Компьютерная микроскопия
Вычислительная микроскопия — это область вычислительной визуализации , которая сочетает в себе алгоритмическую реконструкцию с зондированием для захвата микроскопических изображений объектов. [1] [2] Алгоритмы, используемые в вычислительной микроскопии, часто объединяют информацию нескольких изображений, снятых с использованием различных источников освещения или измерений, для формирования агрегированного 2D- или 3D-изображения с использованием итерационных методов или машинного обучения. [3] [4] Известные формы компьютерной микроскопии включают флуоресцентную микроскопию сверхвысокого разрешения , количественную фазовую визуализацию и птихографию Фурье . [5] [6] [7] [8] [9]Вычислительная микроскопия находится на стыке информатики и оптики . [10] [11] [12]
использованная литература
- ^ Икома, Хаято. «Вычислительная микроскопия для анализа образцов». Кандидатская диссертация, Массачусетский технологический институт, 2014 г.
- ^ де Хаан, Кевин, Яир Ривенсон, Ичен Ву и Айдоган Озджан. «Реконструкция и улучшение изображений на основе глубокого обучения в оптической микроскопии». Труды IEEE 108, нет. 1 (2019): 30-50.
- ^ Уоллер, Лаура и Лей Тиан. «Вычислительная визуализация: машинное обучение для 3D-микроскопии». Природа 523.7561 (2015): 416-417.
- ^ Йе, Ли-Хао, Шветадвип Чоудхури, Николь А. Репина и Лора Уоллер. «Спекл-структурированное освещение для трехмерной фазовой и флуоресцентной вычислительной микроскопии». Биомедицинская оптика экспресс 10, вып. 7 (2019): 3635-3653.
- ^ Маклеод, Юан и Айдоган Озкан. «Нетрадиционные методы визуализации: вычислительная микроскопия и компактные реализации». Отчеты о прогрессе в физике 79, вып. 7 (2016): 076001.
- ^ Хорстмейер, Рорк. Вычислительная микроскопия: Превращение мегапикселей в гигапиксели. 2016.
- ^ Фам, Мин. «Новые алгоритмы в вычислительной микроскопии». Кандидатская диссертация, Калифорнийский университет в Лос-Анджелесе, 2020 г.
- ↑ Чен, Клэр Лифан , Ата Махджубфар, Ли-Чиа Тай, Ян К. Блаби, Аллен Хуанг, Кайван Реза Ниази и Бахрам Джалали. «Глубокое обучение в классификации клеток без меток». Научные отчеты 6 (2016): 21471.
- ^ Юань, Шуай и Крисант Преза. «Разработка функции рассеяния точки для уменьшения влияния сферической аберрации на трехмерную компьютерную флуоресцентную микроскопию». Оптика Экспресс 19, вып. 23 (2011): 23298-23314.
- ^ Холлманн, Джозеф Л., Эндрю К. Данн и Чарльз А. ДиМарцио. «Вычислительная микроскопия в визуализации эмбрионов». Оптика Письма 29, вып. 19 (2004): 2267-2269.
- ^ Эггелинг, Кристиан и Альф Хонигманн. «Сокращение разрыва: подход оптической и компьютерной микроскопии к раскрытию организации биомембран». Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Biomembranes 1858, no. 10 (2016): 2558-2568.
- ↑ Гринбаум, Алон, Ибо Чжан, Альборз Фейзи, Пинг-Луэн Чанг, Вэй Луо, Шивани Р. Кандукури и Айдоган Озджан. «Компьютерная визуализация патологий с широким полем зрения с использованием встроенной микроскопии без линз». Наука трансляционная медицина 6, вып. 267 (2014): 267ra175-267ra175.
