Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
EWSR1
Белок EWSR1 PDB 2cpe.png
Доступные конструкции
PDBПоиск человеческого UniProt: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

2CPE

Идентификаторы
ПсевдонимыEWSR1 , EWS, bK984G1.4, EWS-FLI1, область 1 точки останова при саркоме Юинга, белок 1, связывающий РНК EWS
Внешние идентификаторыOMIM : 133450 HomoloGene : 136069 GeneCards : EWSR1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 22 (человек)
Chr.Хромосома 22 (человека) [1]
Хромосома 22 (человек)
Геномное расположение EWSR1
Геномное расположение EWSR1
Группа22q12.2Начинать29 268 009 п.н. [1]
Конец29 300 525 п.н. [1]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE EWSR1 210012 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывание с ионами металлов
• связывание с белком GO: 0001948
• связывание с кальмодулином
• идентичное связывание с белками
• связывание с нуклеиновой кислотой
• связывание с РНК
Сотовый компонент• цитоплазма
• клеточная мембрана
• ядрышко
• мембрана
• ядро клетки
Биологический процесс• регулирование транскрипции, ДНК-шаблон
• Транскрипция, ДНК-шаблон
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

2130

н / д

Ансамбль

ENSG00000182944

н / д

UniProt

Q01844

н / д

RefSeq (мРНК)

NM_001163285
NM_001163286
NM_001163287
NM_005243
NM_013986

н / д

RefSeq (белок)

NP_001156757
NP_001156758
NP_001156759
NP_005234
NP_053733

н / д

Расположение (UCSC)Chr 22: 29.27 - 29.3 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

РНК-связывающий белок EWS представляет собой белок , который у человека кодируется EWSR1 гена человеческой хромосомы 22 , в частности , 22q12.2. [3] [4] Эта область хромосомы 22 кодирует N-концевой домен трансактивации белка EWS, и эта область может присоединиться к одной из нескольких других хромосом, которые кодируют различные факторы транскрипции, см. [5] Экспрессия химерного белка с доменом трансактивации EWS, слитым с ДНК-связывающей областью фактора транскрипции, генерирует мощный онкогенный белок, вызывающий саркому Юинга и других членов семейства опухолей Юинга. Эти транслокации могут происходить из-за хромоплексии , всплеска сложных хромосомных перестроек, наблюдаемых в раковых клетках. [6] Нормальный ген EWS кодирует РНК-связывающий белок, тесно связанный с FUS (геном) и TAF15 , все из которых связаны с боковым амиотрофическим склерозом . [7]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что белок EWS взаимодействует с:

