• структурная молекула активность • ион металла связывания • GO: 0001948 связывание белка • идентичного связывания с белками • внеклеточного матрикс структурной составной • внеклеточным матрикс структурной составной придающей прочности на разрыв
Сотовый компонент
• Коллаген тример • эндоплазматический ретикулум ого • GO: 0005578 внеклеточного матрикс • базальная мембрана • внеклеточного экзос • внеклеточного пространство • внеклеточная область • коллагенсодержащего внеклеточный матрикс
Биологический процесс
• позитивная регуляция миграции клеток • морфогенез эндотелиальных клеток • реакция на гидростатическое давление • организация внеклеточного матрикса • позитивная регуляция апоптотического процесса эндотелиальных клеток • клеточная адгезия • ангиогенез • позитивная регуляция пролиферации клеточной популяции • морфогенез органов животных • катаболический процесс коллагена • ответ на лекарство • зрительное восприятие • негативная регуляция пролиферации клеточной популяции
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
80781
12822
Ансамбль
ENSG00000182871
ENSMUSG00000001435
UniProt
P39060
P39061
RefSeq (мРНК)
NM_130445 NM_030582 NM_130444 NM_001379500
NM_001109991 NM_009929
RefSeq (белок)
NP_085059 NP_569711 NP_569712 NP_001366429
NP_001103461 NP_034059
Расположение (UCSC)
Chr 21: 45.41 - 45.51 Мб
Chr 10: 77.05 - 77.17 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Коллаген альфа-1 (XVIII) , цепь представляет собой белок , который у человека кодируется COL18A1 гена . [5]
Этот ген кодирует альфа-цепь коллагена типа XVIII. Этот коллаген является одним из мультиплексинов, белков внеклеточного матрикса, которые содержат несколько доменов тройной спирали (коллагеновые домены), прерванных неколлагеновыми доменами. Протеолитически продуцируемый С-концевой фрагмент коллагена типа XVIII представляет собой эндостатин, мощный антиангиогенный белок. Мутации в этом гене связаны с синдромом Кноблоха. Основные признаки этого синдрома включают аномалии сетчатки, поэтому коллаген XVIII типа может играть важную роль в структуре сетчатки и закрытии нервной трубки. Для этого гена обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. [6]
СОДЕРЖАНИЕ
1 См. Также
2 ссылки
3 Дальнейшее чтение
4 Внешние ссылки
См. Также [ править ]
Коллаген
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000182871 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001435 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ О SP, Уорман ML, Seldin MF, Cheng SD, Knoll JH, Тиммонс S, Olsen BR (июнь 1994). «Клонирование кДНК и геномной ДНК, кодирующих человеческий коллаген типа XVIII, и локализация гена коллагена альфа 1 (XVIII) в хромосоме 10 мыши и хромосоме 21 человека». Геномика . 19 (3): 494–9. DOI : 10.1006 / geno.1994.1098 . PMID 8188291 .
^ «Энтрез Ген: коллаген COL18A1, тип XVIII, альфа 1» .
Дальнейшее чтение [ править ]
Пуфе Т., Курц Б., Петерсен В. и др. (2006). «Влияние биомеханических параметров на экспрессию VEGF и эндостатина в костно-суставной системе». Аня. Анат . 187 (5–6): 461–72. DOI : 10.1016 / j.aanat.2005.06.008 . PMID 16320826 .
О, С.П., Камагата Ю., Мурагаки Ю. и др. (1994). «Выделение и секвенирование кДНК белков с множественными доменами повторов Gly-Xaa-Yaa позволяет идентифицировать отдельное семейство коллагеновых белков» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 91 (10): 4229–33. Bibcode : 1994PNAS ... 91.4229O . DOI : 10.1073 / pnas.91.10.4229 . PMC 43758 . PMID 8183893 .
Сертье А.Л., Куимби М., Морейра Э.С. и др. (1996). «Ген, вызывающий серьезные глазные изменения и затылочный энцефалоцеле (синдром Кноблоха), сопоставлен с 21q22.3» . Гм. Мол. Genet . 5 (6): 843–7. DOI : 10.1093 / HMG / 5.6.843 . PMID 8776601 .
O'Reilly MS, Boehm T., Shing Y и др. (1997). «Эндостатин: эндогенный ингибитор ангиогенеза и роста опухоли». Cell . 88 (2): 277–85. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81848-6 . PMID 9008168 . S2CID 14851562 .
Саарела Дж., Юликярппа Р., Рен М. и др. (1998). «Полная первичная структура двух вариантных форм человеческого коллагена типа XVIII и тканеспецифические различия в экспрессии соответствующих транскриптов». Matrix Biol . 16 (6): 319–28. DOI : 10.1016 / S0945-053X (98) 90003-8 . PMID 9503365 .
