Это хорошая статья. Для получения дополнительной информации нажмите здесь.
Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Генетический дрейф (также известный как дрейф аллелей или эффект Сьюэлла Райта ) [1] - это изменение частоты существующего варианта гена ( аллеля ) в популяции из-за случайной выборки организмов. [2] Аллели у потомства являются выборкой аллелей у родителей, и случай играет роль в определении того, выживет ли данный индивид и будет ли он воспроизводиться. Частота аллелей популяции - это доля копий одного гена, которые имеют определенную форму. [3]

Генетический дрейф может привести к полному исчезновению вариантов генов и тем самым уменьшить генетическую изменчивость . [4] Это также может привести к тому, что изначально редкие аллели стали намного более частыми и даже фиксированными.

Когда копий аллеля мало, влияние генетического дрейфа больше, а когда копий много, эффект меньше. В середине 20-го века велись ожесточенные дебаты об относительной важности естественного отбора по сравнению с нейтральными процессами, включая генетический дрейф. Рональд Фишер , который объяснил естественный отбор с использованием Менделя генетики , [5] высказал мнение , что генетический дрейф играет в основном незначительную роль в эволюции , и это остается доминирующим видом в течение нескольких десятилетий. В 1968 году популяционный генетик Мотоо Кимура возобновил дебаты своей нейтральной теорией молекулярной эволюции., который утверждает, что большинство случаев, когда генетические изменения распространяются в популяции (хотя и не обязательно изменения фенотипов ), вызваны генетическим дрейфом, воздействующим на нейтральные мутации . [6] [7]

Аналогия с шариками в банке [ править ]

Процесс генетического дрейфа можно проиллюстрировать с помощью 20 шариков в банке, представляющих 20 организмов в популяции. [8]Считайте эту банку с шариками стартовой популяцией. Половина шариков в банке красная, а половина - синяя, причем каждый цвет соответствует разному аллелю одного гена в популяции. В каждом новом поколении организмы воспроизводятся случайным образом. Чтобы представить эту репродукцию, случайным образом выберите шарик из оригинальной банки и поместите новый шарик того же цвета в новую. Это «потомок» оригинального мрамора, то есть оригинальный мрамор остается в своей банке. Повторяйте этот процесс, пока во второй банке не будет 20 новых шариков. Во второй банке теперь будет 20 «потомков», или шариков разных цветов. Если во второй банке не содержится ровно 10 красных и 10 синих шариков, произошел случайный сдвиг частот аллелей.

Если этот процесс повторяется несколько раз, количество красных и синих шариков, собранных в каждом поколении, будет колебаться. Иногда в банке будет больше красных шариков, чем в «родительской» банке, а иногда больше синих. Это колебание аналогично генетическому дрейфу - изменению частоты аллелей в популяции в результате случайного изменения распределения аллелей от одного поколения к другому.

Возможно даже, что в каком-то одном поколении не будут выбраны шарики определенного цвета, что означает, что у них нет потомства. В этом примере, если красные шарики не выбраны, банка, представляющая новое поколение, содержит только голубые потомки. Если это произойдет, красный аллель будет навсегда потерян в популяции, а оставшийся синий аллель станет фиксированным: все будущие поколения будут полностью синими. В небольших популяциях фиксация может произойти всего за несколько поколений.

В этой симуляции каждая черная точка на шарике означает, что он был выбран для копирования (воспроизведения) один раз. За пять поколений происходит фиксация синего «аллеля».

Вероятность и частота аллелей [ править ]

Механизмы генетического дрейфа можно проиллюстрировать на упрощенном примере. Рассмотрим очень большую колонию бактерий, изолированную в капле раствора. Бактерии генетически идентичны для одного гена с двумя аллелями , меченных исключением и Б . A и B - нейтральные аллели, что означает, что они не влияют на способность бактерий выживать и воспроизводиться; все бактерии в этой колонии имеют равную вероятность выживания и размножения. Предположим , что половина бактерии имеют аллель А , а другая половина имеет аллель B . Таким образом, A и B имеют частоту аллелей 1/2.

Затем капля раствора сжимается, пока в ней не останется пищи, достаточной для существования четырех бактерий. Все остальные бактерии погибают, не размножаясь. Среди четырех , которые выживают, есть шестнадцать возможных комбинаций для A и B аллелей:

(AAAA), (BAAA), (ABAA), (BBAA),
(AABA), (BABA), (ABBA), (BBBA),
(AAAB), (BAAB), (ABAB), (BBAB),
(AABB) ), (BABB), (ABBB), (BBBB).

Поскольку все бактерии в исходном растворе с равной вероятностью выживут при сжатии раствора, четыре выживших представляют собой случайную выборку из исходной колонии. Вероятность того, что каждый из четырех выживших имеет данную аллель 1/2, и поэтому вероятность того, что какая - либо конкретная комбинация аллелей происходит , когда психиатры решения является

(Исходный размер популяции настолько велик, что выборка фактически происходит с заменой). Другими словами, каждая из шестнадцати возможных комбинаций аллелей встречается с равной вероятностью с вероятностью 1/16.

Подсчитывая комбинации с одинаковым количеством A и B , мы получаем следующую таблицу.

Как показано в таблице, общее количество комбинаций, которые имеют такое же количество аллелей A, как и аллелей B, равно шести, а вероятность этой комбинации составляет 6/16. Общее количество других комбинаций равно десяти, поэтому вероятность неравного количества аллелей A и B составляет 10/16. Таким образом, хотя первоначальная колония началась с равным количеством A и Bаллелей, вполне возможно, что количество аллелей в оставшейся популяции из четырех членов не будет равным. Равные числа на самом деле менее вероятны, чем неравные числа. В последнем случае произошел генетический дрейф, потому что частоты аллелей популяции изменились из-за случайной выборки. В этом примере популяция сократилась до четырех случайных выживших - явление, известное как « узкое место» населения .

