Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Chryseobacterium - это род грамотрицательных бактерий . Chryseobacterium представляют собой хемоорганотрофные грамотрицательные бактерии палочковидной формы. Chryseobacterium образуют типичные колонии желто-оранжевого цвета из-за пигмента флексирубинового типа. Род содержит более 100 описанных видов из различных местообитаний, включая пресноводные источники, почву, морских рыб и людей-хозяев. [1]

История [ править ]

Род Chryseobacterium был первоначально создан в 1994 году Vandamme et al . [2] для шести бактериальных таксонов, которые в то время были классифицированы как представители рода Flavobacterium : F. balustinum , F. indologenes , F. gleum , F. meningosepticum , F. indoltheticum и F. scophthalmum . В 2005 г. был создан дополнительный род Elizabethkingia для двух видов рода Chryseobacterium ; а именно C. meningosepticum и C. miricola. [3]В 2002 г. стандарты и руководства по описанию новых таксонов семейства Flavobacteriaceae были опубликованы Bernardet et al. [4] К 2006 году род Chryseobacterium расширился до 10 видов, к 2014 году - более 60 видов [5], а в настоящее время - более 100.

Экология [ править ]

Chryseobacterium spp. были извлечены из почвы, корней растений, цветов, гниющего растительного материала и кленового сока. Некоторые штаммы Chryseobacterium, ассоциированные с растениями , способны подавлять патогенные грибки растений. Chryseobacterium spp. были также извлечены из пресноводных ручьев, озер, их отложений, систем водяного охлаждения, питьевой воды, молочно-кислых напитков, заводов по розливу пива, отстоя биореакторов, загрязненной почвы, морских отложений и вечной мерзлоты . [5] Chryseobacterium spp. связаны с множеством животных - они были обнаружены в средней кишке комаров, в кишечнике тараканов, фекалиях многоножек и гуано пингвинов, гомогенатах кишечника пресноводных копепод, птичьих перьях, коровьем молоке, сыром мясе и курице.Chryseobacterium spp. были извлечены из слизи практически здоровой рыбы, однако иногда их считают организмом порчи. [5] Три новых устойчивых к холоду вида Chryseobacterium , C. oranimense, C. haifense и C. bovis , были обнаружены в сыром молоке в Израиле. [6]

Патогенез [ править ]

Наиболее патогенная разновидность Flavobacterium, Chryseobacterium meningosepticum , вызывающая многочисленные инфекции, была отнесена к роду Elizabethkingia . [3] Chryseobacterium indologenes, хотя и широко распространен в природе, в основном обнаруживается в почве и воде, но является редким патогеном для человека. Однако в редких случаях он может вызвать серьезные инфекции, особенно среди людей с ослабленным иммунитетом. [7] В большинстве случаев инфекции носят внутрибольничный характер, часто связаны с иммуносупрессией или постоянными катетерами. Сообщалось, что он является возбудителем бактериемии , перитонита , пневмонии , эмпиемы , пиелонефрита., цистит , менингит и инфекции, связанные с центральным венозным катетером. Число зарегистрированных инфекций C. indologenes увеличивается. Большинство зарегистрированных случаев заражения было из Тайваня, и только около 10% - за пределами Азии. Несколько отчетов поступили из Австралии, Индии, Европы и США. [7] C. indologenes также патогенен для мягкого клеща, тогда как другие виды Chryseobacterium spp. были получены от больных черепах, лягушек и рыб, в частности C. scophthalmum, C. joostei, C. piscicola, C. chaponense, C. viscerum и C. oncorhynchi, C. aahli, C. hominis, C. shigense, а также C. indologenes, связанный с заболеваниями человека. [5]

Сообщалось, что некоторые виды Chryseobacterium обладают необычными свойствами переваривания матрикса, способными разрушать самые сложные коллагеновые матрицы, такие как перья или экзоскелеты. Эти свойства, вероятно, опосредуются действием специфических хитиназ и металлопротеаз, подобных коллагеназе . Было показано, что некоторые из этих видов, такие как Chryseobacterium nematophagum, способны инфицировать, убивать и, в конечном итоге, потреблять все ткани нематод, включая обычно очень нерастворимый экзоскелет кутикулы. [8] Активность хитиназы, гелеатиназы и металлопротеиназы коллагеназы была связана с Chryseobacterium.скользящая подвижность, обеспечиваемая системами секреции типа IX. Действительно, некоторые из этих ферментов обладают сигналами секреции С-концевого типа IX. [9] Сами Chryseobacterium не имеют ни коллагеновых, ни хитиновых белков или структур. Виды Chryseobacterium принадлежат к типу Bacteriodetes , члены которого все чаще описываются как имеющие необычно связанные подвижность и секреторную систему. [8] [9]

