Международный консорциум эпигенома человека

Международный консорциум эпигена Human (IHEC) является научной организацией, основанной в 2010 году, что помогает координировать глобальные усилия в области Epigenomics . ^{[1] [2] [3] [4]} Первоначальной целью было создать не менее 1000 эталонных (исходных) эпигеномов человека из различных типов нормальных и связанных с заболеванием типов клеток человека . ^{[5] [6] [7]}

Структура и финансирование [ править ]

Деятельность IHEC финансируется его полноправными членами (национальными и региональными научными финансовыми агентствами) и укомплектована в основном на добровольной основе учеными и другими экспертами из участвующих финансовых агентств и проектов картирования эпигеномов. ^[8]

Текущие страны-члены IHEC [ править ]

• Канадские институты медицинских исследований (Канада) ^[9]
• Европейская комиссия (ЕС) ^{[10] [11] [12] [13] [14]}
• Федеральное министерство образования и исследований , Агентство по управлению проектами Немецкого аэрокосмического центра (Германия) ^{[15] [16]}
• Институт генома Сингапура (Сингапур) ^[17]
• Гонконгский эпигеномический проект (Гонконг) ^{[18] [19]}
• Японское агентство медицинских исследований и разработок (Япония) ^[20]
• Национальный институт здоровья (Южная Корея)
• Национальные институты здравоохранения : программа эпигеномики дорожной карты ^[21] и проект Энциклопедия элементов ДНК ( ENCODE ) (США)

Кроме того, страны и агентства, поддерживающие цели IHEC, - это организации, которые еще не сделали полного финансового вклада в проект, но члены которых предоставляют время и знания: ^[22]

• Европейский институт онкологии , Фонд Института молекулярной онкологии FIRC, Итальянский технологический институт , Центр геномных наук (Италия)
• Национальное агентство исследований (Франция)
• Национальный совет здравоохранения и медицинских исследований (Австралия)
• Великобритания Доноры Alliance: Совет по медицинским исследованиям , биотехнологии и биологических наук исследовательский совет , Cancer Research UK и Wellcome Trust (Великобритания)

Надзор за IHEC осуществляется Исполнительным комитетом, члены которого назначаются полноправными организациями-членами. ^[23] Этот комитет работает в тесном сотрудничестве с Международным научным руководящим комитетом, членами которого являются научные руководители участвующих проектов и другие лидеры в области эпигенетики, а также с Координационным центром данных. Дополнительный опыт вносят рабочие группы, состоящие из членов участвующих исследовательских проектов.

IHEC взаимодействует и координирует свои усилия с другими крупномасштабными международными проектами в области геномики, такими как Международный консорциум генома рака (ICGC), ^[24] ENCODE ., ^{[25] [26]} и Глобальный альянс по геномике и здоровью. ^[27] Члены комитетов и рабочих групп, а также другие лица, участвующие в IHEC, ежегодно встречаются на мероприятии, проводимом странами-членами на ротационной основе. ^[28] Большинство встреч проводится вместе с научными симпозиумами, некоторые из которых открыты для ученых, не входящих в IHEC, а иногда и для представителей общественности.

Цели [ править ]

Конечная цель IHEC - определить, как эпигеном формировал человеческие популяции на протяжении поколений и в ответ на окружающую среду. ^{[25] [29]} Первый этап операций IHEC включает координацию производства не менее 1000 эталонных эпигеномов из здоровых и больных клеток человека, а также ограниченного числа модельных организмов, относящихся к конкретным заболеваниям человека. Первоначально основное внимание уделяется клеточным состояниям, включая стволовость, бессмертие, пролиферацию , дифференциацию , старение и стресс. Эталонный эпигеном для каждого образца включает карты метилирования ДНК с высоким разрешением и ключевого регуляторного гистона.модификации с соответствующей информацией о типе и уровне экспрессии всех транскрибируемых генов ( кодирующих белки, а также некодирующих / малых РНК). ^[30] Полученные данные предоставляются в свободный доступ исследовательскому сообществу через портал данных IHEC, ^{[31] [32]} Европейский архив генома-феномена (EGA), ^[33] и в других местах. ^{[34] [25] [35]}

Кроме того, участвующие исследовательские проекты занимаются разработкой новых методов эпигеномики и связанных с ними методов биоинформатики .

В ноябре 2016 года члены IHEC из Канады, Консорциума BLUEPRINT Европейского Союза, Немецкой программы эпигенома «DEEP», Японии, Сингапура и США опубликовали группу из 41 согласованной статьи в Cell Press и других журналах. ^{[36] [37] [38] [39]} Документы включали описания молекулярной биологии и вычислительных методов, а также новые исследования в области нормальной биологии и биологии болезней. ^{[40] [41] [42] [43]}

См. Также [ править ]

• Эпигеном человека

Ссылки [ править ]

^[44]