Из Википедии, свободной энциклопедии
  (Перенаправлено с FKBP12 )
Перейти к навигации Перейти к поиску
FKBP1A
Белок FKBP1A PDB 1a7x.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1A7X , 1B6C , 1BKF , 1BL4 , 1D6O , 1D7H , 1D7I , 1D7J , 1EYM , 1F40 , 1FAP , 1FKB , 1FKD , 1FKF , 1FKG , 1FKH , 1FKI , 1FKJ , 1FKR4 , 1SG4 , 1FKJ , 1FKR4 , 1SG4 , 1FKJ , 1FKR4 , 1SG4 , 1FKJ , 1FKR4 , 1SG4 , 1FKJ 1QPF , 1QPL, 2DG3 , 2DG4 , 2DG9 , 2FAP , 2FKE , 2PPN , 2PPO , 2PPP , 2RSE , 3FAP , 3H9R , 3MDY , 4DH0 , 4FAP , 4IPX , 4N19 , 4ODP , 4ODQ , 4ODR

Идентификаторы
ПсевдонимыFKBP1A , FKBP-12, FKBP-1A, FKBP1, FKBP12, PKC12, PKCI2, PPIASE, связывающий белок 1A FK506, пролилизомераза 1A FKBP
Внешние идентификаторыOMIM : 186945 MGI : 95541 HomoloGene : 105139 GeneCards : FKBP1A
Расположение гена ( человек )
Chr.Хромосома 20 (человека) [1]
Группа20p13Начинать1 368 977 п.н. [1]
Конец1 393 164 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Chr.Хромосома 2 (мышь) [2]
Группа2 | 2 G3Начинать151 542 483 п.н. [2]
Конец151 561 692 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК




Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• активность ингибитора кальциевых каналов
• активин связывания
• изомеразный активность
• макролид связывания
• пептидил-пролил - цис-транс - изомеразы активность
• Активность преобразователя сигнала
• GO: 0001948 связывание белка
• Smad связывания
• трансформирующий фактор роста бета связывания рецептора
• FK506 связывания
• связывания лекарственного средства
• фермент связывания
• Hsp70 связывания с белками
• Тип I трансформирующий фактор роста бета - рецептор связывания
• белок гомодимеризация активности
• ионного канала связывания
Сотовый компонент• цитоплазма
• терминальная цистерна
• диск Z
• внеклеточная экзосома
• внешний компонент мембраны органеллы
• цитоплазматическая сторона мембраны
• рианодиновый рецепторный комплекс
• цитозоль
• мембрана
• саркоплазматический ретикулум
• мембрана саркоплазматического ретикулума
• органелла, ограниченная внутриклеточной мембраной
• конец аксона
Биологический процесс• Сборка белкового комплекса SMAD
• образование амилоидных фибрилл
• регуляция сигнального пути рецептора активина
• созревание протеина путем сворачивания протеина
• регуляция катаболического процесса протеина- предшественника амилоида
• пептидил-пролилизомеризация протеина
• негативная регуляция активности рианодин-чувствительного канала высвобождения кальция
• регуляция локализации белка
• трансмембранный транспорт ионов кальция
• рефолдинг белка
• регуляция иммунного ответа
• положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB
• отрицательное регулирование выпуска поглощенных ионов кальция в цитозоле
• положительное регулирование связывания белка
• положительной регуляции белка убиквитинирования
• «De Novo» складывание белков
• трансформации сигнального фактора роста бета - рецептора пути
• Т - клеточной активации
• шаперона-опосредованной сворачивания белка
• супрамолекулярная волокна организация
• отрицательная регуляция активности фосфопротеинфосфатазы
• сворачивание протеина
• негативная регуляция фосфорилирования протеина
• морфогенез сердца
• сокращение мышц
• ответ на ион железа
• цитокин-опосредованный сигнальный путь
• ответ на кофеин
• пролиферация Т-клеток
• высвобождение секвестрированного иона кальция в цитозоль
• морфогенез ткани сердечной мышцы желудочка
• регуляция активности рианодин-чувствительных каналов высвобождения кальция
• образование сердечных трабекул
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

