Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Фекалибактерии
Научная классификация
Домен:
Бактерии
Тип:
Фирмикуты
Класс:
Clostridia
Заказ:
Clostridiales
Семья:
Ruminococcaceae
Род:
Фекалибактерии

Дункан и др., 2002 г.
Разновидность:
F. prausnitzii
Биномиальное имя
Faecalibacterium prausnitzii
(Hauduroy et al., 1937) Duncan et al., 2002

Faecalibacterium - это род бактерий. Его единственным известные виды, Faecalibacterium prausnitzii является грамположительным, [1] мезофильным, палочковидный, [2] анаэробным [3] и является одним из самых распространенных и важных синантропных бактерий в человеческой микрофлоре кишечника . Это не спорообразующее и неподвижное вещество. [4] Эти бактерии производят бутират и другие короткоцепочечные жирные кислоты в результате ферментации пищевых волокон .

История [ править ]

Бактерия, ранее считавшаяся членом Fusobacterium , названа в честь немецкого бактериолога Отто Праусница . В 2002 году было предложено реклассифицировать его как собственный род Faecalibacterium , содержащий вид Faecalibacterium prausnitzii , поскольку филогенетический анализ изолятов показал, что он только отдаленно родственен Fusobacterium и является более близким членом кластера Clostridium IV . [5]

Генетика [ править ]

Faecalibacterium prausnitzii имеет геном длиной 2 868 932 п.н. и содержание GC 56,9%. Было обнаружено, что бактерия имеет 2707 кодирующих последовательностей, включая 77 РНК, кодирующих гены. [6] Было реконструировано 128 метаболических путей, а также 27 белковых комплексов и 64 тРНК. [7] Филогенетически штаммы F. prausnitzii составляют филогруппы I и II. Большинство новых изолятов этого вида, выделенных М. Tanweer Khan, относятся к филогруппе II. [8] Белок, продуцируемый этой бактерией, оказывает противовоспалительное действие. [9]

Клиническая значимость [ править ]

У здоровых взрослых Faecalibacterium prausnitzii представляют более 5% бактерий в кишечнике, что делает их одной из самых распространенных кишечных бактерий. Среди прочего, он укрепляет иммунную систему. [10] Ниже , чем обычные уровни F. prausnitzii в кишечнике были связаны с болезнью Кроны , ожирением , астмой и большим депрессивным расстройством , [11] [12] [13] [14] и выше , чем обычные уровни был связан с псориаз. [15]

Воспалительное заболевание кишечника [ править ]

При болезни Крона по состоянию на 2015 г. в большинстве исследований (за одним исключением) было обнаружено снижение уровня F. prausnitzii ; [16] это было обнаружено как в фекалиях, так и в образцах слизистых оболочек. [17] Однако это привередливый организм, чувствительный к кислороду и с трудом доставляемый в кишечник. [17]

