Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
EGLN3
Идентификаторы
ПсевдонимыEGLN3 , HIFP4H3, HIFPH3, PHD3, фактор, индуцируемый гипоксией семейства egl-9 3
Внешние идентификаторыOMIM : 606426 MGI : 1932288 HomoloGene : 32531 GeneCards : EGLN3
Расположение гена ( человек )
Хромосома 14 (человек)
Chr.Хромосома 14 (человека) [1]
Хромосома 14 (человек)
Геномное расположение EGLN3
Геномное расположение EGLN3
Группа14q13.1Начинать33 924 227 п.н. [1]
Конец34 462 774 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 12 (мышь)
Chr.Хромосома 12 (мышь) [2]
Хромосома 12 (мышь)
Геномное расположение EGLN3
Геномное расположение EGLN3
Группа12 | 12 C1Начинать54 178 981 п.н. [2]
Конец54 203 860 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE EGLN3 219232 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• оксидоредуктазная активность, действующая на парных доноров, с включением или восстановлением молекулярного кислорода, 2-оксоглутарата в качестве одного донора и включения по одному атому кислорода в оба донора
• связывание ионов железа
• связывание L-аскорбиновой кислоты
• активность диоксигеназы
• металл связывание ионов
• связывание с белками GO: 0001948
• активность оксидоредуктазы, действующая на парных доноров, с включением или восстановлением молекулярного кислорода
• активность оксидоредуктазы
• активность пептидил-пролин-4-диоксигеназы
Сотовый компонент• нуклеоплазма
• ядро клетки
• цитоплазма
• цитозоль
Биологический процесс• ответ на гипоксию
• регуляция процесса апоптоза нейронов
• гидроксилирование пептидил-пролина до 4-гидрокси-L-пролина
• клеточный ответ на стимул повреждения ДНК
• регуляция пролиферации клеток
• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на гипоксию
• активация активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе
• окислительно-восстановительный процесс
• гидроксилирование белка
• апоптотический процесс
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

112399

112407

Ансамбль

ENSG00000129521

ENSMUSG00000035105

UniProt

Q9H6Z9

Q91UZ4

RefSeq (мРНК)

NM_001308103
NM_022073

NM_028133

RefSeq (белок)

NP_001295032
NP_071356

NP_082409

Расположение (UCSC)Chr 14: 33.92 - 34.46 МбChr 12: 54,18 - 54,2 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Egl девять гомолог 3 представляет собой белок , который у человека кодируется EGLN3 гена . [5] ELGN3 является членом суперсемейства альфа-кетоглутарат-зависимых гидроксилаз , которые являются негемными железосодержащими белками.

