leer wikipedia con nuevo diseño

Экспрессия гена

Экспрессия гена - это процесс, с помощью которого информация от гена используется в синтезе функционального генного продукта, который позволяет ему производить конечные продукты, белок или некодирующую РНК , и в конечном итоге влиять на фенотип в качестве конечного эффекта. Эти продукты часто являются белками , но в генах, не кодирующих белки, таких как транспортная РНК (тРНК) и малая ядерная РНК (мяРНК) , продукт представляет собой функциональную некодирующую РНК . Экспрессия генов резюмируется в центральной догме молекулярной биологии, впервые сформулированной Фрэнсисом Криком в 1958 г. [1]далее развился в его статье 1970 года [2] и расширен последующими открытиями обратной транскрипции [3] [4] [5] и репликации РНК . [6]

расширенная центральная догма
Расширенная центральная догма молекулярной биологии включает все клеточные процессы, участвующие в потоке генетической информации.

Процесс экспрессии генов используется всей известной жизнью - эукариотами (включая многоклеточные организмы ), прокариотами ( бактериями и архей ) и вирусами - для создания макромолекулярного аппарата для жизни.

В генетике экспрессия генов является наиболее фундаментальным уровнем, на котором генотип порождает фенотип , то есть наблюдаемый признак. Генетическая информация, хранящаяся в ДНК, представляет генотип, тогда как фенотип является результатом «интерпретации» этой информации. Такие фенотипы часто выражаются синтезом белков, которые контролируют структуру и развитие организма или действуют как ферменты, катализирующие определенные метаболические пути.

Все этапы процесса экспрессии гена можно модулировать (регулировать), включая транскрипцию , сплайсинг РНК , трансляцию и посттрансляционную модификацию белка. Регуляция экспрессии генов дает контроль над временем, местоположением и количеством продукта данного гена (белка или нкРНК), присутствующего в клетке, и может оказывать сильное влияние на клеточную структуру и функцию. Регуляция экспрессии генов является основой клеточной дифференциации , развития , морфогенеза, а также универсальности и приспособляемости любого организма . Следовательно, генная регуляция может служить субстратом для эволюционных изменений.

Механизм

Транскрипция

RNA polymerase moving along a stretch of DNA, leaving behind newly synthetized strand of RNA.
Процесс транскрипции осуществляется РНК-полимеразой (РНКП), которая использует ДНК (черный цвет) в качестве матрицы и производит РНК (синий цвет).

Производство РНК - копии из цепи ДНК называется транскрипцией , и осуществляется РНК полимераз , которые добавляют один рибо нуклеотид в то время , к растущей цепи РНК согласно комплементарности закону нуклеотидных оснований. Эта РНК комплементарна матричной 3 '→ 5' цепи ДНК [7], за исключением того, что тимины (T) заменены урацилами (U) в РНК.

У прокариот транскрипция осуществляется одним типом РНК-полимеразы, которая должна связывать последовательность ДНК, называемую боксом Прибноу, с помощью белка сигма-фактора (σ-фактор), чтобы начать транскрипцию. У эукариот транскрипция осуществляется в ядре тремя типами РНК-полимераз, каждая из которых требует особой последовательности ДНК, называемой промотором, и набора ДНК-связывающих белков - факторов транскрипции - для запуска процесса (см. Регуляцию транскрипции ниже). . РНК-полимераза I отвечает за транскрипцию генов рибосомной РНК (рРНК). РНК-полимераза II (Pol II) транскрибирует все гены, кодирующие белок, но также некоторые некодирующие РНК ( например , мяРНК, мяноРНК или длинные некодирующие РНК). РНК-полимераза III транскрибирует 5S рРНК, гены транспортной РНК (тРНК) и некоторые небольшие некодирующие РНК ( например , 7SK ). Транскрипция заканчивается, когда полимераза встречает последовательность, называемую терминатором .

обработка мРНК

В то время как транскрипция генов, кодирующих прокариотические белки, создает информационную РНК (мРНК), готовую к трансляции в белок, транскрипция эукариотических генов оставляет первичный транскрипт РНК ( пре-РНК ), который сначала должен пройти ряд модификаций, чтобы стать зрелая РНК. Типы и шаги, участвующие в процессах созревания, различаются между кодирующими и некодирующими преРНК; т.е. даже несмотря на то, что молекулы преРНК как для мРНК, так и для тРНК подвергаются сплайсингу, этапы и задействованные механизмы различны. [8] Процессинг некодирующей РНК описан ниже (созревание некодирующей РНК).

Обработка premRNA включают в себя 5 ' укупорки , который установлен ферментативных реакций , которые добавляют 7-метилгуанозин (м 7 г) к 5' - концу premRNA и таким образом защищают РНК от деградации под действием экзонуклеазы . Затем кэп m 7 G связывается гетеродимером комплекса связывания кэпа (CBC20 / CBC80), который способствует экспорту мРНК в цитоплазму, а также защищает РНК от декапирования.

Другая модификация - это 3'- расщепление и полиаденилирование . Они возникают, если сигнальная последовательность полиаденилирования (5'-AAUAAA-3 ') присутствует в пре-мРНК, которая обычно находится между последовательностью, кодирующей белок, и терминатором. Пре-мРНК сначала расщепляется, а затем добавляется серия из ~ 200 аденинов (A) для образования поли (A) хвоста, который защищает РНК от деградации. Поли (A) хвост связан множеством поли (A)-связывающих белков (PABP), необходимых для экспорта мРНК и повторной инициации трансляции. В обратном процессе деаденилирования поли (A) хвосты укорачиваются экзонуклеазой CCR4-Not 3'-5 ', что часто приводит к полному распаду транскрипта.

Pre-mRNA is spliced to form of mature mRNA.
Иллюстрация экзонов и интронов в пре-мРНК и формирование зрелой мРНК путем сплайсинга. UTR (зеленые) - это некодирующие части экзонов на концах мРНК.

Очень важной модификацией пре-мРНК эукариот является сплайсинг РНК . Большинство эукариотических пре-мРНК состоят из чередующихся сегментов, называемых экзонами и интронами . В процессе сплайсинга каталитический комплекс РНК-белок, известный как сплайсосома, катализирует две реакции переэтерификации, которые удаляют интрон и высвобождают его в форме лариатной структуры, а затем сплавляют соседние экзоны вместе. В некоторых случаях некоторые интроны или экзоны могут быть либо удалены, либо сохранены в зрелой мРНК. Этот так называемый альтернативный сплайсинг создает серию различных транскриптов, происходящих из одного гена. Поскольку эти транскрипты потенциально могут транслироваться в различные белки, сплайсинг увеличивает сложность экспрессии эукариотических генов и размер протеома вида .

Обширный процессинг РНК может быть эволюционным преимуществом, которое стало возможным благодаря ядру эукариот. У прокариот транскрипция и трансляция происходят вместе, в то время как у эукариот ядерная мембрана разделяет эти два процесса, давая время для процессинга РНК.

Созревание некодирующей РНК

У большинства организмов некодирующие гены (нкРНК) транскрибируются как предшественники, которые подвергаются дальнейшей обработке. В случае рибосомных РНК (рРНК) они часто транскрибируются как пре-рРНК, которая содержит одну или несколько рРНК. Пре-рРНК расщепляется и модифицируется (2'-O-метилирование и образование псевдоуридина ) в определенных сайтах примерно 150 различными видами РНК, ограниченными малым ядрышком, называемыми мяРНК. SnoRNA связываются с белками, образуя snoRNP. В то время как snoRNA часть пары оснований с целевой РНК и, таким образом, позиционирует модификацию в определенном месте, часть белка выполняет каталитическую реакцию. У эукариот, в частности snoRNP, называемой РНКазой, MRP расщепляет пре-рРНК 45S на 28S, 5.8S и 18S рРНК. Факторы процессинга рРНК и РНК образуют большие агрегаты, называемые ядрышком . [9]

В случае переноса РНК (тРНК), например, 5 'последовательность удаляется РНКазы Р , [10] , тогда как 3' - конец удаляется tRNase Z фермента [11] и необработанного шаблонный 3' CCA хвост добавляется нуклеотидилтрансферазой . [12] В случае микроРНК (miRNA) , miRNA сначала транскрибируются как первичные транскрипты или pri-miRNA с кэпом и поли-A-хвостом и процессируются в короткие 70-нуклеотидные структуры «ствол-петля», известные как pre-miRNA в ядро клетки ферментами Дроша и Паша . После экспорта он затем обрабатывается до зрелых miRNA в цитоплазме посредством взаимодействия с эндонуклеазой Dicer , которая также инициирует образование РНК-индуцированного комплекса сайленсинга (RISC) , состоящего из белка Argonaute .

Даже snRNAs и snoRNAs сами претерпевают серию модификаций, прежде чем они станут частью функционального комплекса RNP. Это происходит либо в нуклеоплазме, либо в специализированных отделах, называемых тельцами Кахаля . Их основания метилированы или псевдоуридинилированы группой малых специфичных для тельца Кахаля РНК (scaRNAs) , которые структурно сходны с snoRNA.

Экспорт РНК

У эукариот наиболее зрелая РНК должна экспортироваться в цитоплазму из ядра . В то время как некоторые РНК функционируют в ядре, многие РНК транспортируются через ядерные поры в цитозоль . [13] Экспорт РНК требует ассоциации со специфическими белками, известными как экспортины. Специфические молекулы экспортина ответственны за экспорт данного типа РНК. Транспорт мРНК также требует правильной ассоциации с комплексом соединения экзонов (EJC), который гарантирует, что правильный процессинг мРНК завершится перед экспортом. В некоторых случаях РНК дополнительно транспортируются в определенную часть цитоплазмы, например, в синапс ; затем они буксируются моторными белками, которые связываются через линкерные белки с конкретными последовательностями (называемыми «почтовыми индексами») на РНК. [14]

Перевод

Для некоторых РНК (некодирующих РНК) зрелая РНК является конечным генным продуктом. [15] В случае информационной РНК (мРНК) РНК является носителем информации, кодирующим синтез одного или нескольких белков. мРНК, несущая одну последовательность белка (обычная для эукариот), является моноцистронной, в то время как мРНК, несущая несколько белковых последовательностей (обычная для прокариот), известна как полицистронная .

Ribosome translating messenger RNA to chain of amino acids (protein).
Во время трансляции тРНК, заряженная аминокислотой, входит в рибосому и выравнивается с правильным триплетом мРНК. Затем рибосома добавляет аминокислоту к растущей белковой цепи.

Каждая мРНК состоит из трех частей: 5'-нетранслируемой области (5'UTR), кодирующей белок области или открытой рамки считывания (ORF) и 3'-нетранслируемой области (3'UTR). Кодирующая область несет информацию о синтезе белка, кодируемую генетическим кодом с образованием триплетов. Каждый триплет нуклеотидов кодирующей области называется кодоном и соответствует сайту связывания, комплементарному триплету антикодона в транспортной РНК. Трансферные РНК с одинаковой антикодоновой последовательностью всегда несут идентичный тип аминокислоты . Затем аминокислоты соединяются рибосомой в соответствии с порядком триплетов в кодирующей области. Рибосома помогает переносить РНК для связывания с информационной РНК и берет аминокислоту из каждой переносящей РНК и делает из нее бесструктурный белок. [16] [17] Каждая молекула мРНК транслируется во множество белковых молекул, в среднем ~ 2800 у млекопитающих. [18] [19]

У прокариот трансляция обычно происходит в момент транскрипции (котранскрипции), часто с использованием информационной РНК, которая все еще находится в процессе создания. У эукариот трансляция может происходить в различных областях клетки в зависимости от того, где должен находиться записываемый белок. Основные местоположения - это цитоплазма для растворимых цитоплазматических белков и мембрана эндоплазматического ретикулума для белков, которые предназначены для экспорта из клетки или встраивания в клеточную мембрану . Белки, которые, как предполагается, экспрессируются в эндоплазматическом ретикулуме, распознаются частично в процессе трансляции. Это регулируется частицей распознавания сигнала - белком, который связывается с рибосомой и направляет ее в эндоплазматический ретикулум, когда он находит сигнальный пептид на растущей (формирующейся) аминокислотной цепи. [20]

Складной

Process of protein folding.
Белок до (слева) и после (справа) сворачивания

Каждый белок существует в виде развернутого полипептида или случайной спирали при трансляции из последовательности мРНК в линейную цепочку аминокислот . У этого полипептида отсутствует развитая трехмерная структура (левая часть соседнего рисунка). Затем полипептид сворачивается в свою характерную и функциональную трехмерную структуру из случайной спирали . [21] Аминокислоты взаимодействуют друг с другом, образуя четко определенную трехмерную структуру, свернутый белок (правая часть рисунка), известный как нативное состояние . Полученная трехмерная структура определяется аминокислотной последовательностью ( догма Анфинсена ). [22]

Правильная трехмерная структура важна для функционирования, хотя некоторые части функциональных белков могут оставаться развернутыми . [23] Неспособность свернуться в намеченную форму обычно приводит к образованию неактивных белков с различными свойствами, включая токсичные прионы . Считается, что несколько нейродегенеративных и других заболеваний возникают в результате накопления неправильно свернутых белков. [24] Многие аллергии вызваны сворачиванием белков, поскольку иммунная система не вырабатывает антитела для определенных белковых структур. [25]

Ферменты, называемые шаперонами, помогают вновь сформированному белку достичь ( свернуться ) трехмерной структуры, необходимой для его функционирования. [26] Точно так же шапероны РНК помогают РНК достичь своей функциональной формы. [27] Содействие сворачиванию белков - одна из основных ролей эндоплазматического ретикулума у ​​эукариот.

Перемещение

Секреторные белки эукариот или прокариот должны быть перемещены, чтобы войти в секреторный путь. Недавно синтезированные белки направляются в эукариотический канал транслокации Sec61 или прокариотический SecYEG с помощью сигнальных пептидов . Эффективность секреции белка у эукариот очень зависит от используемого сигнального пептида . [28]

Белковый транспорт

Многие белки предназначены для других частей клетки, кроме цитозоля, и широкий спектр сигнальных последовательностей или (сигнальных пептидов) используется для направления белков туда, где они должны находиться. У прокариот это обычно простой процесс из-за ограниченной компартментализации клетки. Однако у эукариот существует множество различных процессов нацеливания, которые гарантируют, что белок попадает в нужную органеллу.

Не все белки остаются в клетке, и многие из них экспортируются, например, пищеварительные ферменты , гормоны и белки внеклеточного матрикса . У эукариот путь экспорта хорошо развит, и основным механизмом экспорта этих белков является транслокация в эндоплазматический ретикулум с последующим транспортом через аппарат Гольджи . [29] [30]

Регулирование экспрессии генов

Пятнистая окраска черепаховой кошки - результат разного уровня экспрессии генов пигментации в разных областях кожи .

Регулирование экспрессии гена относится к контролю количества и времени появления функционального продукта гена. Контроль экспрессии жизненно важен для того, чтобы позволить клетке производить нужные ей генные продукты, когда они ей нужны; в свою очередь, это дает клеткам возможность адаптироваться к изменчивой среде, внешним сигналам, повреждениям клетки и другим стимулам. В более общем смысле, генная регуляция дает клетке контроль над всей структурой и функцией и является основой клеточной дифференциации , морфогенеза, а также универсальности и приспособляемости любого организма.

Для описания типов генов используются многочисленные термины в зависимости от того, как они регулируются; это включает:

  • Конститутивный ген представляет собой ген , который транскрибируется непрерывно , в отличие от факультативного гена, который транскрибируется только тогда , когда это необходимо.
  • Гена домашнего хозяйства представляет собой ген , который необходим для поддержания основной клеточной функции и так , как правило , выражается во всех типах клеток организма. Примеры включают актин , GAPDH и убиквитин . Некоторые гены домашнего хозяйства транскрибируются с относительно постоянной скоростью, и эти гены можно использовать в качестве ориентира в экспериментах для измерения скорости экспрессии других генов.
  • Факультативный ген представляет собой ген только расшифрован при необходимости , в отличии от конститутивного гена.
  • Индуцируемый ген представляет собой ген, экспрессия которого является либо реагировать на изменения окружающей среды , или в зависимости от положения в клеточном цикле.

Можно модулировать любую стадию экспрессии гена, от стадии транскрипции ДНК-РНК до посттрансляционной модификации белка. Стабильность конечного генного продукта, будь то РНК или белок, также влияет на уровень экспрессии гена - нестабильный продукт приводит к низкому уровню экспрессии. В целом экспрессия генов регулируется посредством изменений [31] количества и типа взаимодействий между молекулами [32], которые в совокупности влияют на транскрипцию ДНК [33] и трансляцию РНК. [34]

Вот несколько простых примеров того, где важна экспрессия генов:

  • Контроль экспрессии инсулина, чтобы он давал сигнал для регулирования уровня глюкозы в крови .
  • Инактивация Х-хромосомы у самок млекопитающих для предотвращения «передозировки» содержащихся в ней генов.
  • Уровни экспрессии циклина контролируют прохождение эукариотического клеточного цикла .

Транскрипционная регуляция

Когда в прокариоте присутствует лактоза, она действует как индуктор и инактивирует репрессор, так что гены метаболизма лактозы могут быть расшифрованы.

Регуляцию транскрипции можно разделить на три основных пути воздействия; генетический (прямое взаимодействие контрольного фактора с геном), модулирующее взаимодействие контрольного фактора с аппаратом транскрипции и эпигенетический (непоследовательные изменения структуры ДНК, влияющие на транскрипцию).

Ribbon diagram of the lambda repressor dimer bound to DNA.
Лямбда - репрессор фактор транскрипции (зеленый) связывается в виде димера в большую бороздку ДНК - мишени (красный и синий) и отключает инициацию транскрипции. Из PDB : 1 ЛМБ .

Прямое взаимодействие с ДНК - самый простой и самый прямой метод, с помощью которого белок изменяет уровни транскрипции. Гены часто имеют несколько сайтов связывания белков вокруг кодирующей области со специфической функцией регуляции транскрипции. Существует много классов регуляторных сайтов связывания ДНК, известных как энхансеры , инсуляторы и сайленсеры . Механизмы регуляции транскрипции очень разнообразны: от блокирования ключевых сайтов связывания ДНК для РНК-полимеразы до действия в качестве активатора и стимулирования транскрипции путем содействия связыванию РНК-полимеразы.

Активность факторов транскрипции дополнительно модулируется внутриклеточными сигналами, вызывающими посттрансляционную модификацию белка, включая фосфорилирование , ацетилирование или гликозилирование . Эти изменения влияют на способность фактора транскрипции прямо или косвенно связываться с промоторной ДНК, рекрутировать РНК-полимеразу или способствовать удлинению вновь синтезированной молекулы РНК.