Динг Й.Х., Джавахериан К., Ло К.М. и др. (1998). «Цинк-зависимые димеры, наблюдаемые в кристаллах эндостатина человека» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 95 (18): 10443–8. Bibcode : 1998PNAS ... 9510443D . DOI : 10.1073 / pnas.95.18.10443 . PMC 27913 . PMID 9724722 .
Сасаки Т., Геринг В., Миосге Н. и др. (1999). «Связывание тропоэластина с фибулинами, нидогеном-2 и другими белками внеклеточного матрикса» . FEBS Lett . 460 (2): 280–4. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (99) 01362-9 . PMID 10544250 . S2CID 25139630 .
Фелбор У., Драйер Л., Брайант Р.А. и др. (2000). «Секретируемый катепсин L генерирует эндостатин из коллагена XVIII» . EMBO J . 19 (6): 1187–94. DOI : 10.1093 / emboj / 19.6.1187 . PMC 305660 . PMID 10716919 .
Хаттори М., Фудзияма А., Тейлор Т.Д. и др. (2000). «Последовательность ДНК хромосомы 21 человека» . Природа . 405 (6784): 311–9. Bibcode : 2000Natur.405..311H . DOI : 10.1038 / 35012518 . PMID 10830953 .
Сертье А.Л., Сосси В., Камарго А.А. и др. (2000). «Коллаген XVIII, содержащий эндогенный ингибитор ангиогенеза и роста опухоли, играет решающую роль в поддержании структуры сетчатки и в закрытии нервной трубки (синдром Кноблоха)» . Гм. Мол. Genet . 9 (13): 2051–8. DOI : 10.1093 / HMG / 9.13.2051 . PMID 10942434 .
Рен М., Вейккола Т., Кукк-Валдре Э. и др. (2001). «Взаимодействие эндостатина с интегринами, участвующими в ангиогенезе» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 98 (3): 1024–9. DOI : 10.1073 / pnas.031564998 . PMC 14702 . PMID 11158588 .
Каруманчи С.А., Джа В., Рамчандран Р. и др. (2001). «Глипиканы клеточной поверхности представляют собой рецепторы эндостатина с низким сродством» (PDF) . Мол. Cell . 7 (4): 811–22. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (01) 00225-8 . PMID 11336704 .
Фэн Й., Цуй Л. Б., Лю СХ, Ма QJ (2001). «[Ингибирующий эффект очищенного эндостатина in vitro, выраженный в Pichia pastoris]». Шэн У Гун Чэн Сюэ Бао . 17 (3): 278–82. PMID 11517600 .
Югетти П., Судзуки О., Годой П. Х. и др. (2001). «Полиморфизм эндостатина, ингибитора ангиогенеза, предрасполагает к развитию аденокарциномы простаты». Cancer Res . 61 (20): 7375–8. PMID 11606364 .
Ву П, Йонекура Х, Ли Х и др. (2001). «Гипоксия подавляет выработку эндостатина эндотелиальными клетками микрососудов человека и перицитами». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 288 (5): 1149–54. DOI : 10.1006 / bbrc.2001.5903 . PMID 11700031 .
Зорик Т.С., Мустакки З., Бандо С.Ю. и др. (2002). «Высокий уровень эндостатина в сыворотке при синдроме Дауна: значение для улучшения лечения и профилактики солидных опухолей» . Евро. J. Hum. Genet . 9 (11): 811–4. DOI : 10.1038 / sj.ejhg.5200721 . PMID 11781696 .
Ханаи Дж., Дханабал М., Каруманчи С.А. и др. (2002). «Эндостатин вызывает задержку G1 эндотелиальных клеток за счет ингибирования циклина D1» . J. Biol. Chem . 277 (19): 16464–9. DOI : 10.1074 / jbc.M112274200 . PMID 11815623 .
Эргюн С., Килич Н., Вурмбах Дж. Х. и др. (2002). «Эндостатин подавляет ангиогенез за счет стабилизации новообразованных эндотелиальных трубок». Ангиогенез . 4 (3): 193–206. DOI : 10,1023 / A: 1014027218980 . PMID 11911017 . S2CID 28608175 .
Tomono Y, Naito I, Ando K и др. (2002). «Определенные эпитопом моноклональные антитела против мультиплексиновых коллагенов демонстрируют, что коллагены типа XV и XVIII экспрессируются в специализированных базальных мембранах» . Сотовая структура. Функц . 27 (1): 9–20. DOI : 10.1247 / csf.27.9 . PMID 11937714 .
Внешние ссылки [ править ]
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P39060 ( цепь человеческого коллагена альфа-1 (XVIII)) в PDBe-KB .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P39061 ( цепь мышиного коллагена альфа-1 (XVIII)) в PDBe-KB .
vтеPDB галерея
1 млрд : ЦИНК- ЗАВИСИМЫЕ ДИМЕРЫ, ОБНАРУЖЕННЫЕ В КРИСТАЛЛАХ ЭНДОСТАТИНА ЧЕЛОВЕКА
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .
Эта статья о гене на 21 хромосоме человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .
