BTAF1

Идентификаторы

BTAF1 , MOT1, TAF (II) 170, TAF172, TAFII170, B-TFIID TATA-бокс-связывающий белок, связанный с фактором 1

Внешние идентификаторы

OMIM : 605191 MGI : 2147538 HomoloGene : 31978 GeneCards : BTAF1

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 10 (человека) ^[1]

Группа	10q23.32	Начинать	91 923 770 п.н. ^[1]
Группа	10q23.32	Конец	92 030 325 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 19 (мышь) ^[2]

Группа	19 \| 19 C2	Начинать	36 926 079 п.н. ^[2]
Группа	19 \| 19 C2	Конец	37 012 752 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК • Связывание нуклеотидов • активность гидролазы • Связывание АТФ • Активность геликазы GO: 0008026 • Связывание белка GO: 0001948
Сотовый компонент	• внутриклеточная мембраносвязанная органелла • ядро клетки • нуклеоплазма
Биологический процесс	• негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • негативная регуляция связывания хроматина
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


9044


107182

Ансамбль


ENSG00000095564


ENSMUSG00000040565

UniProt


O14981 Q2M1V9


E9QAE3

RefSeq (мРНК)


NM_003972


NM_001080706

RefSeq (белок)


NP_003963 NP_003963.1


NP_001074175

Расположение (UCSC)

Chr 10: 91.92 - 92.03 Мб

Chr 19: 36.93 - 37.01 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

ТАТА-связывающий белок-ассоциированный фактор 172 представляет собой белок , который у человека кодируется BTAF1 гена . ^[5]^[6]^[7]

Функция [ править ]

Инициирование транскрипции с помощью РНК-полимеразы II требует помощи TATA-бокса-связывающего белка (TBP; MIM 600075) и TBP-ассоциированных факторов или TAF (например, TAF2B; MIM 604912) в 2 отдельных комплексах, TFIID и B-TFIID. Комплекс TFIID состоит из TBP и более 8 TAF. Однако большая часть ТВР присутствует в комплексе B-TFIID, который состоит из ТВР и TAFII170, также называемого TAF172, и обладает ДНК-зависимой АТФазной активностью. [Поставляется OMIM] ^[7]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что BTAF1 взаимодействует со связывающим белком TATA . ^[6]^[8]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000095564 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040565 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
↑ van der Knaap JA, Borst JW, van der Vliet PC, Gentz R, Timmers HT (декабрь 1997 г.). «Клонирование кДНК субъединицы фактора II170, связанного с ТАТА-связывающим белком, фактора транскрипции B-TFIID выявляет гомологию с глобальными регуляторами транскрипции у дрожжей и дрозофилы» . Proc Natl Acad Sci USA . 94 (22): 11827–32. DOI : 10.1073 / pnas.94.22.11827 . PMC 23617 . PMID 9342322 .
^ a b Chicca JJ, Обл Д.Т., Пью Б.Ф. (март 1998 г.). «Клонирование и биохимическая характеристика TAF-172, человеческого гомолога дрожжевого Mot1» . Mol Cell Biol . 18 (3): 1701–10. DOI : 10,1128 / MCB.18.3.1701 . PMC 108885 . PMID 9488487 .
^ a b «Ген Entrez: BTAF1 BTAF1 РНК-полимераза II, связанный с фактором транскрипции B-TFIID, 170 кДа (гомолог Mot1, S. cerevisiae)» . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
Перейти ↑ Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (май 1997). «BRCA1 является компонентом холофермента РНК-полимеразы II» . Proc. Natl. Акад. Sci. США 94 (11): 5605–10. DOI : 10.1073 / pnas.94.11.5605 . PMC 20825 . PMID 9159119 .

Внешние ссылки [ править ]

Расположение генома человека BTAF1 и страница сведений о гене BTAF1 в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение [ править ]

