Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с Bbc1 )
Перейти к навигации Перейти к поиску

60S рибосомных белков L13 представляет собой белок , который у человека кодируется RPL13 гена . [4] [5]

Функция [ править ]

Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой 40S- субъединицы и большой 60S- субъединицы. Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомный белок, который является компонентом субъединицы 60S. Белок принадлежит к семейству рибосомных белков L13E. Он находится в цитоплазме . Этот ген экспрессируется на значительно более высоких уровнях при доброкачественных поражениях груди, чем при карциномах груди . Варианты транскриптов, полученные в результате альтернативного сплайсинга и / или альтернативногополиаденилирование ; эти варианты кодируют один и тот же белок. Как типично для генов, кодирующих рибосомные белки, существует множество процессированных псевдогенов этого гена, рассредоточенных по геному. [5]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что RPL13 взаимодействует с CDC5L . [6]

Bbc1 [ править ]

Bbc1 (Mti1p) - это белок, экспрессируемый в дрожжах, который, как полагают, связан с сетями актина . Bbc1 является сокращением от Bni1 синтетического летального и члена комплекса Bee1 ( las17 ). [7] Альтернативное название, Mti1p, является сокращением от белка, взаимодействующего с областью хвоста миозина . [8] Bbc1 участвует в регуляции цитоскелета во время эндоцитоза . Bbc1 у почкующихся дрожжей ингибирует активатор комплекса Las17 Arp2 / 3 ( гомолог WASp ). [9] Белок также взаимодействует с хвостом белков миозина 1 . [8]

У делящихся дрожжей Bbc1 считается цитоскелетным белком семейства WIP. Bbc1 локализуется на актиновых участках коры головного мозга, в сайтах деления клеток, на кончике клетки и в цитозоле. Клетки с делецией гена bbc1 жизнеспособны. [10] BBC1 этого сродство захвачено небулин -семейства нитей актина якоря белок Cyk3 [11] и SMARCAD1 семейства АТФ -зависимой ДНК геликазы Fft3. [10] [12] Bbc1 конкурирует с гомологом WIP Vrp1 за связывание хвоста миозина 1 и регуляцию сборки актина в эндоцитозных сайтах. [13]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000167526 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ Kenmochi N, Кавагути T, Розен S, Davis E Гудман N, Hudson TJ, Tanaka T, Page DC (август 1998). «Карта 75 генов рибосомных белков человека» . Genome Res . 8 (5): 509–23. DOI : 10.1101 / gr.8.5.509 . PMID 9582194 . 
  5. ^ а б «Ген Энтреза: рибосомный белок L13 RPL13» .
  6. ^ Ajuh P, Кюстер B, Панов K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (декабрь 2000). «Функциональный анализ человеческого комплекса CDC5L и идентификация его компонентов с помощью масс-спектрометрии» . EMBO J . 19 (23): 6569–81. DOI : 10.1093 / emboj / 19.23.6569 . PMC 305846 . PMID 11101529 .  
  7. ^ "BBC1 | SGD" . www.yeastgenome.org . Проверено 9 января 2020 .
  8. ^ a b Мочида Дж., Ямамото Т., Фудзимура-Камада К., Танака К. (март 2002 г.). «Новый адаптерный белок, Mti1p и Vrp1p, гомолог белка, взаимодействующего с белком синдрома Вискотта-Олдрича (WIP), может антагонистически регулировать миозины типа I в Saccharomyces cerevisiae» . Генетика . 160 (3): 923–34. OCLC 678661938 . PMC 1462009 . PMID 11901111 .   
  9. ^ RODAL AA, Manning AL, BL Goode, Drubin DG (июнь 2003). «Отрицательная регуляция дрожжевого WASp двумя белками, содержащими домен SH3». Текущая биология . 13 (12): 1000–8. DOI : 10.1016 / s0960-9822 (03) 00383-х . PMID 12814545 . S2CID 11363803 .  
  10. ^ а б "Помбасе" . www.pombase.org . Проверено 9 января 2020 .
  11. ^ Робертс-Гэлбрейт RH, Ohi MD, Ballif BA, Chen JS, McLeod I, McDonald WH и др. (Июль 2010 г.). «Дефосфорилирование белка F-BAR Cdc15 модулирует его конформацию и стимулирует его активность в качестве каркаса в месте деления клетки» . Молекулярная клетка . 39 (1): 86–99. DOI : 10.1016 / j.molcel.2010.06.012 . PMC 2916701 . PMID 20603077 .  
  12. ^ Lee J, Choi ES, Seo HD, Kang K, Gilmore JM, Florens L, et al. (Февраль 2017). «Fft3 индуцирует разборку нуклеосом для облегчения элонгации РНК-полимеразы II» . Nature Communications . 8 : 14527. Bibcode : 2017NatCo ... 814527L . DOI : 10.1038 / ncomms14527 . PMC 5321744 . PMID 28218250 .  
  13. ^ Маккуорри CD, Mangione MC, Carroll R, Джеймс М, Гулд KL, Сироткин V (сентябрь 2019). «Адаптерный белок Bbc1 S. pombe регулирует локализацию Wsp1 и Vrp1 во время сборки эндоцитарного актинового пятна» . Журнал клеточной науки . 132 (17): jcs233502. DOI : 10,1242 / jcs.233502 . PMC 6771142 . PMID 31391237 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Шерсть И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомных белков млекопитающих». Biochem. Cell Biol . 73 (11–12): 933–47. DOI : 10.1139 / o95-101 . PMID  8722009 .
  • Адамс С.М., Хелпс Н.Р., Шарп М.Г., Браммар В.Дж., Уокер Р.А., Варлей Дж.М. (1993). «Выделение и характеристика нового гена с дифференциальной экспрессией в доброкачественных и злокачественных опухолях груди человека». Гм. Мол. Genet . 1 (2): 91–6. DOI : 10.1093 / HMG / 1.2.91 . PMID  1301162 .
  • Като С., Секин С., О SW, Ким Н. С., Умедзава И., Абэ Н., Ёкояма-Кобаяси М., Аоки Т. (1995). «Строительство банка полноразмерных кДНК человека». Джин . 150 (2): 243–50. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90433-2 . PMID  7821789 .
  • Ясин Н.Р., Блобель Г. (1997). «Клонирование и характеристика человеческого кариоферина бета3» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 94 (9): 4451–6. Bibcode : 1997PNAS ... 94.4451Y . DOI : 10.1073 / pnas.94.9.4451 . PMC  20743 . PMID  9114010 .
  • Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х., Люнг А. К., Лам Ю. В., Стин Х, Манн М., Ламонд А. И. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Биол . 12 (1): 1–11. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9 . PMID  11790298 . S2CID  14132033 .
  • Би В., Ян Дж., Станкевич П., Парк С.С., Вальц К., Буркоэль С.Ф., Потоцкий Л., Шаффер Л.Г., Девриндт К., Новачик М.Дж., Иноуэ К., Лупски Д.Р. (2002). «Гены в уточненном интервале критических делеций синдрома Смита-Магениса на хромосоме 17p11.2 и синтенической области мыши» . Genome Res . 12 (5): 713–28. DOI : 10.1101 / gr.73702 . PMC  186594 . PMID  11997338 .
  • Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К., Онг С. Е., Лион CE, Ламонд А. И., Манн М. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Bibcode : 2005Natur.433 ... 77А . DOI : 10,1038 / природа03207 . PMID  15635413 . S2CID  4344740 .
  • Кобаяши Т., Сасаки И., Осима Ю., Ямамото Х, Мита Х, Сузуки Х, Тойота М, Токино Т, Ито Ф, Имаи К., Шиномура Й (2006). «Активация гена рибосомного белка L13 при раке желудочно-кишечного тракта человека» . Int. J. Mol. Med . 18 (1): 161–70. DOI : 10.3892 / ijmm.18.1.161 . PMID  16786168 .

Внешние ссылки [ править ]

  • PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для рибосомного белка 60S человека L13.