма Лаутерборн, 1894 г., исправьте. McCourt в Adl et al. , 2005 (Mesostigmata Turmel, Otis, and Lemieux 2002 )
  • Charophyta Karol et al. , 2001, поправить. Lewis & McCourt, 2004 (Charophyceae Smith 1938, исправил. Mattox and Stewart 1984 ) - зеленые водоросли (часть) и наземные растения
Charophyta sensu lato , как использовали Adl et al. , представляет собой монофилетическую группу, состоящую из некоторых зеленых водорослей, в том числе каменистых (Charophyta sensu stricto ), а также наземных растений (эмбриофитов).
  • Подразделы, отличные от Streptophytina (см. Ниже), не приводятся Adl et al.
Другие источники будут включать зеленые водорослевые группы Chlorokybales , Klebsormidiales , Zygnematales и Coleochaetales . [25]
  • Streptophytina Lewis & McCourt, 2004 - каменные и наземные растения
  • Charales Lindley 1836 (Charophytae Engler, 1887 ) - каменник
  • Plantae Haeckel 1866 (Cormophyta Endlicher, 1836 ; Embryophyta Endlicher, 1836, исправлено. Lewis & McCourt, 2004 ) - наземные растения (эмбриофиты)

Кладограмма [ править ]

Ниже приводится согласованная реконструкция взаимоотношений зеленых водорослей, в основном основанная на молекулярных данных. [26] [27] [28] [29] [30] [31] [32] [33] [34] [35] В то время как Glaucophyta обычно считаются наиболее глубоко укоренившимися Archeaplastida, [36] [37] [38] » [39] некоторые геномные исследования указывают на Rhodophyta как на базальную, возможно, с Cryptista и picozoa, появившимися в Archaeplastida. [40] [41] [42] [43] [44] [45] [46]

Потогонные
Архепластида  + криптиста
 
 

Glaucophyta (сине-зеленые водные растения)

 
Виридипланты /
 
 

Mesostigmatophyceae

 
 
 

Спиротения

 
 

Chlorokybophyceae

 
 
 
 
 

Хлорофита

 
Streptophyta /
 

Klebsormidiophyceae

 
Phragmoplastophyta
 

Charophyceae

 
 
 

Coleochaetophyceae

 
 
 
 

Zygnematophyceae

 
 

Mesotaeniaceae

 
 
 

Эмбриофиты (наземные растения)

 
 
 
 
Charophyta
 
зеленые водоросли
 
 
 

Rhodophyta (красные водоросли / красные водные растения)

 
 

Пикозоа

 
 

Родельфидия (хищная)

 
 
 

Криптиста

 
 (+  Gloeomargarita lithophora ) 
 
 

Гаптиста

 
ЦАРЬ
 

Телонемия

 
SAR
Халвария
 

Страменопилы

 
 

Альвеолаты

 
 
 

Ризария

 
 
 
 
 

Однако вокруг корня Archaeplastida есть много споров, например, являются ли Glaucophyta или Rhodophyta базальными, или, например, Cryptista возникла в пределах Archaeplastida. В 2014 году был опубликован подробный обзор этих несоответствий. [47] Положение Telonemia и Picozoa неясно. Также Хакробия (Haptista + Cryptista) может быть полностью связана с кладой SAR. SAR часто рассматриваются как гибриды эукариот-эукариот, что вносит путаницу в генетический анализ. Сестра литофоры Gloeomargarita была поглощена предком Archaeplastida, что привело к пластидам.которые живут в постоянном эндосимбиозе в большинстве потомков. Поскольку и Gloeomargarita, и родственные цианобактерии, в дополнение к наиболее примитивным архепластидам, все живут в пресной воде, кажется, что Archaeplastida возникла в пресной воде и колонизировала океаны только в конце протерозоя. [48] [49]

Морфология [ править ]

У всех archaeplastidans есть пластиды (хлоропласты), которые осуществляют фотосинтез и, как полагают, происходят от эндосимбиотических цианобактерий. У глаукофитов, возможно, самых примитивных членов группы, хлоропласт называется цианеллой и имеет несколько общих черт с цианобактериями, включая клеточную стенку пептидогликана, которые не сохраняются у других членов группы. Сходство цианелл с цианобактериями поддерживает эндосимбиотическую теорию .

