В энзимологии , A галогенуксусная dehalogenase ( ЕС 3.8.1.3 ) представляет собой фермент , который катализирует в химическую реакцию
Галоацетатдегалогеназа | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||
ЕС нет. | 3.8.1.3 | |||||||
№ CAS | 37289-40-0 | |||||||
Базы данных | ||||||||
IntEnz | Просмотр IntEnz | |||||||
BRENDA | BRENDA запись | |||||||
ExPASy | Просмотр NiceZyme | |||||||
КЕГГ | Запись в KEGG | |||||||
MetaCyc | метаболический путь | |||||||
ПРИАМ | профиль | |||||||
Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | |||||||
Генная онтология | Amigo / QuickGO | |||||||
|
- галогенацетат + H 2 O гликолят + галогенид
Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются галогенацетат и H 2 O , а двумя его продуктами являются гликолят и галогенид . Например, в случае фторацетата будет образовываться гликолят и фторид .
Этот фермент принадлежит к семейству гидролаз , одному из крупнейших известных семейств ферментов, включающих примерно 1% генов в геноме человека , существует в виде гомодимера и специфически действует на галогенидные связи в соединениях галогенида углерода. Систематическое название данного фермента класса галогенуксусной halidohydrolase . Этот фермент также называют моногалогенацетатдегалогеназой и фторацетатдегалогеназой . Этот фермент участвует в деградации гамма-гексахлорциклогексан и деградации 1,2-дихлорэтан .
Реакции
уникален тем, что катализирует разрыв исключительно стабильной связи углерод-фтор фторированного алифатического соединения . В реакции L-2-галогенкислотдегалогеназы и фторацетатдегалогеназы карбоксилатная группа выполняет нуклеофильную атаку на альфа-углеродный атом, перемещая атом галогена. Это действие характерно для галогеналкандегалогеназы и 4-хлорбензоил-КоА-дегалогеназы. DL-2-галоидегалогеназа уникальна тем, что молекула воды напрямую атакует субстрат, вытесняя атом галогена .
Значимость
Поскольку фторацетат ядовит и присутствует в растениях, эндемичных для Австралии, Африки и Центральной Америки, домашний скот часто погибает от отравления фторацетатом. Фторацетат смертоносен для овец и крупного рогатого скота в дозах от 0,25 до 0,5 мг / кг массы тела и представляет собой проблему в животноводстве. Ген фторацетатдегалогеназы из штамма B почвенной бактерии Moraxella разновидностей был перенесен в бактерию рубца Butyrivibrio fibrisolvens и экспрессирован in vitro на достаточно высоких уровнях для детоксикации фторацетата в окружающей среде. Ученые и фермеры хотят определить способ передачи B. fibrisolvens животным или растениям.
Структурные исследования
По состоянию на конец 2007 г. для этого класса ферментов была решена только одна структура с кодом доступа PDB 1Y37 .
Рекомендации
- ГОЛДМАН П. (1965). «Ферментативное расщепление связи углерод-фтор во фторацетате». J. Biol. Chem . 240 : 3434–8. PMID 14321384 .
- Гольдман П., Милн Г. В. (1966). «Разрыв связи углерод-фтор. II. Исследования механизма дефторирования фторацетата». J. Biol. Chem . 241 (23): 5557–9. PMID 5928195 .
- Форум японских химических журналов и Wiley Periodicals, Inc., 2008 г.
- Маккензи Д. Ветер из-за измененных соевых бобов. Новый ученый. Том 148 (2006), стр. 2 декабря 1995 г.
- 1995 Soy Stats. Домашняя страница Американской ассоциации соевых бобов.
- Биотехнологии растений появятся на экране радаров сельскохозяйственного сектора в 1996 году. Биобизнес. 8 декабря 1995 г.
- Тацуо Курихара Журнал биохимии. Vol. 131, стр. 671–677 (2002), Regular paper; 2002