Послушайте эту статью
Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Для научного журнала см. Кладистика (журнал) . Для филогенетической номенклатуры, часто называемой «кладистической номенклатурой» или «кладистической терминологией», см. Филогенетическую номенклатуру .

Часть серии по
Эволюционная биология
Зяблики Дарвина, автор Gould.jpg
Зябликов Дарвина по Джон Гулд
Ключевые темы
Процессы и результаты
Естественная история
История эволюционной теории
Поля и приложения
  • Приложения эволюции
  • Биосоциальная криминология
  • Экологическая генетика
  • Эволюционная эстетика
  • Эволюционная антропология
  • Эволюционные вычисления
  • Эволюционная экология
  • Эволюционная экономика
  • Эволюционная эпистемология
  • Эволюционная этика
  • Эволюционная теория игр
  • Эволюционная лингвистика
  • Эволюционная медицина
  • Эволюционная нейробиология
  • Эволюционная физиология
  • Эволюционная психология
  • Экспериментальная эволюция
  • Филогенетика
  • Палеонтология
  • Селекция
  • Эксперименты по видообразованию
  • Социобиология
  • Систематика
  • Универсальный дарвинизм
Социальные последствия
  • Эволюция как факт и теория
  • Социальные эффекты
  • Споры о сотворении и эволюции
  • Возражения против эволюции
  • Уровень поддержки
  •  Портал эволюционной биологии
  • Категория Категория
  • похожие темы
  • v
  • т
  • е

Кладистики ( / к л ə д ɪ с т ɪ к ы / , от греческого κλάδος , Klados , «ветвь») [1] представляет собой подход к биологической классификации , в котором организмы подразделяются на группы ( « клады ») на основании гипотез самого недавнего общего предка . Доказательством предполагаемых взаимосвязей обычно являются общие производные характеристики ( синапоморфии ).которые не присутствуют в более далеких группах и предках. Теоретически общий предок и все его потомки являются частью клады, однако с эмпирической точки зрения общие предки - это выводы, основанные на кладистической гипотезе взаимоотношений таксонов, состояния характеров которых можно наблюдать. Важно отметить, что все потомки остаются в своей общей родовой кладе. Например, если бы в строгих кладистических рамках использовались термины животные , билатерии / черви , рыбы / позвоночные или обезьяны / антропоидеи , эти термины включали бы людей. Многие из этих терминов обычно используются парафилетически , за пределами кладистики, например, как ' степень'. Радиация приводит к образованию новых субкладов путем бифуркации, но на практике половая гибридизация может размывать очень тесно связанные группировки. [2] [3] [4] [5]

Методы и номенклатура кладистики были применены к дисциплинам, отличным от биологии. (См. Филогенетическую номенклатуру .)

Кладистика в настоящее время является наиболее часто используемым методом классификации организмов. [6]

История [ править ]

Вилли Хенниг 1972
Питер Чалмерс Митчелл в 1920 году
Роберт Джон Тиллард

Оригинальные методы, используемые в кладистическом анализе, и школа таксономии заимствованы из работ немецкого энтомолога Вилли Хеннига , который назвал их филогенетической систематикой (также название его книги 1966 года); термины «кладистика» и «клады» были популяризированы другими исследователями. Кладистика в первоначальном смысле относится к определенному набору методов, используемых в филогенетическом анализе, хотя теперь она иногда используется для обозначения всей области. [7]

То, что сейчас называется кладистическим методом, появилось еще в 1901 году в работе Питера Чалмерса Митчелла для птиц [8] [9], а затем Роберта Джона Тилларда (для насекомых) в 1921 г. [10] и В. Циммермана (для растений). ) в 1943 году. [11] Термин « клады » был введен в 1958 году Джулианом Хаксли после того, как был введен Люсьеном Куэно в 1940 году, [12] «кладогенез» в 1958 году [13] «кладистический» Артуром Кейном и Харрисоном в 1960, [14] «кладист» (для приверженца школы Хеннига).Эрнст Майр в 1965 году [15] и «кладистика» в 1966 году. [13] Хенниг назвал свой подход «филогенетической систематикой». Со времени его первоначальной формулировки и до конца 1970-х кладистика конкурировала как аналитический и философский подход к систематике с фенетикой и так называемой эволюционной систематикой . Фенетику в то время отстаивали численные систематики Питер Снит и Роберт Сокал , а за эволюционную таксономию - Эрнст Майр .

Первоначально задуманная, хотя бы по сути, Вилли Хеннигом в книге, опубликованной в 1950 году, кладистика не процветала до ее перевода на английский язык в 1966 году (Lewin 1997). Сегодня кладистика - самый популярный метод вывода филогенетических деревьев на основе морфологических данных.

В 1990-х годах разработка эффективных методов полимеразной цепной реакции позволила применить кладистические методы к биохимическим и молекулярно-генетическим признакам организмов, значительно расширив объем данных, доступных для филогенетики. В то же время кладистика быстро стала популярной в эволюционной биологии, потому что компьютеры позволили обрабатывать большие объемы данных об организмах и их характеристиках.