Клетки большинства archaeplastidans имеют стенки, обычно, но не всегда, из целлюлозы.

Archaeplastida широко различаются по степени своей клеточной организации: от изолированных клеток до нитей, колоний и многоклеточных организмов. Самые ранние были одноклеточными, и многие группы остаются таковыми сегодня. Многоклеточность развивалась отдельно в нескольких группах, включая красные водоросли, ульвофитные зеленые водоросли и зеленые водоросли, давшие начало каменистым и наземным растениям.

Эндосимбиоз [ править ]

Основная статья: Эндосимбиотическая теория

Поскольку предполагается, что предковый архепластидан приобрел свои хлоропласты непосредственно в результате поглощения цианобактерий, это событие известно как первичный эндосимбиоз (что отражено в названии, выбранном для группы «Archaeplastida», то есть «древняя пластида»). Один из видов зеленых водорослей, Cymbomonas tetramitiformis в отряде Pyramimonadales , является миксотрофом и способен поддерживать себя как фаготрофией, так и фототрофией . Пока не известно, является ли это примитивным признаком и, следовательно, определяет последнего общего предка Archaeplastida, который мог бы объяснить, как он получил свои хлоропласты, или это признак, восстановленный путем горизонтального переноса генов .[50]

Доказательства первичного эндосимбоза включают наличие двойной мембраны вокруг хлоропластов; одна мембрана принадлежала бактерии, а другая - захватившему ее эукариоту. Со временем многие гены из хлоропласта были перенесены в ядро ​​клетки-хозяина. Присутствие таких генов в ядрах эукариот без хлоропластов предполагает, что этот перенос произошел на ранней стадии эволюции группы. [51]

Другие эукариоты с хлоропластами, похоже, получили их, поглотив одноклеточный архепластидан своими собственными хлоропластами, полученными из бактерий. Поскольку эти события связаны с эндосимбиозом клеток, у которых есть собственные эндосимбионты, этот процесс называется вторичным эндосимбиозом . Хлоропласты таких эукариот обычно окружены более чем двумя мембранами, что отражает историю многократного поглощения. Хлоропласты эвгленид , хлорарахниофитов и небольшой группы динофлагеллят, по- видимому, являются захваченными зелеными водорослями [52], тогда как хлоропласты остальных фотосинтезирующих эукариот, таких как водоросли гетероконта , криптофиты ,гаптофиты и динофлагелляты, по-видимому, являются захваченными красными водорослями.

Летопись окаменелостей [ править ]

Возможно, самые древние останки Archaeplastida - это предполагаемые красные водоросли ( Rafatazmia ) в строматолитах в скалах Индии 1600 млн лет назад. [53] Несколько более поздними являются микрофоссилии группы Ропер в северной Австралии. Структура этих одноклеточных окаменелостей напоминает структуру современных зеленых водорослей. Они датируются мезопротерозойской эрой, примерно 1500–1300 млн лет. [54] Эти окаменелости согласуются с исследованием молекулярных часов, которое подсчитало, что эта клады разошлась примерно на 1500 млн лет. [55] Самая старая окаменелость, которую можно отнести к конкретной современной группе, - это красная водоросль Bangiomorpha., с 1200 млн лет. [56]

В конце неопротерозойской эры ископаемые остатки водорослей стали более многочисленными и разнообразными. В конце концов, в палеозойскую эру растения появились на суше и продолжают процветать до настоящего времени.

Ссылки [ править ]

  1. ^ а б в г Адл, СМ; и другие. (2005). «Новая классификация эукариот более высокого уровня с упором на таксономию протистов» . Журнал эукариотической микробиологии . 52 (5): 399–451. DOI : 10.1111 / j.1550-7408.2005.00053.x . PMID  16248873 . S2CID  8060916 .
  2. Перейти ↑ Cavalier-Smith, T. (1981). "Эукариот королевства: семь или девять? " . » Biosystems . 14 (3-4): 461-481. DOI : 10.1016 / 0303-2647 (81) 90050-2 . PMID 7337818 . 
  3. ^ a b Палмер, Джеффри Д .; Солтис, Дуглас Э .; Чейз, Марк В. (2004). «Растение древо жизни: обзор и некоторые точки зрения» . Американский журнал ботаники . 91 (10): 1437–1445. DOI : 10,3732 / ajb.91.10.1437 . PMID 21652302 . 
  4. ^ Ball, S .; Коллеони, К. (январь 2011 г.). Cenci, U .; Raj, JN; Tirtiaux, C. «Эволюция метаболизма гликогена и крахмала у эукариот дает молекулярные ключи к пониманию установления пластидного эндосимбиоза» . Журнал экспериментальной ботаники . 62 (6): 1775–1801. DOI : 10.1093 / JXB / erq411 . PMID 21220783 . 
  5. ^ Институт биологии внутренних вод им. Папанина РАН; Тихоненков, Денис В. (2020). «Хищные жгутиконосцы - недавно обнаруженные новые глубокие ветви эукариотического дерева и их эволюционное и экологическое значение» (PDF) . Протистология . 14 (1). DOI : 10.21685 / 1680-0826-2020-14-1-2 .
  6. ^ Справочник морских микроводорослей: достижения в области биотехнологии
  7. ^ Парфри. LW; Barbero, E .; Лассер, Э; и другие. (Декабрь 2006 г.). «Оценка поддержки текущей классификации эукариотического разнообразия» . PLOS Genetics . 2 (12): e220. DOI : 10.1371 / journal.pgen.0020220 . PMC 1713255 . PMID 17194223 .  
  8. ^ а б Ким, E; Грэм, LE (июль 2008 г.). Редфилд, Розмари Жанна (ред.). «Анализ EEF2 бросает вызов монофилии Archaeplastida и Chromalveolata» . PLOS ONE . 3 (7): e2621. Bibcode : 2008PLoSO ... 3,2621K . DOI : 10.1371 / journal.pone.0002621 . PMC 2440802 . PMID 18612431 .  
  9. ^ Mackiewicz, P .; Гагат П. (2014). «Монофилия супергруппы Archaeplastida и отношения между ее линиями в свете филогенетических и филогеномных исследований. Близки ли мы к консенсусу?» . Acta Societatis Botanicorum Poloniae . 83 (4): 263–280. DOI : 10,5586 / asbp.2014.044 .
  10. ^ Альт, R .; Nyvall, P .; Педерсен, М. (2001). «Уникальные особенности обмена крахмала в красных водорослях» . Труды Королевского общества B: биологические науки . 268 (1474): 1417–1422. DOI : 10.1098 / rspb.2001.1644 . PMC 1088757 . PMID 11429143 .  
  11. Перейти ↑ Copeland, HF (1956). Классификация низших организмов . Пало-Альто: Pacific Books, стр. 29, [1] .
  12. ^ Бесси, CE (1907). "Краткое описание типа растений" . Univ. Небраска Исследования . 7 : 275–358.
  13. ^ Бурки, Фабьен; Камран Шалчян-Тебризи; Марианна Минге; Осмунд Скьевеланд; Сергей Иванович Николаев; Кжетил С. Якобсен; Ян Павловский (2007). Батлер, Джеральдин (ред.). «Филогеномика меняет эукариотические супергруппы» . PLOS ONE . 2 (8): e790. Bibcode : 2007PLoSO ... 2..790B . DOI : 10.1371 / journal.pone.0000790 . PMC 1949 142 . PMID 17726520 .  
