Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
«Кишечные бактерии» перенаправляются сюда. Для использования в других целях, см Кишечные бактерии (значения) .
Escherichia coli , один из многих видов бактерий, присутствующих в кишечнике человека.

Кишечная микробиота , кишечная флора или микробиом - это микроорганизмы, включая бактерии , археи и грибы, которые обитают в пищеварительном тракте людей [1] и других животных, включая насекомых . Метагеном желудочно-кишечного тракта - это совокупность всех геномов кишечной микробиоты . [2] [3] Кишечник является основным местом обитания микробиоты человека . [4]

Обзор [ править ]

У людей кишечная микробиота насчитывает наибольшее количество бактерий и наибольшее количество видов по сравнению с другими частями тела. [5] У людей кишечная флора устанавливается через один-два года после рождения, и к этому времени кишечный эпителий и слизистая оболочка кишечника, которую он секретирует, совместно развиваются и становятся толерантными к ним и даже поддерживают их. кишечная флора, которая также является барьером для патогенных организмов. [6] [7]

Отношения между некоторой кишечной флорой и людьми не просто комменсальные (безвредное сосуществование), а скорее мутуалистические отношения. [4] : 700 Некоторые кишечные микроорганизмы человека приносят пользу хозяину, ферментируя пищевые волокна до короткоцепочечных жирных кислот (SCFA), таких как уксусная кислота и масляная кислота , которые затем абсорбируются хозяином. [5] [8] Кишечные бактерии также играют роль в синтезе витаминов B и K, а также в метаболизме желчных кислот ,стерины и ксенобиотики . [4] [8] Системное значение SCFAs и других соединений, которые они производят, подобны гормонам, а сама кишечная флора, по-видимому, функционирует как эндокринный орган , [8] и нарушение регуляции кишечной флоры коррелирует с множеством воспалительных процессов. и аутоиммунные состояния. [5] [9]

Состав микробиоты кишечника человека меняется со временем, когда меняется диета и общее состояние здоровья. [5] [9] В систематическом обзоре 2016 г. изучались доклинические и небольшие испытания на людях, которые проводились с некоторыми коммерчески доступными штаммами пробиотических бактерий, и были выявлены те, которые имели наибольший потенциал для лечения определенных заболеваний центральной нервной системы . [10]

Классификации [ править ]

Микробный состав микробиоты кишечника варьируется в разных частях пищеварительного тракта. В желудке и тонком кишечнике обычно присутствует относительно небольшое количество видов бактерий. [11] [12] толстая кишка , в отличии от этого , содержит самую высокую плотность микробной , записанную в любой среде обитания на Земле [13] до 10 12 клеток на грамм содержимого кишечника. [11] Эти бактерии представляют от 300 до 1000 различных видов . [11] [12] Однако 99% бактерий происходят примерно от 30 или 40 видов. [14]Вследствие их обилия в кишечнике бактерии также составляют до 60% сухой массы фекалий . [15] Грибы , протисты , археи и вирусы также присутствуют во флоре кишечника, но об их деятельности известно меньше. [16]

Более 99% бактерий в кишечнике являются анаэробами , но в слепом , аэробные бактерии достигают высокую плотность. [4] Подсчитано, что эта кишечная флора имеет в общей сложности примерно в сто раз больше генов, чем в геноме человека . [17]

Candida albicans , диморфный гриб, который развивается как дрожжи в кишечнике.

Многие виды в кишечнике не изучались за пределами их хозяев, потому что большинство из них невозможно культивировать. [12] [14] [18] Хотя существует небольшое количество основных видов микробов, общих для большинства людей, популяции микробов могут широко варьироваться у разных людей. [19] Внутри человека популяции микробов остаются довольно постоянными с течением времени, даже несмотря на то, что некоторые изменения могут происходить с изменениями образа жизни, диеты и возраста. [11] [20] Цель проекта «Микробиом человека» - лучше описать микрофлору кишечника человека и других участков тела.

Четыре доминантных бактериальные фил в кишечнике человека являются Firmicutes , Bacteroidetes , Actinobacteria и Proteobacteria . [21] Большинство бактерий принадлежат к родам Bacteroides , Clostridium , Faecalibacterium , [11] [14] Eubacterium , Ruminococcus , Peptococcus , Peptostreptococcus и Bifidobacterium . [11] [14] Другие роды, такие как Escherichia и Lactobacillus., присутствуют в меньшей степени. [11] Только виды рода Bacteroides составляют около 30% всех бактерий в кишечнике, что позволяет предположить, что этот род особенно важен для функционирования хозяина. [12]

Роды грибов, обнаруженные в кишечнике, включают Candida , Saccharomyces , Aspergillus , Penicillium , Rhodotorula , Trametes , Pleospora , Sclerotinia , Bullera и Galactomyces и другие. [22] [23] Rhodotorula чаще всего встречается у людей с воспалительными заболеваниями кишечника, в то время как Candida чаще всего обнаруживается у людей с циррозом гепатита B и хроническим гепатитом B. [22]

Археи составляют еще один большой класс кишечной флоры, которая играет важную роль в метаболизме бактериальных продуктов ферментации.

Индустрализация связана с изменениями в микробиоте, а сокращение разнообразия может привести к исчезновению некоторых видов; в 2018 году исследователи предложили биобанк хранилища микробиоты человека. [24]

Энтеротип [ править ]

Enterotype является классификация живых организмов на основе его бактериологических экосистемы в кишечнике человека микробиомом не продиктована возраста, пола, массы тела, или национальных подразделений. [25] Есть признаки того, что длительная диета влияет на энтеротип. [26] Было предложено три человеческих энтеротипа, [25] [27], но их ценность была поставлена ​​под сомнение. [28]

Состав [ править ]

Смотрите также: Микробиом человека § Желудочно-кишечный тракт

Бактериома [ править ]

Желудок [ править ]

Из-за высокой кислотности желудка большинство микроорганизмов не могут там выжить. К основным бактериальным обитателям желудка относятся: стрептококки , стафилококки , лактобациллы , пептострептококки . [4] : 720 Helicobacter pylori - это грамотрицательная спиральная бактерия, которая обосновывается на слизистой оболочке желудка, вызывая хронический гастрит и язвенную болезнь , и является канцерогеном при раке желудка . [4] : 904

Кишечник [ править ]

Бактерии, обычно обнаруживаемые в толстой кишке человека [29]
БактерияЗаболеваемость (%)
Bacteroides fragilis100
Bacteroides melaninogenicus100
Bacteroides oralis100
Enterococcus faecalis100
кишечная палочка100
Enterobacter sp.40–80
Klebsiella sp.40–80
Бифидобактерии бифидум30–70
Золотистый стафилококк30–50
Лактобациллы20–60
Clostridium perfringens25–35
Протей мирабилис5–55
Clostridium tetani1–35
Clostridium septicum5–25
Синегнойная палочка3–11
Сальмонелла энтерика3–7
Faecalibacterium prausnitzii?общий
Peptostreptococcus sp.?общий
Peptococcus sp.?общий

Тонкий кишечник содержит незначительное количество микроорганизмов из-за близости и влияния желудка. Грамположительные кокки и палочковидные бактерии являются преобладающими микроорганизмами в тонком кишечнике. [4] Однако в дистальной части тонкого кишечника щелочные условия поддерживают грамотрицательные бактерии Enterobacteriaceae . [4] Бактериальная флора тонкого кишечника способствует широкому спектру функций кишечника. Бактериальная флора обеспечивает регулирующие сигналы, которые позволяют развитию кишечника и его полезности. Чрезмерный рост бактерий в тонком кишечнике может привести к кишечной недостаточности. [30]Вдобавок толстая кишка содержит крупнейшую бактериальную экосистему в организме человека. [4] Около 99% флоры толстого кишечника и кала состоят из облигатных анаэробов, таких как Bacteroides и Bifidobacterium. [31] Факторы, разрушающие популяцию микроорганизмов в толстой кишке, включают антибиотики, стресс и паразитов. [4]

Бактерии составляют большую часть флоры толстой кишки [32] и 60% сухой массы фекалий . [11] Этот факт делает фекалии идеальным источником кишечной флоры для любых тестов и экспериментов путем извлечения нуклеиновой кислоты из образцов фекалий, а последовательности бактериального гена 16S рРНК генерируются с помощью бактериальных праймеров. Эта форма тестирования также часто предпочтительнее более инвазивных методов, таких как биопсия.

Пять филюмы доминируют кишечные микробиоты: Bacteroidetes , Firmicutes , актинобактерия , протеобактерия и verrucomicrobia -са Bacteroidetes и Firmicutes , составляющие 90% от композиции. [33] В кишечнике обитает от 300 [11] до 1000 различных видов [12], по большинству оценок около 500. [34] [35] Однако вполне вероятно, что 99% бактерий происходят от примерно 30 или 40 видов, с Faecalibacterium prausnitzii(phylum firicutes) - самый распространенный вид у здоровых взрослых. [14] [36]

Исследования показывают , что отношения между кишечной флорой и человеком не просто синантропное (а не безвредно сосуществованием), а скорее мутуалистическими , симбиотическими отношения. [12] Хотя люди могут выжить без кишечной флоры, [34] микроорганизмы выполняют множество полезных функций, таких как ферментация неиспользованных энергетических субстратов, тренировка иммунной системы с помощью конечных продуктов метаболизма, таких как пропионат и ацетат , предотвращение роста вредных видов. , регулируя развитие кишечника, вырабатывая витамины для хозяина (такие как биотин ивитамин К ) и вырабатывает гормоны, которые заставляют хозяина накапливать жиры. [4] Обширные модификации и дисбаланс микробиоты кишечника и его микробиома или коллекции генов связаны с ожирением. [37] Однако в определенных условиях считается, что некоторые виды способны вызывать заболевание , вызывая инфекцию или увеличивая риск рака у хозяина. [11] [32]

Микобиом [ править ]

Дополнительная информация: Микобиом

Грибы и простейшие также составляют часть кишечной флоры, но об их деятельности известно меньше. [38]

Виром [ править ]

Дополнительная информация: Виром

Человек virome в основном бактериофаги . [39]

Вариант [ править ]

Возраст [ править ]

Было продемонстрировано, что существуют общие закономерности эволюции состава микробиома в течение жизни. [40] В целом, разнообразие микробиоты в образцах фекалий у взрослых значительно выше, чем у детей, хотя межличностные различия у детей выше, чем у взрослых. [41] Большая часть созревания микробиоты до взрослой конфигурации происходит в течение трех первых лет жизни. [41]

По мере изменения состава микробиома меняется и состав бактериальных белков, вырабатываемых в кишечнике. Во взрослых микробиомах обнаружена высокая распространенность ферментов, участвующих в ферментации, метаногенезе и метаболизме аргинина, глутамата, аспартата и лизина. Напротив, в микробиомах младенцев доминирующие ферменты участвуют в метаболизме цистеина и путях ферментации. [41]

Диета [ править ]

Исследования и статистический анализ выявили различные роды бактерий в микробиоте кишечника и их связи с потреблением питательных веществ. Микрофлора кишечника в основном состоит из трех энтеротипов : Prevotella , Bacteroides и Ruminococcus . Существует связь между концентрацией каждого микробного сообщества и диетой. Например, Prevotella связана с углеводами и простыми сахарами, а Bacteroides связана с белками, аминокислотами и насыщенными жирами. Специализированные микробы, расщепляющие муцин, выживают за счет выделения углеводов хозяином. [42]В зависимости от диеты будет преобладать один энтеротип. Изменение диеты приведет к соответствующему изменению количества видов. [26] Исследование, проведенное в 2021 году, предполагает, что питание и физические упражнения в детстве могут существенно повлиять на состав и разнообразие микробиома взрослого человека. Его авторы показывают, что у мышей диета с высоким содержанием жира и сахара по-прежнему существенно влияет на микробиом кишечника после того, что составляет шесть человеческих лет. [43] [44] [45]

Вегетарианские и веганские диеты [ править ]

В то время как растительные диеты имеют некоторые вариации, наиболее распространены вегетарианские и веганские диеты. Вегетарианские диеты исключают мясные продукты (в том числе рыбу), но по-прежнему разрешают употребление яиц и молочных продуктов, в то время как веганские диеты исключают все формы продуктов животного происхождения. Диеты вегетарианцев и веганов создают микробиом, отличный от мясоедов, однако между ними нет существенной разницы. [46] [ ненадежный медицинский источник? ] В диетах, которые сосредоточены на мясе и продуктах животного происхождения, большое количество Alistipes , Bilophila и Bacteroides.все они толерантны к желчи и могут способствовать воспалению кишечника. В этом типе диеты группа Firmicutes , которая связана с метаболизмом диетических полисахаридов растений, встречается в низких концентрациях. [47] И наоборот, диеты, богатые растительными материалами, связаны с большим разнообразием микробиома кишечника в целом и содержат большее количество Prevotella , ответственного за долгосрочную переработку волокон, а не видов, устойчивых к желчи. [48] [ ненадежный медицинский источник? ]Диета может использоваться для изменения состава микробиома кишечника в относительно короткие сроки. Однако, если вы хотите изменить микробиом для борьбы с болезнью или недугом, долгосрочные изменения в диете оказались наиболее успешными. [47]

География [ править ]

Состав микробиома кишечника зависит от географического происхождения населения. Вариации компромисса Prevotella , представления гена уреазы и представления генов, кодирующих глутаматсинтазу / деградацию или другие ферменты, участвующие в деградации аминокислот или биосинтезе витаминов, демонстрируют значительные различия между популяциями из США, Малави или индейцев. . [41]