Методология [ править ]

Основные статьи: Филогенетика и кладограмма
Смотрите также: Филогенетическое дерево

Кладистический метод интерпретирует каждое преобразование состояния общего символа как потенциальное свидетельство для группировки. Синапоморфии (общие, производные состояния символов) рассматриваются как свидетельство группировки, в то время как симплезиоморфии (общие состояния предков) - нет. Результатом кладистического анализа является кладограмма - древовидная диаграмма ( дендрограмма ) [16], которая интерпретируется как наилучшая гипотеза филогенетических отношений. Хотя традиционно такие кладограммы создавались в основном на основе морфологических признаков и первоначально рассчитывались вручную, данные генетического секвенирования и компьютерная филогенетикав настоящее время широко используются в филогенетическом анализе, и многие филогенетики отказались от критерия экономии в пользу более «сложных», но менее экономных эволюционных моделей трансформации состояния характера. Кладисты утверждают, что эти модели необоснованны, поскольку нет доказательств того, что они восстанавливают больше «истинных» или «правильных» результатов из фактических наборов эмпирических данных [17].

Каждая кладограмма основана на определенном наборе данных, проанализированном определенным методом. Наборы данных - это таблицы, состоящие из молекулярных , морфологических, этологических [18] и / или других признаков и списка операционных таксономических единиц (OTU), которыми могут быть гены, особи, популяции, виды или более крупные таксоны, которые считаются монофилетическими и следовательно, чтобы все вместе образовать одну большую кладу; Филогенетический анализ делает вывод о схеме ветвления внутри этой клады. Различные наборы данных и разные методы, не говоря уже о нарушениях упомянутых предположений, часто приводят к разным кладограммам. Только научное исследование может показать, что с большей вероятностью будет правильным.

До недавнего времени, например, кладограммы, подобные приведенным ниже, обычно считались точным отображением родственных связей между черепахами, ящерицами, крокодилами и птицами: [19]

  ▼
Testudines  

черепахи

 
Диапсида    ♦
Лепидозаврия  

ящерицы

 
Архозаврия
Крокодиломорфа  

крокодилы

 
Динозаврия

птицы

 
 
 
 

Если эта филогенетическая гипотеза верна, то последний общий предок черепах и птиц на ветви около ▼ жил раньше, чем последний общий предок ящериц и птиц, около ♦ . Однако большинство молекулярных доказательств дает кладограммы, более похожие на это: [20]

Диапсида    ♦
Лепидозаврия  

ящерицы

 
Архозавроморфа ▼
Testudines  

черепахи

 
Архозаврия  
Крокодиломорфа  

крокодилы

 
Динозаврия

птицы

 
 
 
 

Если это верно, то последний общий предок черепах и птиц жил позже, чем последний общий предок ящериц и птиц. Поскольку кладограммы предоставляют конкурирующие отчеты о реальных событиях, самое большее одно из них является правильным.

Кладограмма приматов , показывающая монофилетический таксон ( клады : обезьяны или Anthropoidea, желтым цветом), парафилетический таксон (прозимианы, синим цветом, включая красное пятно) и полифилетический таксон (ночные приматы - лори и т. в долгопятах - в красном)

Кладограмма справа представляет текущую общепризнанную гипотезу о том, что все приматы , включая стрепсиринов, таких как лемуры и лори , имели общего предка, все потомки которого были приматами, и таким образом образуют кладу; поэтому для этой клады известно имя Приматы. Предполагается, что среди приматов все антропоиды (обезьяны, обезьяны и люди) имели общего предка, все потомки которого были антропоидами, поэтому они образуют кладу под названием Anthropoidea. «Просимианы», с другой стороны, образуют парафилетический таксон. Название Prosimii не используется в филогенетической номенклатуре , которая называет только клады; вместо этого "просимианцы" делятся между кладамиStrepsirhini и Haplorhini , где последний содержит Tarsiiformes и Anthropoidea.

Терминология состояний персонажей [ править ]

Следующие термины, введенные Хеннигом, используются для обозначения общих или различных состояний характера в группах: [21] [22] [23]