  14. ^ Burki, F .; Inagaki, Y .; Brate, J .; Арчибальд, Дж. М.; Килинг, П.Дж.; Кавальер-Смит, Т .; и другие. (2009). «Крупномасштабные филогеномные анализы показывают, что две загадочные протистские линии, Telonemia и Centroheliozoa, связаны с фотосинтетическими хромальвеолатами» . Геномная биология и эволюция . 1 : 231–238. DOI : 10.1093 / GbE / evp022 . PMC 2817417 . PMID 20333193 .  
  15. Перейти ↑ Cavalier-Smith, Thomas (2009). «Царства Protozoa и Chromista и эозойный корень эукариотического дерева» . Письма биологии . 6 (3): 342–345. DOI : 10.1098 / rsbl.2009.0948 . PMC 2880060 . PMID 20031978 .  
  16. ^ Рогозин, И.Б .; Басу, МК; Чюрош, М. и Кунин, Э.В. (2009). «Анализ редких геномных изменений не поддерживает филогению Униконт-Биконт и предполагает, что цианобактериальный симбиоз является точкой первичного облучения эукариот» . Геномная биология и эволюция . 1 : 99–113. DOI : 10.1093 / GbE / evp011 . PMC 2817406 . PMID 20333181 .  
  17. ^ Baldauf, SL, Roger, AJ, Wenk-Siefert, I., Doolittle, WF 2000. Филогения эукариот на уровне царства, основанная на комбинированных данных о белках. Наука 290: 972-977 (researchgate.net)
  18. ^ Липскомб, Диана. 1991. Широкая классификация: царства и простейшие. В: Parasitic Protozoa, Vol. 1, 2-е изд., JP Kreier, JR Baker (ред.), Стр. 81-136. Academic Press, Сан-Диего.
  19. ^ a b Нодзаки, H .; Maruyama, S .; Matsuzaki, M .; Nakada, T .; Kato, S .; Мисава, К. (декабрь 2009 г.). «Филогенетическое положение Glaucophyta, зеленых растений (Archaeplastida) и Haptophyta (Chromalveolata) по данным медленно развивающихся ядерных генов». Молекулярная филогенетика и эволюция . 53 (3): 872–80. DOI : 10.1016 / j.ympev.2009.08.015 . PMID 19698794 . 
  20. ^ a b Chan, CX; Ян, ЕС; Banerjee, T .; Юн, HS; Martone, PT; Эстевес, JM; Бхаттачарья, Д. (2011). «Монофилия красных и зеленых водорослей и обширное совместное использование генов, обнаруженное в богатом репертуаре генов красных водорослей». Текущая биология . 21 (4): 328–333. DOI : 10.1016 / j.cub.2011.01.037 . PMID 21315598 . S2CID 7162977 .  
  21. ↑ Т. Кавальер-Смит (1981). «Царства эукариотов: семь или девять?». Биосистемы . 14 (3–4): 461–481. DOI : 10.1016 / 0303-2647 (81) 90050-2 . PMID 7337818 . 
  22. ^ Бхаттачарья, Дебашиш; Юн, Хван Су; Хакетт, Иеремия (2003). «Фотосинтезирующие эукариоты объединяются: эндосимбиоз соединяет точки». BioEssays . 26 (1): 50–60. DOI : 10.1002 / bies.10376 . PMID 14696040 . 
  23. ^ Симпсон, AGB (2004). «Таксоны высшего уровня в эукариотах». Первое международное совещание по филогенетической номенклатуре. Париж, 6–9 июля .
  24. ^ Виноградов С.Н.; Fernández, I .; Hoogewijs, D .; Арредондо-Питер Р. (октябрь 2010 г.). «Филогенетические отношения 3/3 и 2/2 гемоглобинов в геномах Archaeplastida к бактериальным и другим гемоглобинам эукариот» . Молекулярный завод . 4 (1): 42–58. DOI : 10.1093 / MP / ssq040 . PMID 20952597 . Архивировано из оригинала на 2012-12-09 . Проверено 8 января 2011 . 
  25. ^ Turmel, M .; Otis, C .; Лемье, К. (2005). «Полные последовательности хлоропласт ДНК по харовым водорослям зеленых водорослей Staurastrum и Zygnema показывают , что хлоропласт геном претерпел значительные изменения в ходе эволюции Zygnematales» . BMC Biology . 3 : 22. DOI : 10.1186 / 1741-7007-3-22 . PMC 1277820 . PMID 16236178 .  
  26. ^ Лелиаерт, Фредерик; Смит, Дэвид Р .; Моро, Эрве; Херрон, Мэтью Д.; Verbruggen, Heroen; Delwiche, Charles F .; Де Клерк, Оливье (2012). «Филогения и молекулярная эволюция зеленых водорослей» (PDF) . Критические обзоры в науках о растениях . 31 : 1–46. DOI : 10.1080 / 07352689.2011.615705 . S2CID 17603352 .  
  27. ^ Марин, Биргер (2012). «Вложенные в хлореллы или независимый класс? Филогения и классификация Pedinophyceae (Viridiplantae), выявленная молекулярным филогенетическим анализом полных ядерных и кодируемых пластидом оперонов рРНК». Протист . 163 (5): 778–805. DOI : 10.1016 / j.protis.2011.11.004 . PMID 22192529 . 
  28. ^ Laurin-Lemay, Саймон; Бринкманн, Хеннер; Филипп, Эрве (2012). «Происхождение наземных растений пересмотрено в свете загрязнения последовательности и отсутствующих данных» . Текущая биология . 22 (15): R593 – R594. DOI : 10.1016 / j.cub.2012.06.013 . PMID 22877776 . 
  29. ^ Лелиаерт, Фредерик; Тронхольм, Ана; Лемье, Клод; Турмель, Моник; DePriest, Michael S .; Бхаттачарья, Дебашиш; Karol, Kenneth G .; Фредерик, Сюзанна; Зехман, Фредерик В. (09.05.2016). «Филогеномный анализ хлоропластов выявил наиболее разветвленную ветвь Chlorophyta, класс Palmophyllophyceae. Nov» . Научные отчеты . 6 : 25367. Bibcode : 2016NatSR ... 625367L . DOI : 10.1038 / srep25367 . ISSN 2045-2322 . PMC 4860620 . PMID 27157793 .   
  30. ^ Кук, Марта E .; Грэм, Линда Э. (2017). Арчибальд, Джон М .; Симпсон, Аластер ГБ; Сламовиц, Клаудио Х. (ред.). Справочник протистов . Издательство Springer International. С. 185–204. DOI : 10.1007 / 978-3-319-28149-0_36 . ISBN 9783319281476.
  31. ^ Льюис, Луиза А .; Ричард М. МакКорт (2004). «Зеленые водоросли и происхождение наземных растений» (аннотация) . Американский журнал ботаники . 91 (10): 1535–1556. DOI : 10,3732 / ajb.91.10.1535 . PMID 21652308 .  
  32. ^ Ruhfel, Brad R .; Gitzendanner, Matthew A .; Soltis, Pamela S .; Солтис, Дуглас Э .; Берли, Дж. Гордон (17 февраля 2014 г.). «От водорослей до покрытосеменных - вывод о филогении зеленых растений (Viridiplantae) на основе 360 геномов пластид» . BMC Evolutionary Biology . 14 : 23. DOI : 10.1186 / 1471-2148-14-23 . ISSN 1471-2148 . PMC 3933183 . PMID 24533922 .   
  33. ^ Адл, Сина М .; Симпсон, Аластер ГБ; Lane, Christopher E .; Лукеш, Юлий; Басс, Дэвид; Bowser, Samuel S .; Браун, Мэтью У .; Бурки, Фабьен; Данторн, Мика (01.09.2012). «Пересмотренная классификация эукариот» . Журнал эукариотической микробиологии . 59 (5): 429–514. DOI : 10.1111 / j.1550-7408.2012.00644.x . ISSN 1550-7408 . PMC 3483872 . PMID 23020233 .   
  34. ^ Лемье, Клод; Отис, Кристиан; Турмель, Моник (12 января 2007 г.). «Клада, объединяющая зеленые водоросли Mesostigma viride и Chlorokybus atmophyticus, представляет собой самую глубокую ветвь Streptophyta в филогении, основанной на хлоропластном геноме» . BMC Biology . 5 : 2. DOI : 10.1186 / 1741-7007-5-2 . ISSN 1741-7007 . PMC 1781420 . PMID 17222354 .   
  35. ^ Умен, Джеймс Г. (2014-11-01). «Зеленые водоросли и истоки многоклеточности в растительном мире» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 6 (11): a016170. DOI : 10.1101 / cshperspect.a016170 . ISSN 1943-0264 . PMC 4413236 . PMID 25324214 .   
