Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
IUPHAR / BPS Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ
Путеводитель по ФАРМАКОЛОГИИ logo long.jpg
Содержание
ОписаниеИнтернет-портал с открытым доступом к фармакологической информации обо всех людях, являющихся мишенями рецептурных лекарств.
Типы данных
захвачены		Номенклатура мишеней, фармакологические данные, лигандные структуры
ОрганизмыЧеловек, Мышь, Крыса
Контакт
Исследовательский центрЭдинбургский университет, Великобритания
Первичное цитированиеРуководство IUPHAR / BPS по ФАРМАКОЛОГИИ на 2020 год: расширение содержания иммунофармакологии и введение Руководства IUPHAR / MMV по ФАРМАКОЛОГИИ МАЛЯРИИ [1]
Доступ
Интернет сайтwww .guidetopharmacology .org
URL-адрес веб-службыwww .guidetopharmacology .org / webServices .jsp
Конечная точка Sparqlrdf .guidetopharmacology .org / sparql
Разное
Управление версиямиКонтент обновляется примерно раз в квартал (например, в 2020.2 указывается [год]. [Номер выпуска])
Политика курированияРуководство, собственное производство

Руководство IUPHAR / BPS по ФАРМАКОЛОГИИ - это веб - сайт с открытым доступом , служащий порталом для информации о биологических мишенях лицензированных лекарств и других малых молекул. Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ (стандартное сокращение - GtoPdb) разработано как совместное предприятие Международного союза фундаментальной и клинической фармакологии (IUPHAR) и Британского фармакологического общества.(БПС). Это заменяет и расширяет исходную базу данных IUPHAR 2009 г. (стандартное сокращение IUPHAR-DB). Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ направлено на предоставление краткого обзора всех фармакологических целей, доступного для всех членов научного и клинического сообществ и заинтересованной общественности, со ссылками на подробную информацию по выбранному набору целей. Представленная информация включает фармакологические данные, номенклатуру мишеней и генов, а также тщательно подобранную химическую информацию для лигандов. Включены обзоры и комментарии по каждому целевому семейству со ссылками на ключевые ссылки.

Предпосылки и развитие [ править ]

Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ было первоначально размещено в Интернете в декабре 2011 года, а дополнительные материалы были выпущены в июле 2012 года. Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ, поддерживаемое группой кураторов из Эдинбургского университета, разработано международной сетью участников, в том числе редакторами журнала Руководство Сжатого к ФАРМАКОЛОГИИ . Как и в случае с исходной IUPHAR-DB, Комитет Международного союза фундаментальной и клинической фармакологии (IUPHAR) по номенклатуре рецепторов и классификации лекарственных средств (NC-IUPHAR) выступает в качестве научного консультативного и редакционного совета для базы данных. Его сеть из более чем 500 специалистов-консультантов (организованных в ~ 90 подкомитетов) делится своими знаниями и данными. Текущий ИП и обладатель гранта проекта GtoPdb - профессор Джейми А. Дэвис.. Разработка и выпуск первой версии GtoPdb в 2012 году были описаны в редакционной статье, опубликованной в Британском журнале фармакологии под названием «Руководство по Pharmacology.org - обновление». [2] IUPHAR-DB больше не разрабатывается, и вся информация, содержащаяся на этом сайте, теперь доступна через Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ (ссылки IUPHAR-DB теперь должны быть перенаправлены).

Содержание и особенности [ править ]

В настоящее время в Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ включены следующие целевые группы:

Информация для каждой целевой группы подразделяется на семьи на основе классификации с отдельной страницей данных для каждой семьи. На каждой странице мишени организованы в списки таблиц, каждая из которых включает номенклатуру белков и генов для мишени со ссылками на базы данных номенклатуры генов и перечисляет выбранные лиганды с активностью в отношении мишени, включая агонисты, антагонисты, ингибиторы и радиолиганды. Приведены фармакологические данные и ссылки, и каждый лиганд связан гиперссылкой на страницу лигандов, отображающую номенклатуру и химическую структуру или пептидную последовательность, а также синонимы и ссылки на соответствующие базы данных. Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ также включает список всех молекул лигандов, представленных на сайте, разделенных на категории, включая малые органические молекулы (включая метаболиты млекопитающих)., гормоны и нейротрансмиттеры ), синтетические органические молекулы, натуральные продукты , пептиды , неорганические молекулы и антитела . Полный список всех одобренных препаратов, представленных на веб-сайте, также доступен через список лигандов. Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ расширяется за счет включения клинической информации о мишенях и лигандах в дополнение к образовательным ресурсам. Функции поиска на веб-сайте включают параметры быстрого и расширенного поиска, а также поиск рецепторов и лигандов, включая поддержку структур лигандов с использованием химических структур. Другие функции включают в себя новости «Горячие темы» и недавний список пар рецептор-лиганд.