  • Plesiomorphy ( «близка форма») или родовое состояние является состоянием символа , которого таксон сохранил от своих предков. Когда два или более таксона, которые не вложены друг в друга, разделяют плезиоморфию, это симплезиоморфия (от син- , «вместе»). Симплезиоморфии не означают, что таксоны, которые демонстрируют это состояние характера, обязательно тесно связаны. Например, рептилии традиционно характеризуются (среди прочего) хладнокровностью (т. Е. Не поддерживают постоянную высокую температуру тела), тогда как птицы теплокровны.. Поскольку хладнокровность - это плезиоморфия, унаследованная от общего предка традиционных рептилий и птиц, и, следовательно, симплезиоморфия черепах, змей и крокодилов (среди прочих), это не означает, что черепахи, змеи и крокодилы образуют кладу, исключающую птицы.
  • Апоморфия ( «отдельная форма») или производное состояние является новшеством. Таким образом, его можно использовать для диагностики клады или даже для определения названия клады в филогенетической номенклатуре . Признаки, которые происходят от отдельных таксонов (один вид или группа, которая представлена ​​одним концом в данном филогенетическом анализе), называются аутапоморфиями (от авто- , «я»). Аутапоморфии ничего не выражают об отношениях между группами; клады идентифицируются (или определяются) синапоморфиями (от син- , «вместе»). Например, наличие цифр , гомологичных таковым у Homo sapiens.это синапоморфия позвоночных. В тетраподы можно выделить как состоящие из первых позвоночного с такими цифрами , гомологичными таковой Homo Sapiens вместе со всеми потомками этого позвоночного животного (ой апоморфией на основе филогенетического определения ). [24] Важно отметить, что змеи и другие четвероногие, у которых нет пальцев, тем не менее, являются четвероногими: другие признаки, такие как амниотические яйца и диапсидные черепа, указывают на то, что они произошли от предков, которые обладали пальцами, гомологичными нашим.
  • Состояние характера является гомопластическим или "случаем гомоплазии"."если он является общим для двух или более организмов, но отсутствует у их общего предка или более позднего предка в линии, ведущей к одному из организмов. Следовательно, предполагается, что он эволюционировал путем конвергенции или обращения. И млекопитающие, и птицы способны чтобы поддерживать высокую постоянную температуру тела (т.е. они теплокровные). Однако принятая кладограмма, объясняющая их важные особенности, указывает на то, что их общий предок находится в группе, лишенной этого состояния характера, поэтому состояние должно было развиваться независимо в двух Теплокровность отдельно является синапоморфией млекопитающих (или более крупной клады) и птиц (или более крупной клады), но она не является синапоморфией какой-либо группы, включающей обе эти клады. Вспомогательный принцип Хеннига [25]утверждает, что состояния общих символов следует рассматривать как свидетельство группировки, если они не противоречат другим свидетельствам; таким образом, гомоплазия некоторого признака среди членов группы может быть выведена только после того, как будет установлена ​​филогенетическая гипотеза для этой группы.

Термины плезиоморфия и апоморфия относительны; их применение зависит от положения группы в дереве. Например, при попытке решить, образуют ли четвероногие кладу, важный вопрос заключается в том, является ли наличие четырех конечностей синапоморфией самых ранних таксонов, включенных в состав Tetrapoda: все ли самые ранние представители Tetrapoda унаследовали четыре конечности от общего предка , тогда как все остальные позвоночные этого не сделали или, по крайней мере, не гомологично? Напротив, для группы четвероногих, таких как птицы, наличие четырех конечностей является плезиоморфией. Использование этих двух терминов позволяет повысить точность обсуждения гомологии, в частности, позволяет четко выразить иерархические отношения между различными гомологичными характеристиками.

Может быть трудно решить, является ли состояние характера на самом деле одинаковым и, таким образом, может быть классифицировано как синапоморфия, которая может идентифицировать монофилетическую группу, или же она только кажется такой же и, таким образом, является гомоплазией, которая не может идентифицировать такую ​​группу. группа. Существует опасность кругового рассуждения: предположения о форме филогенетического дерева используются для обоснования решений о состояниях персонажей, которые затем используются в качестве доказательства формы дерева. [26] Филогенетика использует различные формы экономии.решать такие вопросы; сделанные выводы часто зависят от набора данных и методов. Такова природа эмпирической науки, и по этой причине большинство кладистов называют свои кладограммы гипотезами родства. Кладограммы, которые поддерживаются большим количеством и разнообразием различных типов символов, считаются более надежными, чем те, которые основаны на более ограниченных доказательствах. [27]

Терминология таксонов [ править ]

Моно-, пара- и полифилетические таксоны можно понять на основе формы дерева (как это было сделано выше), а также на основе состояния их характера. [22] [23] [28] Они сравниваются в таблице ниже.