Население США широко представлено ферментами, кодирующими расщепление глутамина, и ферментами, участвующими в биосинтезе витаминов и липоевой кислоты ; в то время как в популяциях Малави и американских индейцев высока представленность ферментов, кодирующих глутаматсинтазу, и в их микробиомах также преобладает α-амилаза . Поскольку у населения США диета богаче жирами, чем у индейцев или малавийцев, которые придерживаются богатой кукурузой диеты, диета, вероятно, является основным фактором, определяющим бактериальный состав кишечника. [41]

Дальнейшие исследования показали большую разницу в составе микробиоты европейских и сельских африканских детей. Фекальные бактерии детей из Флоренции сравнивали с бактериями детей из небольшой сельской деревни Боулпон в Буркина-Фасо . В рационе обычного ребенка, живущего в этой деревне, в основном отсутствуют жиры и животные белки, а в рационе много полисахаридов и растительных белков. В фекальных бактериях европейских детей преобладали Firmicutes, что привело к заметному сокращению биоразнообразия, в то время как в фекальных бактериях детей Boulpon преобладали Bacteroidetes.. Повышенное биоразнообразие и различный состав кишечной флоры у африканского населения могут способствовать перевариванию обычно неперевариваемых полисахаридов растений, а также могут привести к снижению заболеваемости неинфекционными заболеваниями толстой кишки. [49]

В меньшем масштабе было показано, что совместное использование множества общих факторов окружающей среды в семье является сильным фактором, определяющим индивидуальный состав микробиома. Этот эффект не имеет генетического влияния и постоянно наблюдается в разных культурах популяций. [41]

Недоедание [ править ]

У недоедающих детей микробиота кишечника менее зрелая и менее разнообразная, чем у здоровых детей, и изменения в микробиоме, связанные с дефицитом питательных веществ, могут, в свою очередь, быть патофизиологической причиной недоедания. [50] [51] У истощенных детей также обычно более потенциально патогенная кишечная флора и больше дрожжей во рту и горле. [52] Изменение диеты может привести к изменению состава и разнообразия кишечной микробиоты. [42]

Раса и этническая принадлежность [ править ]

Исследователи из American Gut Project и Human Microbiome Project обнаружили, что двенадцать семейств микробов различались по численности в зависимости от расы или этнической принадлежности человека. Сила этих ассоциаций ограничена небольшим размером выборки: Американский проект кишечника собрал данные от 1375 человек, 90% из которых были белыми. [53] Исследование «Здоровая жизнь в городских условиях» (HELIUS) в Амстердаме показало, что люди голландского происхождения имели самый высокий уровень разнообразия кишечной микробиоты, тогда как люди южноазиатского и суринамского происхождения имели самое низкое разнообразие. Результаты исследования показали, что люди одной расы или этнического происхождения имеют больше сходных микробиомов, чем люди разного расового происхождения. [53]

Социально-экономический статус [ править ]

По состоянию на 2020 год как минимум два исследования продемонстрировали связь между социально-экономическим статусом человека (СЭС) и микробиотой кишечника. Исследование, проведенное в Чикаго, показало, что люди в районах с более высоким уровнем SES имели большее разнообразие микробиоты. У людей из районов с более высоким уровнем SES также было больше бактерий Bacteroides . Точно так же исследование близнецов в Соединенном Королевстве показало, что более высокий SES также был связан с большим разнообразием кишечника. [53]

Приобретение у человеческих младенцев [ править ]

Установление кишечной флоры имеет решающее значение для здоровья взрослого человека, а также для функционирования желудочно-кишечного тракта. [54] У людей кишечная флора, подобная флоре взрослого человека, формируется в течение одного-двух лет после рождения, поскольку микробиота передается от родителей к ребенку и переносится из пищи, воды и других источников окружающей среды. [55] [6]

Традиционное представление о желудочно-кишечном тракте нормального плода состоит в том, что он бесплоден, хотя в последние несколько лет эта точка зрения подверглась сомнению. [56] Начали появляться многочисленные доказательства того, что во внутриутробной среде могут быть бактерии. У людей исследования показали, что микробная колонизация может происходить у плода [57], при этом одно исследование показало, что в биоптатах плаценты присутствовали виды Lactobacillus и Bifidobacterium . [58] Несколько исследований на грызунах продемонстрировали присутствие бактерий в околоплодных водах и плаценте, а также в меконии младенцев, рожденных в результате стерильного кесарева сечения.[59] [60] В другом исследовании ученые вводили культуру бактерий орально беременной матери и обнаружили бактерии в потомстве, вероятно, в результате передачи инфекции между пищеварительным трактом и околоплодными водами через кровоток. [61] Однако исследователи предупреждают, что источник этих внутриутробных бактерий, живы ли они, и их роль еще не изучены. [62] [58]

Во время рождения и вскоре после этого бактерии матери и окружающей среды колонизируют кишечник младенца. [6] Точные источники бактерий до конца не изучены, но могут включать родовые пути, других людей (родителей, братьев и сестер, работников больниц), грудное молоко, пищу и общую среду, с которой взаимодействует младенец. [63] Однако по состоянию на 2013 год остается неясным, происходит ли большая часть колонизации от матери или нет. [6] Младенцы, рожденные с помощью кесарева сечения, также могут подвергаться воздействию микрофлоры своей матери, но первоначальное воздействие, скорее всего, будет происходить из окружающей среды, такой как воздух, другие младенцы и медперсонал, которые служат переносчиками инфекции. . [57]В течение первого года жизни состав кишечной флоры, как правило, прост и сильно меняется со временем, а не у разных людей. [6] Первоначальная бактериальная популяция - это, как правило, факультативные анаэробные организмы ; Исследователи полагают, что эти первые колонизаторы уменьшают концентрацию кислорода в кишечнике, что, в свою очередь, позволяет анаэробным бактериям, таким как Bacteroides , Actinobacteria и Firmicutes, закрепиться и развиться. [6] В грудном вскармливании преобладают бифидобактерии , возможно, из-за содержания факторов роста бифидобактерий.в грудном молоке и тем фактом, что грудное молоко содержит пребиотические компоненты, способствующие здоровому росту бактерий. [58] [64] Напротив, микробиота младенцев на искусственном вскармливании более разнообразна, с большим количеством энтеробактерий , энтерококков , бифидобактерий , Bacteroides и клостридий. [65]

Кесарево сечение, антибиотики и кормление смесью могут изменить состав микробиома кишечника. [58] У детей, получавших антибиотики, менее стабильные и менее разнообразные цветочные сообщества. [66] Было показано, что кесарево сечение разрушительно для передачи бактерий от матери к потомству, что влияет на общее состояние здоровья потомства, повышая риск таких заболеваний, как целиакия, астма и диабет 1 типа. [58] Это еще раз доказывает важность здорового микробиома кишечника. Изучаются различные методы восстановления микробиома, обычно включающие воздействие на ребенка влагалищного содержимого матери и пероральные пробиотики. [58]

Функции [ править ]

Когда в 1995 году началось изучение кишечной флоры [67], считалось, что у нее есть три ключевые роли: прямая защита от патогенов , усиление защиты хозяина за счет ее роли в развитии и поддержании кишечного эпителия и индукции в нем производства антител, а также обмен веществ иным образом. неперевариваемые соединения в пище; последующая работа открыла его роль в обучении развивающейся иммунной системы, и все же дальнейшие исследования были сосредоточены на его роли в оси кишечник-мозг . [68]

Прямое подавление патогенов [ править ]

Сообщество кишечной флоры играет непосредственную роль в защите от патогенов, полностью колонизируя пространство, используя все доступные питательные вещества и выделяя соединения, которые убивают или подавляют нежелательные организмы, которые будут конкурировать с ним за питательные вещества, эти соединения известны как цитокины . [69] Различные штаммы кишечных бактерий вызывают производство разных цитокинов. Цитокины - это химические соединения, вырабатываемые нашей иммунной системой для инициирования воспалительной реакции на инфекции. Нарушение кишечной флоры позволяет появиться конкурирующим организмам, таким как Clostridium difficile, которые в противном случае остаются в подвешенном состоянии. [69]

Развитие кишечной защиты и иммунной системы [ править ]

Микроскладчатые клетки переносят антигены (Ag) из просвета кишечника в кишечную лимфоидную ткань (GALT) посредством трансцитоза и представляют их различным клеткам врожденного и адаптивного иммунитета.

У людей кишечная флора, подобная флоре взрослого человека, формируется в течение одного-двух лет после рождения. [6] По мере того, как кишечная флора устанавливается, слизистая оболочка кишечника - кишечный эпителий и слизистая оболочка кишечника, которую он секретирует, - также развиваются таким образом, который является толерантным к определенным микроорганизмам-комменсалистам и даже поддерживает их. степени, а также обеспечивает барьер для патогенных. [6] В частности, бокаловидные клетки, которые продуцируют слизистую оболочку, разрастаются, и слой слизистой оболочки утолщается, создавая внешний слой слизистой оболочки, в котором «дружественные» микроорганизмы могут закрепляться и питаться, а также внутренний слой, в который даже эти организмы не могут проникнуть. [6] [7] Кроме того, разработкаСвязанная с кишечником лимфоидная ткань (GALT), которая является частью кишечного эпителия и которая обнаруживает патогены и реагирует на них, появляется и развивается во время развития и установления кишечной флоры. [6] Развивающийся GALT устойчив к видам кишечной флоры, но не к другим микроорганизмам. [6] GALT также обычно становится толерантным к пище, которой подвергается младенец, а также к пищеварительным продуктам и метаболитам кишечной флоры (молекулы, образующиеся в результате метаболизма), производимым с пищей. [6]

Человеческая система Иммунная создает цитокины , которые могут ездить систему невосприимчивой к продукции воспаления для того , чтобы защитить себя, и что может набить вниз иммунный ответ для поддержания гомеостаза и позволить исцеление после инсульта или травмы. [6] Было показано, что различные виды бактерий, которые появляются во флоре кишечника, способны управлять иммунной системой для избирательного создания цитокинов; например, Bacteroides fragilis и некоторые виды Clostridia, по- видимому, вызывают противовоспалительную реакцию, в то время как некоторые сегментированные нитчатые бактерии управляют выработкой воспалительных цитокинов. [6] [70]Флора кишечника также может регулировать выработку антител иммунной системой. [6] [71] Одна из функций этой регуляции - заставить В-клетки переключиться на IgA . В большинстве случаев В-клетки нуждаются в активации Т-хелперов, чтобы вызвать переключение класса ; однако по другому пути кишечная флора вызывает передачу сигналов NF-kB эпителиальными клетками кишечника, что приводит к секреции дополнительных сигнальных молекул. [72] Эти сигнальные молекулы взаимодействуют с В-клетками, чтобы вызвать переключение класса на IgA. [72]IgA - важный тип антител, которые используются в слизистой оболочке, например в кишечнике. Было показано, что IgA может помочь разнообразить кишечное сообщество и помогает избавиться от бактерий, вызывающих воспалительные реакции. [73] В конечном итоге IgA поддерживает здоровую среду между хозяином и кишечными бактериями. [73] Эти цитокины и антитела могут действовать за пределами кишечника, в легких и других тканях. [6]

Иммунная система также может быть изменена из-за способности кишечных бактерий продуцировать метаболиты, которые могут влиять на клетки иммунной системы. Например, короткоцепочечные жирные кислоты (SCFA) могут продуцироваться некоторыми кишечными бактериями путем ферментации . [74] SCFAs стимулируют быстрое увеличение производства клеток врожденного иммунитета, таких как нейтрофилы , базофилы и эозинофилы . [74] Эти клетки являются частью врожденной иммунной системы, которая пытается ограничить распространение инфекции.