Ядерная мембрана эукариот позволяет дополнительно регулировать факторы транскрипции за счет продолжительности их присутствия в ядре, которое регулируется обратимыми изменениями в их структуре и связыванием других белков. [35] Экологические стимулы или эндокринные сигналы [36] могут вызывать модификацию регуляторных белков [37], вызывая каскады внутриклеточных сигналов [38], которые приводят к регуляции экспрессии генов.

Совсем недавно стало очевидно, что существует значительное влияние не специфичных для ДНК-последовательности эффектов на транскрипцию. Эти эффекты называются эпигенетическими и включают структуру ДНК более высокого порядка, ДНК-связывающие белки, не связанные с последовательностью, и химическую модификацию ДНК. В целом эпигенетические эффекты изменяют доступность ДНК для белков и, таким образом, модулируют транскрипцию.

A cartoon representation of the nucleosome structure.
У эукариот ДНК организована в виде нуклеосом . Обратите внимание, как ДНК (синий и зеленый) плотно обернута вокруг белкового ядра, состоящего из октамера гистонов (ленточные спирали), ограничивая доступ к ДНК. Из PDB : 1KX5 .

У эукариот структура хроматина , контролируемая гистоновым кодом , регулирует доступ к ДНК со значительным влиянием на экспрессию генов в областях эухроматина и гетерохроматина .

Энхансеры, факторы транскрипции, медиаторный комплекс и петли ДНК в транскрипции млекопитающих

Регуляция транскрипции у млекопитающих . Регуляторная область активного энхансера может взаимодействовать с промоторной областью своего гена- мишени за счет образования хромосомной петли. Это может инициировать синтез информационной РНК (мРНК) с помощью РНК-полимеразы II (РНКП II), связанной с промотором в сайте начала транскрипции гена. Петля стабилизируется одним архитектурным белком, прикрепленным к энхансеру, а другой - к промотору, и эти белки соединяются вместе, образуя димер (красные зигзаги). Специфические регуляторные факторы транскрипции связываются с мотивами последовательности ДНК на энхансере. С промотором связываются общие факторы транскрипции. Когда фактор транскрипции активируется сигналом (здесь обозначено как фосфорилирование, показанное маленькой красной звездочкой на факторе транскрипции на энхансере), энхансер активируется и теперь может активировать свой целевой промотор. Активный энхансер транскрибируется на каждой цепи ДНК в противоположных направлениях связанными РНКП II. Медиатор (комплекс, состоящий примерно из 26 белков во взаимодействующей структуре) передает регуляторные сигналы от энхансерных ДНК-связанных факторов транскрипции к промотору.

Экспрессия генов у млекопитающих регулируется многими цис-регуляторными элементами , в том числе коровыми промоторами и промоторными проксимальными элементами , которые расположены рядом с сайтами начала транскрипции генов, выше ДНК (по направлению к 5'-области смысловой цепи ). Другие важные цис-регуляторные модули локализованы в участках ДНК, удаленных от сайтов старта транскрипции. К ним относятся усилители , глушители , изоляторы и элементы привязи. [39] Среди этой совокупности элементов энхансеры и связанные с ними факторы транскрипции играют ведущую роль в регуляции экспрессии генов. [40]

Энхансеры - это участки генома, которые являются основными регулирующими генами элементами. Энхансеры управляют программами экспрессии генов, специфичных для определенного типа клеток, чаще всего путем обхода больших расстояний, чтобы оказаться в физической близости с промоторами своих генов-мишеней. [41] Множественные энхансеры, каждый часто на десятках или сотнях тысяч нуклеотидов, удаленных от своих генов-мишеней, замыкаются на промоторах своих генов-мишеней и координируются друг с другом для контроля экспрессии их общего гена-мишени. [41]

На схематической иллюстрации слева показан энхансер, который зацикливается и находится в непосредственной физической близости с промотором целевого гена. Петля стабилизируется димером соединительного белка (например, димером CTCF или YY1 ), при этом один член димера прикреплен к его мотиву связывания на энхансере, а другой член прикреплен к его мотиву связывания на промоторе (представленном красные зигзаги на иллюстрации). [42] Несколько факторов транскрипции, специфичных для клеточных функций (в клетке человека около 1600 факторов транскрипции [43] ), как правило, связываются со специфическими мотивами на энхансере [44] и небольшой комбинацией этих факторов транскрипции, связанных с энхансером, при сближении. к промотору с помощью петли ДНК, регулируют уровень транскрипции целевого гена. Медиатор (комплекс, обычно состоящий из примерно 26 белков во взаимодействующей структуре) передает регуляторные сигналы от энхансерных ДНК-связанных факторов транскрипции непосредственно ферменту РНК-полимераза II (pol II), связанному с промотором. [45]

Энхансеры, когда они активны, обычно транскрибируются с обеих цепей ДНК с РНК-полимеразами, действующими в двух разных направлениях, производя две эРНК, как показано на рисунке. [46] Неактивный энхансер может быть связан с неактивным фактором транскрипции. Фосфорилирование фактора транскрипции может активировать его, и этот активированный фактор транскрипции может затем активировать энхансер, с которым он связан (см. Маленькую красную звездочку, представляющую фосфорилирование фактора транскрипции, связанного с энхансером, на иллюстрации). [47] Активированный энхансер начинает транскрипцию своей РНК перед активацией транскрипции информационной РНК из своего гена-мишени. [48]

Метилирование и деметилирование ДНК в регуляции транскрипции

Метилирование ДНК - это добавление метильной группы к ДНК, происходящее в цитозине . На изображении показано основание с одним кольцом цитозина и метильная группа, добавленные к 5-му атому углерода. У млекопитающих метилирование ДНК происходит почти исключительно в цитозине, за которым следует гуанин .

Метилирование ДНК является широко распространенным механизмом эпигенетического влияния на экспрессию генов, наблюдается у бактерий и эукариот и играет роль в наследуемом подавлении транскрипции и регуляции транскрипции. Чаще всего метилирование происходит по цитозину (см. Рисунок). Метилирование цитозина в основном происходит в динуклеотидных последовательностях, где за цитозином следует гуанин, сайт CpG . Количество CpG-сайтов в геноме человека составляет около 28 миллионов. [49] В зависимости от типа клетки около 70% сайтов CpG имеют метилированный цитозин. [50]

Метилирование цитозина в ДНК играет важную роль в регуляции экспрессии генов. Метилирование CpG в промоторной области гена обычно подавляет транскрипцию гена [51], в то время как метилирование CpG в теле гена увеличивает экспрессию. [52] Ферменты ТЕТ играют центральную роль в деметилировании метилированных цитозинов. Деметилирование CpG в промоторе гена за счет активности фермента TET увеличивает транскрипцию гена. [53]

Транскрипционная регуляция в обучении и памяти

Выявленные области человеческого мозга участвуют в формировании памяти.

У крыс условное кондиционирование страха (CFC) - болезненный процесс обучения. Всего один эпизод CFC может вызвать воспоминания о страхе на всю жизнь. [54] После эпизода CFC метилирование цитозина изменяется в промоторных областях примерно 9,17% всех генов в ДНК нейрона гиппокампа крысы. [55] гиппокамп , где новые воспоминания изначально хранятся. После CFC около 500 генов увеличили транскрипцию (часто из-за деметилирования сайтов CpG в промоторной области) и около 1000 генов снизили транскрипцию (часто из-за вновь образованного 5-метилцитозина на сайтах CpG в промоторной области). Паттерн индуцированных и репрессированных генов в нейронах, по-видимому, обеспечивает молекулярную основу для формирования первой временной памяти об этом тренировочном событии в гиппокампе мозга крысы. [55]

В частности, ген нейротрофического фактора мозга ( BDNF ) известен как «ген обучения». [56] После CFC произошла повышенная регуляция экспрессии гена BDNF , связанная со снижением CpG-метилирования определенных внутренних промоторов гена, и это коррелировало с обучением. [56]

Регуляция транскрипции при раке

Большинство промоторов генов содержат островок CpG с многочисленными сайтами CpG . [57] Когда многие промоторные сайты CpG гена метилированы, ген заглушается. [58] Колоректальный рак обычно имеет от 3 до 6 мутаций водителя и от 33 до 66 мутаций автостопщика или пассажира. [59] Однако подавление транскрипции может иметь большее значение, чем мутации, в развитии рака. Например, при колоректальном раке от 600 до 800 генов транскрипционно подавляются метилированием CpG-островков (см. Регуляцию транскрипции при раке ). Репрессия транскрипции при раке также может происходить за счет других эпигенетических механизмов, таких как измененная экспрессия микроРНК . [60] При раке груди репрессия транскрипции BRCA1 может происходить чаще за счет сверхэкспрессии микроРНК-182, чем за счет гиперметилирования промотора BRCA1 (см. Низкая экспрессия BRCA1 при раке груди и яичников ).

Посттранскрипционная регуляция

Считается, что у эукариот экспорт РНК необходим для того, чтобы трансляция стала возможной, ядерный экспорт обеспечивает дополнительный контроль над экспрессией генов. Весь транспорт в ядро ​​и из ядра осуществляется через ядерную пору, и транспорт контролируется широким спектром белков импортина и экспортина .

Экспрессия гена, кодирующего белок, возможна только в том случае, если информационная РНК, несущая код, выживет достаточно долго, чтобы ее можно было транслировать. В типичной клетке молекула РНК стабильна только в том случае, если она специально защищена от деградации. Деградация РНК имеет особое значение для регуляции экспрессии в эукариотических клетках, где мРНК должна пройти значительные расстояния, прежде чем будет транслироваться. У эукариот РНК стабилизируется с помощью определенных посттранскрипционных модификаций, особенно 5'-кэпа и полиаденилированного хвоста .