Вероятности количества копий аллеля A (или B ), которые выживают (данные в последнем столбце вышеприведенной таблицы), могут быть рассчитаны непосредственно из биномиального распределения, где «вероятность успеха» (вероятность наличия данного аллеля) равна 1/2 (т.е. вероятность того, что в комбинации есть k копий аллелей A (или B )), определяется как

где n = 4 - количество выживших бактерий.

Математические модели [ править ]

Математические модели генетического дрейфа могут быть разработаны с использованием либо процессов ветвления, либо уравнения диффузии, описывающего изменения частоты аллелей в идеализированной популяции . [9]

Модель Райта – Фишера [ править ]

Рассмотрим ген с двумя аллелями, A или B . В диплоидных популяциях, состоящих из N особей, имеется по 2 N копий каждого гена. У человека может быть две копии одного и того же аллеля или два разных аллеля. Мы можем назвать частоту одного аллеля p, а частоту другого q . Модель Райта-Фишера (названная в честь Сьюэлла Райта и Рональда Фишера ) предполагает, что поколения не пересекаются (например, однолетние растенияиметь ровно одно поколение в год) и что каждая копия гена, обнаруженная в новом поколении, отбирается независимо от всех копий гена в старом поколении. Тогда формула для расчета вероятности получения k копий аллеля, имевшего частоту p в последнем поколении, следующая [10] [11]

где символ " ! " означает факториальную функцию. Это выражение также может быть сформулировано с использованием биномиального коэффициента ,

Модель Морана [ править ]

Модель Морана предполагает перекрытие поколений. На каждом временном шаге выбирается одна особь для воспроизводства, а одна особь выбирается для смерти. Таким образом, на каждом временном шаге количество копий данного аллеля может увеличиваться на одну, уменьшаться на единицу или может оставаться неизменным. Это означает, что матрица перехода является трехдиагональной , а это означает, что математические решения для модели Морана проще, чем для модели Райта – Фишера. С другой стороны, компьютерное моделирование обычно легче выполнять с использованием модели Райта – Фишера, потому что необходимо вычислять меньше временных шагов. В модели Морана для прохождения одного поколения требуется N временных шагов, где N - этоэффективная численность населения . В модели Райта – Фишера требуется всего один. [12]

На практике модели Морана и Райта – Фишера дают качественно аналогичные результаты, но генетический дрейф проходит в два раза быстрее в модели Морана.

Другие модели дрифта [ править ]

Если дисперсия в количестве потомков намного больше, чем та, которую дает биномиальное распределение, предполагаемое моделью Райта-Фишера, то при одинаковой общей скорости генетического дрейфа (эффективный размер дисперсии) дрейф генов является менее мощной силой. по сравнению с выбором. [13] Даже для той же самой дисперсии, если более высокие моменты распределения числа потомков превышают моменты биномиального распределения, тогда снова сила генетического дрейфа существенно ослабевает. [14]

Случайные эффекты, отличные от ошибки выборки [ править ]

Случайные изменения частот аллелей также могут быть вызваны эффектами, отличными от ошибки выборки , например случайными изменениями давления отбора. [15]

Одним из важных альтернативных источников стохастичности , возможно, более важного, чем генетический дрейф, является генетический проект . [16] Генетический отбор - это воздействие на локус путем отбора сцепленных локусов. Математические свойства генетического проекта отличаются от свойств генетического дрейфа. [17] Направление случайного изменения частоты аллелей автокоррелировано между поколениями. [2]

Дрейф и фиксация [ править ]

Принцип Харди – Вайнберга гласит, что в достаточно больших популяциях частоты аллелей остаются постоянными от одного поколения к другому, если равновесие не нарушается миграцией , генетическими мутациями или отбором . [18]

Однако в конечных популяциях новые аллели не получаются в результате случайной выборки аллелей, переданных следующему поколению, но выборка может привести к исчезновению существующего аллеля. Поскольку случайная выборкаможет удалять, но не заменять аллель, и поскольку случайное снижение или увеличение частоты аллелей влияет на ожидаемое распределение аллелей для следующего поколения, генетический дрейф ведет популяцию к генетической однородности с течением времени. Когда аллель достигает частоты 1 (100%), он считается «фиксированным» в популяции, а когда аллель достигает частоты 0 (0%), он теряется. Меньшие популяции достигают фиксации быстрее, тогда как в пределах бесконечной популяции фиксация не достигается. Как только аллель фиксируется, дрейф генов прекращается, и частота аллелей не может измениться, если в популяцию не будет введен новый аллель посредством мутации или потока генов . Таким образом, даже несмотря на то, что генетический дрейф является случайным, бесцельным процессом, он действует, чтобы устранить генетические вариации.через некоторое время. [19]

Скорость изменения частоты аллелей из-за дрейфа [ править ]

Десять симуляций случайного генетического дрейфа одного данного аллеля с начальным частотным распределением 0,5, измеренного в течение 50 поколений, повторенных в трех репродуктивно синхронных популяциях разного размера. В этих симуляциях аллели дрейфуют до потери или фиксации (частота 0,0 или 1,0) только в самой маленькой популяции.

Предполагая, что генетический дрейф является единственной эволюционной силой, действующей на аллель, после t поколений во многих реплицируемых популяциях, начиная с частот аллелей p и q , дисперсия частоты аллелей в этих популяциях равна

[20]

Время фиксации или потери [ править ]

Предполагая, что генетический дрейф является единственной эволюционной силой, действующей на аллель, в любой момент времени вероятность того, что аллель в конечном итоге закрепится в популяции, - это просто его частота в популяции в это время. [21] Например, если частота p для аллеля A составляет 75%, а частота q для аллеля B составляет 25%, то при неограниченном времени вероятность того, что A в конечном итоге станет фиксированным в популяции, составляет 75%, а вероятность того, что B будет стать фиксированным составляет 25%.

Ожидаемое количество поколений, в которых произойдет фиксация, пропорционально размеру популяции, так что, по прогнозам, фиксация будет происходить гораздо быстрее в меньших популяциях. [22] Обычно для определения этих вероятностей используется эффективный размер популяции, который меньше, чем общая численность населения. Эффективная популяция ( N e ) учитывает такие факторы, как уровень инбридинга , стадию жизненного цикла, на которой популяция является наименьшей, а также тот факт, что одни нейтральные гены генетически связаны с другими, находящимися в процессе отбора. [13] Эффективный размер популяции не может быть одинаковым для всех генов в одной и той же популяции. [23]

Одна перспективная формула, используемая для аппроксимации ожидаемого времени до того, как нейтральный аллель станет фиксированным в результате генетического дрейфа, согласно модели Райта-Фишера:

где T - количество поколений, N e - эффективный размер популяции, а p - начальная частота для данного аллеля. Результатом является количество поколений, которое, как ожидается, пройдет до того, как произойдет фиксация данного аллеля в популяции с заданным размером ( N e ) и частотой аллеля ( p ). [24]

Ожидаемое время потери нейтрального аллеля в результате генетического дрейфа можно рассчитать как [10]

Когда мутация появляется только один раз в популяции, достаточно большой, чтобы начальная частота была незначительной, формулы можно упростить до [25]

для среднего числа поколений, ожидаемого до фиксации нейтральной мутации, и

для среднего числа поколений, ожидаемых до потери нейтральной мутации. [26]

Время потерь с дрейфом и мутациями [ править ]

Приведенные выше формулы применимы к аллелю, который уже присутствует в популяции и не подвержен ни мутации, ни естественному отбору. Если аллель теряется в результате мутации гораздо чаще, чем приобретается в результате мутации, то мутация, а также дрейф могут повлиять на время до потери. Если аллель, склонный к мутационной потере, начинается как фиксированный в популяции и теряется в результате мутации со скоростью m за репликацию, то ожидаемое время в поколениях до его потери в гаплоидной популяции определяется как

где - постоянная Эйлера . [27] Первое приближение представляет собой время ожидания до появления первого мутанта, обреченного на потерю, при этом потеря происходит относительно быстро из-за генетического дрейфа, занимая время N e  1 / m . Второе приближение представляет собой время, необходимое для детерминированной потери в результате накопления мутаций. В обоих случаях время до фиксации определяется мутацией через термин 1 / m и меньше зависит от эффективного размера популяции .

Против естественного отбора [ править ]

В естественных популяциях генетический дрейф и естественный отбор не действуют изолированно; оба явления всегда присутствуют вместе с мутацией и миграцией. Нейтральная эволюция является продуктом мутации и дрейфа, а не только дрейфа. Точно так же, даже когда отбор преодолевает дрейф генов, он может воздействовать только на вариации, которые обеспечивает мутация.

В то время как естественный отбор имеет направление, направляя эволюцию к наследуемой адаптации к текущей среде, генетический дрейф не имеет направления и управляется только математикой случая . [28] В результате дрейф влияет на частоту генотипов в популяции без учета их фенотипических эффектов. Напротив, отбор способствует распространению аллелей, фенотипические эффекты которых увеличивают выживаемость и / или воспроизводство их носителей, снижает частоту аллелей, вызывающих неблагоприятные признаки, и игнорирует нейтральные. [29]

Закон больших чисел предсказывает , что , когда абсолютное число копий аллеля мала (например, в небольших популяциях ), величина дрейфа на частотах аллелей за одно поколение больше. Величина дрейфа достаточно велика, чтобы подавить отбор при любой частоте аллеля, когда коэффициент отбора меньше 1, деленного на эффективный размер популяции. Неадаптивная эволюция, являющаяся результатом мутации и генетического дрейфа, поэтому считается последовательным механизмом эволюционных изменений, прежде всего в пределах небольших изолированных популяций. [30]Математика генетического дрейфа зависит от эффективного размера популяции, но неясно, как это связано с фактическим количеством особей в популяции. [16] Генетическая связь с другими генами, находящимися в процессе отбора, может уменьшить эффективный размер популяции, испытываемой нейтральным аллелем. При более высокой скорости рекомбинации уменьшается сцепление, а вместе с ним и этот локальный эффект на эффективный размер популяции. [31] [32] Этот эффект виден в молекулярных данных как корреляция между скоростью локальной рекомбинации и генетическим разнообразием , [33] и отрицательная корреляция между плотностью генов и разнообразием в некодирующих областях ДНК . [34]Стохастичность, связанная со сцеплением с другими генами, находящимися в процессе отбора, не то же самое, что ошибка выборки, и иногда известна как генетический проект , чтобы отличить его от генетического дрейфа. [16]

Когда частота аллелей очень мала, дрейф также может пересилить отбор даже в больших популяциях. Например, в то время как невыгодные мутации обычно быстро устраняются в больших популяциях, новые полезные мутации почти так же уязвимы для потери из-за генетического дрейфа, как и нейтральные мутации. До тех пор, пока частота аллеля полезной мутации не достигнет определенного порога, генетический дрейф не будет иметь никакого эффекта. [29]

Узкое место населения [ править ]

Изменения частоты аллелей в популяции после узкого места в популяции : быстрое и радикальное уменьшение численности популяции привело к уменьшению генетической изменчивости популяции .

Узкое место популяции - это когда популяция сокращается до значительно меньших размеров за короткий период времени из-за какого-то случайного экологического события. В истинном «узком месте» популяции шансы на выживание любого члена популяции являются чисто случайными и не улучшаются каким-либо определенным генетическим преимуществом. Узкое место может привести к радикальным изменениям частот аллелей, совершенно независимо от отбора. [35]

Воздействие узкого места среди населения может быть устойчивым, даже если узкое место вызвано разовым событием, например, стихийным бедствием. Интересный примером узкого места , вызывающее необычное генетическое распределение является относительно высокой долей людей с общей Стержень клеток цветовой слепотой ( ахроматопсия ) на Pingelap атолле в Микронезии . После узкого места инбридинг увеличивается. Это увеличивает ущерб, наносимый рецессивными вредными мутациями, в процессе, известном как инбридинговая депрессия . Наихудшие из этих мутаций отбираются, что приводит к потере других аллелей, генетически связанных с ними, в процессевыбор фона . [2] Для рецессивных вредных мутаций этот отбор может быть усилен как следствие узкого места из-за генетической очистки . Это приводит к дальнейшей утрате генетического разнообразия. Кроме того, устойчивое сокращение размера популяции увеличивает вероятность дальнейших колебаний аллелей из-за дрейфа в грядущих поколениях.

Генетическая изменчивость популяции может быть значительно уменьшена из-за узкого места, и даже полезные адаптации могут быть навсегда устранены. [36] Утрата изменчивости делает выжившую популяцию уязвимой для любых новых факторов отбора, таких как болезни, климатические изменения или сдвиг в доступном источнике пищи, потому что адаптация в ответ на изменения окружающей среды требует достаточной генетической изменчивости в популяции для естественного отбора. место. [37] [38]

В недавнем прошлом было много известных случаев нехватки населения. До прихода европейцев , североамериканские прерии были местом обитания для миллионов больше цыплят прерии . В Иллинойсе только их число сократилось с примерно 100 миллионов птиц в 1900 году до около 50 птиц в 1990 - е годы. Уменьшение численности популяции произошло в результате охоты и разрушения среды обитания, но следствием этого стала потеря большей части генетического разнообразия этого вида. Анализ ДНК, сравнивающий птиц середины века с птицами 1990-х годов, свидетельствует о резком сокращении генетической изменчивости всего за последние несколько десятилетий. В настоящее время прерийный цыпленок имеет низкий репродуктивный успех .[39]

Однако генетическая потеря, вызванная узким местом и генетическим дрейфом, может повысить приспособленность, как у Эрлихии . [40]

Чрезмерная охота также вызвала серьезное сокращение популяции северного морского слона в XIX веке. Уменьшение генетической изменчивости у них можно вывести, сравнив его с таковым у южного морского слона , на которого не так агрессивно охотились. [41]

Эффект основателя [ править ]

Когда очень немногие члены популяции мигрируют, чтобы сформировать отдельную новую популяцию, возникает эффект основателя. В течение периода после основания небольшая популяция испытывает интенсивный дрейф. На рисунке это приводит к фиксации аллеля красного.

Эффект основателя - это частный случай узкого места популяции, возникающий, когда небольшая группа в популяции отделяется от первоначальной популяции и формирует новую. Ожидается, что случайная выборка аллелей в только что сформированной новой колонии сильно искажает исходную популяцию, по крайней мере, в некоторых отношениях. [42] Возможно даже, что количество аллелей для некоторых генов в исходной популяции больше, чем количество копий генов в основателях, что делает невозможным полное представление. Когда новообразованная колония мала, ее основатели могут сильно повлиять на генетический состав популяции в далеком будущем.

Хорошо задокументированный пример - миграция амишей в Пенсильванию в 1744 году. Два члена новой колонии имели общий рецессивный аллель синдрома Эллиса – Ван Кревельда . Члены колонии и их потомки, как правило, религиозны изолированы и остаются относительно изолированными. В результате многих поколений инбридинга синдром Эллиса-Ван Кревельда сейчас гораздо более распространен среди амишей, чем среди населения в целом. [29] [43]

Разница в частотах генов между исходной популяцией и колонией может также привести к значительному расхождению этих двух групп в течение многих поколений. По мере увеличения различия или генетического расстояния две разделенные популяции могут стать разными, как генетически, так и фенетически , хотя этому расхождению способствуют не только генетический дрейф, но и естественный отбор, поток генов и мутации. Этот потенциал относительно быстрых изменений в частоте генов в колонии побудил большинство ученых рассматривать эффект основателя (и, как следствие, генетический дрейф) как важную движущую силу в эволюции новых видов.. Сьюэлл Райт был первым, кто придал такое значение случайному дрейфу и небольшим, недавно изолированным популяциям, своей теорией видообразования с изменяющимся балансом . [44] Вслед за Райтом Эрнст Майр создал множество убедительных моделей, чтобы показать, что снижение генетической изменчивости и небольшой размер популяции после эффекта основателя были критически важны для развития новых видов. [45] Однако сегодня эта точка зрения пользуется гораздо меньшей поддержкой, поскольку гипотеза неоднократно проверялась экспериментальными исследованиями, и результаты в лучшем случае были неоднозначными. [46]

История [ править ]

Роль случайного шанса в эволюции была впервые подчеркнута Арендом Л. Хагедорном и А.К. Хагедорн-Ворстхёвель Ла Брандом в 1921 году. [47] Они подчеркнули, что случайное выживание играет ключевую роль в потере вариативности популяций. Фишер (1922) ответил на это первым, хотя и незначительно неверным, математическим трактованием «эффекта Хагедорна». [48] Примечательно, что он ожидал, что многие естественные популяции были слишком большими (N ~ 10 000), чтобы эффекты дрейфа были существенными, а дрейф мыслей имел незначительное влияние на эволюционный процесс. Скорректированная математическая обработка и термин «генетический дрейф» позже был придуман основателем популяционной генетики , Sewall Райт. Он впервые использовал термин «дрейф» в 1929 году [49], хотя в то время он использовал его в смысле направленного процесса изменения или естественного отбора. Случайный дрейф из-за ошибки выборки стал известен как «эффект Сьюолла – Райта», хотя ему никогда не было вполне комфортно, когда ему дали свое имя. Райт называл все изменения частоты аллелей либо «устойчивым дрейфом» (например, отбор), либо «случайным дрейфом» (например, ошибкой выборки). [50] «Дрейф» стал использоваться как технический термин исключительно в стохастическом смысле. [51] Сегодня это обычно определяется еще более узко, с точки зрения ошибки выборки, [52] хотя это узкое определение не является универсальным.[53] [54]Райт писал, что «ограничение« случайного дрейфа »или даже« дрейфа »только одним компонентом - последствия случайного отбора проб, как правило, приводит к путанице». [50] Сьюэлл Райт рассмотрел процесс случайного генетического дрейфа посредством ошибки выборки, эквивалентный таковому при инбридинге, но более поздние исследования показали, что они различны. [55]

На заре современного эволюционного синтеза ученые начинали смешивать новую науку о популяционной генетике с теорией естественного отбора Чарльза Дарвина . В рамках этой концепции Райт сосредоточился на влиянии инбридинга на небольшие относительно изолированные популяции. Он представил концепцию адаптивного ландшафта, в котором такие явления, как скрещивание и генетический дрейф в небольших популяциях, могут оттолкнуть их от адаптивных пиков, что, в свою очередь, позволяет естественному отбору подтолкнуть их к новым адаптивным пикам. [56]Райт считал, что более мелкие популяции больше подходят для естественного отбора, потому что «инбридинг был достаточно интенсивным, чтобы создать новые системы взаимодействия посредством случайного дрейфа, но недостаточно интенсивным, чтобы вызвать случайную неадаптивную фиксацию генов». [57]

Взгляды Райта на роль генетического дрейфа в эволюционной схеме были противоречивыми почти с самого начала. Одним из самых громких и влиятельных критиков был коллега Рональд Фишер. Фишер признал, что генетический дрейф сыграл некоторую, но незначительную роль в эволюции. Фишера обвиняли в непонимании взглядов Райта, потому что в его критических замечаниях Фишер, казалось, утверждал, что Райт почти полностью отверг выбор. Для Фишера рассмотрение процесса эволюции как длительного, устойчивого и адаптивного развития было единственным способом объяснить постоянно растущую сложность более простых форм. Но споры между «градуалистами» и теми, кто больше склоняется к модели эволюции Райта, продолжаются, где отбор и дрейф вместе играют важную роль. [58]

В 1968 году Мотоо Кимура возобновил дебаты своей нейтральной теорией молекулярной эволюции, которая утверждает, что большинство генетических изменений вызвано генетическим дрейфом, воздействующим на нейтральные мутации. [6] [7]

Роль генетического дрейфа посредством ошибки выборки в эволюции подвергалась критике со стороны Джона Х. Гиллеспи [59] и Уильяма Б. Провайна , которые утверждали, что отбор по связанным сайтам является более важной стохастической силой.

См. Также [ править ]

  • Перипатрическое видообразование
  • Антигенный дрейф
  • Коалесцентная теория
  • Генофонд
  • Мейотический драйв

Примечания и ссылки [ править ]