Метаболизм [ править ]

Без флоры кишечника человеческий организм не смог бы использовать некоторые из потребляемых им непереваренных углеводов , потому что некоторые типы флоры кишечника содержат ферменты , которых не хватает клеткам человека для расщепления определенных полисахаридов . [8] Грызуны, выращенные в стерильных условиях и лишенные кишечной флоры, должны потреблять на 30% больше калорий, чтобы сохранить тот же вес, что и их нормальные собратья. [8] Углеводы, которые люди не могут переварить без помощи бактерий, включают определенные крахмалы , клетчатку , олигосахариды и сахара.что организм не может переваривать и поглощать, как лактозу в случае непереносимости лактозы и сахарных спиртов , слизи, вырабатываемой кишечником, и белков. [5] [8]

Бактерии превращают ферментированные ими углеводы в жирные кислоты с короткой цепью путем ферментации, называемой сахаролитической ферментацией . [35] Продукты включают уксусную кислоту , пропионовую кислоту и масляную кислоту . [14] [35] Эти материалы могут использоваться клетками-хозяевами, являясь основным источником энергии и питательных веществ. [35] Газы (которые участвуют в передаче сигналов [79] и могут вызывать метеоризм ) и органические кислоты , такие как молочная кислота , также производятся при ферментации. [14] Уксусная кислота используетсяВ мышцах пропионовая кислота способствует выработке АТФ в печени , а масляная кислота обеспечивает энергией клетки кишечника. [35]

Флора кишечника также синтезирует витамины, такие как биотин и фолат , и способствует усвоению пищевых минералов , включая магний, кальций и железо. [11] [20] Methanobrevibacter smithii уникален, потому что это не вид бактерий, а член домена Archeae , и это самый распространенный вид архей, продуцирующих метан, в желудочно-кишечной микробиоте человека. [80]

Микробиота кишечника также служит источником витаминов К и В12, которые не производятся организмом или производятся в небольших количествах. [81] [82]

Фармакомикробиомика [ править ]

Метагеном человека (т. Е. Генетический состав человека и всех микроорганизмов, которые обитают на теле человека или внутри него) значительно различается у разных людей. [83] [84] Поскольку общее количество микробных и вирусных клеток в организме человека (более 100 триллионов) значительно превышает количество клеток Homo sapiens (десятки триллионов), [примечание 1] [83] [85] существует значительный потенциал для взаимодействие между лекарственными средствами и микробиомом человека, в том числе: лекарства, изменяющие состав микробиома человека , метаболизм лекарства микробными ферментами, изменяющий фармакокинетику лекарствапрофиль и микробный метаболизм лекарственного средства, влияющие на клиническую эффективность и профиль токсичности лекарственного средства . [83] [84] [86]

Помимо углеводов, микробиота кишечника может также метаболизировать другие ксенобиотики, такие как лекарства, фитохимические вещества и пищевые токсиканты. Было показано, что более 30 лекарств метаболизируются микробиотой кишечника. [87] Микробный метаболизм лекарств иногда может инактивировать лекарство. [88]

Ось кишечник-мозг [ править ]

Основная статья: ось кишечник-мозг

Ось кишечник-мозг - это биохимическая передача сигналов, которая происходит между желудочно-кишечным трактом и центральной нервной системой . [68] Этот термин был расширен и теперь включает роль кишечной флоры во взаимодействии; термин «ось микробиом-кишечник-мозг» иногда используется для описания парадигм, явно включающих кишечную флору. [68] [89] [90] В широком смысле ось кишечник-мозг включает центральную нервную систему, нейроэндокринную и нейроиммунную системы, включая ось гипоталамус-гипофиз-надпочечники (ось HPA), симпатические и парасимпатические ветви вегетативной нервной системы, включая вкишечная нервная система , блуждающий нерв и микробиота кишечника . [68] [90]

В систематическом обзоре 2016 г. изучались доклинические и небольшие испытания на людях, которые были проведены с некоторыми коммерчески доступными штаммами пробиотических бактерий, и было обнаружено, что среди протестированных родов Bifidobacterium и Lactobacillus ( B. longum , B. breve , B. infantis , L. helveticus , L. rhamnosus , L. plantarum и L. casei ), имели наибольший потенциал для применения при некоторых заболеваниях центральной нервной системы . [10]

Изменения в балансе микробиоты [ править ]

Последствия употребления антибиотиков [ править ]

Изменение количества кишечных бактерий, например, путем приема антибиотиков широкого спектра действия , может повлиять на здоровье хозяина и его способность переваривать пищу. [91] Антибиотики могут вызывать диарею, связанную с антибиотиками, непосредственно раздражая кишечник , изменяя уровень микробиоты или позволяя патогенным бактериям расти. [14] Еще одним вредным эффектом антибиотиков является увеличение числа устойчивых к антибиотикам бактерий, обнаруживаемых после их применения, которые, когда они вторгаются в организм хозяина, вызывают заболевания, которые трудно лечить с помощью антибиотиков. [91]

Изменение количества и вида кишечной микробиоты может снизить способность организма ферментировать углеводы и метаболизировать желчные кислоты, а также может вызвать диарею . Не расщепленные углеводы могут поглощать слишком много воды и вызывать жидкий стул, либо недостаток SCFAs, продуцируемых кишечной микробиотой, может вызвать диарею. [14]

Снижение уровней аборигенных видов бактерий также нарушает их способность подавлять рост вредных видов, таких как C. difficile и Salmonella kedougou , и эти виды могут выйти из-под контроля, хотя их чрезмерный рост может быть случайным и не являться истинной причиной понос. [11] [14] [91] Новые протоколы лечения инфекций, вызванных C. difficile, включают трансплантацию фекальной микробиоты донорских фекалий. (см. Фекальная трансплантация ). Первоначальные отчеты о лечении описывают 90% успешных результатов при небольшом количестве побочных эффектов. Предполагается, что эффективность является результатом восстановления бактериального баланса классов бактероидов и фирмикутов. [92]

Состав кишечного микробиома также изменяется при тяжелых заболеваниях не только из-за использования антибиотиков, но и из-за таких факторов, как ишемия кишечника, отказ от приема пищи и иммунитет . Отрицательные эффекты от этого привели к интересу к селективной дезактивации пищеварительного тракта , лечению, которое убивает только патогенные бактерии и позволяет восстановить здоровые. [93]

Антибиотики изменяют популяцию микробиоты в желудочно-кишечном тракте , и это может изменить внутриобщинные метаболические взаимодействия, изменить потребление калорий за счет использования углеводов и глобально повлиять на метаболический, гормональный и иммунный гомеостаз хозяина. [94]

Есть разумные доказательства того, что прием пробиотиков, содержащих виды Lactobacillus, может помочь предотвратить диарею, связанную с антибиотиками, и что прием пробиотиков с Saccharomyces (например, Saccharomyces boulardii ) может помочь предотвратить инфекцию Clostridium difficile после системного лечения антибиотиками. [95]

Беременность [ править ]

Микробиота кишечника женщины изменяется по мере наступления беременности , с изменениями, аналогичными тем, которые наблюдаются при метаболических синдромах, таких как диабет. Изменение микробиоты кишечника не вызывает никаких побочных эффектов. Микробиота кишечника новорожденного напоминает образцы, взятые у матери в первом триместре. Разнообразие микробиома уменьшается с первого по третий триместр по мере увеличения численности определенных видов. [58] [96]

Пробиотики, пребиотики, синбиотики и фармабиотики [ править ]

Пробиотики - это микроорганизмы, которые, как считается, приносят пользу для здоровья при употреблении. [97] [98] Что касается кишечной микробиоты, пребиотики обычно представляют собой неперевариваемые соединения клетчатки, которые проходят непереваренными через верхнюю часть желудочно-кишечного тракта и стимулируют рост или активность полезной кишечной флоры, действуя для них в качестве субстрата . [35] [99]

Синбиотики относятся к пищевым ингредиентам или диетическим добавкам, сочетающим пробиотики и пребиотики в форме синергизма . [100]

Термин «фармабиотики» используется по-разному для обозначения: фармацевтических составов (стандартизованное производство, которое может получить одобрение регулирующих органов в качестве лекарственного средства) пробиотиков, пребиотиков или синбиотиков ; [101] пробиотики, которые были генетически модифицированы или оптимизированы иным образом для достижения наилучших результатов (срок годности, выживаемость в пищеварительном тракте и т. Д.); [102] и естественные продукты метаболизма кишечной флоры (витамины и др.). [103]

Есть некоторые свидетельства того, что лечение некоторыми пробиотическими штаммами бактерий может быть эффективным при синдроме раздраженного кишечника и хронических идиопатических запорах . Эти организмы, которые, скорее всего, приведут к уменьшению симптомов, включают:

  • Enterococcus faecium
  • Lactobacillus plantarum
  • Lactobacillus rhamnosus
  • Propionibacterium freudenreichii
  • Bifidobacterium breve
  • Lactobacillus reuteri
  • Lactobacillus salivarius
  • Bifidobacterium infantis
  • Streptococcus thermophilus [104] [105] [106]

Исследование [ править ]

Тесты на то, могут ли неантибиотические препараты воздействовать на кишечные бактерии человека, были выполнены путем анализа in vitro более 1000 имеющихся на рынке лекарств против 40 штаммов кишечных бактерий, что продемонстрировало, что 24% препаратов подавляли рост по крайней мере одного из бактериальных штаммов. . [107]

Роль в болезни [ править ]

Бактерии в пищеварительном тракте могут по-разному влиять на заболевание. Присутствие или переизбыток некоторых видов бактерий может способствовать воспалительным расстройствам, таким как воспалительное заболевание кишечника . [11] Кроме того, метаболиты некоторых представителей кишечной флоры могут влиять на сигнальные пути хозяина, способствуя таким расстройствам, как ожирение и рак толстой кишки . [11] В качестве альтернативы, в случае разрушения эпителия кишечника проникновение компонентов кишечной флоры в другие компартменты хозяина может привести к сепсису . [11]

Язвы [ править ]

Инфекция Helicobacter pylori может инициировать образование язвы желудка, когда бактерии проникают через эпителиальную выстилку желудка, вызывая воспалительный фагоцитозный ответ . [108] В свою очередь, воспаление повреждает париетальные клетки, которые выделяют чрезмерное количество соляной кислоты в желудок и производят меньше защитной слизи. [109] Повреждение слизистой оболочки желудка, ведущее к язве , развивается, когда желудочная кислота подавляет защитные свойства клеток и подавляетсинтезэндогенного простагландина , снижает секрецию слизи и бикарбоната, снижает кровоток в слизистой оболочке и снижает сопротивляемость травмам. [109]Снижение защитных свойств слизистой оболочки желудка увеличивает уязвимость к дальнейшим травмам и образованию язв под воздействием желудочной кислоты, пепсина и желчных солей. [108] [109]

Перфорация кишечника [ править ]

Обычно комменсальные бактерии могут нанести вред хозяину, если они выходят из кишечного тракта. [6] [7] Транслокация , которая происходит, когда бактерии покидают кишечник через слизистую оболочку кишечника , может возникать при ряде различных заболеваний. [7] Если кишечник перфорирован, бактерии проникают в интерстиций , вызывая потенциально смертельную инфекцию . [4] : 715

Воспалительные заболевания кишечника [ править ]

Два основных типа воспалительных заболеваний кишечника , болезнь Крона и язвенный колит , представляют собой хронические воспалительные заболевания кишечника; причины этих заболеваний неизвестны, и проблемы с кишечной флорой и ее взаимоотношениями с хозяином были связаны с этими состояниями. [9] [110] [111] [112] Кроме того, оказывается, что взаимодействие кишечной флоры с осью кишечник-мозг играет роль в ВЗК, при этом физиологический стресс, опосредованный осью гипоталам-гипофиз-надпочечники, вызывает изменения в кишечном эпителии. а кишечная флора, в свою очередь, высвобождает факторы и метаболиты, которые запускают передачу сигналов вкишечная нервная система и блуждающий нерв . [3]

У людей с воспалительными заболеваниями кишечника разнообразие кишечной флоры, по-видимому, значительно меньше, чем у здоровых людей; кроме того, у людей с язвенным колитом, по-видимому, преобладают протеобактерии и актинобактерии; у людей с болезнью Крона, Enterococcus faecium и некоторые протеобактерии, по-видимому, чрезмерно представлены. [3]

Есть разумные доказательства того, что коррекция дисбаланса кишечной флоры путем приема пробиотиков с лактобациллами и бифидобактериями может уменьшить висцеральную боль и воспаление кишечника при ВЗК. [95]

Синдром раздраженного кишечника [ править ]

Синдром раздраженного кишечника является результатом стресса и хронической активации оси HPA; его симптомы включают боль в животе, изменения дефекации и повышение провоспалительных цитокинов. В целом, исследования показали, что микробиота просвета и слизистых оболочек изменяется у людей с синдромом раздраженного кишечника, и эти изменения могут быть связаны с типом раздражения, таким как диарея или запор . Кроме того, наблюдается уменьшение разнообразия микробиома с низким уровнем фекальных Lactobacilli и Bifidobacteria, высоким уровнем факультативных анаэробных бактерий, таких как Escherichia coli , и повышенным соотношением Firmicutes: Bacteroidetes. [90]

Другие воспалительные или аутоиммунные заболевания [ править ]

Аллергия , астма и сахарный диабет являются аутоиммунными и воспалительными заболеваниями неизвестной причины, но связаны с дисбалансом кишечной флоры и ее взаимоотношениями с хозяином. [9] По состоянию на 2016 год было неясно, вызывают ли изменения кишечной флоры эти аутоиммунные и воспалительные нарушения или являются их результатом или адаптацией к ним. [9] [113]

Астма [ править ]

Что касается астмы, были выдвинуты две гипотезы, объясняющие ее растущую распространенность в развитых странах. Гипотеза гигиены утверждает, что дети в развитом мире не подвергаются воздействию достаточного количества микробов и, следовательно, могут иметь более низкую распространенность конкретных бактериальных таксонов, которые играют защитную роль. [114] Вторая гипотеза фокусируется на диете западного образца , в которой отсутствуют цельнозерновые и клетчатка, а также содержится избыток простых сахаров . [9] Обе гипотезы сходятся во мнении о роли короткоцепочечных жирных кислот (SCFA) в иммуномодуляции.. Эти метаболиты бактериальной ферментации участвуют в передаче иммунных сигналов, которая предотвращает запуск астмы, а более низкие уровни SCFA связаны с заболеванием. [114] [115] При отсутствии защитных родов , таких как Lachnospira , Veillonella , Rothia и Faecalibacterium было связано со снижением уровня SCFA. [114] Кроме того, SCFAs являются продуктом бактериальной ферментации клетчатки, которой мало в диете западного образца. [9] [115] SCFAs предлагают связь между кишечной флорой и иммунными нарушениями, и по состоянию на 2016 год это была активная область исследований. [9]Подобные гипотезы также выдвигались в отношении роста пищевых и других аллергий. [116]

Сахарный диабет 1 типа [ править ]