2280

14225

Ансамбль

ENSG00000088832

ENSMUSG00000032966

UniProt

P62942

P26883

RefSeq (мРНК)

NM_054014
NM_000801
NM_001199786

NM_001302077
NM_001302078
NM_001302079
NM_001302080
NM_008019

NM_001355077
NM_001355078

RefSeq (белок)

NP_000792
NP_001186715
NP_463460

NP_001289006
NP_001289007
NP_001289008
NP_001289009
NP_032045

NP_001342006
NP_001342007

Расположение (UCSC)Chr 20: 1.37 - 1.39 МбChr 2: 151,54 - 151,56 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Пептидил-пролил цис-транс - изомеразы FKBP1A представляет собой фермент , который у человека кодируется FKBP1A гена . [5]

Функция [ править ]

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков иммунофилинов , которые играют роль в иммунорегуляции и основных клеточных процессах, включая сворачивание и транспортировку белка. Этот кодируемый белок представляет собой цис-транс-пролилизомеразу, которая связывает иммунодепрессанты FK506 (такролимус) и рапамицин (сиролимус). Он взаимодействует с несколькими белками передачи внутриклеточного сигнала, включая рецептор TGF-бета I типа. Он также взаимодействует с множеством внутриклеточных каналов высвобождения кальция, включая тетрамерный рианодиновый рецептор скелетных мышц.. У мышей делеция этого гомологичного гена вызывает врожденное заболевание сердца, известное как несуплотнение миокарда левого желудочка. Имеются данные о множестве альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов для этого гена, но полноразмерная природа некоторых вариантов не установлена. [6]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что FKBP1A взаимодействует с:

  • GLMN , [7] [8]
  • ITPR1 [9] [10]
  • KIAA1303 , [11] [12]
  • Мишень рапамицина у млекопитающих , [11] [12] [13] [14] [15] [16]]
  • RYR1 , [17] [18] [19] и
  • Бета-рецептор TGF 1 . [20] [21]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000088832 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032966 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ DiLella AG (сентябрь 1991). «Хромосомная принадлежность гена иммунофилина человека FKBP-12». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 179 (3): 1427–33. DOI : 10.1016 / 0006-291X (91) 91732-R . PMID 1930186 . 
  6. ^ "Entrez Gene: FKBP1A FK506 связывающий белок 1A, 12 кДа" .
  7. ^ Chambraud В, Radanyi С, Camonis JH, Шазенд К, Rajkowski К, Baulieu ЭЭ (декабрь 1996). «FAP48, новый белок, который образует специфические комплексы с иммунофилинами FKBP59 и FKBP12. Профилактика с помощью иммунодепрессантов FK506 и рапамицина» . Журнал биологической химии . 271 (51): 32923–9. DOI : 10.1074 / jbc.271.51.32923 . PMID 8955134 . 
  8. ^ Нейе H (март 2001). «Мутация FKBP-ассоциированного белка 48 (FAP48) в пролине 219 нарушает взаимодействие с FKBP12 и FKBP52». Регуляторные пептиды . 97 (2–3): 147–52. DOI : 10.1016 / s0167-0115 (00) 00206-8 . PMID 11164950 . S2CID 20617551 .  
  9. Перейти ↑ MacMillan D, Currie S, Bradley KN, Muir TC, McCarron JG (декабрь 2005 г.). «В гладких мышцах FK506-связывающий белок модулирует вызванное рецептором IP3 высвобождение Ca2 + с помощью mTOR и кальциневрина» . Журнал клеточной науки . 118 (Pt 23): 5443–51. DOI : 10,1242 / jcs.02657 . PMID 16278292 . 
  10. ^ Cameron AM, Nucifora FC, Fung ET, Ливингстон DJ, Aldape RA, Ross CA, Snyder SH (октябрь 1997). «FKBP12 связывает инозитол-1,4,5-трифосфатный рецептор с лейцин-пролином (1400-1401) и прикрепляет кальциневрин к этому FK506-подобному домену» . Журнал биологической химии . 272 (44): 27582–8. DOI : 10.1074 / jbc.272.44.27582 . PMID 9346894 . 
  11. ^ a b Jacinto E, Loewith R, Schmidt A, Lin S, Rüegg MA, Hall A, Hall MN (ноябрь 2004 г.). «Комплекс TOR 2 млекопитающих контролирует актиновый цитоскелет и нечувствителен к рапамицину». Природа клеточной биологии . 6 (11): 1122–8. DOI : 10.1038 / ncb1183 . PMID 15467718 . S2CID 13831153 .  
  12. ^ a b Сарбасов Д.Д., Али С.М., Ким Д.Х., Гертин Д.А., Латек Р.Р., Эрдьюмент-Бромаж Х., Темпст П., Сабатини Д.М. (июль 2004 г.). «Rictor, новый связывающий партнер mTOR, определяет нечувствительный к рапамицину и независимый от хищников путь, регулирующий цитоскелет». Текущая биология . 14 (14): 1296–302. DOI : 10.1016 / j.cub.2004.06.054 . PMID 15268862 . S2CID 4658268 .  
  13. ↑ Choi J, Chen J, Schreiber SL, Clardy J (июль 1996 г.). «Структура комплекса FKBP12-рапамицин, взаимодействующего со связывающим доменом FRAP человека». Наука . 273 (5272): 239–42. DOI : 10.1126 / science.273.5272.239 . PMID 8662507 . S2CID 27706675 .  
  14. ^ Luker KE, Smith MC, Luker GD, Гаммон ST, Piwnica-Worms H, Piwnica-Worms D (август 2004). «Кинетика регулируемых белок-белковых взаимодействий, выявленная с помощью визуализации комплементации люциферазы светлячков в клетках и живых животных» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12288–93. DOI : 10.1073 / pnas.0404041101 . PMC 514471 . PMID 15284440 .  
  15. ^ Banaszynski Л.А., Лю CW, беспалочковой TJ (апрель 2005). «Характеристика тройного комплекса FKBP.rapamycin.FRB». Журнал Американского химического общества . 127 (13): 4715–21. DOI : 10.1021 / ja043277y . PMID 15796538 . 
