С-конец
С -конец (также известный как карбоксильный конец , карбокси-конец , С-концевой хвост , С- конец или СООН-конец ) представляет собой конец аминокислотной цепи ( белка или полипептида ), оканчивающийся свободным карбоксильная группа (-СООН). Когда белок транслируется с информационной РНК, он создается с N-конца на С-конец. При написании последовательностей пептидов принято помещать С-конец справа и записывать последовательность от N- к С-концу.
Каждая аминокислота имеет карбоксильную группу и аминогруппу . Аминокислоты связываются друг с другом, образуя цепь в результате реакции дегидратации , которая соединяет аминогруппу одной аминокислоты с карбоксильной группой следующей. Таким образом, полипептидные цепи имеют конец с несвязанной карбоксильной группой, С-конец, и конец с несвязанной аминогруппой, N -конец . Белки естественным образом синтезируются, начиная с N-конца и заканчивая С-концом.
В то время как N-конец белка часто содержит нацеливающие сигналы, С-конец может содержать удерживающие сигналы для сортировки белков. Наиболее распространенным сигналом удержания ER является аминокислотная последовательность -KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) или -HDEL (His-Asp-Glu-Leu) на С-конце. Это удерживает белок в эндоплазматическом ретикулуме и предотвращает его попадание в секреторный путь .
С-конец белков может быть модифицирован посттрансляционно , чаще всего путем добавления липидного якоря к С-концу, что позволяет белку встраиваться в мембрану без трансмембранного домена .
Одной из форм модификации С-конца является пренилирование . Во время пренилирования фарнезил- или геранилгеранил- изопреноидный якорь мембраны присоединяется к цистеиновому остатку вблизи С-конца. Небольшие мембраносвязанные G-белки часто модифицируются таким образом.
Другой формой модификации С-конца является добавление фосфогликана, гликозилфосфатидилинозитола (GPI), в качестве якоря мембраны. Якорь GPI присоединяется к С-концу после протеолитического расщепления С-концевого пропептида. Наиболее ярким примером этого типа модификации является прионовый белок.