Преднамеренная деградация мРНК используется не только как механизм защиты от чужеродной РНК (обычно от вирусов), но также как путь дестабилизации мРНК . Если молекула мРНК имеет последовательность, комплементарную небольшой мешающей РНК, то она нацелена на разрушение посредством пути интерференции РНК.

Три первичных нетранслируемых области и микроРНК

Три первичных нетранслируемых области (3'UTR) информационных РНК (мРНК) часто содержат регуляторные последовательности, которые посттранскрипционно влияют на экспрессию генов. Такие 3'-UTR часто содержат как сайты связывания для микроРНК (miRNA), так и для регуляторных белков. Связываясь со специфическими сайтами в 3'-UTR, miRNA могут снижать экспрессию генов различных мРНК, либо ингибируя трансляцию, либо напрямую вызывая деградацию транскрипта. 3'-UTR также может иметь области сайленсера, которые связывают репрессорные белки, которые ингибируют экспрессию мРНК.

3'-UTR часто содержит элементы ответа микроРНК (MRE) . MRE представляют собой последовательности, с которыми связываются миРНК. Это преобладающие мотивы в 3'-UTR. Среди всех регуляторных мотивов в 3'-UTR (например, включая области сайленсеров) MRE составляют около половины мотивов.

По состоянию на 2014 г. веб-сайт miRBase , [61] архив последовательностей и аннотаций miRNA , перечислил 28 645 записей о 233 биологических видах. Из них 1881 miRNA находились в аннотированных локусах miRNA человека. Предполагалось, что miRNA содержат в среднем около четырехсот целевых мРНК (влияющих на экспрессию нескольких сотен генов). [62] Фридман и др. [62] подсчитали, что> 45 000 сайтов-мишеней miRNA в 3'UTR мРНК человека консервативны выше фоновых уровней, и более 60% генов, кодирующих белки человека, находились под селективным давлением для поддержания спаривания с miRNA.

Прямые эксперименты показывают, что одна миРНК может снизить стабильность сотен уникальных мРНК. [63] Другие эксперименты показывают, что одна miRNA может подавлять продукцию сотен белков, но эта репрессия часто бывает относительно мягкой (менее чем в 2 раза). [64] [65]

Эффекты нарушения регуляции экспрессии генов miRNA, по-видимому, важны при раке. [66] Например, при раке желудочно-кишечного тракта девять миРНК были идентифицированы как эпигенетически измененные и эффективные в подавлении регуляции ферментов репарации ДНК. [67]

Эффекты дисрегуляции экспрессии генов miRNA также, по-видимому, важны при нейропсихиатрических расстройствах, таких как шизофрения, биполярное расстройство, большая депрессия, болезнь Паркинсона, болезнь Альцгеймера и расстройства аутистического спектра. [68] [69]

Переводческое регулирование

A chemical structure of neomycin molecule.
Неомицин является примером небольшой молекулы, которая снижает экспрессию всех генов белка, что неизбежно приводит к гибели клеток; таким образом, он действует как антибиотик .

Прямая регуляция трансляции менее распространена, чем контроль транскрипции или стабильности мРНК, но иногда используется. Ингибирование трансляции белков является основной мишенью для токсинов и антибиотиков , поэтому они могут убить клетку, подавляя ее нормальный контроль экспрессии генов. Ингибиторы синтеза белка включают антибиотик неомицин и токсин рицин .

Посттрансляционные модификации

Посттрансляционные модификации (PTM) - это ковалентные модификации белков. Как и сплайсинг РНК, они помогают значительно разнообразить протеом. Эти модификации обычно катализируются ферментами. Кроме того, такие процессы, как ковалентное добавление к остаткам боковой цепи аминокислот, часто могут быть обращены другими ферментами. Однако некоторые из них, например протеолитическое расщепление основной цепи белка, необратимы. [70]

ПТМ играют в клетке множество важных ролей. [71] Например, фосфорилирование в первую очередь участвует в активации и деактивации белков и в сигнальных путях. [72] PTMs участвуют в регуляции транскрипции: важной функцией ацетилирования и метилирования является модификация гистонового хвоста, которая изменяет доступность ДНК для транскрипции. [70] Их также можно увидеть в иммунной системе, где гликозилирование играет ключевую роль. [73] Один тип ПТМ может инициировать другой тип ПТМ, как видно из того, как убиквитинирование помечает белки для деградации посредством протеолиза. [70] Протеолиз, помимо участия в расщеплении белков, также важен для их активации и деактивации, а также для регулирования биологических процессов, таких как транскрипция ДНК и гибель клеток. [74]

Измерение

Измерение экспрессии генов является важной частью многих наук о жизни , поскольку возможность количественно оценить уровень экспрессии конкретного гена в клетке, ткани или организме может предоставить много ценной информации. Например, измерение экспрессии генов может:

  • Определите вирусную инфекцию клетки ( экспрессию вирусного белка ).
  • Определите предрасположенность человека к раку ( экспрессия онкогена ).
  • Определите, устойчива ли бактерия к пенициллину ( экспрессия бета-лактамазы ).

Точно так же анализ местоположения экспрессии белка является мощным инструментом, и это может быть сделано в масштабе организма или клетки. Исследование локализации особенно важно для изучения развития многоклеточных организмов и как индикатор функции белка в отдельных клетках. В идеале измерение экспрессии осуществляется путем обнаружения конечного генного продукта (для многих генов это белок); однако часто бывает легче обнаружить один из предшественников, обычно мРНК, и сделать вывод об уровнях экспрессии генов по этим измерениям.

количественное определение мРНК

Уровни мРНК можно количественно измерить с помощью нозерн-блоттинга , который предоставляет информацию о размере и последовательности молекул мРНК. Образец РНК отделяют на агарозном геле и гибридизуют с радиоактивно меченным РНК-зондом, который комплементарен целевой последовательности. Затем радиоактивно меченную РНК выявляют авторадиографом . Поскольку использование радиоактивных реагентов делает процедуру трудоемкой и потенциально опасной, были разработаны альтернативные методы маркировки и обнаружения, такие как химический состав дигоксигенина и биотина. Предполагаемые недостатки Нозерн-блоттинга заключаются в том, что требуются большие количества РНК и что количественное определение может быть не совсем точным, поскольку оно включает измерение силы полосы на изображении геля. С другой стороны, дополнительная информация о размере мРНК из Нозерн-блоттинга позволяет различать транскрипты с попеременным сплайсингом.

Другой подход к измерению количества мРНК - это RT-qPCR. В этом методе за обратной транскрипцией следует количественная ПЦР . Обратная транскрипция сначала генерирует матрицу ДНК из мРНК; эта одноцепочечная матрица называется кДНК . Затем матрицу кДНК амплифицируют на этапе количественного анализа, во время которого флуоресценция, испускаемая мечеными зондами гибридизации или интеркалирующими красителями, изменяется по мере продвижения процесса амплификации ДНК . С помощью тщательно построенной стандартной кривой кПЦР может произвести абсолютное измерение количества копий исходной мРНК, обычно в единицах копий на нанолитр гомогенизированной ткани или копий на клетку. КПЦР очень чувствительна (теоретически возможно обнаружение одной молекулы мРНК), но может быть дорогостоящей в зависимости от типа используемого репортера; флуоресцентно меченые олигонуклеотидные зонды дороже, чем неспецифические интеркалирующие флуоресцентные красители.

Для профилирования экспрессии или высокопроизводительного анализа многих генов в образце количественная ПЦР может выполняться для сотен генов одновременно в случае массивов с низкой плотностью. Второй подход - это микрочип гибридизации . Один массив или «чип» может содержать зонды для определения уровней транскрипта для каждого известного гена в геноме одного или нескольких организмов. В качестве альтернативы можно использовать технологии «на основе тегов», такие как последовательный анализ экспрессии генов (SAGE) и RNA-Seq , которые могут обеспечить относительную меру клеточной концентрации различных мРНК. Преимуществом методов на основе тегов является «открытая архитектура», позволяющая точно измерить любой транскрипт с известной или неизвестной последовательностью. Секвенирование следующего поколения (NGS), такое как RNA-Seq, - это еще один подход, позволяющий получить огромное количество данных о последовательностях, которые можно сопоставить с эталонным геномом. Хотя NGS является сравнительно трудоемким, дорогостоящим и ресурсоемким, он может идентифицировать однонуклеотидные полиморфизмы , варианты сплайсинга и новые гены, а также может использоваться для профилирования экспрессии в организмах, для которых имеется мало информации о последовательности или ее нет. .

Профили РНК в Википедии

An RNA Expression diagram.
Профиль экспрессии РНК транспортера GLUT4 (одного из основных транспортеров глюкозы в организме человека)

Подобные профили можно найти почти для всех белков, перечисленных в Википедии. Они созданы такими организациями, как Институт геномики исследовательского фонда Novartis и Европейский институт биоинформатики . Дополнительную информацию можно найти, выполнив поиск в их базах данных (для примера изображенного здесь транспортера GLUT4 см. Ссылку). [75] Эти профили показывают уровень экспрессии ДНК (и, следовательно, продуцируемой РНК) определенного белка в определенной ткани и имеют соответствующую цветовую кодировку на изображениях, расположенных в блоке для белков с правой стороны каждой страницы Википедии.