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000129521 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035105 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ «Энтрез Ген: EGLN3 egl 9 гомолог 3 (C. elegans)» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Семенза Г.Л. (октябрь 2001 г.). «HIF-1, O (2) и 3 PHD: как клетки животных сигнализируют ядру о гипоксии». Cell . 107 (1): 1–3. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (01) 00518-9 . PMID  11595178 .
  • Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Тейлор М.С. (сентябрь 2001 г.). «Характеристика и сравнительный анализ семейства генов EGLN». Джин . 275 (1): 125–32. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (01) 00633-3 . PMID  11574160 .
  • Эпштейн А.С., Глидл Дж.М., Макнил Л.А., Хьюитсон К.С., О'Рурк Дж., Мол Д.Р., Мукхерджи М., Метцен Е., Уилсон М.И., Дханда А., Тиан Ю.М., Массон Н., Гамильтон Д.Л., Яаккола П., Барстед Р., Ходжкин Дж. Максвелл PH, Пью CW, Скофилд CJ, Рэтклифф PJ (октябрь 2001 г.). «C. elegans EGL-9 и гомологи млекопитающих определяют семейство диоксигеназ, которые регулируют HIF путем пролилгидроксилирования». Cell . 107 (1): 43–54. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (01) 00507-4 . PMID  11595184 .
  • Bruick RK, McKnight SL (ноябрь 2001 г.). «Консервативное семейство пролил-4-гидроксилаз, модифицирующих HIF». Наука . 294 (5545): 1337–40. DOI : 10.1126 / science.1066373 . PMID  11598268 .
  • Oehme F, Ellinghaus P, Kolkhof P, Smith TJ, Ramakrishnan S, Hütter J, Schramm M, Flamme I (август 2002 г.). «Сверхэкспрессия PH-4, новой предполагаемой пролин-4-гидроксилазы, модулирует активность факторов транскрипции, индуцируемых гипоксией». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 296 (2): 343–9. DOI : 10.1016 / S0006-291X (02) 00862-8 . PMID  12163023 .
  • Метцен Э., Берхнер-Пфанншмидт Ю., Стенгель П., Марксен Дж. Х., Штольце И., Клингер М., Хуанг В. К., Вотцлав С., Хелльвиг-Бюргель Т., Йелкманн В., Аккер Н., Фандри Дж. (Апрель 2003 г.). «Внутриклеточная локализация альфа-гидроксилаз HIF-1 человека: последствия для восприятия кислорода» . Журнал клеточной науки . 116 (Pt 7): 1319–26. DOI : 10,1242 / jcs.00318 . PMID  12615973 .
  • Cioffi CL, Liu XQ, Kosinski PA, Garay M, Bowen BR (апрель 2003 г.). «Дифференциальная регуляция генов HIF-1 альфа-пролил-4-гидроксилазы путем гипоксии в сердечно-сосудистых клетках человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 303 (3): 947–53. DOI : 10.1016 / S0006-291X (03) 00453-4 . PMID  12670503 .
  • Апреликова О., Чандрамули Г.В., Вуд М., Васселли Дж. Р., Рис Дж., Маранчи Дж. К., Линехан В. М., Барретт Дж. К. (июнь 2004 г.). «Регулирование пролилгидроксилаз HIF с помощью факторов, индуцируемых гипоксией» . Журнал клеточной биохимии . 92 (3): 491–501. DOI : 10.1002 / jcb.20067 . PMID  15156561 .
  • Аппельхофф Р.Дж., Тиан Ю.М., Раваль Р.Р., Терли Х., Харрис А.Л., Пью К.В., Рэтклифф П.Дж., Глидл Дж.М. (сентябрь 2004 г.). «Дифференциальная функция пролилгидроксилаз PHD1, PHD2 и PHD3 в регуляции фактора, индуцируемого гипоксией» . Журнал биологической химии . 279 (37): 38458–65. DOI : 10.1074 / jbc.M406026200 . PMID  15247232 .
  • Masson N, Appelhoff RJ, Tuckerman JR, Tian YM, Demol H, Puype M, Vandekerckhove J, Ratcliffe PJ, Pugh CW (июль 2004 г.). «Пролилгидроксилаза PHD3 HIF является потенциальным субстратом шаперонина TRiC» . Письма FEBS . 570 (1–3): 166–70. DOI : 10.1016 / j.febslet.2004.06.040 . PMID  15251459 .
  • Бэк Дж. Х., Махон П. К., О Дж., Келли Б., Кришнамачари Б., Пирсон М., Чан Д. А., Джачча А. Дж., Семенца Г. Л. (февраль 2005 г.). «OS-9 взаимодействует с индуцируемым гипоксией фактором 1альфа и пролилгидроксилазами, способствуя кислородзависимому разложению HIF-1альфа». Молекулярная клетка . 17 (4): 503–12. DOI : 10.1016 / j.molcel.2005.01.011 . PMID  15721254 .
  • Ли С., Накамура Э., Ян Х., Вей В., Лингги М.С., Саджан М.П., ​​Фарезе Р.В., Фриман Р.С., Картер Б.Д., Келин В.Г., Шлисио С. (август 2005 г.). «Апоптоз нейронов, связанный с пролилгидроксилазой EglN3 и генами семейной феохромоцитомы: отбор и рак». Раковая клетка . 8 (2): 155–67. DOI : 10.1016 / j.ccr.2005.06.015 . PMID  16098468 .
  • Хопфер У., Хопфер Х, Яблонски К., Шталь Р.А., Вольф Г (март 2006 г.). «Новый белок Morg1 с WD-повторами действует как молекулярный каркас для индуцируемого гипоксией фактора пролилгидроксилазы 3 (PHD3)» . Журнал биологической химии . 281 (13): 8645–55. DOI : 10.1074 / jbc.M513751200 . PMID  16407229 .
  • Накаяма К., Газдою С., Абрахам Р., Пан З. К., Ронаи З. (январь 2007 г.). «Гипоксия-индуцированная сборка пролилгидроксилазы PHD3 в комплексы: последствия для ее активности и восприимчивости к деградации под действием лигазы E3 Siah2» . Биохимический журнал . 401 (1): 217–26. DOI : 10.1042 / BJ20061135 . PMC  1698661 . PMID  16958618 .


  • v
  • т
  • е