Связь между микробиотой кишечника и сахарным диабетом 1 типа также связана с SCFAs, такими как бутират и ацетат. Рационы, содержащие бутират и ацетат в результате бактериальной ферментации, демонстрируют повышенную экспрессию T reg . [117] Регуляторы Т- клеток подавляют эффекторные Т-клетки , что, в свою очередь, снижает воспалительную реакцию в кишечнике. [118] Бутират является источником энергии для клеток толстой кишки. Таким образом, рационы с содержанием бутирата снижают проницаемость кишечника , обеспечивая достаточную энергию для образования плотных контактов . [119]Кроме того, было показано, что бутират снижает инсулинорезистентность, что позволяет предположить, что кишечные сообщества с низким содержанием бутират-продуцирующих микробов могут увеличить шансы заражения сахарным диабетом 2 типа . [120] Диеты, содержащие бутират, также могут иметь потенциальный эффект подавления колоректального рака . [119]

Ожирение и метаболический синдром [ править ]

Кишечная флора также участвует в ожирении и метаболическом синдроме из-за ключевой роли, которую она играет в пищеварительном процессе; диета западного образца, по-видимому, стимулирует и поддерживает изменения в кишечной флоре, которые, в свою очередь, изменяют количество энергии, получаемой из пищи, и то, как эта энергия используется. [112] [121] Одним из аспектов здорового питания , которого часто не хватает в диете западного образца, является клетчатка и другие сложные углеводы, которые необходимы здоровой кишечной флоре; изменения кишечной флоры в ответ на диету западного образца, по-видимому, увеличивают количество энергии, вырабатываемой кишечной флорой, что может способствовать ожирению и метаболическому синдрому. [95]Есть также свидетельства того, что микробиота влияет на пищевое поведение на основе предпочтений микробиоты, что может привести к тому, что хозяин будет потреблять больше пищи, что в конечном итоге приведет к ожирению. Обычно наблюдается, что при более высоком разнообразии кишечного микробиома микробиота будет тратить энергию и ресурсы на конкуренцию с другой микробиотой и меньше на манипулирование хозяином. Обратное наблюдается при более низком разнообразии микробиома кишечника, и эти микробиоты могут работать вместе, чтобы вызвать у хозяина тягу к еде. [42]

Кроме того, печень играет доминирующую роль в гомеостазе глюкозы в крови , поддерживая баланс между поглощением и хранением глюкозы посредством метаболических путей гликогенеза и глюконеогенеза . Липиды кишечника регулируют гомеостаз глюкозы по оси кишечник-мозг-печень. Прямое введение липидов в верхний отдел кишечника увеличивает уровни длинноцепочечного ацилкофермента А (LCFA-CoA) в верхних отделах кишечника и подавляет выработку глюкозы даже при поддиафрагмальной ваготомии или деафферентации блуждающего нерва.. Это прерывает нервную связь между мозгом и кишечником и блокирует способность липидов верхнего отдела кишечника подавлять выработку глюкозы. Ось кишечник-мозг-печень и состав микробиоты кишечника могут регулировать гомеостаз глюкозы в печени и обеспечивать потенциальные терапевтические методы лечения ожирения и диабета. [122]

Подобно тому, как кишечная флора может функционировать в петле обратной связи, которая может стимулировать развитие ожирения, есть доказательства того, что ограничение потребления калорий (например, диета ) может вызвать изменения в составе кишечной флоры. [112]

Заболевание печени [ править ]

Поскольку печень питается непосредственно воротной веной , все, что проходит через эпителий кишечника и барьер слизистой оболочки кишечника, попадает в печень, как и вырабатываемые там цитокины. [123] Дисбактериоз кишечной флоры был связан с развитием цирроза и неалкогольной жировой болезни печени . [123]

Рак [ править ]

Некоторые роды бактерий, такие как Bacteroides и Clostridium , связаны с увеличением скорости роста опухоли , в то время как другие роды, такие как Lactobacillus и Bifidobacteria , как известно, предотвращают образование опухолей. [11] По состоянию на декабрь 2017 г. были предварительные и косвенные доказательства того, что микробиота кишечника может опосредовать ответ на ингибиторы PD-1 ; механизм был неизвестен. [124]

Нейропсихиатрический [ править ]

Основная статья: ось кишечник-мозг

Интерес к взаимосвязи между кишечной флорой и нейропсихиатрическими проблемами был вызван исследованием 2014 года, показавшим, что мыши без микробов показали преувеличенную реакцию оси HPA на стресс по сравнению с лабораторными мышами без GF. [68] По состоянию на январь 2016 года большая часть работы, которая была проделана по роли кишечной флоры в оси кишечник-мозг, была проведена на животных или характеризовала различные нейроактивные соединения, которые может продуцировать кишечная флора, а также исследования на людях. измерение различий между людьми с различными психическими и неврологическими различиями, или изменения кишечной флоры в ответ на стресс, или измерение эффектов различных пробиотиков (называемых « психобиотиками»в этом контексте), как правило, были небольшими и не могли быть обобщены; Осталось неясным, являются ли изменения кишечной флоры результатом заболевания, причиной заболевания или и тем, и другим в любом количестве возможных петель обратной связи в оси кишечник-мозг. [68] [95]

В систематическом обзоре 2016 г. изучались доклинические и небольшие испытания на людях, которые были проведены с некоторыми коммерчески доступными штаммами пробиотических бактерий, и было обнаружено, что среди протестированных родов Bifidobacterium и Lactobacillus ( B. longum , B. breve , B. infantis , L .helveticus , L. rhamnosus , L. plantarum и L. casei ) обладают наибольшим потенциалом для применения при некоторых заболеваниях центральной нервной системы. [10]

Другие животные [ править ]

Состав микробиома кишечника человека аналогичен составу других человекообразных обезьян. Однако биота кишечника человека уменьшилась в разнообразии и изменилась по составу с тех пор, как мы эволюционно отделились от Пана . [125] У людей наблюдается увеличение Bacteroidetes, бактериального типа, связанного с диетами с высоким содержанием животного белка и жира, и снижение Methanobrevibacter и Fibrobacter, групп, которые ферментируют сложные полисахариды растений. [125] Эти изменения являются результатом комбинированных диетических, генетических и культурных изменений, которым подверглись люди с момента эволюционного отклонения от Пана .

Помимо людей и позвоночных, некоторые насекомые также обладают сложной и разнообразной кишечной микробиотой, которая играет ключевую роль в питании. [126] Микробные сообщества, связанные с термитами, могут составлять большую часть веса особей и выполнять важные роли в переваривании лигноцеллюлозы и азотфиксации . [127] Эти сообщества зависят от хозяина, и близкородственные виды насекомых имеют сопоставимое сходство в составе кишечной микробиоты. [128] [129] У тараканов микробиота кишечника собирается детерминированным образом, независимо от инокулята ; [130]причина этой сборки, специфичной для хоста, остается неясной. Бактериальные сообщества, связанные с насекомыми, такими как термиты и тараканы, определяются комбинацией сил, в первую очередь диетой, но есть некоторые признаки того, что филогения хозяина также может играть роль в выборе клонов. [128] [129]

Более 51 года известно, что введение низких доз антибактериальных средств способствует росту сельскохозяйственных животных и увеличению прибавки в весе. [94]

В исследовании, проведенном на мышах, соотношение Firmicutes и Lachnospiraceae было значительно повышено у животных, получавших субтерапевтические дозы различных антибиотиков. Анализируя калорийность фекалий и концентрацию низкоцепочечных жирных кислот (SCFAs) в желудочно-кишечном тракте, был сделан вывод, что изменения в составе микробиоты приводят к повышенной способности извлекать калории из неперевариваемых компонентов и к увеличение производства SCFAs. Эти данные свидетельствуют о том, что антибиотики нарушают не только состав микробиома желудочно-кишечного тракта, но и его метаболические возможности, особенно в отношении SCFA. [94]

См. Также [ править ]

  • Сопротивление колонизации
  • Список флоры человека
  • Список видов микробиоты нижних половых путей женщин
  • Флора кожи
  • Escherichia coli, продуцирующая веротоксин

Заметки [ править ]