Количественное определение белка

Для генов, кодирующих белки, уровень экспрессии можно напрямую оценить с помощью ряда методов с некоторыми четкими аналогиями с методами количественной оценки мРНК.

Наиболее часто используемый метод [ необходима ссылка ] - это выполнение вестерн-блоттинга интересующего белка - это дает информацию о размере белка в дополнение к его идентичности. Образец (часто клеточный лизат ) отделяют на полиакриламидном геле , переносят на мембрану и затем исследуют антителом к интересующему белку. Антитело можно конъюгировать либо с флуорофором, либо с пероксидазой хрена для визуализации и / или количественной оценки. Гелевый характер этого анализа делает количественную оценку менее точной, но он имеет то преимущество, что позволяет идентифицировать более поздние модификации белка, например протеолиз или убиквитинирование, по изменению размера.

корреляция мРНК-белок

Количественное определение белка и мРНК позволяет корреляцию двух уровней. Вопрос о том, насколько хорошо уровни белка коррелируют с соответствующими уровнями транскриптов, очень обсуждается и зависит от множества факторов. Регуляция на каждом этапе экспрессии гена может влиять на корреляцию, как показано для регуляции трансляции [19] или стабильности белка. [76] Посттрансляционные факторы, такие как транспорт белка в высокополярных клетках, [77] также могут влиять на измеренную корреляцию мРНК-белок.

Локализация

Гибридизация in situ эмбрионов дрозофилы на разных стадиях развития для мРНК, ответственной за экспрессию горбунов . Высокая интенсивность синего цвета отмечает места с высоким количеством мРНК горбуна.

Анализ выражения не ограничивается количественной оценкой; локализация также может быть определена. мРНК может быть обнаружена с помощью соответствующим образом меченой комплементарной цепи мРНК, а белок может быть обнаружен с помощью меченых антител. Затем исследуемый образец исследуют под микроскопом, чтобы определить, где находится мРНК или белок.

A ribbon diagram of green fluorescent protein resembling barrel structure.
Трехмерная структура зеленого флуоресцентного белка . Остатки в центре «бочки» ответственны за производство зеленого света после воздействия синего света с более высокой энергией. Из PDB : 1EMA .

Путем замены гена новой версией, слитой с зеленым флуоресцентным белком (или подобным) маркером, экспрессия может быть непосредственно определена количественно в живых клетках. Это делается путем визуализации с помощью флуоресцентного микроскопа . Очень сложно клонировать слитый с GFP белок в его естественное место в геноме, не влияя на уровни экспрессии, поэтому этот метод часто нельзя использовать для измерения экспрессии эндогенного гена. Однако он широко используется для измерения экспрессии гена, искусственно введенного в клетку, например, с помощью вектора экспрессии . Важно отметить, что путем слияния целевого белка с флуоресцентным репортером поведение белка, включая его клеточную локализацию и уровень экспрессии, может быть значительно изменено.

Иммуноферментный анализ работает с использованием антител , иммобилизованные на микротитрационный планшет , чтобы захватить интерес белки из образцов , добавленных в скважину. Используя детектирующее антитело, конъюгированное с ферментом или флуорофором, количество связанного белка можно точно измерить флуорометрическим или колориметрическим детектированием. Процесс обнаружения очень похож на Вестерн-блоттинг, но, избегая стадий геля, можно достичь более точной количественной оценки.

Система выражения

Система индуцибельной shRNA Tet-ON

Система экспрессии - это система, специально разработанная для производства выбранного генного продукта. Обычно это белок, хотя также может быть РНК, такая как тРНК или рибозим . Система экспрессии состоит из гена, обычно кодируемого ДНК , и молекулярного аппарата, необходимого для транскрипции ДНК в мРНК и трансляции мРНК в белок с использованием предоставленных реагентов. В самом широком смысле это включает в себя каждую живую клетку, но этот термин чаще используется для обозначения экспрессии как лабораторного инструмента. Поэтому экспрессионная система зачастую в некотором роде искусственна. Однако системы экспрессии - это естественный процесс. Вирусы - отличный пример того, как они реплицируются с использованием клетки-хозяина в качестве системы экспрессии вирусных белков и генома.

Индуцируемое выражение

Доксициклин также используется в контролируемой тетрациклином активации транскрипции «Tet-on» и «Tet-off» для регулирования экспрессии трансгена в организмах и культурах клеток .

В природе

В дополнение к этим биологическим инструментам, некоторые наблюдаемые естественным образом конфигурации ДНК (гены, промоторы, энхансеры, репрессоры) и связанный с ними механизм сами по себе называются системой экспрессии. Этот термин обычно используется в случае, когда ген или набор генов включается при четко определенных условиях, например, система экспрессии простого переключения репрессора в фаге лямбда и система оператора lac у бактерий. Несколько систем естественной экспрессии непосредственно используются или модифицируются и используются для искусственных систем экспрессии, таких как системы экспрессии Tet-on и Tet-off .

Генные сети

Гены иногда рассматриваются как узлы в сети, где входными данными являются белки, такие как факторы транскрипции , а выходными данными - уровень экспрессии генов. Сам узел выполняет функцию, и работа этих функций интерпретируется как выполнение своего рода обработки информации в ячейках и определяет поведение ячейки.

Генные сети также могут быть построены без формулирования явной причинно-следственной модели. Это часто имеет место при сборке сетей из больших наборов данных выражений. [78] Ковариация и корреляция экспрессии вычисляются по большой выборке случаев и измерений (часто данные транскриптома или протеома ). Источник вариации может быть экспериментальным или естественным (наблюдательным). Существует несколько способов построения сетей экспрессии генов, но один общий подход состоит в том, чтобы вычислить матрицу всех попарных корреляций экспрессии по условиям, временным точкам или индивидуумам и преобразовать матрицу (после определения порога при некотором пороговом значении) в графическое представление, в котором узлы представляют гены, транскрипты или белки, а ребра, соединяющие эти узлы, представляют силу ассоциации (см. [1] ). [79]

Техники и инструменты

Следующие экспериментальные методы используются для измерения экспрессии генов и перечислены примерно в хронологическом порядке, начиная с более старых, более устоявшихся технологий. Они делятся на две группы в зависимости от степени их мультиплексности .

  • Техники низкого и среднего сплетения:
    • Репортерный ген
    • Нозерн-блот
    • Вестерн-блоттинг [80]
    • Флуоресцентная гибридизация in situ
    • ПЦР с обратной транскрипцией
  • Техники высшего сплетения:
    • МУДРЕЦ [81]
    • ДНК-микрочип [82]
    • Массив листов [83]
    • РНК-Seq [84]

Базы данных экспрессии генов

  • Омнибус экспрессии генов (GEO) в NCBI [85]
  • Атлас экспрессии в EBI
  • База данных по экспрессии генов мышей в лаборатории Джексона
  • CollecTF : база данных экспериментально подтвержденных сайтов связывания факторов транскрипции у бактерий. [86]
  • COLOMBOS: сборник бактериальных компендиумов экспрессии. [87]
  • База данных Many Microbe Microarrays : данные Affymetrix микробов [88]

Смотрите также

  • Тестирование молекулярной экспрессии AlloMap
  • Закладки
  • Выраженный тег последовательности
  • Атлас выражений
  • Профилирование выражений
  • Структура гена
  • Генная инженерия
  • Генетически модифицированный организм
  • Список биологических баз данных
  • Список генов человека
  • Осциллирующий ген
  • Парамутация
  • Производство белка
  • Очистка белков
  • Рибономика
  • Хребет
  • Инструмент профилирования последовательности
  • Транскрипционный разрыв
  • Транскрипционный шум
  • Расшифровка неизвестной функции

Рекомендации

  1. ^ Крика FH (1958). «О синтезе белка». Симпозиумы Общества экспериментальной биологии . 12 : 138–63. PMID  13580867 .
  2. ^ Крик Ф (август 1970 г.). «Центральная догма молекулярной биологии». Природа . 227 (5258): 561–3. Bibcode : 1970Natur.227..561C . DOI : 10.1038 / 227561a0 . PMID  4913914 .
  3. ^ «Центральная догма перевернута». Природа . 226 (5252): 1198–9. Июнь 1970 г. Bibcode : 1970Natur.226.1198. . DOI : 10.1038 / 2261198a0 . PMID  5422595 .
  4. ^ Темин Х.М., Мизутани С. (июнь 1970 г.). «РНК-зависимая ДНК-полимераза в вирионах вируса саркомы Рауса». Природа . 226 (5252): 1211–3. DOI : 10.1038 / 2261211a0 . PMID  4316301 .
  5. ^ Балтимор Д. (июнь 1970 г.). «РНК-зависимая ДНК-полимераза в вирионах РНК опухолевых вирусов». Природа . 226 (5252): 1209–11. DOI : 10.1038 / 2261209a0 . PMID  4316300 .
  6. ^ Айер Л.М., Кунин Е.В., Аравинд Л. (январь 2003 г.). «Эволюционная связь между каталитическими субъединицами ДНК-зависимых РНК-полимераз и эукариотических РНК-зависимых РНК-полимераз и происхождение РНК-полимераз» . BMC Структурная биология . 3 : 1. DOI : 10,1186 / 1472-6807-3-1 . PMC  151600 . PMID  12553882 .
  7. ^ Брюкнер Ф., Армаш К.Дж., Чунг А., Дамсма Г.Э., Кеттенбергер Х., Леманн Э., Сюдов Дж., Крамер П. (февраль 2009 г.). «Структурно-функциональные исследования комплекса элонгации РНК-полимеразы II» . Acta Crystallographica D . 65 (Pt 2): 112–20. DOI : 10.1107 / S0907444908039875 . PMC  2631633 . PMID  19171965 .
  8. ^ Кребс, Джоселин Э. (2017-03-02). Гены Левина XII . Голдштейн, Эллиотт С., Килпатрик, Стивен Т. Берлингтон, Массачусетс. ISBN 978-1-284-10449-3. OCLC  965781334 .
  9. ^ Сирри В., Уркуки-Инчима С., Руссель П., Эрнандес-Верден Д. (январь 2008 г.). «Ядрышко: завораживающее ядерное тело» . Гистохимия и клеточная биология . 129 (1): 13–31. DOI : 10.1007 / s00418-007-0359-6 . PMC  2137947 . PMID  18046571 .
  10. ^ Франк Д. Н., Пейс Н. Р. (1998). «Рибонуклеаза P: единство и разнообразие рибозима, обрабатывающего тРНК» . Ежегодный обзор биохимии . 67 : 153–80. DOI : 10.1146 / annurev.biochem.67.1.153 . PMID  9759486 .
  11. ^ Себальос М., Виоке А (2007). «тРНКаза Z». Буквы о белках и пептидах . 14 (2): 137–45. DOI : 10.2174 / 092986607779816050 . PMID  17305600 .
  12. ^ Вайнер AM (октябрь 2004 г.). «Созревание тРНК: полимеризация РНК без матрицы нуклеиновой кислоты» . Текущая биология . 14 (20): R883–5. DOI : 10.1016 / j.cub.2004.09.069 . PMID  15498478 .
  13. ^ Köhler A, Hurt E (октябрь 2007 г.). «Экспорт РНК из ядра в цитоплазму». Обзоры природы. Молекулярная клеточная биология . 8 (10): 761–73. DOI : 10,1038 / nrm2255 . PMID  17786152 .
  14. ^ Джамбхекар А., Дериси Дж. Л. (май 2007 г.). «Цис-действующие детерминанты асимметричного транспорта цитоплазматической РНК» . РНК . 13 (5): 625–42. DOI : 10,1261 / rna.262607 . PMC  1852811 . PMID  17449729 .
  15. ^ Амарал П.П., Дингер М.Э., Мерсер Т.Р., Мэттик Дж.С. (март 2008 г.). «Геном эукариот как машина РНК». Наука . 319 (5871): 1787–9. Bibcode : 2008Sci ... 319.1787A . DOI : 10.1126 / science.1155472 . PMID  18369136 .
  16. ^ Хансен Т.М., Баранов П.В., Иванов И.П., Гестеланд РФ, Аткинс Дж.Ф. (май 2003 г.). «Поддержание правильной открытой рамки считывания рибосомой» . EMBO Reports . 4 (5): 499–504. DOI : 10.1038 / sj.embor.embor825 . PMC  1319180 . PMID  12717454 .
  17. ^ Берк В., Кейт Дж. Х. (июнь 2007 г.). «Понимание биосинтеза белка из структур бактериальных рибосом». Текущее мнение в структурной биологии . 17 (3): 302–9. DOI : 10.1016 / j.sbi.2007.05.009 . PMID  17574829 .
  18. ^ Шванхойссер Б., Буссе Д., Ли Н., Дитмар Дж., Шуххардт Дж., Вольф Дж., Чен В., Зельбах М. (май 2011 г.). «Глобальная количественная оценка контроля экспрессии генов млекопитающих» (PDF) . Природа . 473 (7347): 337–42. Bibcode : 2011Natur.473..337S . DOI : 10,1038 / природа10098 . PMID  21593866 .
  19. ^ а б Шванхойссер Б., Буссе Д., Ли Н., Диттмар Дж., Шуххардт Дж., Вольф Дж., Чен В., Зельбах М. (март 2013 г.). «Исправление: Глобальная количественная оценка контроля экспрессии генов млекопитающих» . Природа . 495 (7439): 126–7. Bibcode : 2013Natur.495..126S . DOI : 10.1038 / nature11848 . PMID  23407496 .
  20. ^ Hegde RS, Kang SW (июль 2008 г.). «Концепция транслокационной регуляции» . Журнал клеточной биологии . 182 (2): 225–32. DOI : 10,1083 / jcb.200804157 . PMC  2483521 . PMID  18644895 .
  21. ^ Альбертс Б. , Джонсон А., Льюис Дж., Рафф М., Робертс К., Уолтерс П. (2002). «Форма и структура белков» . Молекулярная биология клетки; Четвертое издание . Нью-Йорк и Лондон: Наука о гирляндах. ISBN 978-0-8153-3218-3.
  22. ^ Анфинсен CB (июль 1972 г.). «Формирование и стабилизация структуры белка» . Биохимический журнал . 128 (4): 737–49. DOI : 10.1042 / bj1280737 . PMC  1173893 . PMID  4565129 .
  23. ^ Джереми М. Берг, Джон Л. Тимочко, Люберт Страйер ; Веб-контент Нила Д. Кларка (2002). «3. Структура и функции белка» . Биохимия . Сан-Франциско: WH Freeman. ISBN 978-0-7167-4684-3.CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  24. ^ Selkoe DJ (декабрь 2003 г.). «Смертельное сворачивание белков». Природа . 426 (6968): 900–4. Bibcode : 2003Natur.426..900S . DOI : 10,1038 / природа02264 . PMID  14685251 .
  25. ^ Альбертс Б., Брей Д., Хопкин К., Джонсон А., Льюис Дж., Рафф М., Робертс К., Уолтер П. (2010). «Структура и функции белка». Essential Cell Biology (3-е изд.). Нью-Йорк: Garland Science, Taylor and Francis Group, LLC. С. 120–170.
  26. ^ Hebert DN, Molinari M (октябрь 2007 г.). «В и из ER: сворачивание белка, контроль качества, деградация и родственные болезни человека» . Физиологические обзоры . 87 (4): 1377–408. DOI : 10.1152 / Physrev.00050.2006 . PMID  17928587 .
  27. ^ Рассел Р. (январь 2008 г.). «Неправильная укладка РНК и действие шаперонов» . Границы биологических наук . 13 (13): 1–20. DOI : 10,2741 / 2557 . PMC  2610265 . PMID  17981525 .
  28. ^ Кобер Л., Зехе С., Боде Дж. (Апрель 2013 г.). «Оптимизированные сигнальные пептиды для развития линий клеток СНО с высокой экспрессией». Биотехнология и биоинженерия . 110 (4): 1164–73. DOI : 10.1002 / bit.24776 . PMID  23124363 .
  29. ^ Моро П., Брандици Ф., Хантон С., Шатр Л., Мельсер С., Хоуз С., Сатья-Женеметр Б. (2007). «Интерфейс завода ER-Golgi: высокоструктурированный и динамичный мембранный комплекс» . Журнал экспериментальной ботаники . 58 (1): 49–64. DOI : 10.1093 / JXB / erl135 . PMID  16990376 .
  30. ^ Прудовский И., Тарантини Ф., Ландришина М., Нейвандт Д., Сольди Р., Киров А., Смолл Д., Катир К. М., Раджалингам Д., Кумар Т.К. (апрель 2008 г.). «Секрет без Гольджи» . Журнал клеточной биохимии . 103 (5): 1327–43. DOI : 10.1002 / jcb.21513 . PMC  2613191 . PMID  17786931 .
  31. ^ Заиди С.К., Янг Д.В., Чой Дж.Й., Пратап Дж., Джавед А., Монтесино М., Стейн Дж. Л., Лиан Дж. Б., ван Вейнен А. Дж., Стейн Г. С. (октябрь 2004 г.). «Внутриядерный оборот: организация и сборка регулирующих механизмов для комбинаторного биологического контроля» . Журнал биологической химии . 279 (42): 43363–6. DOI : 10.1074 / jbc.R400020200 . PMID  15277516 .
  32. ^ Маттик Дж. С., Амарал П. П., Дингер М. Е., Мерсер Т. Р., Мехлер М. Ф. (январь 2009 г.). «РНК-регуляция эпигенетических процессов» . BioEssays . 31 (1): 51–9. DOI : 10.1002 / bies.080099 . PMID  19154003 .
  33. ^ Мартинес Нью-Джерси, Уолхаут А.Дж. (апрель 2009 г.). «Взаимодействие между факторами транскрипции и микроРНК в регуляторных сетях на уровне генома» . BioEssays . 31 (4): 435–45. DOI : 10.1002 / bies.200800212 . PMC  3118512 . PMID  19274664 .
