Митохондриальный код асцидии (таблица перевода 13 ) - это генетический код, обнаруженный в митохондриях асцидии .
Код
AAs = FFLLSSSSYY**CCWWLLLLPPPPHHQQRRRRIIMMTTTTNNKKSSGGVVVVAAAADDEEGGGG
Starts = ---M------------------------------MM---------------M------------
Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGG
Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG
Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG
Основания: аденин (A), цитозин (C), гуанин (G) и тимин (T) или урацил (U).
Аминокислоты: аланин (Ala, A), аргинин (Arg, R), аспарагин (Asn, N), аспарагиновая кислота (Asp, D), цистеин (Cys, C), глутаминовая кислота (Glu, E), глутамин (Gln , Q), глицин (Gly, G), гистидин (His, H), изолейцин (Ile, I), лейцин (Leu, L), лизин (Lys, K), метионин (Met, M), фенилаланин (Phe, F), пролин (Pro, P), серин (Ser, S), треонин (Thr, T), триптофан (Trp, W), тирозин (Tyr, Y), валин (Val, V)
Отличия от стандартного кода
Кодоны ДНК | Кодоны РНК | Этот код (13) | Стандартный код (1) | |
---|---|---|---|---|
AGA | AGA | Гли (G) | Арг (R) | |
AGG | AGG | Гли (G) | Арг (R) | |
ATA | AUA | Встреча (M) | Иль (I) | |
TGA | UGA | Trp (Вт) | СТОП = Тер (*) |
Систематический диапазон и комментарии
На филогенетически разнообразном образце оболочников ( Urochordata ) есть свидетельства того, что AGA и AGG кодируют глицин . У других организмов AGA / AGG кодируют аргинин или серин, а в митохондриях позвоночных они кодируют СТОП. Доказательства глициновой трансляции AGA / AGG были впервые обнаружены в 1993 году у Pyura stolonifera [1] и Halocynthia roretzi . [2] Затем это было подтверждено секвенированием тРНК [3] и секвенированием целых митохондриальных геномов. [4] [5]
Альтернативные кодоны инициации
- АТА, ГТГ и ТТГ [5]
- ATT является стартовым кодоном гена CytB в Halocynthia roretzi . [6]
Смотрите также
Рекомендации
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии . [7]
- ^ Durrheim Г.А., Corfield В.А., Harley EH, Ricketts MH (1993). «Нуклеотидная последовательность цитохромоксидазы (субъединица III) из митохондрии оболочки Pyura stolonifera : доказательство того, что AGR кодирует глицин» . Исследования нуклеиновых кислот . 21 (15): 3587–8. DOI : 10.1093 / NAR / 21.15.3587 . PMC 331473 . PMID 8393993 .
- ^ Йокобори С., Уэда Т., Ватанабе К. (январь 1993 г.). «Кодоны AGA и AGG читаются как глицин в митохондриях асцидии». Журнал молекулярной эволюции . 36 (1): 1–8. Bibcode : 1993JMolE..36 .... 1Y . DOI : 10.1007 / bf02407301 . PMID 8381878 . S2CID 12603691 .
- ^ Кондоу А., Сузуки Т., Йокобори С., Уэда Т., Ватанабе К. (июнь 1999 г.). «Дополнительная tRNAGly (U * CU), обнаруженная в митохондриях асцидии, ответственная за декодирование неуниверсальных кодонов AGA / AGG как глицина» . Исследования нуклеиновых кислот . 27 (12): 2554–9. DOI : 10.1093 / NAR / 27.12.2554 . PMC 148460 . PMID 10352185 .
- ^ Йокобори С., Уэда Т., Фельдмайер-Фукс Г., Пэабо С., Уэсима Р., Кондов А., Нисикава К., Ватанабе К. (декабрь 1999 г.). «Полная последовательность ДНК митохондриального генома асцидии Halocynthia roretzi (Chordata, Urochordata)» . Генетика . 153 (4): 1851–62. DOI : 10.1093 / генетика / 153.4.1851 . PMC 1460873 . PMID 10581290 .
- ^ а б Йокобори С., Ватанабэ Ю., Осима Т. (ноябрь 2003 г.). «Митохондриальный геном Ciona savignyi (Urochordata, Ascidiacea, Enterogona): сравнение расположения генов и генов тРНК с митохондриальным геномом Halocynthia roretzi » . Журнал молекулярной эволюции . 57 (5): 574–87. Bibcode : 2003JMolE..57..574Y . DOI : 10.1007 / s00239-003-2511-9 . PMID 14738316 . S2CID 19474615 .
- ^ Гисси C, Песоле G (2003). «Картирование транскриптов и аннотация генома асцидии мтДНК с использованием данных EST» . Геномные исследования . 13 (9): 2203–12. DOI : 10.1101 / gr.1227803 . PMC 403730 . PMID 12915488 .
- ^ Эльзановский А., Остелл Дж, Лейпе Д., Сусов В. "Генетические коды" . Браузер таксономии . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), Национальная медицинская библиотека США . Проверено 5 июня +2016 .