Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Для нетехнического введения в тему см. Введение в генетику . Для использования в других целях, см Геном (значения) .
Диаграмма метки, объясняющая различные части прокариотического генома

Часть серии по
Генетика
Гибридогенез в водных лягушках gametes.svg
 
Ключевые компоненты
История и темы
Исследование
Персонализированная медицина
Персонализированная медицина
Изображение 46 хромосом, составляющих диплоидный геном мужчины. ( Митохондриальная хромосома не показана.)

В области молекулярной биологии и генетики , A генома все генетический материал организма. [1] Он состоит из ДНК (или РНК в РНК-вирусах ). Генома включает в себя как гены (в кодирующих областях ) и кодирующую ДНК , [2] , а также митохондриальная ДНК [3] и хлоропласты ДНК . Изучение генома называется геномикой .

Происхождение термина [ править ]

Термин геном был создан в 1920 году Ганс Винклер , [4] профессор ботаники в университете Гамбурга , Германия. Оксфордский словарь предполагает, что это название представляет собой смесь слов « ген» и « хромосома» . [5] Тем не менее, см. Omics для более подробного обсуждения. Несколько связанного - OMe слова уже существует, такие как биом и корневище , образуя словарь , в который геном припадков систематически. [6]

Секвенирование и отображение [ править ]

Дополнительная информация: Проект генома

Последовательность генома - это полный список нуклеотидов (A, C, G и T для геномов ДНК), из которых состоят все хромосомы человека или вида. Внутри одного вида у разных особей подавляющее большинство нуклеотидов идентичны, но для понимания генетического разнообразия необходимо секвенирование нескольких особей.

Часть последовательности ДНК - прототипирование полного генома вируса

В 1976 году Уолтер Фирс в Университете Гента (Бельгия) был первым , чтобы установить полную нуклеотидную последовательность вирусной РНК-генома ( бактериофаг MS2 ). В следующем году Фред Сэнджер завершил первую последовательность ДНК-генома: фаг Φ-X174 , из 5386 пар оснований. [7] Первые полные последовательности генома среди всех трех доменов жизни были выпущены в течение короткого периода в середине 1990-х годов: первым секвенированным бактериальным геномом был геном Haemophilus influenzae , завершенный командой из Института геномных исследований.в 1995 году. Несколько месяцев спустя был завершен первый эукариотический геном с опубликованными последовательностями 16 хромосом почкующихся дрожжей Saccharomyces cerevisiae в результате предпринятых европейцами усилий, начатых в середине 1980-х годов. Первая последовательность генома архея , Methanococcus jannaschii , была завершена в 1996 году, опять же Институтом геномных исследований.

Развитие новых технологий сделало секвенирование генома значительно дешевле и проще, а количество полных последовательностей генома быстро растет. США Национальный институт здравоохранения поддерживает один из нескольких всеобъемлющих баз данных геномной информации. [8] Среди тысяч завершенных проектов секвенирования генома есть проекты риса , мышей , растения Arabidopsis thaliana , рыбы фугу и бактерии E. coli . В декабре 2013 года ученые впервые расшифровали весь геном в виде неандертальца , вымершего вида людей . Геном был извлечен изкость пальца неандертальца возрастом 130 000 лет, найденная в сибирской пещере . [9] [10]

Новые технологии секвенирования, такие как массовое параллельное секвенирование , также открыли перспективу индивидуального секвенирования генома в качестве диагностического инструмента, впервые предложенного Manteia Predictive Medicine . Важным шагом на пути к достижению этой цели стало завершение в 2007 году полного генома из Джеймс Д. Уотсон , один из соавторов первооткрывателей структуры ДНК. [11]

В то время как последовательность генома перечисляет порядок каждой основы ДНК в геноме, карта генома определяет ориентиры. Карта генома менее подробна, чем последовательность генома, и помогает ориентироваться в геноме. Проект генома человека был организован картой и последовательность в геноме человека . Фундаментальным шагом в реализации проекта стал выпуск подробной геномной карты Жаном Вайссенбахом и его командой в Genoscope в Париже. [12] [13]

Контрольные последовательности генома и карты продолжают обновляться, устраняя ошибки и уточняя области высокой аллельной сложности. [14] Снижение стоимости геномного картирования позволило генеалогическим сайтам предлагать его в качестве услуги [15] до такой степени, что можно представить свой геном в рамках краудсорсинговых научных исследований, таких как DNA.LAND в Центре генома в Нью-Йорке , [16 ] пример как эффекта масштаба, так и гражданской науки . [17]

Вирусные геномы [ править ]

Вирусные геномы могут состоять из РНК или ДНК. Геномы РНК-вирусов могут быть одноцепочечными или двухцепочечными РНК и могут содержать одну или несколько отдельных молекул РНК (сегменты: одно- или многочастичный геном). ДНК-вирусы могут иметь одноцепочечный или двухцепочечный геном. Большинство геномов ДНК-вирусов состоят из одной линейной молекулы ДНК, но некоторые из них состоят из кольцевой молекулы ДНК. [18] Существуют также вирусные РНК, называемые одноцепочечной РНК: она служит матрицей для синтеза мРНК [19] и одноцепочечная РНК: служит матрицей для синтеза ДНК.

Вирусная оболочка [20] - это внешний слой мембраны, который вирусные геномы используют для проникновения в хозяйскую клетку. Некоторые классы вирусной ДНК и РНК состоят из вирусной оболочки, а некоторые нет.

Прокариотические геномы [ править ]

Прокариоты и эукариоты имеют геномы ДНК. Археи и большинство бактерий имеют одну круговую хромосому , [21] Однако, некоторые виды бактерий имеют линейные или несколько хромосом. [22] [23] Если ДНК реплицируется быстрее, чем делятся бактериальные клетки, несколько копий хромосомы могут присутствовать в одной клетке, а если клетки делятся быстрее, чем ДНК может быть реплицирована, множественная репликация хромосомы инициируется до того, как происходит деление, что позволяет дочерним клеткам наследовать полные геномы и уже частично реплицированные хромосомы. У большинства прокариот в геномах очень мало повторяющейся ДНК. [24] Однако некоторые симбиотические бактерии (например, Serratia symbiotica) имеют уменьшенные геномы и высокую долю псевдогенов: только ~ 40% их ДНК кодирует белки. [25] [26]

У некоторых бактерий есть вспомогательный генетический материал, также являющийся частью их генома, который содержится в плазмидах . Для этого слово геном не следует использовать как синоним хромосомы .

Эукариотические геномы [ править ]

Смотрите также: тонкая структура эукариотической хромосомы

Геномы эукариот состоят из одной или нескольких линейных хромосом ДНК. Число хромосом колеблется в широких пределах от Джека Перемычка муравьев и бесполое nemotode , [27] каждый из которых имеет только одну пару, к папоротниковому виду , который имеет 720 пар. [28] Удивительно количество ДНК, которое содержат эукариотические геномы по сравнению с другими геномами. Это количество даже больше, чем необходимо для генов, кодирующих и некодирующих ДНК, из-за того, что эукариотические геномы изменяются в размерах в 64000 раз. [29] Однако эта особенность обусловлена ​​наличием повторяющейся ДНК и мобильных элементов (TE).

Типичная человеческая клетка имеет две копии каждой из 22 аутосом , по одной унаследованной от каждого родителя, плюс две половые хромосомы , что делает ее диплоидной. Гаметы , такие как яйцеклетки, сперматозоиды, споры и пыльца, гаплоидны, то есть они несут только одну копию каждой хромосомы. В дополнение к хромосомам в ядре органеллы, такие как хлоропласты и митохондрии, имеют свою собственную ДНК. Иногда говорят, что у митохондрий есть собственный геном, который часто называют « митохондриальным геномом ». ДНК, обнаруженная в хлоропласте, может быть названа « пластомом ». Как и бактерии, из которых они произошли, митохондрии и хлоропласты имеют круговую хромосому.

В отличие от прокариот, эукариоты имеют экзон-интронную организацию генов, кодирующих белок, и различное количество повторяющейся ДНК. У млекопитающих и растений большая часть генома состоит из повторяющейся ДНК. [30]

Последовательности кодирования [ править ]

Последовательности ДНК, которые несут инструкции по созданию белков, называются кодирующими последовательностями. Доля генома, занятая кодирующими последовательностями, широко варьируется. Геном большего размера не обязательно содержит больше генов, и доля неповторяющейся ДНК уменьшается вместе с увеличением размера генома у сложных эукариот. [30]

Состав генома человека

Некодирующие последовательности [ править ]

Основная статья: Некодирующая ДНК
Смотрите также: Межгенный регион

Некодирующие последовательности включают интроны , последовательности некодирующих РНК, регуляторные области и повторяющуюся ДНК. Некодирующие последовательности составляют 98% генома человека. В геноме есть две категории повторяющейся ДНК: тандемные повторы и вкрапленные повторы. [31]

Тандемные повторы [ править ]

Короткие некодирующие последовательности, которые повторяются от головы к хвосту, называются тандемными повторами . Микросателлиты состоят из 2-5 повторов пар оснований, а минисателлитные повторы имеют длину 30-35 п.н. Тандемные повторы составляют около 4% генома человека и 9% генома плодовой мушки. [32] Тандемные повторы могут быть функциональными. Например, у млекопитающих теломеры состоят из тандемного повтора TTAGGG, и они играют важную роль в защите концов хромосомы.

В других случаях увеличение количества тандемных повторов в экзонах или интронах может вызвать заболевание . [33] Например, ген хантингтина человека обычно содержит 6–29 тандемных повторов нуклеотидов CAG (кодирующих полиглутаминовый тракт). Расширение до более чем 36 повторов приводит к болезни Хантингтона , нейродегенеративному заболеванию. Известно, что двадцать заболеваний человека возникают в результате аналогичных тандемных повторений в различных генах. Механизм, с помощью которого белки с расширенными полигулатаминовыми путями вызывают гибель нейронов, полностью не изучен. Одна возможность состоит в том, что белки не могут правильно складываться и избегать деградации, вместо этого накапливаясь в агрегатах, которые также секвестрируют важные факторы транскрипции, тем самым изменяя экспрессию генов. [33]

Тандемные повторы обычно вызываются проскальзыванием во время репликации, неравным кроссинговером и преобразованием генов. [34]

Переносные элементы [ править ]

Мобильные элементы (TE) - это последовательности ДНК с определенной структурой, которые способны изменять свое положение в геноме. [32] [24] [35] TE классифицируются как механизм, который реплицируется путем копирования и вставки, или как механизм, который может быть вырезан из генома и вставлен в новое место. В геноме человека есть три важных класса TE, которые составляют более 45% ДНК человека; к этим классам относятся длинные вкрапленные ядерные элементы (LINE), вкрапленные ядерные элементы (SINE) и эндогенные ретровирусы. Эти элементы имеют большой потенциал для изменения генетического контроля в организме хозяина. [29]

Движение ТЕ является движущей силой эволюции генома у эукариот, поскольку их вставка может нарушать функции генов, гомологичная рекомбинация между ТЕ может вызывать дупликации, а ТЕ может перемещать экзоны и регуляторные последовательности в новые места. [36]

Ретротранспозоны [ править ]

Ретротранспозоны [37] обнаруживаются в основном у эукариот, но не встречаются у прокариот, а ретротранспозоны составляют значительную часть геномов многих эукариот. Ретротранспозон - это мобильный элемент, который переносится через промежуточное соединение РНК . Ретротранспозоны [38] состоят из ДНК , но транскрибируются в РНК для транспозиции, затем транскрипт РНК копируется обратно для образования ДНК с помощью особого фермента, называемого обратной транскриптазой. Ретротранспозоны, несущие в своем гене обратную транскриптазу, могут запускать собственную транспозицию, но гены, в которых отсутствует обратная транскриптаза, должны использовать обратную транскриптазу, синтезируемую другим ретротранспозоном. Ретротранспозонымогут быть транскрибированы в РНК, которые затем дублируются в другом сайте генома. [39] Ретротранспозоны можно разделить на длинные концевые повторы (LTR) и недлинные концевые повторы (Non-LTR). [36]

Длинные концевые повторы (LTR) происходят от древних ретровирусных инфекций, поэтому они кодируют белки, связанные с ретровирусными белками, включая gag (структурные белки вируса), pol (обратная транскриптаза и интеграза), pro (протеаза) и в некоторых случаях env ( конверт) гены. [35] Эти гены фланкированы длинными повторами как на 5 ', так и на 3' концах. Сообщалось, что LTR составляют наибольшую долю в геноме большинства растений и могут объяснять огромные различия в размере генома. [40]

Недлинные концевые повторы (Non-LTR) классифицируются как длинные вкрапленные ядерные элементы (LINE), короткие вкрапленные ядерные элементы (SINE) и элементы, подобные Пенелопе (PLE). В Dictyostelium discoideum есть еще один DIRS-подобные элементы, принадлежащие к Non-LTR. Не-LTR широко распространены в геномах эукариот. [41]

Длинные вкрапленные элементы (LINE) кодируют гены обратной транскриптазы и эндонуклеазы, что делает их автономными мобильными элементами. В геноме человека около 500 000 СТРОК, что составляет около 17% генома. [42]

Короткие вкрапленные элементы (SINE) обычно состоят из менее 500 пар оснований и не автономны, поэтому для транспозиции они полагаются на белки, кодируемые LINE. [43] Элемент Alu является наиболее распространенным синусоидальным элементом у приматов. Он составляет около 350 пар оснований и занимает около 11% генома человека с примерно 1 500 000 копий. [36]

Транспозоны ДНК [ править ]

Транспозоны ДНК кодируют фермент транспозазу между инвертированными концевыми повторами. При экспрессии транспозаза распознает концевые инвертированные повторы, фланкирующие транспозон, и катализирует его вырезание и повторное внедрение в новый сайт. [32] Этот механизм вырезания и вставки обычно повторно вставляет транспозоны рядом с их исходным местоположением (в пределах 100 КБ). [36] Транспозоны ДНК обнаружены в бактериях и составляют 3% генома человека и 12% генома круглого червя C. elegans . [36]

Размер генома [ править ]

Логарифмический график общего количества аннотированных белков в геномах, представленных в GenBank, в зависимости от размера генома.

Размер генома - это общее количество пар оснований ДНК в одной копии гаплоидного генома. Размер генома широко варьируется в зависимости от вида. У беспозвоночных небольшой геном, это также коррелирует с небольшим количеством мобильных элементов. У рыб и земноводных есть геномы среднего размера, а у птиц - относительно небольшие геномы, но было высказано предположение, что птицы потеряли значительную часть своих геномов на этапе перехода к полету. До этой потери метилирование ДНК позволяет адекватное расширение генома. [29]

У человека ядерный геном состоит приблизительно из 3,2 миллиарда нуклеотидов ДНК, разделенных на 24 линейных молекулы, самые короткие 50 000 000 нуклеотидов в длину и самые длинные 260 000 000 нуклеотидов, каждая из которых содержится в разных хромосомах. [44] Нет четкой и последовательной корреляции между морфологической сложностью и размером генома ни у прокариот, ни у низших эукариот . [30] [45] Размер генома во многом является функцией расширения и сжатия повторяющихся элементов ДНК.

Поскольку геномы очень сложны, одна из исследовательских стратегий состоит в том, чтобы сократить количество генов в геноме до минимума и при этом сохранить жизнеспособность рассматриваемого организма. Сейчас проводятся экспериментальные работы по минимальным геномам одноклеточных организмов, а также минимальным геномам многоклеточных организмов (см. Биология развития ). Работа проводится как in vivo, так и in silico . [46] [47]

Размер генома за счет подвижных элементов [ править ]

Существует множество огромных различий в размерах геномов, о которых мы особо упоминали ранее в отношении геномов многоклеточных эукариот. Основная причина такого большого разнообразия размеров заключается в наличии сменных элементов. Известно, что TE вносят вклад в значительное изменение массы ДНК клетки. [29] Этот процесс коррелирует с их долгосрочным размещением в геноме хозяина и, следовательно, с увеличением размера генома.

Вот таблица некоторых значимых или репрезентативных геномов. См. Также # См. Также списки секвенированных геномов.

Тип организмаОрганизмРазмер генома
( пары оснований )		Прибл. нет. геновПримечание
ВирусЦирковирус свиней типа 11,7591,8 кБНаименьшие вирусы, автономно реплицирующиеся в эукариотических клетках. [48]
ВирусБактериофаг MS23,5693,5 КБПервый секвенированный РНК-геном [49]
ВирусSV405,2245.2 КБ[50]
ВирусФаг Φ-X1745 3865,4 кБПервый секвенированный ДНК-геном [51]
ВирусВИЧ9 7499,7 кБ[52]
ВирусФаг λ48 50248,5 кБЧасто используется как вектор для клонирования рекомбинантной ДНК.

[53] [54] [55]

ВирусМегавирус1,259,1971,3 МБДо 2013 года самый крупный известный вирусный геном. [56]
ВирусPandoravirus salinus2,470,0002,47 МБСамый большой известный вирусный геном. [57]
Эукариотическая органеллаМитохондрия человека16 56916.6 кБ[58]
БактерияNasuia deltocephalinicola (штамм NAS-ALF)112 091112 кБ137Наименьший известный невирусный геном. Симбионт цикадок . [59]
БактерияКарсонелла руддии159 662160 КБЭндосимбионта из psyllid насекомых
БактерияBuchnera aphidicola600 000600 кБЭндосимбионт тли [60]
БактерияВигглсуортия глоссинидия700 000700 КБСимбионт в кишечнике мухи цеце
Бактерия - цианобактерияProchlorococcus spp. (1,7 Мб)1,700,0001,7 МБ1884Наименьший из известных геномов цианобактерий. Один из основных фотосинтезаторов на Земле. [61] [62]
БактерияHaemophilus influenzae1 830 0001,8 МБСеквенирование первого генома живого организма, июль 1995 г. [63]
Бактериякишечная палочка4 600 0004,6 МБ4 288[64]
Бактерия - цианобактерияNostoc punctiforme9 000 0009 МБ7 4327432 открытых рамки считывания [65]
БактерияSolibacter usitatus (штамм Ellin 6076)9 970 00010 МБ[66]
АмебовидныйПолихаос дубий ( «Амеба» дубия )670 000 000 000670 ГБСамый большой известный геном. [67] (оспаривается) [68]
РастениеGenlisea tuberosa61 000 00061 МБНаименьший зарегистрированный геном цветкового растения , 2014 г. [69]
РастениеArabidopsis thaliana135 000 000 [70]135 МБ27 655 [71]Секвенирование первого генома растения, декабрь 2000 г. [72]
РастениеPopulus trichocarpa480 000 000480 МБ73 013Секвенирование первого генома дерева, сентябрь 2006 г. [73]
РастениеFritillaria assyriaca130 000 000 000130 ГБ
РастениеParis japonica (родом из Японии, бледно-лепестковый)150 000 000 000150 ГБСамый крупный из известных геномов растений [74]
Растение - мохPhyscomitrella patens480 000 000480 МБСеквенирование первого генома мохообразного , январь 2008 г. [75]
Грибок - дрожжиSaccharomyces cerevisiae12 100 00012,1 МБ6 294Первый секвенированный геном эукариот, 1996 г. [76]
ГрибокAspergillus nidulans30 000 00030 МБ9 541[77]
НематодаPratylenchus coffeae20 000 00020 МБ[78] Наименьший известный геном животного [79]
НематодаCaenorhabditis elegans100 300 000100 МБ19 000Первое секвенирование генома многоклеточного животного, декабрь 1998 г. [80]
НасекомоеDrosophila melanogaster (плодовая муха)175 000 000175 МБ13 600Размер варьируется в зависимости от штамма (175–180 МБ; стандартный штамм yw - 175 МБ) [81]
НасекомоеApis mellifera (медоносная пчела)236 000 000236 МБ10 157[82]
НасекомоеBombyx mori (шелковая моль)432 000 000432 МБ14 62314 623 предсказанных гена [83]
НасекомоеSolenopsis invicta (огненный муравей)480 000 000480 МБ16 569[84]
МлекопитающееMus musculus2 700 000 0002,7 ГБ20 210[85]
МлекопитающееПан панискус3 286 640 0003,3 ГБ20 000Бонобо - предполагаемый размер генома 3,29 млрд п.н. [86]
МлекопитающееHomo sapiens3 000 000 0003 ГБ20 000Размер генома Homo sapiens в 2001 г. оценивался в 3,2 Гбит / с [87] [88]

Первоначальное секвенирование и анализ генома человека [89]

ПтицаGallus gallus1 043 000 0001.0 ГБ20 000[90]
РыбыTetraodon nigroviridis (вид рыбы фугу)385 000 000390 МБНаименьший известный геном позвоночных составляет 340 Mb [91] [92] - 385 Mb. [93]
РыбыProtopterus aethiopicus (мраморная двоякодышащая рыба)130 000 000 000130 ГБИзвестен крупнейший геном позвоночных

Геномные изменения [ править ]

Все клетки организма происходят из одной клетки, поэтому ожидается, что они будут иметь идентичные геномы; однако в некоторых случаях возникают различия. Как процесс копирования ДНК во время деления клеток, так и воздействие мутагенов окружающей среды могут привести к мутациям в соматических клетках. В некоторых случаях такие мутации приводят к раку, потому что они заставляют клетки быстрее делиться и вторгаться в окружающие ткани. [94] В некоторых лимфоцитах иммунной системы человека рекомбинация V (D) J генерирует различные геномные последовательности, так что каждая клетка продуцирует уникальные антитела или рецепторы Т-клеток.

Во время мейоза диплоидные клетки дважды делятся с образованием гаплоидных зародышевых клеток. Во время этого процесса рекомбинация приводит к перетасовке генетического материала из гомологичных хромосом, так что каждая гамета имеет уникальный геном.

Перепрограммирование всего генома [ править ]

Общегеномное перепрограммирование в первичных половых клетках мышей включает стирание эпигенетического импринта, ведущее к тотипотентности . Перепрограммированию способствует активное деметилирование ДНК , процесс, который влечет за собой путь репарации эксцизией оснований ДНК . [95] Этот путь используется для удаления метилирования CpG (5mC) в первичных половых клетках. Стирание 5mC происходит за счет его превращения в 5-гидроксиметилцитозин (5hmC) за счет высоких уровней десять-одиннадцати ферментов диоксигеназы TET1 и TET2 . [96]

Эволюция генома [ править ]

Геномы - это больше, чем просто сумма генов организма, и они обладают характеристиками, которые можно измерить и изучить без привязки к деталям каких-либо конкретных генов и их продуктов. Исследователи сравнивают такие характеристики, как кариотип (число хромосом), размер генома , порядок генов, смещение использования кодонов и GC-контент, чтобы определить, какие механизмы могли привести к появлению большого разнообразия геномов, существующих сегодня (последние обзоры см. В Brown 2002; Saccone and Pesole 2003; Benfey and Protopapas 2004; Gibson and Muse 2004; Reese 2004; Gregory 2005).

Дупликации играют важную роль в формировании генома. Дупликация может варьироваться от удлинения коротких тандемных повторов до дублирования кластера генов и вплоть до дупликации целых хромосом или даже целых геномов . Такие дупликации, вероятно, фундаментальны для создания генетической новизны.

Горизонтальный перенос генов используется для объяснения того, почему часто существует крайнее сходство между небольшими частями геномов двух организмов, которые в остальном очень отдаленно связаны. Горизонтальный перенос генов, по-видимому, распространен среди многих микробов . Кроме того, эукариотические клетки, кажется, испытали перенос некоторого генетического материала из своих хлоропластных и митохондриальных геномов в свои ядерные хромосомы. Недавние эмпирические данные предполагают важную роль вирусов и субвирусных РНК-сетей, которые представляют главную движущую роль в создании генетической новизны и естественного редактирования генома.

В художественной литературе [ править ]

Произведения научной фантастики демонстрируют опасения по поводу доступности последовательностей генома.

Роман Майкла Крайтона 1990 года « Парк юрского периода» и последующий фильм рассказывают историю миллиардера, который создает тематический парк клонированных динозавров на отдаленном острове, что привело к катастрофическим последствиям. Генетик извлекает ДНК динозавров из крови древних комаров и заполняет пробелы ДНК современных видов, чтобы создать несколько видов динозавров. Теоретика хаоса просят высказать свое экспертное мнение о безопасности создания экосистемы с динозаврами, и он неоднократно предупреждает, что результаты проекта будут непредсказуемыми и, в конечном итоге, неконтролируемыми. Эти предупреждения об опасностях использования геномной информации - основная тема книги.

Действие фильма 1997 года « Гаттака» происходит в футуристическом обществе, где геномы детей спроектированы таким образом, чтобы содержать наиболее идеальную комбинацию черт их родителей, а такие показатели, как риск сердечных заболеваний и прогнозируемая продолжительность жизни, документируются для каждого человека на основе его генома. Люди, рожденные вне программы евгеники, известные как «In-Valids», страдают от дискриминации и переходят к черным профессиям. Главный герой фильма - Недействительный, который пытается преодолеть предполагаемые генетические разногласия и осуществить свою мечту о работе космическим навигатором. Фильм предостерегает от будущего, в котором геномная информация питает предрассудки и крайние классовые различия между теми, кто может и не может позволить себе генетически модифицированных детей. [97]

См. Также [ править ]

  • Размер бактериального генома
  • Криоконсервация генетических ресурсов животных
  • Браузер генома
  • Компилятор генома
  • Топология генома
  • Полногеномное исследование ассоциации
  • Список секвенированных геномов животных
  • Список секвенированных геномов архей
  • Список секвенированных бактериальных геномов
  • Список секвенированных эукариотических геномов
  • Список секвенированных геномов грибов
  • Список секвенированных геномов растений
  • Список секвенированных пластомов
  • Список секвенированных геномов протистов
  • Метагеномика
  • Микробиом
  • Молекулярная эпидемиология
  • Молекулярная патологическая эпидемиология
  • Молекулярная патология
  • Последовательность нуклеиновой кислоты
  • Пангеном
  • Точная медицина
  • Регуляторный ген
  • Sequenceome
  • Секвенирование всего генома

Ссылки [ править ]

  1. ↑ Рот, Стефани Клэр (1 июля 2019 г.). "Что такое геномная медицина?" . Журнал Медицинской библиотечной ассоциации . Университетская библиотечная система Питтсбургского университета. 107 (3). DOI : 10,5195 / jmla.2019.604 . ISSN  1558-9439 . PMC  6579593 . PMID  31258451 .
  2. ^ Brosius, J (2009), "фрагментированного Gene", Анналы Нью - Йоркской академии наук , 1178 (1): 186-93, Bibcode : 2009NYASA1178..186B , DOI : 10.1111 / j.1749-6632.2009.05004 .x , PMID 19845638 , S2CID 8279434  
  3. Перейти ↑ Ridley M (2006). Геном: автобиография вида в 23 главах (PDF) . Нью-Йорк: Многолетний Харпер. ISBN  978-0-06-019497-0. Архивировано из оригинального (PDF) 24 октября 2018 года . Дата обращения 11 мая 2016 .
  4. ^ Винклер HL (1920). Verbreitung und Ursache der Parthenogenesis im Pflanzen- und Tierreiche . Йена: Верлаг Фишер.
  5. ^ «Определение генома в Оксфордском словаре» . Проверено 25 марта 2014 года .
  6. ^ Ледерберг Дж, МакКрэй АТ (2001). " ' OME Свита' Omics - генеалогическая Сокровищница Слова" (PDF) . Ученый . 15 (7). Архивировано из оригинального (PDF) 29 сентября 2006 года.
  7. ^ "Все о генах" . www.beowulf.org.uk .
  8. ^ «Геномный дом» . 8 декабря 2010 . Проверено 27 января 2011 года .
  9. ↑ Zimmer C (18 декабря 2013 г.). «Ископаемые пальцы ноги обеспечивают полный геном неандертальца» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 18 декабря 2013 года .
  10. ^ Prüfer K, Racimo F, Patterson N, Jay F, Sankararaman S, Sawyer S и др. (Январь 2014). «Полная последовательность генома неандертальца с Горного Алтая» . Природа . 505 (7481): 43–49. Bibcode : 2014Natur.505 ... 43P . DOI : 10,1038 / природа12886 . PMC 4031459 . PMID 24352235 .  
  11. ↑ Wade N (31 мая 2007 г.). «Расшифрован геном первопроходца ДНК» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 2 апреля 2010 года .
  12. ^ "Что такое геном?" . Genomenewsnetwork.org. 15 января 2003 . Проверено 27 января 2011 года .
  13. ^ NCBI_user_services (29 марта 2004 г.). «Картографический информационный бюллетень» . Архивировано из оригинала 19 июля 2010 года . Проверено 27 января 2011 года .
  14. ^ Консорциум ссылок на геном. «Сборка генома» . Дата обращения 23 августа 2016 .
  15. ↑ Каплан, Сара (17 апреля 2016 г.). «Как ваши 20 000 генов определяют столько совершенно разных черт? Они многозадачны» . Вашингтон Пост . Проверено 27 августа +2016 .
  16. Перейти ↑ Hayden, Erika (2015). «Ученые надеются привлечь миллионы в« DNA.LAND » » . Природа . DOI : 10.1038 / nature.2015.18514 .
  17. ^ Циммер, Карл. «Игра геномов, серия 13: ответы и вопросы» . СТАТ . Проверено 27 августа +2016 .
  18. ^ Gelderblom, Hans R. (1996). Медицинская микробиология (4-е изд.). Галвестон, Техас: Медицинский филиал Техасского университета в Галвестоне.
  19. ^ Урри, Лиза А. (2016). Кэмпбелл Биология: седьмое издание . Нью-Йорк: Хобокен: Высшее образование Пирсона. С. 403–404. ISBN 0134093410.
  20. ^ Урри, Лиза A (2016). Кэмпбелл Биология: седьмое издание . Нью-Йорк: Хобокен: Высшее образование Пирсона. С. 403–404. ISBN 0134093410.
  21. ^ Samson RY, Bell SD (2014). «Биология архейных хромосом» . Журнал молекулярной микробиологии и биотехнологии . 24 (5–6): 420–27. DOI : 10.1159 / 000368854 . PMC 5175462 . PMID 25732343 .  
  22. ^ Chaconas G, Chen CW (2005). «Репликация линейных бактериальных хромосом: больше не ходить по кругу» . Бактериальная хромосома : 525–540. DOI : 10.1128 / 9781555817640.ch29 . ISBN 9781555812324.
  23. ^ «Бактериальные хромосомы» . Микробная генетика . 2002 г.
  24. ^ a b Кунин Э.В., Вольф Ю.И. (июль 2010 г.). «Ограничения и пластичность в эволюции генома и молекулярного феномена» . Обзоры природы. Генетика . 11 (7): 487–98. DOI : 10.1038 / nrg2810 . PMC 3273317 . PMID 20548290 .  
  25. ^ Маккатчеон JP, Moran NA (ноябрь 2011). «Экстремальное сокращение генома симбиотических бактерий». Обзоры природы. Микробиология . 10 (1): 13–26. DOI : 10.1038 / nrmicro2670 . PMID 22064560 . S2CID 7175976 .  
  26. ^ Land M, Hauser L, Jun SR, Nookaew I, Leuze MR, Ahn TH, Karpinets T, Lund O, Kora G, Wassenaar T, Poudel S, Ussery DW (март 2015). «Выводы за 20 лет секвенирования бактериального генома» . Функциональная и интегративная геномика . 15 (2): 141–61. DOI : 10.1007 / s10142-015-0433-4 . PMC 4361730 . PMID 25722247 .  
  27. ^ "Ученые обнаружили бесполого крошечного червяка, чья родословная насчитывает 18 миллионов лет" . ScienceDaily . Проверено 7 ноября 2017 года .
  28. ^ Khandelwal S (март 1990). «Хромосомная эволюция рода Ophioglossum L.». Ботанический журнал Линнеевского общества . 102 (3): 205–17. DOI : 10.1111 / j.1095-8339.1990.tb01876.x .
  29. ^ a b c d Чжоу, Wanding; Лян, Ганнин; Моллой, Питер Л .; Джонс, Питер А. (11 августа 2020 г.). «Метилирование ДНК делает возможным расширение генома, управляемое мобильными элементами» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 117 (32): 19359–19366. DOI : 10.1073 / pnas.1921719117 . ISSN 1091-6490 . PMC 7431005 . PMID 32719115 .   
  30. ^ а б в Левин Б. (2004). Гены VIII (8-е изд.). Река Аппер Сэдл, Нью-Джерси: Пирсон / Прентис-Холл. ISBN 978-0-13-143981-8.
  31. ^ Стоянович N, изд. (2007). Вычислительная геномика: современные методы . Wymondham: Horizon Bioscience. ISBN 978-1-904933-30-4.
  32. ^ a b c Падекен Дж, Целлер П., Гассер С.М. (апрель 2015 г.). «Повторите ДНК в организации и стабильности генома». Текущее мнение в области генетики и развития . 31 : 12–19. DOI : 10.1016 / j.gde.2015.03.009 . PMID 25917896 . 
  33. ↑ a b Usdin K (июль 2008 г.). «Биологические эффекты простых тандемных повторов: уроки болезней распространения повторений» . Геномные исследования . 18 (7): 1011–19. DOI : 10.1101 / gr.070409.107 . PMC 3960014 . PMID 18593815 .  
  34. ^ Li YC, Корол AB, Фахима T, Beiles A, E Нево (декабрь 2002). «Микросателлиты: геномное распределение, предполагаемые функции и мутационные механизмы: обзор» . Молекулярная экология . 11 (12): 2453–65. DOI : 10.1046 / j.1365-294X.2002.01643.x . PMID 12453231 . S2CID 23606208 .  
  35. ^ a b Wessler SR (ноябрь 2006 г.). «Мобильные элементы и эволюция геномов эукариот» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (47): 17600–01. Bibcode : 2006PNAS..10317600W . DOI : 10.1073 / pnas.0607612103 . PMC 1693792 . PMID 17101965 .  
  36. ^ a b c d e Казазян Х. Х. (март 2004 г.). «Мобильные элементы: драйверы эволюции генома». Наука . 303 (5664): 1626–32. Bibcode : 2004Sci ... 303.1626K . DOI : 10.1126 / science.1089670 . PMID 15016989 . S2CID 1956932 .  
  37. ^ «Транспозон | генетика» . Британская энциклопедия . Дата обращения 5 декабря 2020 .
  38. ^ Сандерс, Марк Фредерик (2019). Генетический анализ: комплексный подход третье издание . Нью-Йорк: Пирсон, всегда учится и совершенствуется. п. 425. ISBN 9780134605173.
  39. ^ Deininger PL, Moran СП, Батцер М.А., Kazazian HH (декабрь 2003). «Мобильные элементы и эволюция генома млекопитающих». Текущее мнение в области генетики и развития . 13 (6): 651–58. DOI : 10.1016 / j.gde.2003.10.013 . PMID 14638329 . 
  40. ^ Kidwell MG, Lisch DR (март 2000). «Мобильные элементы и эволюция генома хозяина». Тенденции в экологии и эволюции . 15 (3): 95–99. DOI : 10.1016 / S0169-5347 (99) 01817-0 . PMID 10675923 . 
  41. ^ Ричард GF, Kerrest A, Dujon B (декабрь 2008 г.). «Сравнительная геномика и молекулярная динамика повторов ДНК у эукариот» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 72 (4): 686–727. DOI : 10.1128 / MMBR.00011-08 . PMC 2593564 . PMID 19052325 .  
  42. ^ Cordaux R, Батцер MA (октябрь 2009). «Влияние ретротранспозонов на эволюцию генома человека» . Обзоры природы. Генетика . 10 (10): 691–703. DOI : 10.1038 / nrg2640 . PMC 2884099 . PMID 19763152 .  
  43. ^ Хан JS, Boeke JD (август 2005). «Ретротранспозоны LINE-1: модуляторы количества и качества экспрессии генов млекопитающих?». BioEssays . 27 (8): 775–84. DOI : 10.1002 / bies.20257 . PMID 16015595 . S2CID 26424042 .  
  44. ^ «Геном человека» . Проверено 19 августа 2016 .
  45. ↑ Грегори Т. Р., Никол Дж. А., Тамм Х, Куллман Б., Куллман К., Лейтч И. Дж., Мюррей Б. Г., Капраун Д. Ф., Грейлхубер Дж., Беннетт Мэриленд (январь 2007 г.) «Базы данных размеров эукариотических геномов» . Исследования нуклеиновых кислот . 35 (выпуск базы данных): D332–38. DOI : 10.1093 / NAR / gkl828 . PMC 1669731 . PMID 17090588 .  
  46. ↑ Glass JI, Assad-Garcia N, Alperovich N, Yooseph S, Lewis MR, Maruf M, Hutchison CA, Smith HO, Venter JC (январь 2006 г.). «Основные гены минимальной бактерии» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (2): 425–30. Bibcode : 2006PNAS..103..425G . DOI : 10.1073 / pnas.0510013103 . PMC 1324956 . PMID 16407165 .  
  47. Перейти ↑ Forster AC, Church GM (2006). «К синтезу минимальной клетки» . Молекулярная системная биология . 2 (1): 45. DOI : 10.1038 / msb4100090 . PMC 1681520 . PMID 16924266 .  
  48. ^ Mankertz P (2008). «Молекулярная биология цирковирусов свиней» . Вирусы животных: молекулярная биология . Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-22-6.
  49. ^ Fiers W, Contreras R, Duerinck F, Haegeman G, Iserentant D, Merregaert J, Min Jou W, Molemans F, Raeymaekers A, Van den Berghe A, Volckaert G, Ysebaert M (апрель 1976). «Полная нуклеотидная последовательность РНК бактериофага MS2: первичная и вторичная структура гена репликазы». Природа . 260 (5551): 500–07. Bibcode : 1976Natur.260..500F . DOI : 10.1038 / 260500a0 . PMID 1264203 . S2CID 4289674 .  
  50. ^ Fiers W, Contreras R, Haegemann G, Rogiers R, Van de Voorde A, Van Heuverswyn H, Van Herreweghe J, Volckaert G, Ysebaert M (май 1978). «Полная нуклеотидная последовательность ДНК SV40». Природа . 273 (5658): 113–20. Bibcode : 1978Natur.273..113F . DOI : 10.1038 / 273113a0 . PMID 205802 . S2CID 1634424 .  
  51. ↑ Sanger F, Air GM, Barrell BG, Brown NL, Coulson AR, Fiddes CA, Hutchison CA, Slocombe PM, Smith M (февраль 1977). «Нуклеотидная последовательность ДНК бактериофага phi X174». Природа . 265 (5596): 687–95. Bibcode : 1977Natur.265..687S . DOI : 10.1038 / 265687a0 . PMID 870828 . S2CID 4206886 .  
  52. ^ "Вирусология - вирус иммунодефицита человека и СПИД, структура: геном и белки ВИЧ" . Pathmicro.med.sc.edu. 1 июля 2010 . Проверено 27 января 2011 года .
  53. ^ Томасон л, Суд Д.Л., Bubunenko М, Костантино Н, Н Уилсон, Датт S, Оппенхайм А (апрель 2007 г.). «Рекомбинирование: генная инженерия бактерий с использованием гомологичной рекомбинации». Текущие протоколы в молекулярной биологии . Глава 1: Раздел 1.16. DOI : 10.1002 / 0471142727.mb0116s78 . ISBN 978-0-471-14272-0. PMID  18265390 . S2CID  490362 .
  54. ^ Суд DL, Оппенгейм AB, Adhya SL (январь 2007). «Новый взгляд на генетические сети лямбда бактериофагов» . Журнал бактериологии . 189 (2): 298–304. DOI : 10.1128 / JB.01215-06 . PMC 1797383 . PMID 17085553 .  
  55. ↑ Sanger F, Coulson AR, Hong GF, Hill DF, Petersen GB (декабрь 1982 г.). «Нуклеотидная последовательность лямбда-ДНК бактериофага». Журнал молекулярной биологии . 162 (4): 729–73. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (82) 90546-0 . PMID 6221115 . 
  56. Перейти ↑ Legendre M, Arslan D, Abergel C, Claverie JM (январь 2012 г.). «Геномика мегавируса и неуловимая четвертая область жизни» . Коммуникативная и интегративная биология . 5 (1): 102–06. DOI : 10,4161 / cib.18624 . PMC 3291303 . PMID 22482024 .  
  57. ^ Филипп N, Лежандр M, Doutre G, Couté Y, Poirot O, Lescot M, Arslan D, Seltzer V, Bertaux L, Bruley C, Garin J, Claverie JM, Abergel C (июль 2013 г.). «Пандоровирусы: вирусы амеб с геномом до 2,5 МБ, достигающие геномов паразитических эукариот» (PDF) . Наука . 341 (6143): 281–86. Bibcode : 2013Sci ... 341..281P . DOI : 10.1126 / science.1239181 . PMID 23869018 . S2CID 16877147 .   
  58. ↑ Anderson S, Bankier AT, Barrell BG, de Bruijn MH, Coulson AR, Drouin J, Eperon IC, Nierlich DP, Roe BA, Sanger F, Schreier PH, Smith AJ, Staden R, Young IG (апрель 1981). «Последовательность и организация митохондриального генома человека». Природа . 290 (5806): 457–65. Bibcode : 1981Natur.290..457A . DOI : 10.1038 / 290457a0 . PMID 7219534 . S2CID 4355527 .  
  59. ↑ Bennett GM, Moran NA (5 августа 2013 г.). «Маленький, меньший, самый маленький: происхождение и эволюция древних двойных симбиозов у ​​насекомых, питающихся флоэмами» . Геномная биология и эволюция . 5 (9): 1675–88. DOI : 10.1093 / GbE / evt118 . PMC 3787670 . PMID 23918810 .  
  60. Перейти ↑ Shigenobu S, Watanabe H, Hattori M, Sakaki Y, Ishikawa H (сентябрь 2000 г.). «Последовательность генома внутриклеточного бактериального симбионта тлей Buchnera sp. APS» . Природа . 407 (6800): 81–86. Bibcode : 2000Natur.407 ... 81S . DOI : 10.1038 / 35024074 . PMID 10993077 . 
  61. ^ Rocap G, Larimer FW, Lamerdin J, Malfatti S, Chain P, Ahlgren NA и др. (Август 2003 г.). «Дивергенция генома у двух экотипов Prochlorococcus отражает дифференциацию океанических ниш». Природа . 424 (6952): 1042–47. Bibcode : 2003Natur.424.1042R . DOI : 10,1038 / природа01947 . PMID 12917642 . S2CID 4344597 .  
  62. ^ Dufresne A, Salanoubat M, Partensky F, Artiguenave F, Axmann IM, Barbe V и др. (Август 2003 г.). «Последовательность генома цианобактерии Prochlorococcus marinus SS120, почти минимальный оксифотрофный геном» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (17): 10020–25. Bibcode : 2003PNAS..10010020D . DOI : 10.1073 / pnas.1733211100 . PMC 187748 . PMID 12917486 .  
  63. ^ Флейшман RD, Adams MD, белый O, Clayton RA, Kirkness EF, Kerlavage AR, Bult CJ, Tomb JF, Догерти Б.А., Меррик JM (июль 1995). «Полногеномное случайное секвенирование и сборка Haemophilus influenzae Rd». Наука . 269 (5223): 496–512. Bibcode : 1995Sci ... 269..496F . DOI : 10.1126 / science.7542800 . PMID 7542800 . S2CID 10423613 .  
  64. ^ Blattner FR, Plunkett G, Bloch CA, Perna NT, Burland V, Riley M и др. (Сентябрь 1997 г.). «Полная последовательность генома Escherichia coli K-12» . Наука . 277 (5331): 1453–62. DOI : 10.1126 / science.277.5331.1453 . PMID 9278503 . 
  65. ^ Микс JC, Elhai Дж, Thiel Т, Потс М, Larimer Ж, Lamerdin Дж, Predki Р, Р Атлас (2001). «Обзор генома Nostoc punctiforme, многоклеточной симбиотической цианобактерии». Фотосинтез Исследования . 70 (1): 85–106. DOI : 10,1023 / A: 1013840025518 . PMID 16228364 . S2CID 8752382 .  
  66. ^ Challacombe JF, Eichorst SA, Hauser L, M Land, Се G, Куске CR (15 сентября 2011). Стейнке Д. (ред.). «Биологические последствия приобретения и дупликации древних генов в большом геноме Candidatus Solibacter usitatus Ellin6076» . PLOS ONE . 6 (9): e24882. Bibcode : 2011PLoSO ... 624882C . DOI : 10.1371 / journal.pone.0024882 . PMC 3174227 . PMID 21949776 .  
  67. ^ Parfrey LW, Лар DJ, Katz LA (апрель 2008). «Динамическая природа эукариотических геномов» . Молекулярная биология и эволюция . 25 (4): 787–94. DOI : 10.1093 / molbev / msn032 . PMC 2933061 . PMID 18258610 .  
  68. ^ ScienceShot: Самый большой геном, когда-либо существовавший, заархивированный 11 октября 2010 года в Wayback Machine , комментирует: «Измерение Amoeba dubia и других простейших, у которых, как сообщается, очень большие геномы, было сделано в 1960-х годах с использованием грубого биохимического подхода, который теперь считается быть ненадежным методом для точного определения размера генома ".
  69. ↑ Fleischmann A, Michael TP, Rivadavia F, Sousa A, Wang W, Temsch EM, Greilhuber J, Müller KF, Heubl G (декабрь 2014 г.). «Эволюция размера генома и числа хромосом у плотоядных растений рода Genlisea (Lentibulariaceae) с новой оценкой минимального размера генома у покрытосеменных» . Летопись ботаники . 114 (8): 1651–63. DOI : 10.1093 / Aob / mcu189 . PMC 4649684 . PMID 25274549 .  
  70. ^ "Сборка генома" . Информационный ресурс по арабидопсису (ТАИР) .
  71. ^ "Детали - Arabidopsis thaliana - Ensembl Genomes 40" . plant.ensembl.org .
  72. ^ Greilhuber Дж, Борщ Т, Мюллер К, Worberg А, Porembski S, Barthlott Вт (ноябрь 2006 года). «Наименьшие геномы покрытосеменных, обнаруженные у lentibulariaceae, с хромосомами размером с бактерии». Биология растений . 8 (6): 770–77. DOI : 10,1055 / с-2006-924101 . PMID 17203433 . 
  73. ^ Tuskan GA, Difazio S, Jansson S, Bohlmann J, Grigoriev I, Hellsten U, et al. (Сентябрь 2006 г.). «Геном черного тополя, Populus trichocarpa (Torr. & Gray)» (PDF) . Наука . 313 (5793): 1596–604. Bibcode : 2006Sci ... 313.1596T . DOI : 10.1126 / science.1128691 . PMID 16973872 . S2CID 7717980 .   
  74. ^ Пеллисер J, Fay MF, Leitch IJ (15 сентября 2010). "Самый крупный из них эукариотический геном?" . Ботанический журнал Линнеевского общества . 164 (1): 10–15. DOI : 10.1111 / j.1095-8339.2010.01072.x .
  75. ^ Lang D, Zimmer А.Д., Rensing С.А., РЭСКВ R (октябрь 2008). «Изучение биоразнообразия растений: геном Physcomitrella и не только». Тенденции в растениеводстве . 13 (10): 542–49. DOI : 10.1016 / j.tplants.2008.07.002 . PMID 18762443 . 
  76. ^ "База данных генома Saccharomyces" . Yeastgenome.org . Проверено 27 января 2011 года .
  77. ^ Галаган JE, Кальво С.Е., Куомо С, Ма LJ, Уортман JR, Batzoglou С, и др. (Декабрь 2005 г.). «Секвенирование Aspergillus nidulans и сравнительный анализ с A. fumigatus и A. oryzae» . Природа . 438 (7071): 1105–15. Bibcode : 2005Natur.438.1105G . DOI : 10,1038 / природа04341 . PMID 16372000 . 
  78. ^ Leroy S, Bouamer S, S Моран, Fargette M (2007). «Размер генома нематод, паразитирующих на растениях». Нематология . 9 (3): 449–50. DOI : 10.1163 / 156854107781352089 .
  79. ^ Грегори TR (2005). «База данных размеров генома животных» . Грегори, Т.Р. (2016). База данных размеров генома животных.
  80. ^ C. Элеганс Секвенирование Consortium (декабрь 1998). «Последовательность генома нематоды C. elegans: платформа для изучения биологии». Наука . 282 (5396): 2012–18. Bibcode : 1998Sci ... 282.2012. . DOI : 10.1126 / science.282.5396.2012 . PMID 9851916 . S2CID 16873716 .  
  81. ↑ Ellis LL, Huang W, Quinn AM, Ahuja A, Alfrejd B, Gomez FE, Hjelmen CE, Moore KL, Mackay TF, Johnston JS, Tarone AM (июль 2014 г.). «Изменение размера внутрипопуляционного генома у D. melanogaster отражает изменение и пластичность жизненного цикла» . PLOS Genetics . 10 (7): e1004522. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1004522 . PMC 4109859 . PMID 25057905 .  
  82. ^ Консорциум по секвенированию генома медоносной пчелы (октябрь 2006 г.). «Понимание социальных насекомых из генома пчелы Apis mellifera» . Природа . 443 (7114): 931–49. Bibcode : 2006Natur.443..931T . DOI : 10,1038 / природа05260 . PMC 2048586 . PMID 17073008 .  
  83. ↑ Международный геном тутового шелкопряда (декабрь 2008 г.). «Геном чешуекрылого модельного насекомого, тутового шелкопряда Bombyx mori». Биохимия и молекулярная биология насекомых . 38 (12): 1036–45. DOI : 10.1016 / j.ibmb.2008.11.004 . PMID 19121390 . 
  84. ^ Вюрм У, Ван - J, Риба-Grognuz О, Корона М, Найгаард S, Хант Б. и др. (Апрель 2011 г.). «Геном огненного муравья Solenopsis invicta» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (14): 5679–84. Bibcode : 2011PNAS..108.5679W . DOI : 10.1073 / pnas.1009690108 . PMC 3078418 . PMID 21282665 .  
  85. ^ Church DM, Goodstadt L, Hillier LW, Zody MC, Goldstein S, She X и др. (Май 2009 г.). Робертс Р.Дж. (ред.). «Специфическая биология линии, выявленная завершенной сборкой генома мыши» . PLOS Биология . 7 (5): e1000112. DOI : 10.1371 / journal.pbio.1000112 . PMC 2680341 . PMID 19468303 .  
  86. ^ «Пан панискус (карликовый шимпанзе)» . nih.gov . Проверено 30 июня +2016 .
  87. ^ Эрик Лендер; и другие. (15 февраля 2001 г.). «Первоначальное секвенирование и анализ генома человека» . Природа . 409 (6822): 860–921. DOI : 10.1038 / 35057062 . PMID 11237011 .  Таблица 8.
  88. ^ "Функциональный и сравнительный информационный бюллетень геномики" . Ornl.gov. Архивировано из оригинального 20 сентября 2008 года.
  89. ^ Вентер Дж. С. , Адамс, доктор медицины, Майерс Э. У., Ли П. У., Фреска Р. Дж., Саттон Г. Г. и др. (Февраль 2001 г.). «Последовательность генома человека» . Наука . 291 (5507): 1304–51. Bibcode : 2001Sci ... 291.1304V . DOI : 10.1126 / science.1058040 . PMID 11181995 . 
  90. ^ Международный консорциум по секвенированию куриного генома (декабрь 2004 г.). «Последовательность и сравнительный анализ генома курицы обеспечивают уникальные перспективы эволюции позвоночных» . Природа . 432 (7018): 695–716. Bibcode : 2004Natur.432..695C . DOI : 10,1038 / природа03154 . ISSN 0028-0836 . PMID 15592404 .  
  91. ^ Roest Crollius Н, Жайон О, DaSilva С, Озуф-Costaz С, Fizames С, Фишер С, Bouneau л, Бийо А, Quetier Ж, Saurin Вт, Bernot А, Вайссенбах J (июль 2000 г.). «Характеристика и повторный анализ компактного генома пресноводного иглобрюха Tetraodon nigroviridis» . Геномные исследования . 10 (7): 939–49. DOI : 10.1101 / gr.10.7.939 . PMC 310905 . PMID 10899143 .  
  92. ^ Jaillon O, Aury JM, Brunet F, Petit JL, Stange-Thomann N, Mauceli E, et al. (Октябрь 2004 г.). «Дупликация генома костистых рыб Tetraodon nigroviridis выявляет ранний протокариотип позвоночных» . Природа . 431 (7011): 946–57. Bibcode : 2004Natur.431..946J . DOI : 10,1038 / природа03025 . PMID 15496914 . 
  93. ^ "Информация о проекте Tetraodon" . Архивировано из оригинального 26 сентября 2012 года . Проверено 17 октября 2012 года .
  94. ^ Martincorena I, Кэмпбелл PJ (сентябрь 2015). «Соматическая мутация в раковых и нормальных клетках». Наука . 349 (6255): 1483–89. Bibcode : 2015Sci ... 349.1483M . DOI : 10.1126 / science.aab4082 . PMID 26404825 . S2CID 13945473 .  
  95. ^ Hájková P, Джеффрис SJ, Ли C, Миллер N, Джексон SP, Сурани MA (июль 2010). «Репрограммирование всего генома в зародышевой линии мыши влечет за собой основной путь эксцизионной репарации» . Наука . 329 (5987): 78–82. Bibcode : 2010Sci ... 329 ... 78H . DOI : 10.1126 / science.1187945 . PMC 3863715 . PMID 20595612 .  
  96. ^ Hackett JA, Сенгупт R, Zylicz JJ, Мураки K, Ли C, вниз TA, Сураните MA (январь 2013). «Динамика деметилирования ДНК зародышевой линии и стирание отпечатка с помощью 5-гидроксиметилцитозина» . Наука . 339 (6118): 448–52. Bibcode : 2013Sci ... 339..448H . DOI : 10.1126 / science.1229277 . PMC 3847602 . PMID 23223451 .  
  97. ^ "Гаттака (фильм)" . Тухлые помидоры .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Бенфей П., Протопапас А.Д. (2004). Основы геномики . Прентис Холл.
  • Браун Т.А. (2002). Геномы 2 . Оксфорд: Bios Scientific Publishers. ISBN 978-1-85996-029-5.
  • Гибсон Дж., Муза С.В. (2004). Учебник по геномной науке (второе изд.). Сандерленд, Массачусетс: Sinauer Assoc. ISBN 978-0-87893-234-4.
  • Грегори Т.Р. (2005). Эволюция генома . Эльзевир. ISBN 978-0-12-301463-4.
  • Рис RJ (2004). Анализ генов и геномов . Чичестер: Джон Уайли и сыновья. ISBN 978-0-470-84379-6.
  • Saccone C, Pesole G (2003). Справочник по сравнительной геномике . Чичестер: Джон Уайли и сыновья. ISBN 978-0-471-39128-9.
  • Вернер Э (декабрь 2003 г.). «In silico многоклеточная системная биология и минимальные геномы». Открытие наркотиков сегодня . 8 (24): 1121–27. DOI : 10.1016 / S1359-6446 (03) 02918-0 . PMID  14678738 .

Внешние ссылки [ править ]

  • UCSC Genome Browser - просматривайте геном и аннотации для более чем 80 организмов.
  • genomecenter.howard.edu
  • Постройте молекулу ДНК
  • Некоторые сравнительные размеры генома
  • DNA Interactive: история науки о ДНК
  • ДНК с самого начала
  • Все о проекте "Геном человека" - с сайта Genome.gov.
  • База данных размеров генома животных
  • База данных размеров генома растений
  • ЗОЛОТО: База данных геномов онлайн
  • Сеть новостей генома
  • База данных NCBI Entrez Genome Project
  • NCBI Genome Primer
  • GeneCards - интегрированная база данных генов человека
  • BBC News - опубликована последняя глава "генома"
  • IMG (The Integrated Microbial Genomes system) - для анализа генома DOE-JGI
  • Анализ данных секвенирования нового поколения GeKnome Technologies - анализ данных секвенирования нового поколения для Illumina и 454 Service от GeKnome Technologies.