Было обнаружено, что эксклюзивное энтеральное питание, которое, как известно, вызывает ремиссию при болезни Крона, снижает уровень F. prausnitzii у респондентов. [18]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Мартин R, Микель S, Беневидес L, Бридонно C, Роберт V, Худо S, Цепь F, Берто О, Азеведо V, Шатель JM, Сокол H, Бермудес-Хумаран LG, Томас М, Лангелла П (2017). «F. prausnitzii как пробиотик нового поколения» . Границы микробиологии . 8 : 1226. DOI : 10,3389 / fmicb.2017.01226 . PMC  5492426 . PMID  28713353 .
  2. ^ Мартин R, Микель S, Беневидес L, Бридонно C, Роберт V, Худо S, Цепь F, Берто О, Азеведо V, Шатель JM, Сокол H, Бермудес-Хумаран LG, Томас М, Лангелла П (2017). «F. prausnitzii как пробиотик нового поколения» . Границы микробиологии . 8 : 1226. DOI : 10,3389 / fmicb.2017.01226 . PMC 5492426 . PMID 28713353 .  
  3. ^ Хан MT, Duncan SH, Stams AJ, ван Dijl JM, Flint HJ, Harmsen HJ (август 2012). «Кишечный анаэроб Faecalibacterium prausnitzii использует внеклеточный электронный челнок для роста на кислородно-бескислородных интерфазах» . Журнал ISME . 6 (8): 1578–85. DOI : 10.1038 / ismej.2012.5 . PMC 3400418 . PMID 22357539 .  
  4. ↑ Bag S, Ghosh TS, Das B (ноябрь 2017 г.). «Faecalibacterium prausnitzii, выделенный из кишечника здорового взрослого индейца» . Анонсы генома . 5 (46). DOI : 10,1128 / genomeA.01286-17 . PMC 5690339 . PMID 29146862 .  
  5. ^ Дункан SH, Hold GL, Хармсен HJ, Стюарт CS, Флинт HJ (ноябрь 2002 г.). «Требования к выращиванию и продукты ферментации Fusobacterium prausnitzii, а также предложение о реклассификации его как Faecalibacterium prausnitzii gen. Nov., Comb. Nov» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 52 (Pt 6): 2141–6. DOI : 10.1099 / 00207713-52-6-2141 . PMID 12508881 . 
  6. ↑ Bag S, Ghosh TS, Das B (ноябрь 2017 г.). «Faecalibacterium prausnitzii, выделенный из кишечника здорового взрослого индейца» . Анонсы генома . 5 (46). DOI : 10,1128 / genomeA.01286-17 . PMC 5690339 . PMID 29146862 .  
  7. ^ "Сводка Faecalibacterium prausnitzii, штамм A2-165, версия 21.5" . BioCyc .
  8. Перейти ↑ Lopez-Siles M, Khan TM, Duncan SH, Harmsen HJ, Garcia-Gil LJ, Flint HJ (январь 2012 г.). «Культивированные представители двух основных филогрупп Faecalibacterium prausnitzii из толстой кишки человека могут использовать для роста пектин, уроновые кислоты и субстраты, полученные от хозяина» . Прикладная и экологическая микробиология . 78 (2): 420–8. DOI : 10,1128 / AEM.06858-11 . PMC 3255724 . PMID 22101049 .  
  9. ^ Quévrain Е, Мобер М.А., Мишон С, цепи F, Marquant R, Тайад Дж, Микель S, Карлье л, Бермудес-Humarán Л.Г., Pigneur В, Lequin О, Харрат Р, Томас О, Rainteau Д, Обри С, Breyner Н , Afonso C, Lavielle S, Grill JP, Chassaing G, Chatel JM, Trugnan G, Xavier R, Langella P, Sokol H, Seksik P (март 2016 г.). «Идентификация противовоспалительного белка из Faecalibacterium prausnitzii, комменсальной бактерии, дефицитной при болезни Крона» . Кишечник . 65 (3): 415–425. DOI : 10.1136 / gutjnl-2014-307649 . PMC 5136800 . PMID 26045134 .  
  10. ↑ Miquel S, Martín R, Rossi O, Bermúdez-Humarán LG, Chatel JM, Sokol H, Thomas M, Wells JM, Langella P (июнь 2013 г.). «Faecalibacterium prausnitzii и здоровье кишечника человека». Текущее мнение в микробиологии . 16 (3): 255–61. DOI : 10.1016 / j.mib.2013.06.003 . PMID 23831042 . 
  11. ^ Sokol H, Pigneur B, Watterlot L, Lakhdari O, Bermúdez-Humarán LG, Gratadoux JJ, Blugeon S, Bridonneau C, Furet JP, Corthier G, Grangette C, Vasquez N, Pochart P, Trugnan G, Thomas G, Blottière HM , Доре Дж, Марто П., Сексик П., Ланджелла П. (октябрь 2008 г.). «Faecalibacterium prausnitzii - противовоспалительная комменсальная бактерия, идентифицированная анализом кишечной микробиоты пациентов с болезнью Крона» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (43): 16731–6. DOI : 10.1073 / pnas.0804812105 . PMC 2575488 . PMID 18936492 .  
  12. ^ «Бактерия„виноваты Крон “ » . Новости BBC. 2008-10-21 . Проверено 21 октября 2008 .
  13. ↑ Newton RJ, McLellan SL, Dila DK, Vineis JH, Morrison HG, Eren AM, Sogin ML (февраль 2015 г.). «Сточные воды отражают микробиомы человеческих популяций» . mBio . 6 (2): e02574. DOI : 10,1128 / mBio.02574-14 . PMC 4358014 . PMID 25714718 .  
  14. ↑ Jiang H, Ling Z, Zhang Y, Mao H, Ma Z, Yin Y, Wang W, Tang W, Tan Z, Shi J, Li L, Ruan B (август 2015). «Измененный состав фекальной микробиоты у пациентов с большим депрессивным расстройством» . Мозг, поведение и иммунитет . 48 : 186–94. DOI : 10.1016 / j.bbi.2015.03.016 . PMID 25882912 . 
  15. ^ Codoñer ЧМ, Рамирес-Bosca А, Климент Е, Каррион-Гутьеррес М, М Герреро, Переса-Orquín Ю.М., Horga де ла Parte Дж, Genovés S, D Рамон, Наварро-López В, Chenoll Е (февраль 2018). «Микробный состав кишечника у больных псориазом» . Научные отчеты . 8 (1): 3812. Bibcode : 2018NatSR ... 8.3812C . DOI : 10.1038 / s41598-018-22125-у . PMC 5830498 . PMID 29491401 .  
  16. ^ Райт Е.К., Kamm М.А., Тео С.М., Иноуай М, Вагнер Дж, Кирквуд компакт (июнь 2015). «Последние достижения в характеристике микробиома желудочно-кишечного тракта при болезни Крона: систематический обзор» . Воспалительные заболевания кишечника . 21 (6): 1219–28. DOI : 10.1097 / MIB.0000000000000382 . PMC 4450900 . PMID 25844959 .  
  17. ^ а б Эль Хаге Р., Эрнандес-Санабриа Э, Ван де Виле Т (2017-09-29). «Новые тенденции в« умных пробиотиках »: функциональное рассмотрение для разработки новых медицинских и промышленных приложений» . Границы микробиологии . 8 : 1889. DOI : 10,3389 / fmicb.2017.01889 . PMC 5626839 . PMID 29033923 .  
  18. ^ Эдвардс, Кристина А .; Макгроган, Параик; Блаут, Майкл; Ханске, Лаура; Берц, Мартин; Ломан, Ник; Айва, Кристофер; Хансен, Ричард; Рассел, Ричард (2014-07-01). «Роль Faecalibacterium prausnitzii в болезни Крона: друг, враг или на самом деле не имеет значения?». Воспалительные заболевания кишечника . 20 (7): E18 – E19. DOI : 10.1097 / MIB.0000000000000079 . ISSN 1078-0998 . PMID 24859302 .  
  • v
  • т
  • е