  16. ^ Сабли CJ, Мартин М., Бруна GJ, Williams JM, Dumont FJ, Видеррехт G, Abraham RT (январь 1995). «Выделение белка-мишени комплекса FKBP12-рапамицин в клетках млекопитающих» . Журнал биологической химии . 270 (2): 815–22. DOI : 10.1074 / jbc.270.2.815 . PMID 7822316 . 
  17. Перейти ↑ Avila G, Lee EH, Perez CF, Allen PD, Dirksen RT (июнь 2003 г.). «Связывание FKBP12 с RyR1 модулирует сцепление возбуждения-сокращения в скелетных мышечных трубках мышей» . Журнал биологической химии . 278 (25): 22600–8. DOI : 10.1074 / jbc.M205866200 . PMID 12704193 . 
  18. ^ Bultynck G, De Smet Р, Росси D, G Callewaert, Missiaen л, Соррентино В, Де Smedt Н, Парис JB (март 2001). «Характеристика и картирование сайта связывания 12 кДа FK506-связывающего белка (FKBP12) на различных изоформах рианодинового рецептора и инозитол-1,4,5-трифосфатного рецептора» . Биохимический журнал . 354 (Pt 2): 413–22. DOI : 10.1042 / bj3540413 . PMC 1221670 . PMID 11171121 .  
  19. ^ Gaburjakova МЫ, Gaburjakova Дж, Reiken S, Хуанг F, Маркс ТАК, Rosemblit N, Marks АР (май 2001 г.). «Связывание FKBP12 модулирует закрытие канала рианодинового рецептора» . Журнал биологической химии . 276 (20): 16931–5. DOI : 10.1074 / jbc.M100856200 . PMID 11279144 . 
  20. ^ Ван Т, Донахоу ПК, Зервос А.С. (июль 1994). «Специфическое взаимодействие рецепторов типа I семейства TGF-бета с иммунофилином FKBP-12». Наука . 265 (5172): 674–6. DOI : 10.1126 / science.7518616 . PMID 7518616 . 
  21. ^ Лю Р, Р Вентура, Дуди J, J Массаге (июль 1995). «Человеческий рецептор типа II для костных морфогенных белков (BMP): расширение модели двухкиназного рецептора на BMP» . Молекулярная и клеточная биология . 15 (7): 3479–86. DOI : 10.1128 / mcb.15.7.3479 . PMC 230584 . PMID 7791754 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Schiene-Fischer C, Yu C. (апрель 2001 г.). «Рецепторные вспомогательные ферменты-помощники сворачивания: функциональная роль пептидилпролил цис / транс-изомераз» . Письма FEBS . 495 (1–2): 1–6. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (01) 02326-2 . PMID  11322937 . S2CID  42263861 .
  • Дилелла А.Г., Хокинс А., Крейг Р.Дж., Шрайбер С.Л., Гриффин, Калифорния (декабрь 1992 г.). «Присвоение хромосомных полос генов, кодирующих человеческие FKBP12 и FKBP13». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 189 (2): 819–23. DOI : 10.1016 / 0006-291X (92) 92276-4 . PMID  1281998 .
  • Jayaraman T, Brillantes AM, Timerman AP, Fleischer S, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Marks AR (май 1992 г.). «Связывающий белок FK506, связанный с каналом высвобождения кальция (рецептор рианодина)». Журнал биологической химии . 267 (14): 9474–7. PMID  1374404 .
  • Лепре Калифорния, Томсон Дж. А., Мур Дж. М. (май 1992 г.). «Структура решения FK506, связанного с FKBP-12» . Письма FEBS . 302 (1): 89–96. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (92) 80292-O . PMID  1375171 . S2CID  41469360 .
  • Маки Н., Сэкигучи Ф., Нисимаки Дж., Мива К., Хаяно Т., Такахаши Н., Судзуки М. (июль 1990 г.). «Комплементарная ДНК, кодирующая человеческий Т-клеточный FK506-связывающий белок, пептидилпролил цис-транс-изомеразу, отличную от циклофилина» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (14): 5440–3. DOI : 10.1073 / pnas.87.14.5440 . PMC  54340 . PMID  1695378 .
  • Standaert RF, Galat A, Verdine GL, Schreiber SL (август 1990 г.). «Молекулярное клонирование и сверхэкспрессия человеческого FK506-связывающего белка FKBP». Природа . 346 (6285): 671–4. DOI : 10.1038 / 346671a0 . PMID  1696686 . S2CID  4368221 .
