Бромодомен белок , содержащий 3 (BRD3) , также известный как ring3-подобный белок (RING3L) представляет собой белок , который у человека кодируется BRD3 гена . [5] [6] [7] Этот ген был идентифицирован на основе его гомологии с геном , кодирующим ring3 ( BRD2 ) белок , А серин / треонин киназа . Ген соответствует 9q34 , региону, который содержит несколько генов главного комплекса гистосовместимости (MHC).
BRD3 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | BRD3 , ORFX, RING3L, бромодомен, содержащий 3 | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 601541 MGI : 1914632 HomoloGene : 81801 GeneCards : BRD3 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 9: 134.03 - 134.07 Мб | Chr 2: 27,45 - 27,51 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
Состав
BRD3 является членом семейства белков бромодоменов и экстра-терминальных мотивов (BET) . Как и другие члены семейства BET, он содержит два тандемных гомологичных бромодомена и «экстра-терминальный» мотив.
BRD3, как и BRD2, не имеет длинного C-концевого домена, в отличие от белков семейства BET BRD4 и BRDT . [8]
Функция
Подобно другим членам семейства белков BET , BRD3 связывается с остатками ацетилированного лизина на гистонах и факторах транскрипции . [9] [10]
BRD3 участвует в ремоделировании нуклеосом в контексте транскрипции. [11] Кроме того, было показано, что BRD3 взаимодействует с молекулами РНК и образует агрегаты белок-РНК [12] .
BRD2 и BRD3 выполняют перекрывающиеся клеточные функции. [13]
Клиническое значение
Хромосомная транслокация BRD3 с геном NUT причастна к карциноме средней линии NUT . [14] Раковые образования, управляемые BRD3-NUT, гистопатологически неотличимы от раковых заболеваний, управляемых BRD4-NUT, вероятно, потому, что эти транслокации вовлекают N-концевую часть этих белков, содержащую бромодомен, которая является высококонсервативной.
Истощение BRD3 замедляет рост моделей рака, включая рак простаты и медуллобластому . Эффект истощения BRD3 слабее, чем у других белков BET BRD2 и BRD4, когда каждый из них тестируется изолированно. [15] [16] Ингибиторы BET нацелены на высококонсервативные бромодомены BET и одновременно вытесняют BRD2, BRD3 и BRD4 из хроматина. Функциональная избыточность между BRD2 и BRD3 предполагает, что их одновременное нарушение этих белков может быть более важным, чем оценивается при истощении этих белков по отдельности. [17]
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000169925 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026918 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Номура Н., Нагасе Т., Миядзима Н., Сазука Т., Танака А., Сато С., Секи Н., Каварабаяси И., Исикава К., Табата С. (декабрь 1995 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. II. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0041-KIAA0080), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1» . Исследования ДНК . 1 (5): 223–9. DOI : 10.1093 / dnares / 1.5.223 . PMID 7584044 .
- ^ Торп К.Л., Абдулла С., Кауфман Дж., Троусдейл Дж., Бек С. (октябрь 1996 г.). «Филогения и структура гена RING3». Иммуногенетика . 44 (5): 391–6. DOI : 10.1007 / BF02602785 . PMID 8781126 . S2CID 44613743 .
- ^ «Ген Entrez: бромодомен BRD3, содержащий 3» .
- ^ Белкина А.С., Денис Г.В. (июль 2012 г.). «Корегуляторы BET домена при ожирении, воспалении и раке» . Обзоры природы. Рак . 12 (7): 465–77. DOI : 10.1038 / nrc3256 . PMC 3934568 . PMID 22722403 .
- ^ Gamsjaeger R, Webb SR, Lamonica JM, Billin A, Blobel GA, Mackay JP (июль 2011 г.). «Структурные основы и специфичность распознавания ацетилированного фактора транскрипции GATA1 бромодоменным белком Brd3 семейства BET» . Молекулярная и клеточная биология . 31 (13): 2632–40. DOI : 10.1128 / MCB.05413-11 . PMC 3133386 . PMID 21555453 .
- ^ Ламоника Дж. М., Дэн В., Кадауке С., Кэмпбелл А. Э., Гамсджегер Р., Ван Х, Ченг Й., Биллин А. Н., Хардисон Р. К., Маккей Дж. П., Блобель Г. А. (май 2011 г.). «Бромодоменовый белок Brd3 ассоциируется с ацетилированным GATA1, чтобы способствовать его занятости хроматином в генах-мишенях эритроида» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (22): E159-68. DOI : 10.1073 / pnas.1102140108 . PMC 3107332 . PMID 21536911 .
- ^ Лерой Г., Рикардс Б., Флинт С.Дж. (апрель 2008 г.). «Белки с двойным бромодоменом Brd2 и Brd3 соединяют ацетилирование гистонов с транскрипцией» . Молекулярная клетка . 30 (1): 51–60. DOI : 10.1016 / j.molcel.2008.01.018 . PMC 2387119 . PMID 18406326 .