  • ATF1 , [8]
  • BARD1 , [9]
  • ERG , [10]
  • POU4F1 , [11]
  • PTK2B [12]
  • SF1 , [13]
  • SNRPC , [14] и
  • ZNF165 . [15]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000182944 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ Делаттр О, Zucman Дж, Plougastel В, Desmaze С, Т Мелот, Питер М, Ковар Н, Жубер Я, де - Jong P, Rouleau G (октябрь 1992 г.). «Слияние генов с ДНК-связывающим доменом ETS, вызванное транслокацией хромосом в опухолях человека». Природа . 359 (6391): 162–5. Bibcode : 1992Natur.359..162D . DOI : 10.1038 / 359162a0 . PMID 1522903 . 
  4. ^ "Энтрез Ген: EWSR1 область точки останова саркомы Юинга 1" .
  5. ^ "Гены слияния семейства EWS - OMIM" .
  6. ^ Андерсон Д., де Борха R, Young MD, Fuligni F, Rosic А, Робертс Н.Д., Hajjar S, M, Layeghifard Novokmet A, Kowalski PE, Anaka M (август 2018 года). «Всплески реаранжировки генерируют канонические слияния генов в опухолях костей и мягких тканей» . Наука . 361 (6405): eaam8419. DOI : 10.1126 / science.aam8419 . PMC 6176908 . PMID 30166462 .  
  7. ^ Couthouis Дж, Харт МП, Эрион R, король О.Д., Диас Z, Накайя Т Ибрагим Р, Ким HJ, Mojsilovic-Петрович Дж, Паносян S, Ким CE, Фракельтон EC, Сольски JA, Williams KL, Клей-Фалькон Д, Элман Л., Маккласки Л., Грин Р., Хаконарсон Х., Калб Р.Г., Ли В.М., Трояновски Дж.К., Николсон Г.А., Блэр И.П., Бонини Н.М., Ван Дирлин В.М., Мурелатос З., Шортер Дж., Гитлер А.Д. (2012). «Оценка роли связанного с FUS / TLS гена EWSR1 в боковом амиотрофическом склерозе» . Гм. Мол. Genet . 21 (13): 2899–911. DOI : 10,1093 / HMG / dds116 . PMC 3373238 . PMID 22454397 .  
  8. ↑ Fujimura Y, Ohno T, Siddique H, Lee L, Rao VN, Reddy ES (январь 1996 г.). «Ген EWS-ATF-1, участвующий в злокачественной меланоме мягких частей тела с транслокацией t (12; 22) хромосомы, кодирует конститутивный активатор транскрипции». Онкоген . 12 (1): 159–67. PMID 8552387 . 
  9. ^ Spahn л, Петерман R, Siligan С, Schmid JA, Aryee Д.Н., Ковар Н (август 2002 г.). «Взаимодействие NH2-конца EWS с BARD1 связывает ген саркомы Юинга с общим путем подавления опухоли». Cancer Res . 62 (16): 4583–7. PMID 12183411 . 
  10. ^ Оно Т, М Ouchida, Ли L, Z Gatalica, Рао В.Н., Редди Е.С. (октябрь 1994 г.). «Ген EWS, связанный с опухолями семейства Юинга, злокачественной меланомой мягких частей тела и десмопластическими мелкоклеточными опухолями, кодирует РНК-связывающий белок с новыми регуляторными доменами». Онкоген . 9 (10): 3087–97. PMID 8084618 . 
  11. ^ Томас GR, Latchman DS (2002). «Проонкопротеин EWS (белок саркомы Юинга) взаимодействует с фактором транскрипции Brn-3a POU и подавляет его способность активировать транскрипцию» . Cancer Biol. Ther . 1 (4): 428–32. DOI : 10,4161 / cbt.1.4.23 . PMID 12432261 . 
  12. ^ Felsch JS, Lane WS, Перальта EG (май 1999). «Тирозинкиназа Pyk2 опосредует регуляцию рецептора, связанного с G-белком, РНК-связывающего белка EWS саркомы Юинга». Curr. Биол . 9 (9): 485–8. DOI : 10.1016 / s0960-9822 (99) 80214-0 . PMID 10322114 . 
  13. ↑ Zhang D, Paley AJ, Childs G (июль 1998 г.). «Репрессор транскрипции ZFM1 взаимодействует с EWS и модулирует его способность активировать транскрипцию» . J. Biol. Chem . 273 (29): 18086–91. DOI : 10.1074 / jbc.273.29.18086 . PMID 9660765 . 
  14. ^ Кноп LL, Baker SJ (август 2000). «Фактор сплайсинга U1C подавляет трансактивацию, опосредованную EWS / FLI» . J. Biol. Chem . 275 (32): 24865–71. DOI : 10.1074 / jbc.M001661200 . PMID 10827180 . 
  15. ^ Руала ДФ, Венкатесан К, Хао Т, Hirozane-Kishikawa Т, Dricot А, Ли Н, Беррис Г.Ф., Джиббонс ФО, Дрезе М, Ayivi-Guedehoussou Н, Klitgord Н, Саймон С, Boxem М, Мильштейн S, Розенберг J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S , Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети белок-белкового взаимодействия человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID 16189514 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Оно Т, Рао В.Н., Редди Э.С. (декабрь 1993 г.). «Химерный белок EWS / Fli-1 является активатором транскрипции». Cancer Res . 53 (24): 5859–63. PMID  7503813 .
  • Оучида М., Оно Т., Фудзимура Ю., Рао В. Н., Редди Е. С. (сентябрь 1995 г.). «Потеря онкогенности клеток саркомы Юинга, экспрессирующих антисмысловую РНК к транскриптам слияния EWS». Онкоген . 11 (6): 1049–54. PMID  7566963 .