СрокОпределение на основе узловОпределение на основе символов
МонофилияКлады , монофилетическая таксона, является таксоном , который включает в себя все потомок с выведенным предком.Клада характеризуется одной или несколькими апоморфиями : производными состояниями признаков, присутствующими в первом члене таксона, унаследованными его потомками (если они не утрачены вторично) и не унаследованы никакими другими таксонами.
ПарафилияПарафилетическая сборка - это сборка, которая создается путем взятия клады и удаления одной или нескольких меньших клад. [29] (Удаление одной клады дает единичную парафилетическую сборку, удаление двух дает двойную парафилектическую сборку и т. Д.) [30]Парафилетический комплекс характеризуется одной или несколькими плезиоморфиями : состояниями характера, унаследованными от предков, но не присутствующими у всех их потомков. Как следствие, парафилетический комплекс усечен в том смысле, что он исключает одну или несколько клад из монофилетического таксона в остальном. Альтернативное название - эволюционная ступень , относящаяся к наследственному состоянию характера внутри группы. В то время как парафилетические сообщества популярны среди палеонтологов и эволюционных систематиков, кладисты не признают парафилетические сообщества как имеющие какое-либо формальное информационное содержание - они просто части клад.
ПолифилияПолифилетический ансамбль - это тот, который не является ни монофилетическим, ни парафилетическим.Полифилетическая совокупность характеризуется одной или несколькими гомоплазиями : состояниями характера, которые сближаются или возвращаются, чтобы быть одинаковыми, но которые не были унаследованы от общего предка. Ни один систематик не признает полифилетические сообщества как таксономически значимые объекты, хотя экологи иногда считают их значимыми ярлыками для функциональных участников экологических сообществ (например, первичных продуцентов, детритофагов и т. Д.).

Критика [ править ]

Кладистика, как в целом, так и в конкретных приложениях, подвергалась критике с самого начала. Решения относительно того, являются ли определенные состояния характера гомологичными , предварительное условие их синапоморфизма, были оспорены как предполагающие круговое рассуждение и субъективные суждения. [31] Конечно, потенциальная ненадежность доказательств является проблемой для любого систематического метода, да и вообще для любого эмпирического научного исследования. [32]

Трансформированная кладистика возникла в конце 1970-х годов [33] в попытке решить некоторые из этих проблем, удалив априорные предположения о филогении из кладистического анализа, но она осталась непопулярной. [34]

Проблемы [ править ]

Кладистический метод не определяет ископаемые виды как реальных предков клады. [35] Вместо этого ископаемые таксоны идентифицируются как принадлежащие к отдельным вымершим ветвям. Хотя ископаемый вид мог быть фактическим предком клады, об этом невозможно узнать. Следовательно, более консервативная гипотеза состоит в том, что ископаемый таксон связан с другими ископаемыми и современными таксонами, что подразумевается набором общих апоморфных признаков. [36]

В дисциплинах помимо биологии [ править ]

Сравнения, используемые для получения данных, на которых могут быть основаны кладограммы , не ограничиваются областью биологии. [37] Любая группа лиц или классов, которые предположительно имеют общего предка и к которым может применяться или не применяться набор общих характеристик, может быть сравнен попарно. Кладограммы могут использоваться для изображения гипотетических родственных связей внутри групп предметов во многих различных академических областях. Единственное требование состоит в том, чтобы предметы имели характеристики, которые можно идентифицировать и измерить.

Антропология и археология : [38] Кладистские методы использовались для реконструкции развития культур или артефактов с использованием групп культурных черт или особенностей артефактов.

Сравнительная мифология и сказки используют кладистические методы для реконструкции прототипов многих мифов. Мифологические филогении, построенные на мифемах, явно поддерживают низкие горизонтальные передачи (заимствования), исторические (иногда палеолитические) диффузии и прерывистую эволюцию. [39] Они также являются мощным способом проверки гипотез о межкультурных отношениях между сказками. [40] [41]

Литература : кладистические методы были использованы в классификации уцелевших рукописей Кентерберийского , [42] и рукописи санскритского Чарака Самхита . [43]

Историческая лингвистика : [44] Кладистические методы использовались для реконструкции филогении языков с использованием лингвистических особенностей. Это похоже на традиционный сравнительный метод исторической лингвистики, но более явный в использовании экономии и позволяет намного быстрее анализировать большие наборы данных ( вычислительная филогенетика ).

Текстуальная критика или стемматика : [43] [45] Кладистские методы использовались для реконструкции филогении рукописей одного и того же произведения (и восстановления утраченного оригинала) с использованием характерных ошибок копирования в качестве апоморфий. Это отличается от традиционной историко-сравнительной лингвистики тем, что позволяет редактору оценивать и помещать в генетические отношения большие группы рукописей с большим количеством вариантов, которые невозможно обработать вручную. Это также позволяет проводить экономичный анализ зараженных традиций передачи, которые невозможно оценить вручную в разумные сроки.

Астрофизика [46] делает выводы об истории взаимоотношений между галактиками, чтобы создать гипотезы диаграмм ветвления о диверсификации галактик.

См. Также [ править ]

  • Биоинформатика
  • Биоматематика
  • Коалесцентная теория
  • Общий спуск
  • Глоссарий научного нейминга
  • Языковая семья
  • Патрокладограмма
  • Филогенетическая сеть
  • Научная классификация
  • Стратокладистика
  • Субклад
  • Систематика
  • Анализ трех таксонов
  • Модель дерева
  • Древовидная структура

Примечания и ссылки [ править ]

  1. ^ Харпер, Дуглас. "клады" . Интернет-словарь этимологии .
  2. ^ Колумбийская энциклопедия [ требуется полная ссылка ]
  3. ^ «Введение в кладистику» . Ucmp.berkeley.edu . Проверено 6 января 2014 года .
  4. ^ Оксфордский словарь английского языка [ требуется полная ссылка ]
  5. ^ Оксфордский словарь английского языка [ требуется полная ссылка ]
  6. ^ «Потребность в кладистике» . www.ucmp.berkeley.edu . Проверено 12 августа 2018 .
  7. ^ Бринкмен & Leipe 2001 , стр. 323
  8. ^ Шух, Рэндалл. 2000. Биологическая систематика: принципы и приложения, стр.7 (цитата из Нельсона и Платника, 1981). Издательство Корнельского университета (books.google)
  9. ^ Folinsbee, Kaila et al. 2007. 5 Количественные подходы к филогенетике, с. 172. Rev. Mex. Div. 225-52 (kfolinsb.public.iastate.edu)
  10. ^ Craw, RC (1992). «Границы кладистики: идентичность, различия и место в возникновении филогенетической систематики». В Гриффитсе, ЧП (ред.). Деревья жизни: Очерки философии биологии . Дордрехт: Kluwer Academic. С. 65–107. ISBN 978-94-015-8038-0.
  11. ^ Шух, Рэндалл. 2000. Биологическая систематика: принципы и приложения, стр.7. Корнелл У. Пресс
  12. ^ Куэно 1940
  13. ^ a b Девятый новый университетский словарь Вебстера
  14. ^ Каин и Харрисон 1960
  15. ^ Dupuis 1984
  16. ^ Weygoldt 1998
  17. ^ Rindal, Эйрик; Брауэр, Эндрю В.З. (2011), «Филогенетический анализ, основанный на моделях, работает лучше, чем экономия? Тест с эмпирическими данными», Cladistics , 27 : 331–334
  18. ^ Джерисон 2003 , стр. 254
  19. Перейти ↑ Benton, Michael J. (2005), Vertebrate Palaeontology , Blackwell, pp. 214, 233, ISBN 978-0-632-05637-8
  20. ^ Лайсон, Тайлер; Гилберт, Скотт Ф. (март – апрель 2009 г.), «Черепахи на всем пути вниз: ссоры в корне хелонического дерева» (PDF) , Evolution & Development , 11 (2): 133–135, CiteSeerX 10.1.1.695. 4249 , DOI : 10.1111 / j.1525-142X.2009.00325.x , PMID 19245543 , S2CID 3121166    
  21. ^ Patterson 1982 , стр. 21-74
  22. ^ а б Паттерсон 1988
  23. ^ а б де Пинна 1991
  24. ^ Лорин и Андерсон 2004
  25. ^ Хенниг 1966
  26. ^ Джеймс и Pourtless IV 2009 , стр. 25: «Синапоморфии вызываются для защиты гипотезы; гипотеза вызывается для защиты синапоморфий».
  27. ^ Брауэр, AVZ и Schuh, RT. 2021. Биологическая систематика: принципы и приложения (3-е изд.). Издательство Корнельского университета, Итака, Нью-Йорк
  28. ^ Паттерсон 1982
  29. ^ Многие источники дают словесное определение «парафилетических», которое не требует, чтобы отсутствующие группы были монофилетическими. Однако, когда представлены диаграммы, представляющие парафилетические группы, они неизменно показывают недостающие группы как монофилетические. См., Например, Wiley et al. 1991 , стр. 4
  30. ^ Тейлор 2003
  31. ^ Adrain, Edgecombe и Либерман 2002 , стр. 56-57
  32. ^ Oreskes, Наоми, Кристин Шрадер-Фрешет и Кеннет Belitz. «Проверка, подтверждение и подтверждение численных моделей в науках о Земле». Наука 263, вып. 5147 (1994): 641-646.
  33. ^ Платник, Норман I. "Философия и трансформация кладистики". Систематическая зоология 28, вып. 4 (1979): 537-546.
  34. ^ Брауэр, Эндрю В.З. «Пятьдесят оттенков кладизма». Биология и философия 33, вып. 1-2 (2018): 8.
  35. ^ Крелл, Франк-Т; Крэнстон, Питер С. (2004). «Какая сторона дерева прикорневая ?: От редакции». Систематическая энтомология . 29 (3): 279–281. DOI : 10.1111 / j.0307-6970.2004.00262.x . S2CID 82371239 . 
  36. ^ Паттерсон, Колин. «Значение окаменелостей в определении эволюционных отношений». Ежегодный обзор экологии и систематики 12, вып. 1 (1981): 195-223.
  37. Перейти ↑ Mace, Clare & Shennan 2005 , p. 1
  38. ^ Lipo et al. 2006 г.
  39. ^ d'Huy 2012a, b; d'Huy 2013a, b, c, d
  40. ^ Росс и др. 2013
  41. ^ Тегеран, 2013
  42. ^ "Проект Сказок Кентербери" . Архивировано из оригинала 7 июля 2009 года . Проверено 4 июля 2009 года .
  43. ^ а б Маас 2010–2011 гг.
  44. ^ Oppenheimer 2006 , стр. 290-300, 340-56
  45. ^ Робинсон и О'Хара 1996
  46. ^ Fraix-Burnet et al. 2006 г.