  1. ^ Состав микробиома и концентрация микробов сильно различаются в зависимости от анатомической области. [83] [84] Жидкость из толстой кишки человека, которая содержит самую высокую концентрацию микробов из всех анатомических областей, содержит приблизительно один триллион (10 ^ 12) бактериальных клеток / мл. [83]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Мошак, М; Szulińska, M; Богданьски П. (15 апреля 2020 г.). «Вы - то, что вы едите - взаимосвязь между диетой, микробиотой и метаболическими нарушениями - обзор» . Питательные вещества . 12 (4): 1096. DOI : 10,3390 / nu12041096 . PMC  7230850 . PMID  32326604 . S2CID  216108564 .
  2. ^ Сегата, N; Boernigen, D; Щекотать, TL; Морган, XC; Гарретт, WS; Хаттенхауэр, К. (14 мая 2013 г.). «Вычислительная мета'омика для исследований микробного сообщества» . Молекулярная системная биология . 9 : 666. DOI : 10.1038 / msb.2013.22 . PMC 4039370 . PMID 23670539 .  
  3. ^ a b c Saxena, R .; Шарма, ВК (2016). «Метагеномное понимание микробиома человека: его значение для здоровья и болезней» . У Д. Кумара; С. Антонаракис (ред.). Медицина и геномика здоровья . Elsevier Science. п. 117. DOI : 10.1016 / B978-0-12-420196-5.00009-5 . ISBN 978-0-12-799922-7.
  4. ^ Б с д е е г ч я J K L Шервуда, Линда; Уилли, Джоанна; Вулвертон, Кристофер (2013). Микробиология Прескотта (9-е изд.). Нью-Йорк: Макгроу Хилл. С. 713–21. ISBN 9780073402406. OCLC  886600661 .
  5. ^ а б в г д Квигли, Э. М. (2013). «Кишечные бактерии в здоровье и болезни» . Гастроэнтерология и гепатология . 9 (9): 560–9. PMC 3983973 . PMID 24729765 .  
  6. ^ Б с д е е г ч я J к л м п о р д Sommer, Felix; Бэкхед, Фредрик (2013). «Микробиота кишечника - мастера развития и физиологии организма». Обзоры природы микробиологии . 11 (4): 227–38. DOI : 10.1038 / nrmicro2974 . PMID 23435359 . S2CID 22798964 .  
  7. ^ a b c d Фадерл, Мартин; Ноти, Марио; Корацца, Надя; Мюллер, Кристоф (2015). «Как держать насекомых под контролем: слой слизи как критический компонент в поддержании гомеостаза кишечника». IUBMB Life . 67 (4): 275–85. DOI : 10.1002 / iub.1374 . PMID 25914114 . S2CID 25878594 .  
  8. ^ a b c d e е Кларк, Джерард; Стиллинг, Роман М; Кеннеди, Пол Дж; Стэнтон, Кэтрин; Крайан, Джон Ф; Динан, Тимоти Дж. (2014). «Мини-обзор: кишечная микробиота: забытый эндокринный орган» . Молекулярная эндокринология . 28 (8): 1221–38. DOI : 10.1210 / me.2014-1108 . PMC 5414803 . PMID 24892638 .  
  9. ^ Б с д е е г ч Shen, Sj; Вонг, Конни Х.Й. (2016). «Облегчение воспаления: роль микробиоты кишечника» . Клиническая и трансляционная иммунология . 5 (4): e72. DOI : 10.1038 / cti.2016.12 . PMC 4855262 . PMID 27195115 .  
  10. ^ a b c Ван, Хуэйин; Ли, Ин-Сеон; Браун, Кристоф; Энк, Пол (2016). «Влияние пробиотиков на функции центральной нервной системы у животных и людей: систематический обзор» . Журнал нейрогастроэнтерологии и моторики . 22 (4): 589–605. DOI : 10,5056 / jnm16018 . PMC 5056568 . PMID 27413138 .  
  11. ^ a b c d e f g h i j k l m n o p Guarner, F; Малагелада, Дж (2003). «Флора кишечника в здоровье и болезни». Ланцет . 361 (9356): 512–19. DOI : 10.1016 / S0140-6736 (03) 12489-0 . PMID 12583961 . S2CID 38767655 .  
  12. ^ Б с д е е Sears, Синтия Л. (2005). «Динамичное партнерство: чествуем нашу кишечную флору». Анаэроб . 11 (5): 247–51. DOI : 10.1016 / j.anaerobe.2005.05.001 . PMID 16701579 . 
  13. ^ Шапира, Майкл (2016-07-01). «Кишечные микробиоты и эволюция хозяев: расширение симбиоза» . Тенденции в экологии и эволюции . 31 (7): 539–549. DOI : 10.1016 / j.tree.2016.03.006 . ISSN 0169-5347 . PMID 27039196 .  
  14. ^ a b c d e f g h i j Beaugerie, Laurent; Пети, Жан-Клод (2004). «Диарея, связанная с антибиотиками». Передовая практика и исследования в клинической гастроэнтерологии . 18 (2): 337–52. DOI : 10.1016 / j.bpg.2003.10.002 . PMID 15123074 . 
  15. ^ Стивен, AM; Каммингс, Дж. Х. (1980). «Микробный вклад в массу фекалий человека» . Журнал медицинской микробиологии . 13 (1): 45–56. DOI : 10.1099 / 00222615-13-1-45 . PMID 7359576 . 
  16. ^ Lozupone, Catherine A .; Stombaugh, Джесси I .; Гордон, Джеффри I .; Янссон, Джанет К .; Рыцарь, Роб (2012). «Разнообразие, стабильность и устойчивость микробиоты кишечника человека» . Природа . 489 (7415): 220–30. Bibcode : 2012Natur.489..220L . DOI : 10.1038 / nature11550 . PMC 3577372 . PMID 22972295 .  
  17. ^ Цинь, Цзюньцзе; Ли, Жуйцян; Раес, Джерун; Арумугам, Маниможиян; Бургдорф, Кристоффер Сольвстен; Маничан, Чайсаванх; Нильсен, Трина; Понс, Николас; Левенес, Флоренция; Ямада, Такудзи; Mende, Daniel R .; Ли, Цзюньхуа; Сюй, Цзюньминь; Ли, Шаочуань; Ли, Дунфан; Цао, Цзяньцзюнь; Ван, Бо; Лян, Хуэйцин; Чжэн, Хуйсун; Се, Иньлун; Тап, Жюльен; Лепаж, Патрисия; Берталан, Марсело; Батто, Жан-Мишель; Хансен, Торбен; Ле Пелье, Дени; Линнеберг, Аллан; Нильсен, Х. Бьёрн; Пеллетье, Эрик; Рено, Пьер (2010). «Каталог микробных генов кишечника человека, созданный путем метагеномного секвенирования» . Природа . 464 (7285): 59–65. Bibcode : 2010Natur.464 ... 59. . doi :10.1038 / природа08821 . PMC  3779803 . PMID  20203603 .
  18. ^ Шанахан, Фергус (2002). «Интерфейс хозяина и микроба в кишечнике». Лучшие практики и исследования в клинической гастроэнтерологии . 16 (6): 915–31. DOI : 10.1053 / bega.2002.0342 . PMID 12473298 . 
  19. ^ Тап, Жюльен; Мондо, Станислав; Левенес, Флоренция; Пеллетье, Эрик; Кэрон, Кристоф; Фюре, Жан-Пьер; Угарте, Эдгардо; Муньос-Тамайо, Рафаэль; Paslier, Denis LE; Налин, Рено; Доре, Джоэл; Леклерк, Марион (2009). «К филогенетическому ядру кишечной микробиоты человека». Экологическая микробиология . 11 (10): 2574–84. DOI : 10.1111 / j.1462-2920.2009.01982.x . PMID 19601958 . 
  20. ^ а б О'Хара, Энн М; Шанахан, Фергус (2006). «Кишечная флора как забытый орган» . EMBO Reports . 7 (7): 688–93. DOI : 10.1038 / sj.embor.7400731 . PMC 1500832 . PMID 16819463 .  
  21. ^ Ханна, Сахил; Тош, Притиш К (2014). «Букварь для клинициста о роли микробиома в здоровье и болезнях человека» . Труды клиники Мэйо . 89 (1): 107–14. DOI : 10.1016 / j.mayocp.2013.10.011 . PMID 24388028 . 
  22. ^ а б Цуй, Лицзя; Моррис, Элисон; Гедин, Элоди (2013). «Микобиом человека в здоровье и болезнях» . Геномная медицина . 5 (7): 63. DOI : 10,1186 / gm467 . PMC 3978422 . PMID 23899327 .  
  23. ^ Эрдоган, Аскин; Рао, Сатиш С.К. (2015). «Разрастание тонких кишечных грибков». Текущие отчеты гастроэнтерологии . 17 (4): 16. DOI : 10.1007 / s11894-015-0436-2 . PMID 25786900 . S2CID 3098136 .  
  24. ^ Белло, Мария Г. Домингес; Рыцарь, Роб; Гилберт, Джек А .; Блазер, Мартин Дж. (4 октября 2018 г.). «Сохранение микробного разнообразия». Наука . 362 (6410): 33–34. Bibcode : 2018Sci ... 362 ... 33B . DOI : 10.1126 / science.aau8816 . PMID 30287652 . S2CID 52919917 .  
  25. ^ а б Арумугам, Маниможиян; Раес, Джерун; Пеллетье, Эрик; Ле Пелье, Дени; Ямада, Такудзи; Mende, Daniel R .; Fernandes, Gabriel R .; Тап, Жюльен; Брюлс, Томас; Батто, Жан-Мишель; Берталан, Марсело; Борруэль, Наталья; Каселлас, Франсеск; Фернандес, Лейден; Готье, Лоран; Хансен, Торбен; Хаттори, Масахира; Хаяси, Тэцуя; Kleerebezem, Michiel; Курокава, Кен; Леклерк, Марион; Левенес, Флоренция; Маничан, Чайсаванх; Нильсен, Х. Бьёрн; Нильсен, Трина; Понс, Николас; Пулен, Джули; Цинь, Цзюньцзе; Зихериц-Понтен, Томас; Тимс, Себастьян (2011). «Энтеротипы микробиома кишечника человека» . Природа . 473 (7346): 174–80. Bibcode : 2011Natur.473..174. . Дои: 10.1038 / природа09944 . PMC  3728647 . PMID  21508958 .
  26. ^ a b Wu, GD; Chen, J .; Hoffmann, C .; Биттингер, К .; Chen, Y.-Y .; Keilbaugh, SA; Bewtra, M .; Рыцари, D .; Уолтерс, Вашингтон; Knight, R .; Sinha, R .; Gilroy, E .; Gupta, K .; Baldassano, R .; Nessel, L .; Li, H .; Бушман, ФО; Льюис, JD (2011). «Связь долгосрочных диетических моделей с кишечными микробными энтеротипами» . Наука . 334 (6052): 105–08. Bibcode : 2011Sci ... 334..105W . DOI : 10.1126 / science.1208344 . PMC 3368382 . PMID 21885731 .  
  27. ↑ Циммер, Карл (20 апреля 2011 г.). «Бактерии делят людей на 3 типа, - говорят ученые» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 21 апреля 2011 года . группа ученых теперь сообщает только о трех различных экосистемах в кишечнике людей, которых они изучали.
  28. ^ Рыцари, Дэн; Уорд, Тоня; Маккинли, Кристофер; Миллер, Ханна; Гонсалес, Антонио; Макдональд, Дэниел; Рыцарь, Роб (8 октября 2014 г.). «Переосмысление« энтеротипов » » . Клеточный хозяин и микроб . 16 (4): 433–37. DOI : 10.1016 / j.chom.2014.09.013 . PMC 5558460 . PMID 25299329 .  
  29. ^ Кеннет Тодар (2012). «Нормальная бактериальная флора человека» . Интернет-учебник по бактериологии Тодара . Проверено 25 июня, 2016 .
  30. ^ Куигли, Имонн MM; Кера, Родриго (2006). «Избыточный бактериальный рост в тонком кишечнике: роль антибиотиков, пребиотиков и пробиотиков» . Гастроэнтерология . 130 (2): S78–90. DOI : 10,1053 / j.gastro.2005.11.046 . PMID 16473077 . S2CID 16904501 .  
  31. ^ Адамс, MR; Мосс, Миссури (2007). Пищевая микробиология . DOI : 10.1039 / 9781847557940 . ISBN 978-0-85404-284-5.
  32. ^ a b Университет Глазго. 2005. Нормальная кишечная флора. Доступно в веб-архиве. Доступ 22 мая 2008 г.
  33. ^ Braune А, Blaut М (2016). «Виды бактерий, участвующие в преобразовании пищевых флавоноидов в кишечнике человека» . Кишечные микробы . 7 (3): 216–234. DOI : 10.1080 / 19490976.2016.1158395 . PMC 4939924 . PMID 26963713 .  
  34. ^ a b Steinhoff, U (2005). «Кто управляет толпой? Новые открытия и старые вопросы о микрофлоре кишечника». Письма иммунологии . 99 (1): 12–16. DOI : 10.1016 / j.imlet.2004.12.013 . PMID 15894105 . 
  35. ^ Б с д е е Gibson, Гленн R (2004). «Волокно и влияние на пробиотики (пребиотическая концепция)». Клинические пищевые добавки . 1 (2): 25–31. DOI : 10.1016 / j.clnu.2004.09.005 .
  36. ^ Микель, S; Martín, R; Росси, О; Бермудес-Хумаран, LG; Chatel, JM; Сокол, Н; Thomas, M; Уэллс, JM; Лангелла, П (2013). «Faecalibacterium prausnitzii и здоровье кишечника человека». Текущее мнение в микробиологии . 16 (3): 255–61. DOI : 10.1016 / j.mib.2013.06.003 . PMID 23831042 . 
  37. Перейти ↑ Ley, Ruth E (2010). «Ожирение и микробиом человека». Текущее мнение в гастроэнтерологии . 26 (1): 5–11. DOI : 10.1097 / MOG.0b013e328333d751 . PMID 19901833 . S2CID 23329156 .  
  38. ^ Нэш, Андреа К; Auchtung, Thomas A; Вонг, Мэтью С; Смит, Дэниел П.; Геселл, Джонатан Р.; Росс, Мэтью С; Стюарт, Кристофер Дж; Меткалф, Джинджер А; Музны, Донна М; Гиббс, Ричард А; Аджами, Надим Дж; Петросино, Джозеф Ф (2017). «Микобиом кишечника здоровой когорты Проекта микробиома человека» . Микробиом . 5 (1): 153. DOI : 10,1186 / s40168-017-0373-4 . PMC 5702186 . PMID 29178920 .  
  39. ^ Скарпеллини, Эмидио; Ианиро, Джанлука; Аттили, Фабия; Бассанелли, Кьяра; Де Сантис, Адриано; Гасбаррини, Антонио (2015). «Микробиота кишечника человека и виром: потенциальные терапевтические последствия» . Заболевания органов пищеварения и печени . 47 (12): 1007–12. DOI : 10.1016 / j.dld.2015.07.008 . PMC 7185617 . PMID 26257129 .  
  40. ^ Герритсен, Жаколин; Смидт, Хауке; Райкерс, Гер; де Вос, Виллем (27 мая 2011 г.). «Кишечная микробиота в здоровье и болезнях человека: влияние пробиотиков» . Гены и питание . 6 (3): 209–40. DOI : 10.1007 / s12263-011-0229-7 . PMC 3145058 . PMID 21617937 .  
  41. ^ Б с д е е Yatsunenko, Т .; Рей, ИП; Манары, MJ; Trehan, I .; Домингес-Белло, MG; Contreras, M .; Magris, M .; Hidalgo, G .; Baldassano, RN; Анохин А.П .; Хит, AC; Warner, B .; Reeder, J .; Kuczynski, J .; Caporaso, JG; Лозупоне, Калифорния; Lauber, C .; Clemente, JC; Рыцари, D .; Knight, R .; Гордон, JI (2012). «Микробиом кишечника человека в зависимости от возраста и географии» . Природа . 486 (7402): 222–27. Bibcode : 2012Natur.486..222Y . DOI : 10.1038 / nature11053 . PMC 3376388 . PMID 22699611 .  
  42. ^ a b c Олкок, Джо; Малей, Карло С; Актипис, К. Афина (2014). «Управляется ли пищевое поведение микробиотой желудочно-кишечного тракта? Эволюционное давление и потенциальные механизмы» . BioEssays . 36 (10): 940–9. DOI : 10.1002 / bies.201400071 . PMC 4270213 . PMID 25103109 .  
  43. ^ «Исследование показало , детство диета имеет пожизненное влияние» . Phys.org . Проверено 13 февраля 2021 года .
  44. ^ «Плохое питание в детстве может иметь длительное влияние на микробиом кишечника» . Новый Атлас . 4 февраля 2021 . Проверено 13 февраля 2021 года .
  45. ^ Макнамара, Моника П .; Синглтон, Дженнифер М .; Cadney, Marcell D .; Ruegger, Paul M .; Борнеман, Джеймс; Гарланд, Теодор (1 января 2021 г.). «Влияние западной диеты и физических упражнений молодых людей на состав микробиома кишечника взрослых мышей в молодом возрасте» . Журнал экспериментальной биологии : jeb.239699. DOI : 10,1242 / jeb.239699 . ISSN 0022-0949 . PMID 33431595 . Проверено 13 февраля 2021 года .  
  46. ^ Ага, Мин-Чин; Глик-Бауэр, Мариан (ноябрь 2014 г.). «Польза для здоровья веганской диеты: изучение связи кишечной микробиоты» . Питательные вещества . 6 (11): 4822–4838. DOI : 10.3390 / nu6114822 . PMC 4245565 . PMID 25365383 .  
  47. ^ а б Дэвид, Лоуренс А .; Морис, Корин Ф .; Кармоди, Рэйчел Н .; Гутенберг, Дэвид Б .; Баттон, Джули Э .; Вулф, Бенджамин Е .; Линг, Алиша В .; Девлин, А. Слоан; Варма, Юг; Fischbach, Michael A .; Biddinger, Sudha B .; Даттон, Рэйчел Дж .; Тернбо, Питер Дж. (11 декабря 2013 г.). «Диета быстро и воспроизводимо изменяет микробиом кишечника человека» . Природа . 505 (7484): 559–563. DOI : 10,1038 / природа12820 . PMC 3957428 . PMID 24336217 .  
  48. ^ Джеффри, Ян; О'Тул, Пол (17 января 2013 г.). «Взаимодействие диеты и микробиоты и их значение для здорового образа жизни» . Питательные вещества . 5 (1): 234–252. DOI : 10.3390 / nu5010234 . PMC 3571646 . PMID 23344252 .  
  49. ^ Де Филиппо, C; Кавальери, Д; Ди Паола, М; Ramazzotti, M; Poullet, J. B; Massart, S; Collini, S; Pieraccini, G; Лионетти, П. (2010). «Влияние диеты на формирование микробиоты кишечника, выявленное сравнительным исследованием у детей из Европы и сельских районов Африки» . Труды Национальной академии наук . 107 (33): 14691–6. Bibcode : 2010PNAS..10714691D . DOI : 10.1073 / pnas.1005963107 . PMC 2930426 . PMID 20679230 .  
  50. ^ Jonkers, Daisy МАЭ (2016). «Микробные нарушения и модуляция в условиях, связанных с недостаточностью питания и мальабсорбцией». Лучшие практики и исследования в клинической гастроэнтерологии . 30 (2): 161–72. DOI : 10.1016 / j.bpg.2016.02.006 . PMID 27086883 . 
  51. ^ Миллион, Матье; Диалло, Альдиума; Рауль, Дидье (май 2017 г.). «Микробиота кишечника и недоедание». Микробный патогенез . 106 : 127–138. DOI : 10.1016 / j.micpath.2016.02.003 . PMID 26853753 . 
  52. ^ Rytter, Марен Johanne Heilskov; Колте, Лилиан; Бринд, Андре; Фриис, Хенрик; Кристенсен, Вибеке Брикс (2014). «Иммунная система у детей с недоеданием - систематический обзор» . PLOS ONE . 9 (8): e105017. Bibcode : 2014PLoSO ... 9j5017R . DOI : 10.1371 / journal.pone.0105017 . PMC 4143239 . PMID 25153531 .  
  53. ^ a b c Ренсон, Одри; Стадо, Памела; Дауд, Дженнифер Б. (2020). «Больные люди и больные (микробные) популяции: проблемы эпидемиологии и микробиома» . Ежегодный обзор общественного здравоохранения . 41 : 63–80. DOI : 10,1146 / annurev-publhealth-040119-094423 . PMID 31635533 . 
  54. ^ Туррони, Франческа; Пеано, Клелия; Пройдите, Даниэль А; Форони, Елена; Севернини, Марко; Клаэссон, Маркус Дж; Керр, Колм; Хурихейн, Джонатан; Мюррей, Дейрдра; Фулиньи, Фабио; Геймонд, Мигель; Марголлес, Абелардо; Де Беллис, Джанлука; о'Тул, Пол В; Ван Синдерен, Доув; Marchesi, Julian R; Вентура, Марко (2012). «Разнообразие бифидобактерий в кишечной микробиоте младенцев» . PLOS ONE . 7 (5): e36957. Bibcode : 2012PLoSO ... 736957T . DOI : 10.1371 / journal.pone.0036957 . PMC 3350489 . PMID 22606315 .  
  55. ^ Дэвенпорт, Эмили Р .; Сандерс, Джон Дж .; Сон, Се Джин; Amato, Katherine R .; Кларк, Эндрю Дж .; Рыцарь, Роб (27.12.2017). «Микробиом человека в эволюции» . BMC Biology . 15 (1): 127. DOI : 10,1186 / s12915-017-0454-7 . ISSN 1741-7007 . PMC 5744394 . PMID 29282061 .   
  56. ↑ Перес-Муньос, Мария Элиза; Арриета, Мария-Клэр; Рамер-Тейт, Аманда Э; Уолтер, Йенс (2017). «Критическая оценка гипотез« стерильной матки »и« внутриутробной колонизации »: значение для исследования микробиома новорожденного младенца» . Микробиом . 5 (1): 48. DOI : 10,1186 / s40168-017-0268-4 . PMC 5410102 . PMID 28454555 .  
  57. ^ a b Матаморос, Себастьян; Гра-Леген, Кристель; Ле Вакон, Франсуаза; Потель, Жиль; де ла Кошетьер, Мари-Франс (2013). «Развитие кишечной микробиоты у младенцев и его влияние на здоровье». Тенденции в микробиологии . 21 (4): 167–73. DOI : 10.1016 / j.tim.2012.12.001 . PMID 23332725 . 
  58. ^ a b c d e f g Мюллер, Ноэль Т .; Бакач, Элизабет; Комбеллик, Джоан; Григорян Зоя; Домингес-Белло, Мария Г. (2015). «Развитие микробиома младенца: мама имеет значение» . Тенденции в молекулярной медицине . 21 (2): 109–17. DOI : 10.1016 / j.molmed.2014.12.002 . PMC 4464665 . PMID 25578246 .  
  59. ^ Хименес, Эстер; Фернандес, Леонидес; Марин, Мария Л; Мартин, Росио; Odriozola, Juan M; Нуэно-Палоп, Кармен; Нарбад, Арджан; Оливарес, Моника; Хаус, Хорди; Родригес, Хуан М (2005). «Выделение комменсальных бактерий из пуповинной крови здоровых новорожденных, рожденных путем кесарева сечения». Современная микробиология . 51 (4): 270–4. DOI : 10.1007 / s00284-005-0020-3 . PMID 16187156 . S2CID 43438656 .  
  60. ^ Колладо, Мария Кармен; Раутава, Самули; Аакко, Джухани; Исолаури, Эрика; Салминен, Сеппо (2016). «Колонизация кишечника человека может быть инициирована внутриутробно различными микробными сообществами в плаценте и околоплодных водах» . Научные отчеты . 6 : 23129. Bibcode : 2016NatSR ... 623129C . DOI : 10.1038 / srep23129 . PMC 4802384 . PMID 27001291 .  
  61. ^ Хименес, Эстер; Марин, Мария Л .; Мартин, Росио; Odriozola, Juan M .; Оливарес, Моника; Хаус, Хорди; Фернандес, Леонидес; Родригес, Хуан М. (2008). «Неужели меконий от здоровых новорожденных действительно бесплоден?». Исследования в области микробиологии . 159 (3): 187–93. DOI : 10.1016 / j.resmic.2007.12.007 . PMID 18281199 . 
  62. ↑ Перес-Муньос, Мария Элиза; Арриета, Мария-Клэр; Рамер-Тейт, Аманда Э; Уолтер, Йенс (2017). «Критическая оценка гипотез« стерильной матки »и« внутриутробной колонизации »: значение для исследования микробиома новорожденного младенца» . Микробиом . 5 (1): 48. DOI : 10,1186 / s40168-017-0268-4 . PMC 5410102 . PMID 28454555 .  
  63. ^ Адлерберт, я; Уолд, AE (2009). «Создание микробиоты кишечника у западных младенцев». Acta Paediatrica . 98 (2): 229–38. DOI : 10.1111 / j.1651-2227.2008.01060.x . PMID 19143664 . S2CID 205859933 .  
  64. ^ Коппа, GV; Зампини, L; Галеацци, Т; Габриэлли, О. (2006). «Пребиотики в грудном молоке: обзор». Заболевания органов пищеварения и печени . 38 : S291–4. DOI : 10.1016 / S1590-8658 (07) 60013-9 . PMID 17259094 . 
  65. ^ Фанаро, S; Chierici, R; Guerrini, P; Виги, V (2007). «Микрофлора кишечника в раннем детстве: состав и развитие». Acta Paediatrica . 92 (441): 48–55. DOI : 10.1111 / j.1651-2227.2003.tb00646.x . PMID 14599042 . S2CID 10316311 .  
  66. ^ Яссур, Моран; Ватанен, Томми; Сильяндер, Хели; Хямяляйнен, Ану-Маария; Härkönen, Taina; Ryhänen, Samppa J; Franzosa, Eric A; Вламакис, Гера; Хаттенхауэр, Кертис; Геверс, Дирк; Лендер, Эрик С; Книп, Микаэль; Ксавье, Рамник Дж (2016). «Естественная история микробиома кишечника младенца и влияние лечения антибиотиками на разнообразие и стабильность бактериальных штаммов» . Трансляционная медицина науки . 8 (343): 343ra81. DOI : 10.1126 / scitranslmed.aad0917 . PMC 5032909 . PMID 27306663 .  
  67. ^ https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/7782892/
  68. ^ Б с д е е Ван Ян; Каспер, Ллойд Х (2014). «Роль микробиома в расстройствах центральной нервной системы» . Мозг, поведение и иммунитет . 38 : 1–12. DOI : 10.1016 / j.bbi.2013.12.015 . PMC 4062078 . PMID 24370461 .  
  69. ^ а б Юн, My Young; Ли, Кихун; Юн, Сан Сон (2014). «Защитная роль кишечных комменсальных микробов против кишечных инфекций». Журнал микробиологии . 52 (12): 983–9. DOI : 10.1007 / s12275-014-4655-2 . PMID 25467115 . S2CID 54622675 .  
  70. ^ Рейносо Уэбб, Синтия; Кобозиев, Юрий; Ферр, Кэтрин Л; Гришэм, Мэтью Б. (2016). «Защитная и провоспалительная роль кишечных бактерий» . Патофизиология . 23 (2): 67–80. DOI : 10.1016 / j.pathophys.2016.02.002 . PMC 4867289 . PMID 26947707 .  
  71. ^ Mantis, Нью-Джерси; Rol, N; Кортези, Б. (2011). «Комплексная роль секреторного IgA в иммунитете и гомеостазе слизистой оболочки кишечника» . Иммунология слизистой оболочки . 4 (6): 603–11. DOI : 10.1038 / mi.2011.41 . PMC 3774538 . PMID 21975936 .  
  72. ^ a b Петерсон, Лэнс У; Артис, Дэвид (2014). «Эпителиальные клетки кишечника: регуляторы барьерной функции и иммунного гомеостаза». Обзоры природы Иммунология . 14 (3): 141–53. DOI : 10.1038 / nri3608 . PMID 24566914 . S2CID 3351351 .  
  73. ^ а б Хонда, Кения; Литтман, Дэн Р. (2016). «Микробиота в адаптивном иммунном гомеостазе и болезни». Природа . 535 (7610): 75–84. Bibcode : 2016Natur.535 ... 75H . DOI : 10.1038 / nature18848 . PMID 27383982 . S2CID 4461492 .  
  74. ^ a b Леви, М .; Тайсс, Калифорния; Елинав, Э. (2016). «Метаболиты: посредники между микробиотой и иммунной системой» . Гены и развитие . 30 (14): 1589–97. DOI : 10,1101 / gad.284091.116 . PMC 4973288 . PMID 27474437 .  
  75. ^ Б с д е е г ч я Zhang LS, Davies SS (апрель 2016). «Микробный метаболизм диетических компонентов до биоактивных метаболитов: возможности новых терапевтических вмешательств» . Genome Med . 8 (1): 46. DOI : 10,1186 / s13073-016-0296-х . PMC 4840492 . PMID 27102537 . Lactobacillus spp. превращают триптофан в индол-3-альдегид (I3A) с помощью неидентифицированных ферментов [125]. Clostridium sporogenes  преобразовать триптофан в IPA [6], вероятно, через триптофандезаминазу. ... IPA также эффективно улавливает гидроксильные радикалы
    Таблица 2: Микробные метаболиты: их синтез, механизмы действия и влияние на здоровье и болезнь
    Рисунок 1: Молекулярные механизмы действия индола и его метаболитов на физиологию и болезнь хозяина
  76. ^ Wikoff WR, Anfora AT, Liu J, Schultz PG, Lesley SA, Петерс EC, Siuzdak G (март 2009). «Метаболомический анализ показывает большое влияние микрофлоры кишечника на метаболиты крови млекопитающих» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 106 (10): 3698–3703. DOI : 10.1073 / pnas.0812874106 . PMC 2656143 . PMID 19234110 . Было показано, что производство IPA полностью зависит от присутствия микрофлоры кишечника и может быть установлено путем колонизации бактерией Clostridium sporogenes .  
    Диаграмма метаболизма IPA
  77. ^ «3-Индолепропионовая кислота» . База данных метаболома человека . Университет Альберты . Проверено 12 июня 2018 . Индол-3-пропионат (IPA), продукт дезаминирования триптофана, образующийся симбиотическими бактериями в желудочно-кишечном тракте млекопитающих и птиц. Было показано, что 3-индолепропионовая кислота предотвращает окислительный стресс и гибель первичных нейронов и клеток нейробластомы, подвергшихся воздействию бета-амилоидного белка в форме амилоидных фибрилл, одного из наиболее заметных нейропатологических признаков болезни Альцгеймера. 3-Индолепропионовая кислота также демонстрирует высокий уровень нейрозащиты в двух других парадигмах окислительного стресса. ( PMID 10419516 ) ... Совсем недавно было обнаружено, что более высокие уровни индол-3-пропионовой кислоты в сыворотке / плазме связаны со снижением вероятности диабета 2 типа и с более высоким уровнем потребления продуктов, богатых клетчаткой ( PMID 28397877 ). Происхождение: • Эндогенный • Микробный 
  78. ^ Chyan YJ, Poeggeler В, Омар Р.А., Цепь Д.Г., Frangione В, Ghiso Дж, Pappolla М.А. (июль 1999 г.). «Мощные нейрозащитные свойства против бета-амилоида Альцгеймера за счет эндогенной структуры индола, связанной с мелатонином, индол-3-пропионовой кислоты». J. Biol. Chem . 274 (31): 21937–21942. DOI : 10.1074 / jbc.274.31.21937 . PMID 10419516 . [Индол-3-пропионовая кислота (IPA)] ранее была обнаружена в плазме и спинномозговой жидкости человека, но ее функции неизвестны. ... В экспериментах по кинетической конкуренции с использованием агентов, улавливающих свободные радикалы, способность IPA улавливать гидроксильные радикалы превышала способность мелатонина, индоламина, который считается наиболее мощным естественным поглотителем свободных радикалов. В отличие от других антиоксидантов, IPA не превращался в реакционноспособные промежуточные продукты с прооксидантной активностью.
  79. ^ Хоппер, Кристофер П .; Де ла Крус, леди Кимберли; Lyles, Kristin V .; Wareham, Lauren K .; Гилберт, Джек А .; Эйхенбаум, Зехава; Magierowski, Marcin; Пул, Роберт К .; Воллборн, Якоб; Ван, Бинхэ (23 декабря 2020 г.). «Роль окиси углерода в коммуникации микробиома хозяина и кишечника» . Химические обзоры . 120 (24): 13273–13311. DOI : 10.1021 / acs.chemrev.0c00586 . ISSN 0009-2665 . 
  80. ^ Rajilić-Стоянович, Миряна; Де Вос, Виллем М (2014). «Первые 1000 культивируемых видов микробиоты желудочно-кишечного тракта человека» . FEMS Microbiology Reviews . 38 (5): 996–1047. DOI : 10.1111 / 1574-6976.12075 . PMC 4262072 . PMID 24861948 .  
  81. ^ Хилл, MJ (март 1997). «Кишечная флора и эндогенный витаминный синтез» . Европейский журнал профилактики рака . 6 Дополнение 1: S43–45. DOI : 10.1097 / 00008469-199703001-00009 . ISSN 0959-8278 . PMID 9167138 . S2CID 8740364 .   
  82. ^ "Микробиом" . Пучки сейчас . 2013-09-17 . Проверено 9 декабря 2020 .
  83. ^ a b c d e ElRakaiby M, Dutilh BE, Rizkallah MR, Boleij A, Cole JN, Aziz RK (июль 2014 г.). «Фармакомикробиомика: влияние изменений микробиома человека на системную фармакологию и персонализированную терапию» . Омикс . 18 (7): 402–414. DOI : 10.1089 / omi.2014.0018 . PMC 4086029 . PMID 24785449 .  Сотни триллионов микробов и вирусов, обитающих в каждом человеческом теле, которых больше, чем человеческие клетки, и вносят, по крайней мере, в 100 раз больше генов, чем те, которые закодированы в геноме человека (Ley et al., 2006), предлагают огромный вспомогательный пул для генетических вариация, которая была недооценена и в значительной степени неизучена (Savage, 1977; Medini et al., 2008; Minot et al., 2011; Wylie et al., 2012). ... Между тем, уже давно существует огромное количество литературы о биотрансформации ксенобиотиков, особенно кишечными бактериями (обзор в Sousa et al., 2008; Rizkallah et al., 2010; Johnson et al., 2012; Haiser and Turnbaugh). , 2013). Эта ценная информация в основном касается метаболизма лекарств неизвестными микробами, связанными с человеком; однако зарегистрировано лишь несколько случаев вариаций микробиома между индивидуумами [например,дигоксин (Mathan et al., 1989) и ацетаминофен (Clayton et al., 2009)].
  84. ^ a b c Cho I, Blaser MJ (март 2012 г.). «Микробиом человека: на стыке здоровья и болезни» . Обзоры природы. Генетика . 13 (4): 260–270. DOI : 10.1038 / nrg3182 . PMC 3418802 . PMID 22411464 . Состав микробиома варьируется в зависимости от анатомического участка (рис. 1). Основным фактором, определяющим состав сообщества, является анатомическое расположение: межличностные различия значительны 23,24 и выше, чем временные вариации, наблюдаемые на большинстве участков у одного человека 25  . ... Как микробиом влияет на фармакологию лекарств? Можем ли мы «микротип» улучшить фармакокинетику и / или снизить токсичность? Можем ли мы манипулировать микробиомом для улучшения фармакокинетической стабильности?
  85. ^ Хуттер Т, Gimbert С, Бучард F, Lapointe FJ (2015). «Быть ​​человеком - это внутреннее чувство» . Микробиом . 3 : 9. дои : 10,1186 / s40168-015-0076-7 . PMC 4359430 . PMID 25774294 .  Некоторые метагеномные исследования показали, что менее 10% клеток, составляющих наши тела, являются клетками Homo sapiens. Остальные 90% - это бактериальные клетки. Описание этого так называемого микробиома человека представляет большой интерес и важность по нескольким причинам. Во-первых, это помогает нам заново определить, что такое биологический человек. Мы предполагаем, что человеческую особь сейчас лучше всего описать как супер-индивидуум, в котором сосуществует большое количество различных видов (включая Homo sapiens).
  86. ^ Kumar K, Dhoke Г.В., Шарма А.К., Джайсвал С.К., Sharma VK (январь 2019). «Механистическое выяснение метаболизма амфетамина с помощью тираминоксидазы из микробиоты кишечника человека с использованием моделирования молекулярной динамики». Журнал клеточной биохимии . 120 (7): 11206–11215. DOI : 10.1002 / jcb.28396 . PMID 30701587 . S2CID 73413138 . В частности, в случае кишечника человека, в котором обитает большое разнообразие видов бактерий, различия в микробном составе могут значительно изменить метаболическую активность в просвете кишечника. 4  Различная метаболическая активность из-за различий в видах кишечных микробов недавно была связана с различными метаболическими нарушениями и заболеваниями. 5-12 Помимо влияния микробного разнообразия кишечника или дисбактериоза на различные заболевания человека, появляется все больше доказательств того, что микробы кишечника могут влиять на биодоступность и эффективность различных молекул перорально вводимых лекарств посредством беспорядочного ферментативного метаболизма. 13,14 ... Настоящее исследование атомистических деталей связывания амфетамина и сродства связывания с тираминоксидазой наряду со сравнением с двумя природными субстратами этого фермента, а именно тирамином и фенилаланином, предоставляет убедительные доказательства беспорядочного метаболизма амфетамина тираминоксидазой. фермент кишечной палочки. Полученные результаты будут иметь решающее значение при разработке суррогатной молекулы амфетамина, которая может помочь либо в повышении эффективности и биодоступности амфетаминового препарата посредством конкурентного ингибирования, либо в изменении конструкции препарата для улучшения фармакологических эффектов. Это исследование также будет иметь полезные клинические последствия в снижении микробиоты кишечника, вызванной вариабельностью ответа на лекарства среди разных групп населения.
  87. ^ Соуза, Тьяго; Патерсон, Ронни; Мур, Ванесса; Карлссон, Андерс; Абрахамссон, Бертил; Басит, Абдул В. (2008). «Микробиота желудочно-кишечного тракта как место биотрансформации лекарств». Международный фармацевтический журнал . 363 (1-2): 1-25. DOI : 10.1016 / j.ijpharm.2008.07.009 . PMID 18682282 . 
  88. ^ Хайзер, Х. Дж; Гутенберг, Д. Б.; Чатман, К; Sirasani, G; Бальскус, Э. П; Тернбо, П. Дж (2013). «Прогнозирование и управление инактивацией сердечных лекарств кишечной бактерией человека Eggerthella lenta» . Наука . 341 (6143): 295–8. Bibcode : 2013Sci ... 341..295H . DOI : 10.1126 / science.1235872 . PMC 3736355 . PMID 23869020 .  
  89. ^ Майер, Э. А; Рыцарь, R; Мазманян, С.К .; Cryan, J. F; Тиллиш, К. (2014). «Кишечные микробы и мозг: смена парадигмы в нейробиологии» . Журнал неврологии . 34 (46): 15490–6. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.3299-14.2014 . PMC 4228144 . PMID 25392516 .  
  90. ^ a b c Динан, Тимоти Г; Крайан, Джон Ф (2015). «Влияние кишечной микробиоты на мозг и поведение». Текущее мнение о клиническом питании и метаболическом лечении . 18 (6): 552–8. DOI : 10,1097 / MCO.0000000000000221 . PMID 26372511 . S2CID 21424690 .  
  91. ^ a b c Карман, Роберт Дж .; Саймон, Мэри Элис; Фернандес, Хайде; Миллер, Маргарет А .; Варфоломей, Мэри Дж. (2004). «Ципрофлоксацин в низких дозах нарушает устойчивость к колонизации фекальной микрофлоры человека, растущей в хемостатах». Нормативная токсикология и фармакология . 40 (3): 319–26. DOI : 10.1016 / j.yrtph.2004.08.005 . PMID 15546686 . 
  92. ^ Брандт, Лоуренс Дж .; Бороды, Томас Юлиус; Кэмпбелл, Джордана (2011). «Эндоскопическая трансплантация фекальной микробиоты». Журнал клинической гастроэнтерологии . 45 (8): 655–57. DOI : 10.1097 / MCG.0b013e3182257d4f . PMID 21716124 . 
  93. ^ Рыцарь, DJW; Гирлинг, KJ (2003). «Флора кишечника в здоровье и болезни». Ланцет . 361 (9371): 512–19. DOI : 10.1016 / S0140-6736 (03) 13438-1 . PMID 12781578 . S2CID 40683723 .  
  94. ^ a b c Cho, I .; Yamanishi, S .; Cox, L .; Methé, BA; Zavadil, J .; Ли, К .; Gao, Z .; Mahana, D .; Raju, K .; Тейтлер, I .; Li, H .; Алексеенко, А.В.; Блазер, MJ (2012). «Антибиотики в раннем возрасте изменяют микробиом толстой кишки и ожирение мышей» . Природа . 488 (7413): 621–26. Bibcode : 2012Natur.488..621C . DOI : 10.1038 / nature11400 . PMC 3553221 . PMID 22914093 .  
  95. ^ a b c d Шнейдерхан, Дж; Мастер-Охотник, Т; Локк, А (2016). «Ориентация на кишечную флору для лечения и профилактики заболеваний». Журнал семейной практики . 65 (1): 34–8. PMID 26845162 . 
  96. ^ Бейкер, Моня (2012). «Беременность изменяет резидентные микробы кишечника» . Природа . DOI : 10.1038 / nature.2012.11118 . S2CID 87078157 . 
  97. ^ Хилл, Колин; Гварнер, Франсиско; Рид, Грегор; Гибсон, Гленн Р.; Меренштейн, Даниэль Дж; Горшок, Бруно; Морелли, Лоренцо; Канани, Роберто Берни; Флинт, Гарри Дж; Салминен, Сеппо; Колдер, Филип С; Сандерс, Мэри Эллен (2014). «Консенсусное заявление Международной научной ассоциации пробиотиков и пребиотиков относительно области применения и надлежащего использования термина пробиотик» . Nature Reviews Гастроэнтерология и гепатология . 11 (8): 506–14. DOI : 10.1038 / nrgastro.2014.66 . PMID 24912386 . 
  98. ^ Rijkers, Гер Т; Де Вос, Виллем М.; Брюммер, Роберт-Ян; Морелли, Лоренцо; Кортье, Жерар; Марто, Филипп (2011). «Польза для здоровья и утверждения пробиотиков для здоровья: соединяя науку и маркетинг» . Британский журнал питания . 106 (9): 1291–6. DOI : 10.1017 / S000711451100287X . PMID 21861940 . 
  99. ^ Хаткинс, Роберт W; Крамбек, Янина А; Биндельс, Лауре Б; Кани, Патрис Д.; Фэйи, Джордж; Го, Йонг Джун; Хамакер, Брюс; Мартенс, Эрик С; Миллс, Дэвид А; Растал, Роберт А; Воан, Элейн; Сандерс, Мэри Эллен (2016). «Пребиотики: почему определения имеют значение» . Текущее мнение в области биотехнологии . 37 : 1–7. DOI : 10.1016 / j.copbio.2015.09.001 . PMC 4744122 . PMID 26431716 .  
  100. ^ Пандей, Кавита. Р; Наик, Суреш. Р; Вакиль, Бабу. V (2015). «Пробиотики, пребиотики и синбиотики - обзор» . Журнал пищевой науки и технологий . 52 (12): 7577–87. DOI : 10.1007 / s13197-015-1921-1 . PMC 4648921 . PMID 26604335 .  
  101. ^ Broeckx, Жеральдин; Ванденхёвель, Дитер; Клаас, Ингмар JJ; Лебир, Сара; Кикенс, Филип (2016). «Методы сушки пробиотических бактерий как важный шаг к разработке новых фармабиотиков». Международный фармацевтический журнал . 505 (1-2): 303-18. DOI : 10.1016 / j.ijpharm.2016.04.002 . hdl : 10067/1328840151162165141 . PMID 27050865 . 
  102. ^ Слейтор, Рой D; Хилл, Колин (2009). «Рациональный дизайн улучшенных фармабиотиков» . Журнал биомедицины и биотехнологии . 2009 : 275287. дои : 10,1155 / 2009/275287 . PMC 2742647 . PMID 19753318 .  
  103. ^ Паттерсон, Элейн; Крайан, Джон Ф; Фитцджеральд, Джеральд Ф; Росс, Р. Пол; Динан, Тимоти Дж. Стэнтон, Кэтрин (2014). «Микробиота кишечника, производимые ими фармакологические препараты и обеспечивающие здоровье» . Труды Общества питания . 73 (4): 477–89. DOI : 10.1017 / S0029665114001426 . PMID 25196939 . 
  104. ^ Форд, Александр C; Куигли, Имонн ММ; Лейси, Брайан Э; Лембо, Энтони Дж; Сайто, Юрий А; Шиллер, Лоуренс R; Соффер, Эди Э; Spiegel, Brennan MR; Моайеди, Пол (2014). «Эффективность пребиотиков, пробиотиков и синбиотиков при синдроме раздраженного кишечника и хронических идиопатических запорах: систематический обзор и метаанализ». Американский журнал гастроэнтерологии . 109 (10): 1547-61, викторины 1546 1562. DOI : 10.1038 / ajg.2014.202 . PMID 25070051 . S2CID 205100508 .  
  105. ^ Дюпон, Эндрю; Ричардс; Елинек, Кэтрин А; Крил, Джозеф; Рахими, Эрик; Гури, Йезаз (2014). «Систематический обзор рандомизированных контролируемых исследований пробиотиков, пребиотиков и синбиотиков при воспалительном заболевании кишечника» . Клиническая и экспериментальная гастроэнтерология . 7 : 473–87. дои : 10,2147 / CEG.S27530 . PMC 4266241 . PMID 25525379 .  
  106. ↑ Yu, Cheng Gong; Хуан, Цинь (2013). «Недавние успехи в изучении роли кишечной микробиоты в патогенезе воспалительных заболеваний кишечника» . Журнал болезней органов пищеварения . 14 (10): 513–7. DOI : 10.1111 / 1751-2980.12087 . PMID 23848393 . S2CID 26982085 .  
  107. ^ Майер, Лиза; Прутяну, Михаэла; Кун, Майкл; Целлер, Георг; Тельцеров, Аня; Андерсон, Эксин Эрин; Брочадо, Ана Рита; Фернандес, Кейт Конрад; Доза, Хитоми; Мори, Хиротада; Патил, Киран Раосахеб; Борк, Пер; Типас, Афанасий (2018). «Обширное влияние неантибиотических препаратов на кишечные бактерии человека» . Природа . 555 (7698): 623–628. Bibcode : 2018Natur.555..623M . DOI : 10.1038 / nature25979 . PMC 6108420 . PMID 29555994 .  
  108. ^ а б Камбой, АК; Коттер, Т.Г .; Оксентенко, А.С. (2017). «Helicobacter pylori: прошлое, настоящее и будущее в управлении» . Труды клиники Мэйо . 92 (4): 599–604. DOI : 10.1016 / j.mayocp.2016.11.017 . ISSN 0025-6196 . PMID 28209367 .  
  109. ^ a b c «Язвенная болезнь» (PDF) . Медицинский факультет Университета Джонса Хопкинса. 2013 . Проверено 21 октября 2020 года .
  110. ^ Буриш, Йохан; Джесс, Тайн; Мартинато, Маттео; Лакатос, Питер L (2013). «Бремя воспалительных заболеваний кишечника в Европе» . Журнал Крона и колита . 7 (4): 322–37. DOI : 10.1016 / j.crohns.2013.01.010 . PMID 23395397 . 
  111. ^ Бландино, G; Inturri, R; Lazzara, F; Di Rosa, M; Малагуарнера, Л. (2016). «Влияние микробиоты кишечника на сахарный диабет». Диабет и обмен веществ . 42 (5): 303–315. DOI : 10.1016 / j.diabet.2016.04.004 . PMID 27179626 . 
  112. ^ a b c Буланже, Клэр Л.; Невес, Ана Луиза; Шиллу, Жюльен; Николсон, Джереми К.; Дюма, Марк-Эммануэль (2016). «Влияние микробиоты кишечника на воспаление, ожирение и нарушение обмена веществ» . Геномная медицина . 8 (1): 42. DOI : 10,1186 / s13073-016-0303-2 . PMC 4839080 . PMID 27098727 .  
  113. ^ Спиллер, Робин (2016). «Синдром раздраженного кишечника: новые сведения о механизмах симптомов и достижениях в лечении» . F1000 Исследования . 5 : 780. DOI : 10,12688 / f1000research.7992.1 . PMC 4856111 . PMID 27158477 .  
  114. ^ a b c Арриета, Мария-Клэр; Stiemsma, Leah T; Димитриу, Педро А; Торсон, Лиза; Рассел, Шеннон; Юрист-Дауч, Софи; Кузельевич, Борис; Голд, Мэтью Дж; Бриттон, Хайди М; Лефевр, Диана Л; Суббарао, Падмаджа; Мандхане, Пиуш; Беккер, Аллан; МакНэгни, Келли М; Sears, Malcolm R; Коллманн, Тобиас; Мон, Уильям В; Турви, Стюарт Э; Бретт Финли, Б. (2015). «Микробные и метаболические изменения в раннем младенчестве влияют на риск детской астмы». Трансляционная медицина науки . 7 (307): 307ra152. DOI : 10.1126 / scitranslmed.aab2271 . PMID 26424567 . S2CID 206687974 .  
  115. ^ a b Stiemsma, Leah T; Турви, Стюарт Э (2017). «Астма и микробиом: определение критического окна в раннем возрасте» . Аллергия, астма и клиническая иммунология . 13 : 3. DOI : 10,1186 / s13223-016-0173-6 . PMC 5217603 . PMID 28077947 .  
  116. ^ Ипчи, Каган; Алтынтопрак, Ниязи; Мулук, Нурай Баяр; Сентурк, Мехмет; Чинги, Джемаль (2016). «Возможные механизмы микробиома человека при аллергических заболеваниях». Европейский архив оторино-ларингологии . 274 (2): 617–626. DOI : 10.1007 / s00405-016-4058-6 . PMID 27115907 . S2CID 27328940 .  
  117. ^ Мариньо, Э., Ричардс, Дж. Л., Маклеод, К. Х., Стэнли, Д., Яп, Ю. А., Найт, Дж., Маккензи, К., Кранич, Дж., Оливейра, А. С., Росселло, Ф. Дж., Кришнамурти, Б. , Nefzger, CM, Macia, L., Thorburn, A., Baxter, AG, Morahan, G., Wong, LH, Polo, JM, Moore, RJ,… Mackay, CR (2017). Метаболиты кишечных микробов ограничивают частоту аутоиммунных Т-клеток и защищают от диабета 1 типа. Иммунология природы, 18 (5), 552–562. https://doi.org/10.1038/ni.3713
  118. ^ Bettelli E, Carrier Y, W Гао, Korn T, Strom TB, Oukka M, Weiner HL, Kuchroo В.К. (май 2006). «Взаимные пути развития для генерации патогенных эффекторных TH17 и регуляторных Т-клеток». Природа . 441 (7090): 235–8. Bibcode : 2006Natur.441..235B. DOI : 10,1038 / природа04753. PMID 16648838.
  119. ^ a b ЗЕМАНН, MD, БЁМИГ, Джорджия, ЭСТЕРРАЙХЕР, CH, БЕРТШЕР, Х., ПАРОЛИНИ, О., ДИАКОС, К., Штёкль, Дж., Хёрль, WH, & ZLABINGER, GJ (2000). Противовоспалительное действие бутирата натрия на моноциты человека: сильное ингибирование IL-12 и усиление выработки IL-10. Журнал FASEB, 14 (15), 2380–2382. https://doi.org/10.1096/fj.00-0359fje
  120. ^ Гао, Z; Инь, Дж; Чжан, Дж; Ward, R.E; Мартин, Р. Дж; Лефевр, М; Чефалу, В. Т; Йе, Дж (2009). «Бутират улучшает чувствительность к инсулину и увеличивает расход энергии у мышей» . Диабет . 58 (7): 1509–17. DOI : 10,2337 / db08-1637 . PMC 2699871 . PMID 19366864 .  
  121. ^ Мазиди, Мохсен; Резаи, Пейман; Кенне, Андре Паскаль; Мобархан, Маджид Гайур; Папоротники, Гордон А (2016). «Микробиом кишечника и метаболический синдром». Диабет и метаболический синдром: клинические исследования и обзоры . 10 (2): S150–7. DOI : 10.1016 / j.dsx.2016.01.024 . PMID 26916014 . 
  122. ^ Чен, Сяо; д'Суза, Рошан; Хонг, Сеонг-Тшул (2013). «Роль кишечной микробиоты в оси кишечник-мозг: текущие проблемы и перспективы» . Белки и клетки . 4 (6): 403–14. DOI : 10.1007 / s13238-013-3017-х . PMC 4875553 . PMID 23686721 .  
  123. ^ a b Минемура, Масами (2015). «Микробиота кишечника и болезни печени» . Всемирный журнал гастроэнтерологии . 21 (6): 1691–702. DOI : 10,3748 / wjg.v21.i6.1691 . PMC 4323444 . PMID 25684933 .  
  124. ^ Син, Николай L; Teng, Michele WL; Мок, Тони СК; Су, Росс А. (2017). «De-novo и приобретенная устойчивость к нацеливанию на иммунные контрольные точки». Ланцетная онкология . 18 (12): e731–41. DOI : 10.1016 / s1470-2045 (17) 30607-1 . PMID 29208439 . 
  125. ^ a b Moeller, Andrew H .; Ли, Иньин; Нголе, Эйтель Мпуди; Ахука-Мундеке, Стив; Lonsdorf, Elizabeth V .; Pusey, Anne E .; Петерс, Мартина; Hahn, Beatrice H .; Охман, Ховард (18 ноября 2014 г.). «Быстрые изменения микробиома кишечника в процессе эволюции человека» . Труды Национальной академии наук . 111 (46): 16431–16435. Bibcode : 2014PNAS..11116431M . DOI : 10.1073 / pnas.1419136111 . ISSN 0027-8424 . PMC 4246287 . PMID 25368157 .   
  126. ^ Engel, P .; Моран, Н. (2013). «Микробиота кишечника насекомых - разнообразие по строению и функциям» . FEMS Microbiology Reviews . 37 (5): 699–735. DOI : 10.1111 / 1574-6976.12025 . PMID 23692388 . 
  127. Перейти ↑ Brune, A. (2014). «Симбиотическое переваривание лигноцеллюлозы в кишечнике термитов». Обзоры природы микробиологии . 12 (3): 168–80. DOI : 10.1038 / nrmicro3182 . PMID 24487819 . S2CID 5220210 .  
  128. ^ a b Дитрих, С .; Köhler, T .; Брюн, А. (2014). «Таракан происхождение микробиоты кишечника термитов: закономерности в структуре бактериального сообщества отражают основные эволюционные события» . Прикладная и экологическая микробиология . 80 (7): 2261–69. DOI : 10,1128 / AEM.04206-13 . PMC 3993134 . PMID 24487532 .  
  129. ^ а б Микаелян, А .; Дитрих, С .; Köhler, T .; Poulsen, M .; Sillam-Dussès, D .; Брюн, А. (2015). «Диета является основным фактором, определяющим структуру бактериального сообщества в кишечнике высших термитов». Молекулярная экология . 24 (20): 5824–95. DOI : 10.1111 / mec.13376 . PMID 26348261 . S2CID 206182668 .  
  130. ^ Микаэлян, А .; Thompson, C .; Hofer, M .; Брюн, А. (2016). «Детерминированная сборка сложных бактериальных сообществ в кишечнике тараканов без микробов» . Прикладная и экологическая микробиология . 82 (4): 1256–63. DOI : 10,1128 / AEM.03700-15 . PMC 4751828 . PMID 26655763 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