  36. ^ Vries, Ян де; Гулд, Свен Б. (01.01.2017). «Монопластидное узкое место в эволюции водорослей и растений» . J Cell Sci . 131 (2): jcs.203414. DOI : 10,1242 / jcs.203414 . ISSN 0021-9533 . PMID 28893840 .  
  37. ^ Понсе-Толедо, Рафаэль I .; Дешам, Филипп; Лопес-Гарсия, Пурификасьон; Живанович, Иван; Бензерара, Карим; Морейра, Дэвид (2017). «Пресноводная цианобактерия с ранним ветвлением в происхождении пластид» . Текущая биология . 27 (3): 386–391. DOI : 10.1016 / j.cub.2016.11.056 . PMC 5650054 . PMID 28132810 .  
  38. ^ Диттами, Саймон М .; Хиш, Свенья; Olsen, Jeanine L .; Коллен, Йонас (2017-08-01). «Переходы между морской и пресноводной средами дают новые подсказки о происхождении многоклеточных растений и водорослей» (PDF) . Журнал психологии . 53 (4): 731–745. DOI : 10.1111 / jpy.12547 . ISSN 1529-8817 . PMID 28509401 . S2CID 43325392 .    
  39. ^ Смит, Дэвид Р. (2018). «Затерянные в свете: эволюция пластидного генома нефотосинтетических водорослей». Эволюция пластидного генома . Успехи ботанических исследований. 85 . С. 29–53. DOI : 10.1016 / bs.abr.2017.10.001 . ISBN 9780128134573.
  40. ^ Бурки, Фабьен; Каплан, Майя; Тихоненков, Денис В .; Златогурский, Василий; Минь, Буй Куанг; Радайкина, Людмила В .; Смирнов, Алексей; Мыльников, Александр П .; Килинг, Патрик Дж. (27 января 2016 г.). «Распутывая раннюю диверсификацию эукариот: филогеномное исследование эволюционного происхождения Centrohelida, Haptophyta и Cryptista» . Proc. R. Soc. B . 283 (1823): 20152802. дои : 10.1098 / rspb.2015.2802 . ISSN 0962-8452 . PMC 4795036 . PMID 26817772 .   
  41. ^ Браун, Мэтью У .; Хейсс, Аарон; Камикава, Риома; Инагаки, Юдзи; Ябуки, Акинори; Тайс, Александр К .; Ширатори, Такаши; Исида, Кен; Хасимото, Тецуо (03.12.2017). «Филогеномика помещает сиротские протистанские линии в новую эукариотическую супергруппу» . Genome Biol Evol . 10 (2): 427–433. DOI : 10.1093 / GbE / evy014 . PMC 5793813 . PMID 29360967 .  
  42. ^ Ли, ДжунМо; Чо, Чон Хён; Парк, Сын Ин; Чой, Джи Вон; Сон, Хён Сок; West, John A .; Бхаттачарья, Дебашиш; Юн, Хван Су (2016-09-02). «Параллельная эволюция высококонсервативной архитектуры пластидного генома у красных водорослей и семенных растений» . BMC Biology . 14 : 75. DOI : 10,1186 / s12915-016-0299-5 . ISSN 1741-7007 . PMC 5010701 . PMID 27589960 .   
  43. ^ Bodył, Анджей (2018). «Некоторые пластиды, полученные из красных водорослей, эволюционировали посредством клептопластии? Гипотеза». Биологические обзоры . 93 (1): 201–222. DOI : 10.1111 / brv.12340 . ISSN 1464-7931 . PMID 28544184 . S2CID 24613863 .   
  44. ^ Gitzendanner, Мэтью А .; Soltis, Pamela S .; Wong, Gane K.-S .; Ruhfel, Brad R .; Солтис, Дуглас Э. (2018). «Пластидный филогеномный анализ зеленых растений: миллиард лет эволюционной истории» . Американский журнал ботаники . 105 (3): 291–301. DOI : 10.1002 / ajb2.1048 . ISSN 0002-9122 . PMID 29603143 .  
  45. ^ Штрассерт, Юрген FH; Джейми, Махваш; Мыльников, Александр П .; Тихоненков, Денис В .; Бурки, Фабьен (30.08.2018). «Новый филогеномный анализ загадочного филума Телонемия решает вопрос о древе жизни эукариот» . bioRxiv : 403329. дои : 10,1101 / 403329 .