Библиография [ править ]

  • Адрейн, Джонатан М .; Эджкомб, Грегори Д. и Либерман, Брюс С. (2002), Ископаемые, филогения и форма: аналитический подход , Нью-Йорк: Kluwer Academic, ISBN 978-0-306-46721-9, дата обращения 15 августа 2012.
  • Барон, К. и Хёг, Дж. Т. (2005), «Гулд, Шарм и палеонтологическая перспектива в эволюционной биологии», в Коенеманн, С. и Дженнер, Р. А. (ред.), « Отношения ракообразных и членистоногих» , CRC Press, стр. 3 –14, ISBN 978-0-8493-3498-6, дата обращения 15 октября 2008.
  • Бентон, MJ (2000), "Стебли, узлы, клады короны и списки без рангов: мертв ли ​​Линней?" (PDF) , Biological Reviews , 75 (4): 633–648, CiteSeerX  10.1.1.573.4518 , doi : 10.1111 / j.1469-185X.2000.tb00055.x , PMID  11117201 , S2CID  17851383 , заархивировано из исходного ( PDF) 9 августа 2017 г. , дата обращения 2 октября 2011 г.
  • Бентон, MJ (2004), Палеонтология позвоночных (3-е изд.), Oxford: Blackwell Science, ISBN 978-0-632-05637-8
  • Бринкман, Фиона С.Л. и Лейпе, Детлеф Д. (2001), «Филогенетический анализ» (PDF) , у Баксеваниса, Андреаса Д. и Уэллетта, Б.Ф. Фрэнсиса (ред.), Биоинформатика: практическое руководство по анализу генов и белков. (2-е изд.), Стр. 323–358, архивировано из оригинального (PDF) 20 октября 2013 г. , извлечено 19 октября 2013 г.
  • Каин, AJ; Харрисон, Джорджия (1960), «Филетическое взвешивание», Труды Лондонского зоологического общества , 35 : 1–31.
  • Куэно, Люсьен (1940), "Remarques sur un essai d'arbre généalogique du règne animal", Comptes Rendus de l'Académie des Sciences de Paris , 210 : 23–27.Доступно бесплатно в Интернете на сайте Gallica (без прямого URL-адреса). Это статья, которую Хенниг в 1979 г. назвал первым использованием термина «клады».
  • Дюпюи, Клод (1984), «Влияние Вилли Хеннига на таксономическое мышление», Ежегодный обзор экологии и систематики , 15 : 1–24, DOI : 10.1146 / annurev.ecolsys.15.1.1 , ISSN  0066-4162 .
  • Фаррис, Джеймс С. (1977), «О фенетическом подходе к классификации позвоночных», в Hecht, MK; Гуди, ПК; Hecht, BM (eds.), Major Patterns in Vertebrate Evolution , Plenum, New York, pp. 823–850.
  • Фэррис, Джеймс С. (1979а), "О естественности филогенетической классификации", Систематическая Зоология , 28 (2): 200-214, DOI : 10,2307 / 2412523 , JSTOR  2412523
  • Фэррис, Джеймс С. (1979b), "Информационное содержание филогенетической системы", Систематическая Зоология , 28 (4): 483-519, DOI : 10,2307 / 2412562 , JSTOR  2412562
  • Фэррис, Джеймс С. (1980), "Эффективные диагнозы филогенетической системы", Систематическая Зоология , 29 (4): 386-401, DOI : 10,2307 / 2992344 , JSTOR  2992344
  • Фаррис, Джеймс С. (1983), «Логическая основа филогенетического анализа», в Platnick, Norman I; Функ, Вики А. (ред.), Достижения в кладистике, т. 2 , Columbia University Press, Нью-Йорк, стр. 7–36.
  • Fraix-Burnet, D .; Choler, P .; Дузери, EJP; Verhamme, A. (2006), «Астрокладистика: филогенетический анализ эволюции галактик II. Формирование и диверсификация галактик», Journal of Classification , 23 (1): 57–78, arXiv : astro-ph / 0602580 , Bibcode : 2006JClas ..23 ... 57F , DOI : 10.1007 / s00357-006-0004-4 , S2CID  2537194
  • Хенниг, Вилли (1966), Филогенетическая систематика (тр. Д. Дуайт Дэвис и Райнер Зангерл) , Урбана, Иллинойс: Univ. из Illinois Press (перепечатано в 1979 и 1999 гг.), ISBN 978-0-252-06814-0
  • Хенниг, Вилли (1975), " " кладистический анализ или Кладистические классификации?: Ответ на Эрнст Майра" (PDF) , Systematic зоологии , 24 (2): 244-256, DOI : 10,2307 / 2412765 , JSTOR  2412765 ,в ответ на Mayr 1974 .
  • Хенниг, Вилли (1999), Филогенетическая систематика (3-е издание книги 1966 года) , Урбана: University of Illinois Press, ISBN 978-0-252-06814-0 Переведено с рукописи на немецком языке, опубликованной в 1982 г. (Phylogenetische Systematik, Verlag Paul Parey, Берлин).
  • Халл, Дэвид (1988), Наука как процесс , University of Chicago Press, ISBN 978-0-226-36051-5
  • Джеймс, Фрэнсис К. и Портлесс IV, Джон А. (2009), Кладистика и происхождение птиц: обзор и два новых анализа (PDF) , Орнитологические монографии, № 66, Американский союз орнитологов, ISBN 978-0-943610-85-6, получено 14 декабря 2010 г.
  • д'Юи, Жюльен (2012a). "Un ours dans les étoiles: recherche phylogénétique sur un mythe prehistorique" . Préhistoire du Sud-Ouest . 20 (1): 91–106.
  • д'Юи, Жюльен (2012b), «Le motif de Pygmalion: origine afrasienne et diffusion en Afrique». Сахара , 23: 49-59 [1] .
  • д'Юи, Жюльен (2013a), «Полифем (Aa. Th. 1137)». «Филогенетическая реконструкция доисторической сказки». Nouvelle Mythologie Comparée / New Comparative Mythology 1, [2]
  • д'Юи, Жюльен (2013b). «Филогенетический подход к мифологии и его археологические последствия» . Исследования наскального искусства . 30 (1): 115–118.
  • д'Юи, Жюльен (2013c) "Les mythes évolueraient par ponctuations". Mythologie française , 252, 2013c: 8-12. [3]
  • д'Юи, Жюльен (2013d) «Космическая охота в берберском небе: филогенетическая реконструкция палеолитической мифологии». Les Cahiers de l'AARS , 15, 2013d: 93-106. [4]