  34. ^ Томилин Н.В. (апрель 2008 г.). «Регулирование экспрессии генов млекопитающих ретроэлементами и некодирующими тандемными повторами» . BioEssays . 30 (4): 338–48. DOI : 10.1002 / bies.20741 . PMID  18348251 .
  35. ^ Вейтия РА (ноябрь 2008 г.). «Тысяча и один способ создания функционально похожих энхансеров транскрипции». BioEssays . 30 (11–12): 1052–7. DOI : 10.1002 / bies.20849 . PMID  18937349 .
  36. ^ Нгуен Т., Ниои П., Пикетт CB (май 2009 г.). «Путь передачи сигнала Nrf2-антиоксидантного ответного элемента и его активация окислительным стрессом» . Журнал биологической химии . 284 (20): 13291–5. DOI : 10.1074 / jbc.R900010200 . PMC  2679427 . PMID  19182219 .
  37. ^ Пол С. (ноябрь 2008 г.). «Дисфункция убиквитин-протеасомной системы при множественных заболеваниях: терапевтические подходы». BioEssays . 30 (11–12): 1172–84. DOI : 10.1002 / bies.20852 . PMID  18937370 .
  38. ^ Лос М., Маддика С., Эрб Б., Шульце-Остхофф К. (май 2009 г.). «Переключение Акт: от сигнала выживания к смертельной реакции» . BioEssays . 31 (5): 492–5. DOI : 10.1002 / bies.200900005 . PMC  2954189 . PMID  19319914 .
  39. ^ Verheul TC, van Hijfte L, Perenthaler E, Barakat TS (2020). «Почему YY1: механизмы регуляции транскрипции Инь Ян 1» . Front Cell Dev Biol . 8 : 592164. DOI : 10,3389 / fcell.2020.592164 . PMC  7554316 . PMID  33102493 .
  40. ^ Spitz F, Furlong EE (сентябрь 2012 г.). «Факторы транскрипции: от связывания энхансера до контроля развития». Nat Rev Genet . 13 (9): 613–26. DOI : 10.1038 / nrg3207 . PMID  22868264 .
  41. ^ а б Шенфельдер С., Фрейзер П. (август 2019 г.). «Дальние контакты энхансер-промотор в контроле экспрессии генов». Nat Rev Genet . 20 (8): 437–455. DOI : 10.1038 / s41576-019-0128-0 . PMID  31086298 .
  42. ^ Weintraub AS, Li CH, Zamudio AV, Sigova AA, Hannett NM, Day DS, Abraham BJ, Cohen MA, Nabet B, Buckley DL, Guo YE, Hnisz D, Jaenisch R, Bradner JE, Gray NS, Young RA (декабрь 2017 г. ). «YY1 является структурным регулятором петель энхансер-промотор» . Cell . 171 (7): 1573–1588.e28. DOI : 10.1016 / j.cell.2017.11.008 . PMC  5785279 . PMID  29224777 .
  43. ^ Lambert SA, Jolma A, Campitelli LF, Das PK, Yin Y, Albu M, Chen X, Taipale J, Hughes TR, Weirauch MT (февраль 2018 г.). «Факторы транскрипции человека» . Cell . 172 (4): 650–665. DOI : 10.1016 / j.cell.2018.01.029 . PMID  29425488 .
  44. ^ Гроссман С.Р., Энгрейц Дж., Рэй Дж. П., Нгуен Т.Х., Хакоэн Н., Ландер Е.С. (июль 2018 г.). «Позиционная специфичность различных классов факторов транскрипции в энхансерах» . Proc Natl Acad Sci USA . 115 (30): E7222 – E7230. DOI : 10.1073 / pnas.1804663115 . PMC  6065035 . PMID  29987030 .
  45. ^ Аллен Б.Л., Taatjes DJ (март 2015 г.). «Медиаторный комплекс: центральный интегратор транскрипции» . Nat Rev Mol Cell Biol . 16 (3): 155–66. DOI : 10.1038 / nrm3951 . PMC  4963239 . PMID  25693131 .
  46. ^ Михайличенко О., Бондаренко В., Харнетт Д., Шор И. Е., Самцы М., Виалес Р. Р., Ферлонг Е. Е. (январь 2018 г.). «Степень активности энхансера или промотора отражается уровнями и направленностью транскрипции эРНК» . Genes Dev . 32 (1): 42–57. DOI : 10,1101 / gad.308619.117 . PMC  5828394 . PMID  29378788 .
  47. ^ Ли QJ, Ян Ш., Маэда Y, Sladek FM, Sharrocks AD, Martins-Green M (январь 2003 г.). «Зависимая от фосфорилирования MAP-киназы активация Elk-1 приводит к активации соактиватора p300» . EMBO J . 22 (2): 281–91. DOI : 10,1093 / emboj / cdg028 . PMC  140103 . PMID  12514134 .
  48. ^ Карулло Н.В., Филлипс И. Р., Саймон Р. К., Сото С. А., Хайндс Дж. Э., Солсбери А. Дж., Реванна Дж. С., Баннер К. Д., Янов Л., Султан Ф. А., Савелл К. Э., Герсбах, Калифорния, Дэй Джей-Джей (сентябрь 2020 г.). «Энхансерные РНК предсказывают регуляторные связи энхансер-ген и имеют решающее значение для функции энхансера в нейронных системах» . Nucleic Acids Res . 48 (17): 9550–9570. DOI : 10.1093 / NAR / gkaa671 . PMC  7515708 . PMID  32810208 .
  49. ^ Левквист К., Додд И.Б., Снеппен К., Хертер Дж.О. (июнь 2016 г.). «Метилирование ДНК в эпигеномах человека зависит от локальной топологии сайтов CpG» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (11): 5123–32. DOI : 10.1093 / NAR / gkw124 . PMC  4914085 . PMID  26932361 .
  50. ^ Джаббари К., Бернарди Дж. (Май 2004 г.). «Метилирование цитозина и частоты CpG, TpG (CpA) и TpA». Джин . 333 : 143–9. DOI : 10.1016 / j.gene.2004.02.043 . PMID  15177689 .
  51. ^ Weber M, Hellmann I, Stadler MB, Ramos L, Pääbo S, Rebhan M, Schübeler D (апрель 2007 г.). «Распределение, потенциал молчания и эволюционное влияние метилирования промоторной ДНК в геноме человека». Nat. Genet . 39 (4): 457–66. DOI : 10.1038 / ng1990 . PMID  17334365 .
  52. ^ Ян Х, Хан Х, Де Карвалью Д. Д., Лэй Ф. Д., Джонс ПА, Лян Г. (октябрь 2014 г.). «Метилирование тела генов может изменять экспрессию генов и является терапевтической мишенью при раке» . Раковая клетка . 26 (4): 577–90. DOI : 10.1016 / j.ccr.2014.07.028 . PMC  4224113 . PMID  25263941 .
  53. ^ Maeder ML, Angstman JF, Richardson ME, Linder SJ, Cascio VM, Tsai SQ, Ho QH, Sander JD, Reyon D, Bernstein BE, Costello JF, Wilkinson MF, Joung JK (декабрь 2013 г.). «Направленное деметилирование ДНК и активация эндогенных генов с использованием программируемых слитых белков TALE-TET1» . Nat. Biotechnol . 31 (12): 1137–42. DOI : 10.1038 / nbt.2726 . PMC  3858462 . PMID  24108092 .
  54. ^ Ким Дж.Дж., Юнг М.В. (2006). «Нейронные цепи и механизмы, участвующие в формировании условного рефлекса страха Павлова: критический обзор» . Неврология и биоповеденческие обзоры . 30 (2): 188–202. DOI : 10.1016 / j.neubiorev.2005.06.005 . PMC  4342048 . PMID  16120461 .
  55. ^ а б Duke CG, Kennedy AJ, Gavin CF, Day JJ, Sweatt JD (июль 2017 г.). «Зависящая от опыта эпигеномная реорганизация в гиппокампе» . Обучение и память . 24 (7): 278–288. DOI : 10,1101 / lm.045112.117 . PMC  5473107 . PMID  28620075 .
  56. ^ а б Кейфер Дж. (Февраль 2017 г.). «Прайм-тайм для изучения генов» . Гены (Базель) . 8 (2). DOI : 10,3390 / genes8020069 . PMC  5333058 . PMID  28208656 .
  57. ^ Саксонов С., Берг П., Брутлаг Д.Л. (январь 2006 г.). «Полногеномный анализ динуклеотидов CpG в геноме человека позволяет выделить два различных класса промоторов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (5): 1412–7. Bibcode : 2006PNAS..103.1412S . DOI : 10.1073 / pnas.0510310103 . PMC  1345710 . PMID  16432200 .
  58. ^ Птица А (январь 2002 г.). «Паттерны метилирования ДНК и эпигенетическая память» . Гены и развитие . 16 (1): 6–21. DOI : 10,1101 / gad.947102 . PMID  11782440 .
  59. ^ Фогельштейн Б., Пападопулос Н., Велкулеску В.Е., Чжоу С., Диас Л.А., Кинзлер К.В. (март 2013 г.). «Пейзажи генома рака» . Наука . 339 (6127): 1546–58. Bibcode : 2013Sci ... 339.1546V . DOI : 10.1126 / science.1235122 . PMC  3749880 . PMID  23539594 .
  60. ^ Tessitore A, Cicciarelli G, Del Vecchio F, Gaggiano A, Verzella D, Fischietti M, Vecchiotti D, Capece D, Zazzeroni F, Alesse E (2014). «МикроРНК в сети повреждения / восстановления ДНК и рака» . Международный журнал геномики . 2014 : 1–10. DOI : 10.1155 / 2014/820248 . PMC  3926391 . PMID  24616890 .
  61. ^ miRBase.org
  62. ^ а б Friedman RC, Farh KK, Burge CB, Bartel DP (январь 2009 г.). «Большинство мРНК млекопитающих являются консервативными мишенями для микроРНК» . Геномные исследования . 19 (1): 92–105. DOI : 10.1101 / gr.082701.108 . PMC  2612969 . PMID  18955434 .