Чжоу Кью, Шарп PA (1995). «Новый механизм и фактор регуляции Tat ВИЧ-1» . EMBO J . 14 (2): 321–8. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07006.x . PMC 398086 . PMID 7835343 .
Parada CA, Юн JB, Roeder RG (1995). «Новое LBP-1-опосредованное ограничение транскрипции ВИЧ-1 на уровне элонгации in vitro» . J. Biol. Chem . 270 (5): 2274–83. DOI : 10.1074 / jbc.270.5.2274 . PMID 7836461 .
Ou SH, Гарсия-Мартинес LF, Паулссен EJ, Gaynor RB (1994). «Роль фланкирующих мотивов E-бокса в функции элемента TATA вируса иммунодефицита человека 1 типа» . J. Virol . 68 (11): 7188–99. DOI : 10,1128 / JVI.68.11.7188-7199.1994 . PMC 237158 . PMID 7933101 .
Кашанчи Ф., Пирас Дж., Радонович М.Ф., Дюваль Дж. Ф., Фаттей А., Чанг С.М., Рёдер Р.Г., Брэди Дж. «Прямое взаимодействие человеческого TFIID с трансактиватором ВИЧ-1 tat». Природа . 367 (6460): 295–9. DOI : 10.1038 / 367295a0 . PMID 8121496 . S2CID 4362048 .
Ван З., Моррис Г. Ф., Райс А. П., Сюн В., Моррис С. Б. (1996). «Мутанты дикого типа и трансактивационные дефектные мутанты белка Tat вируса иммунодефицита человека типа 1 связывают человеческий TATA-связывающий белок in vitro». J. Acquir. Иммунодефицит. Syndr. Гм. Ретровирол . 12 (2): 128–38. DOI : 10.1097 / 00042560-199606010-00005 . PMID 8680883 .
Пендерграст П.С., Моррисон Д., Танси В.П., Эрнандес Н. (1996). «Мутации в карбокси-концевом домене ТВР одинаково влияют на синтез полноразмерных и коротких транскриптов вируса иммунодефицита человека типа 1» . J. Virol . 70 (8): 5025–34. DOI : 10,1128 / JVI.70.8.5025-5034.1996 . PMC 190456 . PMID 8764009 .
Кашанчи Ф., Хлейф С.Н., Дюваль Дж.Ф., Садаи М.Р., Радонович М.Ф., Чо М., Мартин М.А., Чен С.Ю., Вайнманн Р., Брэди Дж. Н. (1996). «Взаимодействие Tat вируса иммунодефицита человека типа 1 с уникальным сайтом TFIID ингибирует отрицательный кофактор Dr1 и стабилизирует комплекс TFIID-TFIIA» . J. Virol . 70 (8): 5503–10. DOI : 10,1128 / JVI.70.8.5503-5510.1996 . PMC 190508 . PMID 8764062 .
Чжоу Q, Шарп PA (1996). «Tat-SF1: кофактор для стимуляции удлинения транскрипции с помощью Tat ВИЧ-1». Наука . 274 (5287): 605–10. Bibcode : 1996Sci ... 274..605Z . DOI : 10.1126 / science.274.5287.605 . PMID 8849451 . S2CID 13266489 .
Гарсиа-Мартинес Л.Ф., Иванов Д., Гейнор РБ (1997). «Ассоциация Tat с очищенными комплексами преинициации транскрипции ВИЧ-1 и ВИЧ-2» . J. Biol. Chem . 272 (11): 6951–8. DOI : 10.1074 / jbc.272.11.6951 . PMID 9054383 .
Скалли Р., Андерсон С.Ф., Чао Д.М., Вей В., Е Л., Янг Р.А., Ливингстон Д.М., Парвин Д.Д. (1997). «BRCA1 является компонентом холофермента РНК-полимеразы II» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 94 (11): 5605–10. DOI : 10.1073 / pnas.94.11.5605 . PMC 20825 . PMID 9159119 .
Ван дер Кнаап Дж. А., Ван Ден Бум В., Кейперс Дж., Ван Эйк М. Дж., Ван дер Влиет П. К., Тиммерс Х. Т. (2000). «Ген человеческого фактора, связанного с ТАТА-связывающим белком (TAFII) 170: структура, промотор и хромосомная локализация» . Биохим. Дж . 345 (3): 521–7. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3450521 . PMC 1220786 . PMID 10642510 .
Вадхва Р., Ягути Т., Хасан М.К., Тайра К., Каул С.К. (2003). «Взаимодействия Mortalin-MPD (мевалонатпирофосфатдекарбоксилаза) и их роль в контроле клеточной пролиферации». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 302 (4): 735–42. DOI : 10.1016 / S0006-291X (03) 00226-2 . PMID 12646231 .
Перейра Л.А., Клейман М.П., Рульманн К., Кавелаарс Ф., Улад-Абдельгани М., Тиммерс Х.Т., Шульц П. (2004). «Молекулярная архитектура базального фактора транскрипции B-TFIID» . J. Biol. Chem . 279 (21): 21802–7. DOI : 10.1074 / jbc.M313519200 . PMID 14988402 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кантли Л.С., Гиги С.П. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . DOI : 10.1073 / pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
Клейман М.П., Перейра Л.А., ван Зеебург Х.Дж., Гилфиллан С., Мейстерернст М., Тиммерс Х.Т. (2004). «NC2α взаимодействует с BTAF1 и стимулирует его АТФ-зависимую ассоциацию с ТАТА-связывающим белком» . Мол. Клетка. Биол . 24 (22): 10072–82. DOI : 10.1128 / MCB.24.22.10072-10082.2004 . PMC 525489 . PMID 15509807 .
Grob P, Cruse MJ, Inouye C, Peris M, Penczek PA, Tjian R, Nogales E (2006). «Криоэлектронные микроскопические исследования человеческого TFIID: конформационное дыхание в интеграции генных регуляторных сигналов». Структура . 14 (3): 511–20. DOI : 10.1016 / j.str.2005.11.020 . PMID 16531235 .

Эта статья о гене на хромосоме 10 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000095564 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040565 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9342322-5] van der Knaap JA, Borst JW, van der Vliet PC, Gentz R, Timmers HT (декабрь 1997 г.). «Клонирование кДНК субъединицы фактора II170, связанного с ТАТА-связывающим белком, фактора транскрипции B-TFIID выявляет гомологию с глобальными регуляторами транскрипции у дрожжей и дрозофилы» . Proc Natl Acad Sci USA . 94 (22): 11827–32. DOI : 10.1073 / pnas.94.22.11827 . PMC 23617 . PMID 9342322 .

[pmid9488487-6] Chicca JJ, Обл Д.Т., Пью Б.Ф. (март 1998 г.). «Клонирование и биохимическая характеристика TAF-172, человеческого гомолога дрожжевого Mot1» . Mol Cell Biol . 18 (3): 1701–10. DOI : 10,1128 / MCB.18.3.1701 . PMC 108885 . PMID 9488487 .

[entrez-7] «Ген Entrez: BTAF1 BTAF1 РНК-полимераза II, связанный с фактором транскрипции B-TFIID, 170 кДа (гомолог Mot1, S. cerevisiae)» . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )

[pmid9159119-8] Перейти ↑ Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (май 1997). «BRCA1 является компонентом холофермента РНК-полимеразы II» . Proc. Natl. Акад. Sci. США 94 (11): 5605–10. DOI : 10.1073 / pnas.94.11.5605 . PMC 20825 . PMID 9159119 .

[1]