Обзорные статьи
  • Марандуба, Карлуш Маньо да Кошта; Де Кастро, Сандра Бертелли Рибейро; Соуза, Густаво Торрес де; Россато, Криштиану; Да Гиа, Франсиско Карлос; Валенте, Мария Анете Сантана; Ретторе, Жоао Витор Паес; Марандуба, Клаудинейя Перейра; Соуза, Камила Морманн де; Карму, Антониу Марсиу Резенде ду; МакЭдо, Гилсон Коста; Сильва, Фернандо де Са (2015). «Кишечная микробиота как модуляторы иммунной системы и нейроиммунной системы: влияние на здоровье хозяина и гомеостаз» . Журнал иммунологических исследований . 2015 : 931574. дои : 10,1155 / 2015/931574 . PMC  4352473 . PMID  25759850 .
  • Де Претер, Вики; Hamer, Henrike M; Уинди, Карен; Вербеке, Кристин (2011). «Влияние пре- и / или пробиотиков на метаболизм толстой кишки человека: влияет ли это на здоровье человека?». Молекулярное питание и пищевые исследования . 55 (1): 46–57. DOI : 10.1002 / mnfr.201000451 . PMID  21207512 .
  • Пракаш, Сатья; Родес, Летиция; Кусса-Чарли, Майкл; Томаро-Дюшено, Екатерина; Томаро-Дюшено, Екатерина; Кусса-Чарли; Родес (2011). «Микробиота кишечника: новый рубеж в понимании здоровья человека и разработке биотерапевтических средств» . Биологические препараты: цели и терапия . 5 : 71–86. DOI : 10.2147 / BTT.S19099 . PMC  3156250 . PMID  21847343 .
  • Wu, GD; Chen, J .; Hoffmann, C .; Биттингер, К .; Chen, Y.-Y .; Keilbaugh, SA; Bewtra, M .; Рыцари, D .; Уолтерс, Вашингтон; Knight, R .; Sinha, R .; Gilroy, E .; Gupta, K .; Baldassano, R .; Nessel, L .; Li, H .; Бушман, ФО; Льюис, JD (2011). «Связь долгосрочных диетических моделей с кишечными микробными энтеротипами» . Наука . 334 (6052): 105–08. Bibcode : 2011Sci ... 334..105W . DOI : 10.1126 / science.1208344 . PMC  3368382 . PMID  21885731 .