  • Джерисон, Гарри Дж. (2003), «Теория сравнительной психологии», в Штернберге, Роберт Дж .; Кауфман, Джеймс К. (ред.), Эволюция интеллекта , Махва, Нью-Джерси: Lawrence Erlbaum Associates, Inc., ISBN 978-0-12-385250-2
  • Лаурин М. и Андерсон Дж. (2004), «Значение имени Тетрапода в научной литературе: обмен» (PDF) , Систематическая биология , 53 (1): 68–80, DOI : 10.1080 / 10635150490264716 , PMID  14965901
  • Липо, Карл; О'Брайен, Майкл Дж .; Коллард, Марк; и др., ред. (2006), Отображение наших предков: филогенетические подходы в антропологии и предыстории , Piscataway: Transaction Publishers, ISBN 978-0-202-30751-0
  • Маас, Филипп (2010–2011), Юрген, Ханнедер; Маас, Филипп (ред.), «Компьютерная стемматика - Пример пятидесяти двух текстовых версий Carakasasahitā Vimānasthāna 8.67-157», Wiener Zeitschrift für die Kunde Südasiens , 52–53: 63–120, doi : 10.1553- / wzks2009- / wzks 2010-е63
  • Мейс, Рут; Клэр, Клэр Дж .; Шеннан, Стивен, ред. (2005), Эволюция культурного разнообразия: филогенетический подход , Портленд: Кавендиш Пресс, ISBN 978-1-84472-099-6
  • Майр, Эрнст (1974), "Кладистический анализ или кладистическая классификация?" (PDF) , Zeitschrift für Zoologische Systematik und Evolutionsforschung , 12 : 94–128, DOI : 10.1111 / j.1439-0469.1974.tb00160.x
  • Майр, Эрнст (1976), Эволюция и разнообразие жизни (Избранные очерки) , Кембридж, Массачусетс: Издательство Гарвардского университета, ISBN 978-0-674-27105-0Переиздан в 1997 году в мягкой обложке. Включает перепечатку антикладистической статьи Майра 1974 года на стр. 433–476, «Кладистический анализ или кладистическая классификация». Это статья, на которую Хенниг 1975 является ответом.
  • Mayr, Ernst (1978), "Происхождение и история некоторых терминов в систематической и эволюционной биологии", Систематическая Зоология , 27 (1): 83-88, DOI : 10,2307 / 2412818 , JSTOR  2412818 .
  • Майр, Эрнст (1982), Рост биологической мысли: разнообразие, эволюция и наследование , Кембридж, Массачусетс: Издательство Гарвардского университета, ISBN 978-0-674-36446-2
  • Оппенгеймер, Стивен (2006), Истоки британцев , Лондон: Робинсон, ISBN 978-0-7867-1890-0
  • Паттерсон, Колин (1982), «Морфологические признаки и гомология», Джойси, Кеннет А; Пятница, AE (ред.), Проблемы филогенетической реконструкции , Специальный том 21 Ассоциации систематики, Лондон: Academic Press, ISBN 978-0-12-391250-3.
  • Паттерсона, Колин (1988), "гомология в классической и молекулярной биологии", молекулярная биология и эволюция , 5 (6): 603-625, DOI : 10,1093 / oxfordjournals.molbev.a040523 , PMID  3065587
  • де Пина, МГГ (1991), " Основные понятия и испытание гомологии в кладистической парадигме" (PDF) , кладистика , 7 (4): 367-394, CiteSeerX  10.1.1.487.2259 , DOI : 10.1111 / j.1096-0031.1991 .tb00045.x , S2CID  3551391 , заархивировано из оригинала (PDF) 22 июля 2011 г. , получено 24 октября 2017 г.
  • де Кейруш, К. & Готье, J. (1992), "филогенетического систематики" (PDF) , Ежегодный обзор экологии и систематики , 23 : 449-480, DOI : 10,1146 / annurev.ecolsys.23.1.449 , архивируются с оригинал (PDF) от 20 марта 2012 г. , дата обращения 28 июля 2012 г.
  • Робинсон, Питер М.В. и О'Хара, Роберт Дж. (1996), «Кладистический анализ древнескандинавской рукописной традиции» , Research in Humanities Computing , 4 : 115–137 , получено 13 декабря 2010 г.
  • Росс, Роберт М .; Гринхилл, Саймон Дж .; Аткинсон, Квентин Д. (2013). «Состав населения и культурная география сказки в Европе» . Труды Королевского общества B: биологические науки . 280 (1756): 20123065. DOI : 10.1098 / rspb.2012.3065 . PMC  3574383 . PMID  23390109 .
  • Шух, Рэндалл Т. и Брауэр, Эндрю В.З. (2009), Биологическая систематика: принципы и приложения (2-е изд.), Cornell University Press, ISBN 978-0-8014-4799-0
  • Тейлор, Майк (2003), Что означают такие термины, как монофилетический, парафилетический и полифилетический? , получено 13 декабря 2010 г.
  • Тегерани, Джамшид Дж., 2013, «Филогения Красной Шапочки», PLOS ONE , 13 ноября. [5]
  • Трамбле, Фредерик (2013), "Николаи Хартманн и Метафизический Фонд филогенетической систематики" , биологическая теория , 7 (1): 56-68, DOI : 10.1007 / s13752-012-0077-8 , S2CID  84932063
  • Weygoldt, P. (февраль 1998), "Эволюция и систематика Хелицерового", экспериментальная и прикладная акарология , 22 (2): 63-79, DOI : 10,1023 / A: 1006037525704 , S2CID  35595726
  • Уиллер, Квентин (2000), Видовые концепции и филогенетическая теория: дебаты , Columbia University Press, ISBN 978-0-231-10143-1
  • Wiley, EO; Siegel-Causey, D .; Брукс, Д. Р. и Функ, В. А. (1991), «Глава 1 Введение, термины и концепции», The Compleat Cladist: A Primer of Phylogenetic Procedure (PDF) , Музей естественной истории Канзасского университета, ISBN 978-0-89338-035-9, получено 13 декабря 2010 г.
  • Williams, PA (1992), "Путаница в cladism", синтезированное , 01 (1-2): 135-152, DOI : 10.1007 / BF00484973 , S2CID  46974048