- ^ Данешвар К., Ардехали М.Б., Кляйн И.А., Шей Ф.К., Краткевич А.Дж., Махпур А.; и другие. (2020). «lncRNA DIGIT и белок BRD3 образуют фазово-разделенные конденсаты для регулирования дифференцировки энтодермы» . Nat Cell Biol . 22 (10): 1211–1222. DOI : 10.1038 / s41556-020-0572-2 . PMC 8008247 . PMID 32895492 .CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
- ^ Stonestrom AJ, Hsu SC, Jahn KS, Huang P, Keller CA, Giardine BM, Kadauke S, Campbell AE, Evans P, Hardison RC, Blobel GA (февраль 2015 г.). «Функции белков BET в экспрессии эритроидных генов» . Кровь . 125 (18): 2825–34. DOI : 10.1182 / кровь-2014-10-607309 . PMC 4424630 . PMID 25696920 .
- ^ Французский CA (2012). «Патогенез карциномы средней линии NUT». Ежегодный обзор патологии . 7 : 247–65. DOI : 10,1146 / annurev-патол-011811-132438 . PMID 22017582 .
- ^ Асангани И.А., Доммети В.Л., Ван Х, Малик Р., Цеслик М., Ян Р., Эскара-Уилке Дж., Уайлдер-римляне К., Дханиредди С., Энгельке С., Айер М.К., Цзин Х, Ву Ю.М., Цао Х, Цинь З.С., Ван S, Feng FY, Chinnaiyan AM (июнь 2014 г.). «Терапевтическое воздействие белков бромодомена BET при устойчивом к кастрации раке простаты» . Природа . 510 (7504): 278–82. DOI : 10,1038 / природа13229 . PMC 4075966 . PMID 24759320 .
- ^ Tang Y, Gholamin S, Schubert S, Willardson MI, Lee A, Bandopadhayay P, Bergthold G, Masoud S, Nguyen B, Vue N, Balansay B, Yu F, Oh S, Woo P, Chen S, Ponnuswami A, Monje M , Этвуд С.Х., Уитсон Р.Дж., Митра С., Чешир С.Х., Ци Дж., Бероухим Р., Тан Дж.Й., Векслер-Рейя Р., Оро А.Э., Линк Б.А., Брэднер Дж.Э., Чо Ю.Дж. (июль 2014 г.). «Эпигенетическое нацеливание транскрипционного выхода пути Hedgehog посредством ингибирования бромодомена BET» (PDF) . Природная медицина . 20 (7): 732–40. DOI : 10.1038 / nm.3613 . PMC 4108909 . PMID 24973920 .
- ^ Stonestrom AJ, Hsu SC, Jahn KS, Huang P, Keller CA, Giardine BM, Kadauke S, Campbell AE, Evans P, Hardison RC, Blobel GA (апрель 2015 г.). «Функции белков BET в экспрессии эритроидных генов» . Кровь . 125 (18): 2825–34. DOI : 10.1182 / кровь-2014-10-607309 . PMC 4424630 . PMID 25696920 .
Внешние ссылки
- Расположение генома человека BRD3 и страница сведений о гене BRD3 в браузере генома UCSC .
дальнейшее чтение
- Торп К.Л., Горман П., Томас С., Шир Д., Троусдейл Дж., Бек С. (октябрь 1997 г.). «Хромосомная локализация, структура гена и образец транскрипции гена ORFX, гомолога гена RING3, связанного с MHC». Джин . 200 (1-2): 177–83. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00415-0 . PMID 9373153 .
- Канеко Х., Иноуэ Р., Терамото Т., Моримото В., Исогай К., Касахара К., Кондо Н. (2003). «Обнаружение генов, индуцированных в активированных лимфоцитах с помощью модифицированного дифференциального дисплея». Журнал исследовательской аллергологии и клинической иммунологии . 12 (2): 86–90. PMID 12371535 .
- Чжоу М., Пэн Ц., Ни XM, Чжан BC, Чжу С.Г., Ю И, Ли XL, Ли Г.Й. (февраль 2003 г.). «[Экспрессия BRD7-взаимодействующих белков, BRD2 и BRD3, в тканях карциномы носоглотки]». AI Zheng = Aizheng = Китайский журнал рака . 22 (2): 123–7. PMID 12600283 .
- Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кантли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. DOI : 10.1073 / pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
- Исии Х., Мимори К., Мори М., Векчионе А. (июль 2005 г.). «Дифференциально выраженные гены в дифференцировке эндотелия». ДНК и клеточная биология . 24 (7): 432–7. DOI : 10.1089 / dna.2005.24.432 . PMID 16008511 .
- Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .