Немецкий ресурсный центр исследований генома


Немецкий ресурсный центр исследования генома ( RZPD, Resourcen z entrum P rimär d atenbank) был сервисным центром по генным и геномным исследованиям в БерлинеШарлоттенбурге и Гейдельберге .

В 1987 году Ганс Лерах и Гюнтер Цетнер основали Справочную библиотеку/Первичную базу данных (RLDB) в Имперском фонде исследований рака (ICRF) в Лондоне . [1] [2] RLDB распространяла макромассивы , созданные в ICRF [3] , среди исследовательских групп по всему миру. Макрочипы состояли из клонов геномных библиотек и библиотек кДНК , перенесенных на нейлоновые фильтры размером 22 × 22 см с помощью роботов, разработанных Zehetner в ICRF. Машины первого поколения достигли разрешения 1/100 мм с использованием двухфазных шаговых двигателей.в полушаговом режиме с 400 шагами за оборот. Эти роботы достигли плотности пятна более 400 точек на квадратный сантиметр, будучи запрограммированы на пространственное разрешение 0,015 мм при длине перемещения 600 мм. Второе поколение роботов, разработанных с 1991 по 1992 год, уже достигло плотности пятна до 2500 точек на квадратный сантиметр с использованием линейных двигателей . [4] Экспериментальные результаты, проведенные со стандартизированными материалами, были переданы исследователями и собраны в первичной базе данных . [5] В январе 1990 года Зехетнер был назначен ассоциированным научным сотрудником ICRF при тогдашнем генеральном директоре сэре Уолтере Бодмере .

В начале 1995 года RLDB переехала в Берлин, в Институт молекулярной генетики им. Макса Планка , где продолжила свою работу. [6]

Летом 1995 года Ресурсный центр был создан в рамках Немецкого проекта генома человека (DHGP) [7] Гансом Лерахом (Институт молекулярной генетики им. Макса Планка (MPIMG), Берлин-Далем ), Гюнтером Цетнером (MPIMG, до июль 2000 г. научный руководитель Берлинского ресурсного центра) и Аннемари Пустка ( Немецкий центр исследования рака (DKFZ), Гейдельберг). В качестве Ресурсного центра/основной базы данных (RZPD) он взял на себя работу RLDB. Он финансировался Федеральным министерством образования и исследований (BMBF), чтобы бесплатно предоставлять материалы членам DHGP, в то время как они были доступны другим исследователям за плату. РЗПД стала крупнейшейбазу данных генетических клонов по всему миру и был связан со многими крупными национальными и международными проектами по исследованию генов и генома. RZPD была одним из двух дистрибьюторов клонов кДНК IMAGE в Европе , а также создала свои собственные библиотеки плазмид , космид , YAC и кДНК . Каждый клон хранили в лунках 96- или 384-луночных микротитрационных планшетов , которые хранили, пока не использовали для нанесения пятен, в морозильных камерах при температуре -80°C.

1 июля 2000 г. РЗПД была преобразована в некоммерческую организацию Gesellschaft mit beschränkter Haftung (gGmbH). Эта компания с ограниченной ответственностью была поддержана тремя наиболее важными исследовательскими компаниями в Германии: Обществом Макса Планка , Немецким центром исследования рака и Центром молекулярной медицины Макса Дельбрюка (MDC Berlin-Buch ). Членами научной компании были Ханс Лерах (MPIMG), Аннемари Пустка (DKFZ), Йенс Райх (MDC), Матиас Улен ( Каролинский институт , Стокгольм ) и Харальд цур Хаузен (DKFZ).

31 июля 2007 года некоммерческая компания была расформирована. Большая часть существующих услуг была передана двум новым компаниям. ImaGenes (стартап бывших управляющих директоров РЗПД) и ATLAS Biolabs GmbH , которую Лехрах основал вместе с бывшими руководителями отделов РЖД Уве Раделофом и Берндом Дрешером. [8]