  • Сикерка Дж., Видеррехт Дж., Грейлих Х., Бултон Д., Хунг С.Х., Крайан Дж., Ходжес П.Дж., Сигал Н.Х. (декабрь 1990 г.). «Цитозольный связывающий белок для иммунодепрессанта FK-506 представляет собой как повсеместную, так и высококонсервативную пептидил-пролил-цис-транс-изомеразу». Журнал биологической химии . 265 (34): 21011–5. PMID  1701173 .
  • Michnick SW, Rosen MK, Wandless TJ, Karplus M, Schreiber SL (май 1991 г.). «Структура раствора FKBP, фермента ротамазы и рецептора для FK506 и рапамицина». Наука . 252 (5007): 836–9. DOI : 10.1126 / science.1709301 . PMID  1709301 . S2CID  28289138 .
  • Van Duyne GD, Standaert RF, Karplus PA, Schreiber SL, Clardy J (май 1991 г.). «Атомная структура FKBP-FK506, комплекса иммунофилин-иммунодепрессант». Наука . 252 (5007): 839–42. DOI : 10.1126 / science.1709302 . PMID  1709302 . S2CID  32539611 .
  • Розен М.К., Михник С.В., Карплюс М., Шрайбер С.Л. (май 1991 г.). «Последовательное назначение протонов и азота и определение вторичной структуры человеческого FK506 и рапамицин-связывающего белка». Биохимия . 30 (19): 4774–89. CiteSeerX  10.1.1.559.2890 . DOI : 10.1021 / bi00233a020 . PMID  1709363 .
  • Джин Ю.Дж., Альберс М.В., Лейн В.С., Бирер Б.Э., Шрайбер С.Л., Буракофф С.Дж. (август 1991 г.). «Молекулярное клонирование ассоциированного с мембраной человеческого FK506- и рапамицин-связывающего белка, FKBP-13» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 88 (15): 6677–81. DOI : 10.1073 / pnas.88.15.6677 . PMC  52151 . PMID  1713687 .
  • DiLella AG, Craig RJ (сентябрь 1991 г.). «Экзонная организация человеческого гена FKBP-12: корреляция со структурными и функциональными доменами белка». Биохимия . 30 (35): 8512–7. DOI : 10.1021 / bi00099a002 . PMID  1716149 .
  • Harding MW, Galat A, Uehling DE, Schreiber SL (октябрь 1989 г.). «Рецептор иммунодепрессанта FK506 представляет собой цис-транс-пептидил-пролилизомеразу». Природа . 341 (6244): 758–60. DOI : 10.1038 / 341758a0 . PMID  2477715 . S2CID  4349152 .
  • Ван Т., Донахью П.К., Зервос А.С. (июль 1994 г.). «Специфическое взаимодействие рецепторов типа I семейства TGF-бета с иммунофилином FKBP-12». Наука . 265 (5172): 674–6. DOI : 10.1126 / science.7518616 . PMID  7518616 .
  • Peattie DA, Hsiao K, Benasutti M, Lippke JA (декабрь 1994 г.). «Три различных информационных РНК могут кодировать человеческий иммунодепрессант-связывающий белок FKBP12». Джин . 150 (2): 251–7. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90434-0 . PMID  7529739 .
  • Ян В.М., Иноуэ СиДжей, Сето Э. (июнь 1995 г.). «Циклофилин A и FKBP12 взаимодействуют с YY1 и изменяют его транскрипционную активность» . Журнал биологической химии . 270 (25): 15187–93. DOI : 10.1074 / jbc.270.25.15187 . PMID  7541038 .
  • Кавамура А., Су М.С. (июнь 1995 г.). «Взаимодействие FKBP12-FK506 с кальциневрином А в домене связывания субъединицы В» . Журнал биологической химии . 270 (26): 15463–6. DOI : 10.1074 / jbc.270.26.15463 . PMID  7541044 .
  • Гриффит Дж. П., Ким Дж. Л., Ким Е. Е., Синтчак, М. Д., Томсон, Дж. А., Фицгиббон, М. Дж., Флеминг, М. А., Карон, ПР, Сяо К., Navia MA (август 1995 г.). «Рентгеновская структура кальциневрина ингибируется комплексом иммунофилин-иммунодепрессант FKBP12-FK506». Cell . 82 (3): 507–22. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (95) 90439-5 . PMID  7543369 . S2CID  15502270 .
  • Van Duyne GD, Standaert RF, Karplus PA, Schreiber SL, Clardy J (январь 1993 г.). «Атомные структуры комплексов человеческого иммунофилина FKBP-12 с FK506 и рапамицином». Журнал молекулярной биологии . 229 (1): 105–24. DOI : 10.1006 / jmbi.1993.1012 . PMID  7678431 .