  • Бан Дж., Силиган С., Креппель М., Арье Д., Ковар Х. (2007). EWS-FLI1 при саркоме Юинга: реальные цели и сопутствующий ущерб . Adv. Exp. Med. Биол . Успехи экспериментальной медицины и биологии. 587 . С. 41–52. DOI : 10.1007 / 978-1-4020-5133-3_4 . ISBN 978-1-4020-4966-8. PMID  17163154 .
  • Мейстер HP (1976). «[Морфологические данные хронического запора в детстве]». Monatsschrift für Kinderheilkunde . 124 (5): 354–6. PMID  934118 .
  • Гатри GM, Verstraete A, Deines MM, Stern RM (1975). «Симптомы стресса в четырех обществах». Журнал социальной психологии . 95 (Вторая половина): 165–72. DOI : 10.1080 / 00224545.1975.9918699 . PMID  1127890 .
  • Бхагиратх Т., Абэ С., Нодзима Т., Йошида М.С. (1995). «Молекулярный анализ транслокационного соединения at (11; 22) в случае саркомы Юинга». Гены Хромосомы Рак . 13 (2): 126–32. DOI : 10.1002 / gcc.2870130209 . PMID  7542907 .
  • Оно Т., Оучида М., Ли Л., Гаталика З., Рао В. Н., Редди Е. С. (1994). «Ген EWS, связанный с опухолями семейства Юинга, злокачественной меланомой мягких частей тела и десмопластическими мелкоклеточными опухолями, кодирует РНК-связывающий белок с новыми регуляторными доменами». Онкоген . 9 (10): 3087–97. PMID  8084618 .
  • Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Plougastel B, Zucman J, Peter M, Thomas G, Delattre O (1994). «Геномная структура гена EWS и его связь с EWSR1, участком транслокации хромосомы, связанной с опухолью». Геномика . 18 (3): 609–15. DOI : 10.1016 / S0888-7543 (05) 80363-5 . PMID  8307570 .
  • Zucman J, Delattre O, Desmaze C, Epstein AL, Stenman G, Speleman F, Fletchers CD, Aurias A, Thomas G (1993). «Слияние генов EWS и ATF-1, вызванное транслокацией t (12; 22) в злокачественной меланоме мягких частей тела». Nat. Genet . 4 (4): 341–5. DOI : 10.1038 / ng0893-341 . PMID  8401579 .
  • Броди С.Г., Стокер С.Дж., Вардлоу Дж.С., Дункан М.Х., МакКоннелл Т.С., Феддерсен Р.М., Уильямс TM (1996). «Слияние генов EWS и WT-1 в десмопластической мелкоклеточной опухоли брюшной полости». Гм. Патол . 26 (12): 1370–4. DOI : 10.1016 / 0046-8177 (95) 90303-8 . PMID  8522311 .
  • Фудзимура Y, Оно Т, Сиддик Х, Ли Л., Рао В. Н., Редди Э. С. (1996). «Ген EWS-ATF-1, участвующий в злокачественной меланоме мягких частей тела с транслокацией t (12; 22) хромосомы, кодирует конститутивный активатор транскрипции». Онкоген . 12 (1): 159–67. PMID  8552387 .
  • Кларк Дж., Бенджамин Х., Гилл С., Сидхар С., Гудвин Дж., Экипаж Дж., Гастерсон Б.А., Шипли Дж., Купер С.С. (1996). «Слияние гена EWS с CHN, членом суперсемейства генов стероидных / тироидных рецепторов, в миксоидной хондросаркоме человека». Онкоген . 12 (2): 229–35. PMID  8570200 .
  • Magnaghi-Jaulin L, Masutani H, Robin P, Lipinski M, Harel-Bellan A (1996). «Элементы SRE являются сайтами связывания слитого белка EWS-FLI-1» . Nucleic Acids Res . 24 (6): 1052–8. DOI : 10.1093 / NAR / 24.6.1052 . PMC  145748 . PMID  8604338 .
  • Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов» . Genome Res . 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID  8889548 .
  • Аман П., Панагопулос И., Лассен С., Фьоретос Т., Менсингер М., Торессон Х., Хёглунд М., Форстер А., Рэббитс Т.Х., Рон Д., Мандаль Н., Мительман Ф. (1997). «Паттерны экспрессии человеческих сарком-ассоциированных генов FUS и EWS и геномная структура FUS». Геномика . 37 (1): 1–8. DOI : 10.1006 / geno.1996.0513 . PMID  8921363 .
  • Морохоши Ф., Араи К., Такахаши Э.И., Танигами А., Оки М. (1997). «Клонирование и картирование гена RBP56 человека, кодирующего предполагаемый РНК-связывающий белок, подобный белкам FUS / TLS и EWS». Геномика . 38 (1): 51–7. DOI : 10.1006 / geno.1996.0591 . PMID  8954779 .
  • Цукман-Росси Дж, Legoix P, Томас Дж. (1997). «Идентификация новых членов семейств Gas2 и Ras в области хромосомы 22q12». Геномика . 38 (3): 247–54. DOI : 10.1006 / geno.1996.0625 . PMID  8975699 .
  • Guinamard R, Fougereau M, Seckinger P (1997). «Домен SH3 тирозинкиназы Брутона взаимодействует с Vav, Sam68 и EWS» . Сканд. J. Immunol . 45 (6): 587–95. DOI : 10.1046 / j.1365-3083.1997.d01-447.x . PMID  9201297 .
  • Делульм Дж. К., Причард Л., Делаттр О., Storm DR (1997). «Проонкопротеин EWS связывает кальмодулин и фосфорилируется протеинкиназой С через домен IQ» . J. Biol. Chem . 272 (43): 27369–77. DOI : 10.1074 / jbc.272.43.27369 . PMID  9341188 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Область 1 точки останова при саркоме Юинга в Атласе генетики и онкологии