Руководство ИЮФАР по ИММУНОФАРМАКОЛОГИИ [ править ]

В период с ноября 2015 года по октябрь 2018 года Wellcome Trust поддерживал проект по разработке Руководства IUPHAR по ИММУНОФАРМАКОЛОГИИ.(GtoImmuPdb), основанный на схеме GtoPdb. GtoImmuPdb - это ресурс с открытым доступом, который привносит иммунологическую перспективу в высококачественные, тщательно отобранные экспертами фармакологические данные, содержащиеся в существующем Руководстве IUPHAR / BPS по ФАРМАКОЛОГИИ. Белковые мишени и лиганды, относящиеся к иммунофармакологии, были помечены и помещены в GtoImmuPdb. Они также были связаны с новыми типами иммунологических данных, такими как иммунологические процессы, типы клеток и болезни. GtoImmuPdb предоставляет базу знаний, которая связывает иммунологию с фармакологией, принося дополнительную пользу и поддерживая исследования и разработку лекарств, направленных на модуляцию иммунных, воспалительных или инфекционных компонентов заболевания. [3]

Краткое руководство по ФАРМАКОЛОГИИ [ править ]

Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ включает онлайн-версию базы данных с открытым доступом Краткого руководства по ФАРМАКОЛОГИИ , ранее «Руководства по рецепторам и каналам» [4], доступного в HTML, PDF и печатных форматах. Краткое изложение онлайн-базы данных в печатном виде публикуется как Краткое руководство по фармакологии 2017/2018 [5] в виде серии статей в качестве полугодового приложения к Британскому журналу фармакологии .

Ссылки на базу данных [ править ]

Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ включает ссылки на другие соответствующие ресурсы на страницах-мишенях и лигандах на кратких и подробных страницах просмотра. Многие из этих ресурсов поддерживают взаимные ссылки на соответствующие страницы Руководства по ФАРМАКОЛОГИИ.

  • Комитет по номенклатуре генов HUGO
  • Информатика генома мыши
  • База данных генома крыс
  • Ансамбль
  • UniProt
  • Entrez
  • PubChem
  • ChemSpider
  • ЧЭМБЛ
  • ЧЭБИ
  • КЕГГ
  • Онлайн-менделевское наследование в человеке (OMIM)
  • DrugBank
  • Банк данных белков

Будущие направления [ править ]

Благодаря финансированию Wellcome Trust с 2012 по 2015 год Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ было расширено и теперь включает биологические цели всех рецептурных препаратов и другие вероятные цели будущих низкомолекулярных препаратов. На страницах сводного представления представлены обзоры основных функций широкого диапазона целей, а на страницах подробных представлений представлена ​​более подробная информация о свойствах выбранного подмножества целей. С января 2018 г. предприятие « Лекарства от малярии» поддерживает новое расширение для разработки Руководства по фармакологии малярии . Ядро GtoPdb продолжает поддерживаться Британским фармакологическим обществом .

См. Также [ править ]

  • Международный союз фундаментальной и клинической фармакологии
  • Британское фармакологическое общество
  • Биологическая мишень
  • Британский журнал фармакологии

Ссылки [ править ]

  1. ^ Армстронг, JF; Faccenda, E; Harding, SD; Поусон, AJ; Саутан, К; Шарман, JL; Кампо, Б; Кавана, Д.Р .; Александр, SPH; Давенпорт, AP; Спеддинг, М; Дэвис, Джеймс (8 января 2020 г.). «Руководство IUPHAR / BPS по ФАРМАКОЛОГИИ на 2020 год: расширение содержания иммунофармакологии и введение Руководства IUPHAR / MMV по ФАРМАКОЛОГИИ МАЛЯРИИ» . Исследования нуклеиновых кислот . 48 (D1): D1006 – D1021. DOI : 10.1093 / NAR / gkz951 . PMC  7145572 . PMID  31691834 .
  2. ^ Александр, ИП; Бенсон, HE; Davenport, A .; Mathie, A .; McGrath, IJ; Поусон, AJ; Peters, JA; Шарман, JL; Спеддинг, М .; Хармар, AJ (2012). «GuideToPharmacology.org - обновление» . Британский журнал фармакологии . 167 (4): 697–698. DOI : 10.1111 / j.1476-5381.2012.02141.x . PMC 3575771 . PMID 23003568 .  
  3. ^ Хардинг, SD; Faccenda, E; Саутан, К; Maffia, P; Дэвис, Дж. А. (декабрь 2018 г.). «Новое руководство по иммунофармакологии». Обзоры природы. Иммунология . 18 (12): 729. DOI : 10.1038 / s41577-018-0079-2 . PMID 30327546 . 
  4. ^ Александр, ИП; Мэти, А; Петерс, Дж. А. (ноябрь 2011 г.). «Руководство по рецепторам и каналам (GRAC), 5-е издание» . Британский журнал фармакологии . 164 Дополнение 1: S1–324. DOI : 10.1111 / j.1476-5381.2011.01649_1.x . PMC 3315626 . PMID 22040146 .  
  5. ^ Александр, ИП; Келли, Э; Marrion, NV; Peters, JA; Faccenda, E; Harding, SD; Поусон, AJ; Шарман, JL; Саутан, К; Buneman, OP; Cidlowski, JA; Christopoulos, A; Давенпорт, AP; Fabbro, D; Спеддинг, М; Стриссниг, Дж; Дэвис, JA; CGTP, Соавторы. (Декабрь 2017 г.). «Краткое руководство по фармацевтике 2017/18: Обзор» . Британский журнал фармакологии . 174 Приложение 1: S1 – S16. DOI : 10.1111 / bph.13882 . PMC 5650665 . PMID 29055037 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • IUPHAR / BPS Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ
  • Международный союз фундаментальной и клинической фармакологии (IUPHAR)
  • Британское фармакологическое общество (BPS)
  • Британский журнал фармакологии
  • Краткое руководство по ФАРМАКОЛОГИИ
  • Wellcome Trust
  • Лекарства от малярии Venture