  46. ^ Гаврилюк, Райан MR; Тихоненков, Денис В .; Хехенбергер, Элизабет; Хусник, Филип; Мыльников, Александр П .; Килинг, Патрик Дж. (2019-09-08). «Нефотосинтезирующие хищники - сестра красных водорослей». Природа . 572 (7768): 240–243. DOI : 10.1038 / s41586-019-1398-6 . ISSN 0028-0836 . PMID 31316212 . S2CID 197542583 .   
  47. ^ Мацкевич, Павел; Гагат, Пшемыслав (31 декабря 2014 г.). «Монофилия супергруппы Archaeplastida и отношения между ее линиями в свете филогенетических и филогеномных исследований. Близки ли мы к консенсусу?» . Acta Societatis Botanicorum Poloniae . 83 (4): 263–280. DOI : 10,5586 / asbp.2014.044 . ISSN 2083-9480 . 
  48. ^ де Фрис, Ян; Арчибальд, Джон М. (2017). «Эндосимбиоз: развились ли пластиды из пресноводных цианобактерий?» . Текущая биология . 27 (3): R103 – R105. DOI : 10.1016 / j.cub.2016.12.006 . PMID 28171752 . 
  49. Перейти ↑ Lewis, LA (2017). «Держите соль: пресноводное происхождение первичных пластид» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 114 (37): 9759–9760. DOI : 10.1073 / pnas.1712956114 . PMC 5604047 . PMID 28860199 .  
  50. ^ Рэйвен, Джон А. (2013). «Клетки внутри клеток: симбиоз и продолжающаяся фаготрофия» . Текущая биология . 23 (12): R530 – R531. DOI : 10.1016 / j.cub.2013.05.006 . PMID 23787050 . 
  51. ^ Андерссон, Ян О.; Роджер, Эндрю Дж. (2002). «Ген цианобактерии у нефотосинтетических протистов - раннее приобретение хлоропластов у эукариот?». Текущая биология . 12 (2): 115–119. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (01) 00649-2 . PMID 11818061 . S2CID 18809784 .  
  52. ^ Килинг, Патрик Дж. (2010). «Эндосимбиотическое происхождение, разнообразие и судьба пластид» . Философские труды Королевского общества B: биологические науки . 365 (1541): 729–748. DOI : 10.1098 / rstb.2009.0103 . PMC 2817223 . PMID 20124341 .  
  53. ^ Бенгтсон, Стефан; Салльштедт, Тереза; Беливанова, Венета; Белый дом, Мартин (2017). «Трехмерное сохранение клеточных и субклеточных структур предполагает, что красные водоросли группы кроны возрастом 1,6 миллиарда лет» . PLOS Биология . 15 (3): e2000735. DOI : 10.1371 / journal.pbio.2000735 . PMC 5349422 . PMID 28291791 .  
  54. ^ Javaux, Emmanuelle J .; Knoll, Andrew H .; Уолтер, Малкольм Р. (2004). «Свидетельство ТЕА для эукариотического разнообразия в среднем протерозое океанов». Геобиология . 2 (3): 121–132. DOI : 10.1111 / j.1472-4677.2004.00027.x . S2CID 53600639 . 
  55. ↑ Юн, Су Хван; Hackett, Jeremiah D .; Чинилья, Клаудиа; Пинто, Габриэле; Бхаттачарья, Дебашиш (2004). «Молекулярный график происхождения фотосинтезирующих эукариот» . Молекулярная биология и эволюция . 21 (5): 809–818. DOI : 10.1093 / molbev / msh075 . PMID 14963099 . 
  56. ^ Баттерфилд, Николас Дж. (2000). " Bangiomorpha pubescens n. Gen., N. Sp .: значение для эволюции пола, многоклеточности и мезопротерозойского / неопротерозойского излучения эукариот". Палеобиология . 26 (3): 386–404. DOI : 10,1666 / 0094-8373 (2000) 026 <0386: BPNGNS> 2.0.CO; 2 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Древо жизни эукариоты