Ботулинические нейротоксиноподобные (BoNT-подобные) токсины обнаружены в геноме Chryseobacterium piperi str. CTM, и они представляют собой сильно различающуюся группу BoNT-подобных токсинов. Один из предсказанных BoNT-подобных токсинов C. piperi индуцировал некротическую гибель клеток в клетках почек человека, но не было обнаружено, что он расщепляет обычные субстраты SNARE для BoNT. [10]

Устойчивость к антибиотикам [ править ]

Chryseobacterium spp. по своей природе устойчивы к широкому спектру антибиотиков , включая тетрациклины , эритромицин , линезолид , полимиксины , аминогликозиды , хлорамфеникол и многие бета-лактамы , а также обладают промежуточной чувствительностью к ванкомицину и клиндамицину и различаются по своей чувствительности к триметоприм-сульфаметоксазолу . [5]

Виды [ править ]

Виды включают: [11]

  • Chryseobacterium aahli
  • Chryseobacterium angstadtii
  • Chryseobacterium antarcticum
  • Chryseobacterium anthropi
  • Chryseobacterium aquaticum
  • Chryseobacterium aquifrigidense
  • Chryseobacterium arachidiradicis
  • Chryseobacterium arachidis
  • Chryseobacterium arthrosphaerae
  • Chryseobacterium artocarpi
  • Chryseobacterium balustinum
  • Chryseobacterium bernardetii
  • Chryseobacterium bovis
  • Chryseobacterium caeni
  • Chryseobacterium camelliae
  • Chryseobacterium carnipullorum
  • Chryseobacterium carnis
  • Chryseobacterium chaponense
  • Chryseobacterium cucumeris
  • Chryseobacterium contaminans
  • Chryseobacterium culicis
  • Chryseobacterium daecheongense
  • Chryseobacterium daeguense
  • Chryseobacterium defluvii
  • Chryseobacterium echinoideorum
  • Chryseobacterium endophyticum
  • Chryseobacterium elymi
  • Chryseobacterium flavum
  • Chryseobacterium formosense
  • Chryseobacterium frigidisoli
  • Chryseobacterium frigidum
  • Chryseobacterium gallinarum
  • Chryseobacterium gambrini
  • Chryseobacterium geocarposphaerae
  • Chryseobacterium ginsengiterrae
  • Chryseobacterium ginsengisoli
  • Chryseobacterium ginsenosidimutans
  • Chryseobacterium glaciei
  • Chryseobacterium gleum
  • Chryseobacterium greenlandense
  • Chryseobacterium gregarium
  • Chryseobacterium gwangjuense
  • Chryseobacterium hagamense
  • Chryseobacterium haifense
  • Chryseobacterium halperniae
  • Chryseobacterium hispalense
  • Chryseobacterium hispanicum
  • Chryseobacterium hominis
  • Chryseobacterium humi
  • Chryseobacterium hungaricum
  • Chryseobacterium indologenes
  • Chryseobacterium indoltheticum
  • Chryseobacterium jejuense
  • Chryseobacterium jeonii
  • Chryseobacterium joostei
  • Chryseobacterium koreense
  • Chryseobacterium kwangjuense
  • Chryseobacterium limigenitum
  • Chryseobacterium lactis
  • Chryseobacterium lathyri
  • Chryseobacterium lineare
  • Chryseobacterium luteum
  • Chryseobacterium marinum
  • Chryseobacterium montanum
  • Chryseobacterium molle
  • Chryseobacterium nakagawai
  • Chryseobacterium nematophagum
  • Chryseobacterium nepalense
  • Chryseobacterium oleae
  • Chryseobacterium oncorhynchi
  • Chryseobacterium oranimense
  • Chryseobacterium pallidum
  • Chryseobacterium palustre
  • Chryseobacterium piperi
  • Chryseobacterium piscicola
  • Chryseobacterium piscium
  • Chryseobacterium polytrichastri
  • Chryseobacterium profundimaris
  • Chryseobacterium Psychotolerans
  • Chryseobacterium reticulitermitis
  • Chryseobacterium rhizoplanae
  • Chryseobacterium rhizosphaerae
  • Chryseobacterium rigui
  • Chryseobacterium salipaludis
  • Chryseobacterium sediminis
  • Chryseobacterium scophthalmum
  • Chryseobacterium shandongense
  • Chryseobacterium shigense
  • Chryseobacterium soldanellicola
  • Chryseobacterium solani
  • Chryseobacterium soli
  • Chryseobacterium solincola
  • Chryseobacterium taeanense
  • Chryseobacterium taichungense
  • Chryseobacterium taihuense
  • Chryseobacterium taiwanense
  • Chryseobacterium takakiae
  • Chryseobacterium taklimakanense
  • Chryseobacterium tenax
  • Chryseobacterium treverense
  • Chryseobacterium tructae
  • Chryseobacterium ureilyticum
  • Chryseobacterium vietnamense
  • Chryseobacterium viscerum
  • Chryseobacterium vrystaatense
  • Chryseobacterium wanjuense
  • Chryseobacterium xinjiangense
  • Chryseobacterium xixisoli
  • Chryseobacterium yonginense
  • Chryseobacterium zeae