  63. ^ Лим LP, Лау NC, Гарретт-Энгеле П., Гримсон А., Шелтер Дж. М., Касл Дж., Бартель Д. П., Линсли П. С., Джонсон Дж. М. (февраль 2005 г.). «Анализ микроматрицы показывает, что некоторые микроРНК подавляют большое количество целевых мРНК». Природа . 433 (7027): 769–73. Bibcode : 2005Natur.433..769L . DOI : 10,1038 / природа03315 . PMID  15685193 .
  64. ^ Зельбах М., Шванхойссер Б., Тирфельдер Н., Фанг З., Ханин Р., Раевский Н. (сентябрь 2008 г.). «Широко распространенные изменения в синтезе белка, вызванные микроРНК». Природа . 455 (7209): 58–63. Bibcode : 2008Natur.455 ... 58S . DOI : 10,1038 / природа07228 . PMID  18668040 .
  65. ^ Бэк Д., Виллен Дж., Шин С., Камарго Ф. Д., Гиги С. П., Бартель Д. П. (сентябрь 2008 г.). «Влияние микроРНК на выход белка» . Природа . 455 (7209): 64–71. Bibcode : 2008Natur.455 ... 64В . DOI : 10,1038 / природа07242 . PMC  2745094 . PMID  18668037 .
  66. ^ Palmero EI, de Campos SG, Campos M, de Souza NC, Guerreiro ID, Carvalho AL, Marques MM (июль 2011 г.). «Механизмы и роль нарушения регуляции микроРНК в возникновении и прогрессировании рака» . Генетика и молекулярная биология . 34 (3): 363–70. DOI : 10.1590 / S1415-47572011000300001 . PMC  3168173 . PMID  21931505 .
  67. ^ Бернштейн C, Бернштейн H (май 2015 г.). «Эпигенетическое снижение репарации ДНК при прогрессировании рака желудочно-кишечного тракта» . Всемирный журнал онкологии желудочно-кишечного тракта . 7 (5): 30–46. DOI : 10,4251 / wjgo.v7.i5.30 . PMC  4434036 . PMID  25987950 .
  68. ^ Меллиос Н., Сур М. (2012). «Растущая роль микроРНК в шизофрении и расстройствах аутистического спектра» . Границы в психиатрии . 3 : 39. DOI : 10,3389 / fpsyt.2012.00039 . PMC  3336189 . PMID  22539927 .
  69. ^ Гиган М., Кэрнс MJ (август 2015 г.). «МикроРНК и посттранскрипционная дисрегуляция в психиатрии» . Биологическая психиатрия . 78 (4): 231–9. DOI : 10.1016 / j.biopsych.2014.12.009 . PMID  25636176 .
  70. ^ а б в Walsh CT, Garneau-Tsodikova S , Gatto GJ (декабрь 2005 г.). «Посттрансляционные модификации белков: химия диверсификации протеома». Angewandte Chemie . 44 (45): 7342–72. DOI : 10.1002 / anie.200501023 . PMID  16267872 . S2CID  32157563 .
  71. ^ Хури Г.А., Балибан Р.К., Флоудас Калифорния (сентябрь 2011 г.). «Статистика посттрансляционных модификаций в масштабе протеома: частотный анализ и курирование базы данных swiss-prot» . Научные отчеты . 1 (90): 90. Bibcode : 2011NatSR ... 1E..90K . DOI : 10.1038 / srep00090 . PMC  3201773 . PMID  22034591 .
  72. ^ Манн М., Дженсен О.Н. (март 2003 г.). «Протеомный анализ посттрансляционных модификаций». Природа Биотехнологии . 21 (3): 255–61. DOI : 10.1038 / nbt0303-255 . PMID  12610572 .
  73. ^ Со Дж., Ли К. Дж. (Январь 2004 г.). «Посттрансляционные модификации и их биологические функции: протеомный анализ и систематические подходы» . Журнал биохимии и молекулярной биологии . 37 (1): 35–44. DOI : 10.5483 / bmbrep.2004.37.1.035 . PMID  14761301 .
  74. ^ Роджерс Л.Д., Общий директор по менеджменту (декабрь 2013 г.) «Протеолитическая посттрансляционная модификация белков: протеомные инструменты и методология» . Молекулярная и клеточная протеомика . 12 (12): 3532–42. DOI : 10.1074 / mcp.M113.031310 . PMC  3861706 . PMID  23887885 .
  75. ^ «Профиль экспрессии РНК GLUT4» .
  76. ^ Буркхарт Дж. М., Водель М., Гамбарян С., Радау С., Вальтер Ю., Мартенс Л., Гейгер Дж., Сикманн А., Захеди Р. П. (октябрь 2011 г.). «Первый всесторонний и количественный анализ белкового состава тромбоцитов человека позволяет провести сравнительный анализ структурных и функциональных путей» . Кровь . 120 (15): e73–82. DOI : 10.1182 / кровь-2012-04-416594 . PMID  22869793 .
  77. ^ Moritz CP, Mühlhaus T, Tenzer S, Schulenborg T, Friauf E (июнь 2019 г.). «Плохая корреляция транскрипт-белок в мозге: отрицательно коррелирующие генные продукты показывают полярность нейронов как потенциальную причину» (PDF) . Журнал нейрохимии . 149 (5): 582–604. DOI : 10.1111 / jnc.14664 . PMID  30664243 .
  78. ^ Банф М., Ри С.Ю. (январь 2017 г.). «Вычислительный вывод сетей регуляции генов: подходы, ограничения и возможности» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - механизмы регуляции генов . 1860 (1): 41–52. DOI : 10.1016 / j.bbagrm.2016.09.003 . PMID  27641093 .
  79. ^ Чеслер Э.Дж., Лу Л., Ван Дж., Уильямс Р.В., Мэнли К.Ф. (май 2004 г.). «WebQTL: быстрый исследовательский анализ экспрессии генов и генетических сетей для мозга и поведения». Природа Неврологии . 7 (5): 485–6. DOI : 10.1038 / nn0504-485 . PMID  15114364 .
  80. ^ Песня Y, Ван W, Цюй X, Sun S (февраль 2009 г.). «Эффекты индуцируемого гипоксией фактора-1альфа (HIF-1альфа) на рост и адгезию в клетках плоскоклеточного рака языка». Индийский журнал медицинских исследований . 129 (2): 154–63. PMID  19293442 .
  81. ^ Ханриот Л., Кейме С., Гей Н., Фор С., Доссат С., Винкер П., Скоте-Блахон С., Пейрон С., Гандриллон О. (сентябрь 2008 г.). «Комбинация LongSAGE с секвенированием Solexa хорошо подходит для изучения глубины и сложности транскриптома» . BMC Genomics . 9 : 418. DOI : 10.1186 / 1471-2164-9-418 . PMC  2562395 . PMID  18796152 .
  82. ^ Уилан С.Дж., Мартинес Мурильо Ф., Боке Д.Д. (июль 2008 г.). «Невероятно сужающийся мир микрочипов ДНК» . Молекулярные биосистемы . 4 (7): 726–32. DOI : 10.1039 / b706237k . PMC  2535915 . PMID  18563246 .
  83. ^ Миякоши М., Нисида Х., Шинтани М., Ямане Х., Нодзири Х. (январь 2009 г.). «Картирование плазмидных транскриптомов в различных бактериях-хозяевах с высоким разрешением» . BMC Genomics . 10 : 12. DOI : 10.1186 / 1471-2164-10-12 . PMC  2642839 . PMID  19134166 .
  84. ^ Деноуд Ф., Оури Дж. М., Да Силва С., Ноэль Б., Рожье О., Делледон М., Морганте М., Валле Дж., Винкер П., Скарпелли С., Джайон О., Артигенав Ф (2008). «Аннотирование геномов с помощью массового секвенирования РНК» . Геномная биология . 9 (12): R175. DOI : 10.1186 / GB-2008-9-12-R175 . PMC  2646279 . PMID  19087247 .
  85. ^ Клаф Э., Барретт Т. (2016). «Омнибусная база данных по экспрессии генов». Статистическая геномика . Методы молекулярной биологии. 1418 . С. 93–110. DOI : 10.1007 / 978-1-4939-3578-9_5 . ISBN 978-1-4939-3576-5. PMC  4944384 . PMID  27008011 .
  86. ^ Килич С., Уайт Э.Р., Загитова Д.М., Корниш Дж. П., Эрилл I (январь 2014 г.). «CollecTF: база данных экспериментально подтвержденных сайтов связывания факторов транскрипции у бактерий» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (Выпуск базы данных): D156–60. DOI : 10.1093 / NAR / gkt1123 . PMC  3965012 . PMID  24234444 .
  87. ^ Моретто М., Сонего П., Дирксенс Н., Брилли М., Бьянко Л., Ледезма-Техейда Д. и др. (Январь 2016 г.). «COLOMBOS v3.0: использование компендиума экспрессии генов для межвидового анализа» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (D1): D620–3. DOI : 10.1093 / NAR / gkv1251 . PMC  4702885 . PMID  26586805 .
  88. ^ Фейт Дж.Дж., Дрисколл М.Э., Фусаро В.А., Косгроув Э.Д., Хайете Б., Джун Ф.С. и др. (Январь 2008 г.). «База данных многих микробов: единообразно нормализованные сборники Affymetrix со структурированными экспериментальными метаданными» . Исследования нуклеиновых кислот . 36 (выпуск базы данных): D866–70. DOI : 10.1093 / NAR / gkm815 . PMC  2238822 . PMID  17932051 .

Внешние ссылки

  • База данных факторов транскрипции растений и платформа для анализа данных и регуляции транскрипции растений

This page is based on a Wikipedia article Text is available under the CC BY-SA 4.0 license; additional terms may apply. Images, videos and audio are available under their respective licenses.

  • Terms of Use
  • Privacy Policy