  1. ^ Gould SJ (2002). «Глава 7, раздел« Синтез как упрочнение » ». Структура эволюционной теории .
  2. ^ a b c Masel J (октябрь 2011 г.). «Генетический дрейф» . Текущая биология . Cell Press . 21 (20): R837-8. DOI : 10.1016 / j.cub.2011.08.007 . PMID 22032182 . 
  3. ^ Футуйма 1998 , Глоссарий
  4. Перейти ↑ Star B, Spencer HG (май 2013 г.). «Влияние генетического дрейфа и потока генов на избирательное поддержание генетической изменчивости» . Генетика . 194 (1): 235–44. DOI : 10.1534 / genetics.113.149781 . PMC 3632471 . PMID 23457235 .  
  5. Перейти ↑ Miller 2000 , p. 54
  6. ^ а б Кимура М (февраль 1968 г.). «Скорость эволюции на молекулярном уровне». Природа . Издательская группа "Природа". 217 (5129): 624–6. Bibcode : 1968Natur.217..624K . DOI : 10.1038 / 217624a0 . PMID 5637732 . S2CID 4161261 .  
  7. ^ а б Футуйма 1998 , стр. 320
  8. ^ «Ошибка выборки и эволюция» . Понимание эволюции . Калифорнийский университет в Беркли . Архивировано 8 декабря 2015 года . Дата обращения 1 декабря 2015 .
  9. Wahl LM (август 2011 г.). «Фиксация при изменении N и s: классические подходы дают новые элегантные результаты» . Генетика . Американское общество генетиков . 188 (4): 783–5. DOI : 10.1534 / genetics.111.131748 . PMC 3176088 . PMID 21828279 .  
  10. ^ a b Hartl & Clark 2007 , стр. 112
  11. ^ Тиан 2008 , стр. 11
  12. Перейти ↑ Moran PA (1958). «Случайные процессы в генетике». Математические труды Кембриджского философского общества . 54 (1): 60–71. Bibcode : 1958PCPS ... 54 ... 60M . DOI : 10.1017 / S0305004100033193 .
  13. ^ a b Charlesworth B (март 2009 г.). «Основные концепции генетики: эффективный размер популяции и закономерности молекулярной эволюции и вариации». Обзоры природы. Генетика . Издательская группа "Природа" . 10 (3): 195–205. DOI : 10.1038 / nrg2526 . PMID 19204717 . S2CID 205484393 .  
  14. Der R, Эпштейн CL , Plotkin JB (сентябрь 2011 г.). «Обобщенные популяционные модели и природа генетического дрейфа». Теоретическая популяционная биология . Эльзевир . 80 (2): 80–99. DOI : 10.1016 / j.tpb.2011.06.004 . PMID 21718713 . 
  15. Li & Graur 1991 , стр. 28
  16. ^ a b c Гиллеспи JH (ноябрь 2001 г.). «Имеет ли значение размер популяции вида для его эволюции?» . Эволюция; Международный журнал органической эволюции . John Wiley & Sons от Общества изучения эволюции . 55 (11): 2161–9. DOI : 10.1111 / j.0014-3820.2001.tb00732.x . PMID 11794777 . S2CID 221735887 .  
  17. ^ Neher RA, Shraiman BI (август 2011). «Генетическая тяга и квазинейтральность в больших факультативно сексуальных популяциях» . Генетика . Американское общество генетиков. 188 (4): 975–96. arXiv : 1108,1635 . DOI : 10.1534 / genetics.111.128876 . PMC 3176096 . PMID 21625002 .  
  18. ^ Юэнс 2004
  19. Li & Graur 1991 , стр. 29
  20. ^ Бартон и др. 2007 , стр. 417
  21. ^ Futuyma 1998 , стр. 300
  22. Перейти ↑ Otto SP , Whitlock MC (июнь 1997). «Вероятность фиксации в популяциях изменяющегося размера» (PDF) . Генетика . Американское общество генетиков. 146 (2): 723–33. PMC 1208011 . PMID 9178020 . Архивировано 19 марта 2015 года (PDF) .   
  23. Перейти ↑ Cutter AD, Choi JY (август 2010). «Естественный отбор формирует нуклеотидный полиморфизм в геноме нематоды Caenorhabditis briggsae» . Геномные исследования . Лабораторный пресс Колд-Спринг-Харбор . 20 (8): 1103–11. DOI : 10.1101 / gr.104331.109 . PMC 2909573 . PMID 20508143 .  
  24. ^ Хедрик 2005 , стр. 315
  25. Li & Graur 1991 , стр. 33
  26. ^ Кимура и Охта 1971
  27. ^ Masel J , King OD, Моэн H (январь 2007). «Утрата адаптивной пластичности в течение длительного периода экологического застоя» . Американский натуралист . Издательство Чикагского университета от имени Американского общества естествоиспытателей . 169 (1): 38–46. DOI : 10.1086 / 510212 . PMC 1766558 . PMID 17206583 .  
  28. ^ «Естественный отбор: как работает эволюция» . Actionbioscience . Вашингтон, округ Колумбия: Американский институт биологических наук . Архивировано 6 января 2010 года . Проверено 24 ноября 2009 года .Интервью с Дугласом Дж. Футуймой . См. Ответ на вопрос: является ли естественный отбор единственным механизмом эволюции?
  29. ^ a b c Кавалли-Сфорца, Меноцци и Пьяцца 1996
  30. ^ Циммер 2001
  31. Перейти ↑ Golding 1994 , p. 46
  32. ^ Чарльзуорт B, Morgan MT, Чарльзуорт D (август 1993). «Влияние вредных мутаций на нейтральную молекулярную изменчивость» (PDF) . Генетика . Американское общество генетиков. 134 (4): 1289–303. PMC 1205596 . PMID 8375663 .   
  33. ^ Presgraves DC (сентябрь 2005). «Рекомбинация усиливает адаптацию белков у Drosophila melanogaster». Текущая биология . Cell Press. 15 (18): 1651–6. DOI : 10.1016 / j.cub.2005.07.065 . PMID 16169487 . S2CID 15120927 .  
  34. ^ Nordborg M, Hu TT, Ishino Y, Jhaveri J, Toomajian C, Zheng H, Bakker E, Calabrese P, Gladstone J, Goyal R, Jakobsson M, Kim S, Morozov Y, Padhukasahasram B, Plagnol V, Rosenberg NA, Shah С., Уолл Дж. Д., Ван Дж., Чжао К., Кальбфляйш Т., Шульц В., Крайтман М., Бергельсон Дж. (Июль 2005 г.). «Паттерн полиморфизма Arabidopsis thaliana» . PLOS Биология . Публичная научная библиотека . 3 (7): e196. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0030196 . PMC 1135296 . PMID 15907155 .  
  35. ^ Робинсон R, изд. (2003). «Узкое место населения» . Генетика . 3 . Нью-Йорк: Справочник Macmillan USA . ISBN 0-02-865609-1. LCCN  2002003560 . OCLC  614996575 . Проверено 14 декабря 2015 года .
  36. ^ Futuyma 1998 , стр. 303-304
  37. ^ O'Corry-Crowe G (март 2008). «Изменение климата и молекулярная экология арктических морских млекопитающих» . Экологические приложения . Экологическое общество Америки . 18 (2 доп.): С56-76. DOI : 10.1890 / 06-0795.1 . PMID 18494363 . 
  38. ^ Cornuet JM, Luikart G (декабрь 1996). «Описание и анализ мощности двух тестов для обнаружения недавних узких мест в популяции на основе данных частоты аллелей» . Генетика . Американское общество генетиков. 144 (4): 2001–14. PMC 1207747 . PMID 8978083 .  
  39. ^ Sadava et al. 2008 , гл. 1, 21–33, 52–57
  40. Перейти ↑ Dale C, Moran NA (август 2006 г.). «Молекулярные взаимодействия между бактериальными симбионтами и их хозяевами». Cell . 126 (3): 453–65. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.07.014 . PMID 16901780 . S2CID 15985536 .  
  41. ^ «Узкие места и эффекты основателя» . Понимание эволюции . Калифорнийский университет в Беркли. Архивировано 4 декабря 2015 года . Проверено 14 декабря 2015 года .
  42. Перейти ↑ Campbell 1996 , p. 423
  43. ^ «Генетический дрейф и эффект основателя» . Библиотека эволюции (Интернет-ресурс). Эволюция. Бостон, Массачусетс: Образовательный фонд WGBH ; Clear Blue Sky Productions, Inc. 2001. OCLC 48165595 . Архивировано 14 марта 2009 года . Проверено 7 апреля 2009 года . 
  44. ^ Вольф, Броди и Уэйд 2000
  45. Эй, Fitch и Аяла, 2005 г.
  46. ^ Говард & Berlocher 1998
  47. ^ Хагедорн, Алабама; Хагедорн-Форстхёвель Ла Бранд, AC (1921). Относительная ценность процессов, вызывающих эволюцию . Гаага: Мартинус Нийхофф.
  48. Перейти ↑ Fisher, RA (1922). «О соотношении доминирования». Труды Королевского общества Эдинбурга . 42 : 321–341. DOI : 10.1017 / s0370164600023993 .
  49. Райт S (ноябрь – декабрь 1929 г.). «Эволюция доминирования». Американский натуралист . Чикаго, Иллинойс: Издательство Чикагского университета от имени Американского общества естествоиспытателей. 63 (689): 556–561. DOI : 10.1086 / 280290 . ISSN 0003-0147 . JSTOR 2456825 .  
  50. ^ а б Райт S (1955). «Классификация факторов эволюции». Симпозиумы Колд-Спринг-Харбор по количественной биологии . Колд-Спринг-Харбор, Нью-Йорк: Лаборатория Колд-Спринг-Харбор. 20 : 16–24. DOI : 10.1101 / SQB.1955.020.01.004 . ISSN 0091-7451 . PMID 13433551 .   Симпозиум: «Популяционная генетика: природа и причины генетической изменчивости популяций».
  51. ^ Стивенсон 1991
  52. ^ Фриман и Херрон 2007
  53. ^ Masel J (август 2012). «Переосмысление Харди-Вайнберга и дрейфа генов в биологии бакалавриата». BioEssays . Джон Вили и сыновья. 34 (8): 701–10. DOI : 10.1002 / bies.201100178 . PMID 22576789 . S2CID 28513167 .  
  54. ^ Линч 2007
  55. ^ Crow JF (март 2010). «Райт и Фишер об инбридинге и случайном дрейфе» . Генетика . Американское общество генетиков. 184 (3): 609–11. DOI : 10.1534 / genetics.109.110023 . PMC 2845331 . PMID 20332416 .  
  56. ^ Larson 2004 , стр. 221-243
  57. Стивенсон 1991 : цитата, приписываемая Уильяму Б. Провайну в книге «Истоки теоретической популяционной генетики» (1971), стр. 162; Чикаго: Издательство Чикагского университета.
  58. ^ Аверс 1989
  59. ^ Gillespie JH (июнь 2000). «Генетический дрейф в бесконечной популяции. Модель псевдостопа» . Генетика . Американское общество генетиков. 155 (2): 909–19. PMC 1461093 . PMID 10835409 .  