См. Также [ править ]

  • Bacteroidetes
  • Флавобактерии

Ссылки [ править ]

  1. ^ Мату А, Лум Нде А, Остхуизен Л, Хитцерот А, Баденхорст М, Дуба Л, Гидага М, Клинк Дж, Крик И.М., Лекома П.Дж., Нел Л., Дос Рамос С.М., Россоу Дж., Саломан Н., Сегон Н., Серобе С. , Тияни Т., Хьюго Си Джей, Ньюман Дж. Д. (январь 2019 г.). «Типовые штаммы Chryseobacterium» . Объявления о микробиологических ресурсах . 8 (1): e01518–18. DOI : 10.1128 / MRA.01518-18 . PMC  6318376 . PMID  30637405 .
  2. ^ Вандамм Р, Bernardet ДФ, Сегерс Р, Kersters К, Холмс Б (1994-10-01). «ПРИМЕЧАНИЯ: Новые перспективы в классификации флавобактерий: описание Chryseobacterium gen. Nov., Bergeyella gen. Nov. И Empedobacter nom. Rev» . Международный журнал систематической бактериологии . 44 (4): 827–831. DOI : 10.1099 / 00207713-44-4-827 . ISSN 0020-7713 . 
  3. ^ а б Ким К.К., Ким М.К., Лим Дж. Х., Пак Х.Й., Ли ST (май 2005 г.). «Перенос Chryseobacterium meningosepticum и Chryseobacterium miricola на Elizabethkingia gen. Nov. Как Elizabethkingia meningoseptica comb. Nov. И Elizabethkingia miricola comb. Nov.» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 55 (Pt 3): 1287–93. DOI : 10.1099 / ijs.0.63541-0 . PMID 15879269 . 
  4. ^ Бернардет Дж. Ф., Накагава Ю., Холмс Б. и др. (Подкомитет по систематике флавобактерий и цитофагоподобных бактерий Международного комитета по систематике прокариот) (май 2002 г.). «Предложены минимальные стандарты для описания новых таксонов семейства Flavobacteriaceae и исправлено описание семейства» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 52 (Pt 3): 1049–70. DOI : 10.1099 / 00207713-52-3-1049 . PMID 12054224 . 
  5. ^ a b c d e Loch TP, Faisal M (май 2015 г.). «Новые флавобактериальные инфекции у рыб: обзор» . Журнал перспективных исследований . 6 (3): 283–300. DOI : 10.1016 / j.jare.2014.10.009 . PMC 4522593 . PMID 26257926 .  
  6. ^ Hantsis-Е Захаров, Shaked Т, Сендерович Y, Хальперн М (ноябрь 2008 г.). «Chryseobacterium oranimense sp. Nov., Психротолерантная, протеолитическая и липолитическая бактерия, выделенная из сырого коровьего молока» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 58 (Pt 11): 2635–9. DOI : 10.1099 / ijs.0.65819-0 . PMID 18984706 . Краткое содержание - EurekAlert! . 
  7. ^ а б Мукерджи Р., Какарала Р., Смит С.Дж., Куш Г.Г. (апрель 2016 г.). «Chryseobacterium indologenes: новая инфекция в США» . Отчеты о делах BMJ . 2016 : bcr2016214486. DOI : 10.1136 / BCR-2016-214486 . PMC 4840731 . PMID 27053540 .  
  8. ^ a b Page AP, Робертс М., Феликс М.А., Пикард Д., Пейдж А, Вейр В. (февраль 2019 г.). «Золотая палочка смерти Chryseobacterium nematophagum - новый матриксный патоген нематод, переваривающий» . BMC Biology . 17 (1): 10. DOI : 10,1186 / s12915-019-0632-х . PMC 6394051 . PMID 30813925 .  
  9. ^ a b McBride MJ, Zhu Y (январь 2013 г.). «Гены скользящей подвижности и системы секреции Por широко распространены среди представителей филума бактероидов» . Журнал бактериологии . 195 (2): 270–8. DOI : 10.1128 / JB.01962-12 . PMC 3553832 . PMID 23123910 .  
  10. ^ Mansfield MJ, Докси AC (июнь 2018). «Геномные взгляды на эволюцию и экологию нейротоксинов ботулина» . Возбудители и болезни . 76 (4). DOI : 10.1093 / femspd / fty040 . PMID 29684130 . 
  11. ^ «Род Chryseobacterium» . LPSN .