Внешние ссылки [ править ]

Послушайте эту статью ( 13 минут )
Разговорный значок Википедии
Этот аудиофайл был создан на основе редакции этой статьи от 30 апреля 2005 г. и не отражает последующих правок. ( 2005-04-30 )
( Аудио справка  · Больше устных статей )
  • СМИ, связанные с кладистикой, на Викискладе?
  • OneZoom: Tree of Life - все живые виды в виде интуитивно понятного и масштабируемого исследователя фракталов (адаптивный дизайн)
  • Общество Вилли Хеннига
  • Кладистика (научный журнал Общества Вилли Хеннига)
  • Коллинз, Аллен Дж .; Гуралник, Роб; Смит, Дэйв (1994–2005). «Путешествие в филогенетическую систематику» . Музей палеонтологии Калифорнийского университета . Проверено 21 января 2010 года .
  • Фельзенштейн, Джо. «Филогенетические программы» . Сиэтл: Вашингтонский университет . Проверено 21 января 2010 года .
  • О'Нил, Деннис (1998–2008). «Классификация живых существ» . Сан-Маркос, Калифорния: Паломарский колледж . Проверено 21 января 2010 года .
  • Робинсон, Питер; О'Хара, Роберт Дж. (1992). "Отчет о вызове текстовой критики 1991" . rjohara.net . Проверено 21 января 2010 года .
  • Теобальд, Дуглас (1999–2004). «Учебник по филогенетике» . Архив TalkOrigins . Проверено 21 января 2010 года .