Библиография [ править ]

  • Аверс CJ (1989). Процесс и образец в эволюции . Нью-Йорк: Издательство Оксфордского университета . ISBN 0-19-505275-7. LCCN  88005368 . OCLC  17677554 .
  • Бартон Н.Х. , Бриггс Д.Е. , Эйзен Дж. А. , Гольдштейн Д. Б. , Патель Н.Х. (2007). Эволюция . Колд-Спринг-Харбор, Нью-Йорк: Лаборатория Колд-Спринг-Харбор . ISBN 978-0-87969-684-9. LCCN  2007010767 . OCLC  86090399 .
  • Кэмпбелл Н.А. (1996). Биология . Серия Бенджамина / Каммингса в науках о жизни (4-е изд.). Менло-Парк, Калифорния: Benjamin / Cummings Pub. Co. ISBN 0-8053-1940-9. LCCN  95045572 . OCLC  33333455 .
  • Кавалли-Сфорца, LL , Menozzi P, Piazza A (1996). История и география человеческих генов (сокращенное издание в мягкой обложке). Принстон, Нью-Джерси: Издательство Принстонского университета . ISBN 0-691-02905-9. OCLC  35527063 .
  • Юэнс WJ (2004). Математическая популяционная генетика I. Теоретическое введение . Междисциплинарная прикладная математика. 27 (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer-Verlag . ISBN 0-387-20191-2. LCCN  2003065728 . OCLC  53231891 .
  • Фримен С., Херрон Дж. С. (2007). Эволюционный анализ (4-е изд.). Река Аппер Сэдл, штат Нью-Джерси: Pearson Prentice Hall . ISBN 978-0-13-227584-2. LCCN  2006034384 . OCLC  73502978 .
  • Футуйма Д (1998). Эволюционная биология (3-е изд.). Сандерленд, Массачусетс: Sinauer Associates . ISBN 0-87893-189-9. LCCN  97037947 . OCLC  37560100 .
  • Голдинг Б, изд. (1994). Ненейтральная эволюция: теории и молекулярные данные . Нью-Йорк: Чепмен и Холл . ISBN 0-412-05391-8. LCCN  93047006 . OCLC  29638235 .«Материалы семинара, организованного Канадским институтом перспективных исследований ».
  • Хартл Д.Л., Кларк А.Г. (2007). Принципы популяционной генетики (4-е изд.). Сандерленд, Массачусетс: Sinauer Associates. ISBN 978-0-87893-308-2. LCCN  2006036153 . OCLC  75087956 .
  • Хедрик П.В. (2005). Генетика популяций (3-е изд.). Бостон, Массачусетс: издательство "Джонс и Бартлетт" . ISBN 0-7637-4772-6. LCCN  2004056666 . OCLC  56194719 .
  • Привет, J , Fitch WM , Ayala FJ , ред. (2005). Систематика и происхождение видов: к 100-летию Эрнста Майра . Вашингтон, округ Колумбия: Пресса национальных академий . ISBN 978-0-309-09536-5. LCCN  2005017917 . OCLC  70745851 .
  • Говард DJ, Berlocher SH, ред. (1998). Бесконечные формы: виды и видообразование . Нью-Йорк: Издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0-19-510901-6. LCCN  97031461 . OCLC  37545522 .
  • Кимура М. , Охта Т. (1971). Теоретические аспекты популяционной генетики . Монографии по популяционной биологии. 4 . Принстон, Нью-Джерси: Издательство Принстонского университета . С. 1–219. ISBN 0-691-08096-8. LCCN  75155963 . OCLC  299867647 . PMID  5162676 .
  • Ларсон EJ (2004). Эволюция: замечательная история научной теории . Современные библиотечные хроники. 17 . Нью-Йорк: Современная библиотека . ISBN 0-679-64288-9. LCCN  2003064888 . OCLC  53483597 .
  • Ли В. , Граур Д. (1991). Основы молекулярной эволюции . Сандерленд, Массачусетс: Sinauer Associates. ISBN 0-87893-452-9. LCCN  90043581 . OCLC  22113526 .
  • Линч М. (2007). Истоки архитектуры генома . Сандерленд, Массачусетс: Sinauer Associates. ISBN 978-0-87893-484-3. LCCN  2007000012 . OCLC  77574049 .
  • Миллер Г (2000). Брачный разум: как сексуальный выбор повлиял на эволюцию человеческой природы . Нью-Йорк: Doubleday . ISBN 0-385-49516-1. LCCN  00022673 . OCLC  43648482 .
  • Садава Д., Хеллер Х. К. , Орианс Г. Х. , Пурвес В. К., Хиллис Д. М. (2008). Жизнь: Наука биологии . II: Эволюция, разнообразие и экология (8-е изд.). Сандерленд, Массачусетс; Гордонсвилл, Вирджиния: Sinauer Associates; WH Freeman and Company . ISBN 978-0-7167-7674-1. LCCN  2006031320 . OCLC  71632224 .
  • Стивенсон JC (1991). Словарь понятий физической антропологии . Справочные источники по общественным и гуманитарным наукам. 10 . Вестпорт, Коннектикут: Greenwood Press . ISBN 0-313-24756-0. LCCN  90022815 . OCLC  22732327 .
  • Тиан JP (2008). Эволюционные алгебры и их приложения . Конспект лекций по математике. 1921 . Берлин; Нью-Йорк: Спрингер. DOI : 10.1007 / 978-3-540-74284-5 . ISBN 978-3-540-74283-8. LCCN  2007933498 . OCLC  173807298 . Zbl  1136.17001 .
  • Вольф Дж. Б., Броди Э. Д., Уэйд М. Дж. , Ред. (2000). Эпистаз и эволюционный процесс . Оксфорд, Великобритания; Нью-Йорк: Издательство Оксфордского университета. ISBN 0-19-512806-0. LCCN  99046515 . OCLC  42603105 .
  • Циммер С. (2001). Эволюция: торжество идеи . Введение Стивеном Джеем Гулдом ; предисловие Ричарда Хаттона (1-е изд.). Нью-Йорк: HarperCollins . ISBN 0-06-019906-7. LCCN  2001024077 . OCLC  46359440 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Шихи, Боб. «Программа моделирования популяционной генетики» . Рэдфорд, Вирджиния: Рэдфордский университет . Проверено 21 декабря 2015 года .
  • Граймс, Билл. «Моделирование генетического дрейфа» . Тусон, Аризона: Университет Аризоны . Проверено 25 августа +2016 .